MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015574	AAG	2	6	40255	40260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986279
502	NC_015574	ATT	2	6	40364	40369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986279
503	NC_015574	TGA	2	6	40471	40476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015574	ACT	2	6	40570	40575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015574	TAA	2	6	40614	40619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015574	CAA	2	6	40629	40634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015574	ATG	3	9	40818	40826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986280
508	NC_015574	CAT	3	9	40894	40902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986280
509	NC_015574	GGA	3	9	40906	40914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986280
510	NC_015574	CAT	2	6	40930	40935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986280
511	NC_015574	TTG	2	6	41293	41298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015574	AAG	2	6	41444	41449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986281
513	NC_015574	GGA	2	6	41556	41561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986281
514	NC_015574	ACG	2	6	41612	41617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986281
515	NC_015574	GAA	2	6	41641	41646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986281
516	NC_015574	AAT	2	6	41652	41657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986281
517	NC_015574	GCA	2	6	41686	41691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986281
518	NC_015574	GCA	2	6	41737	41742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986281
519	NC_015574	AGG	2	6	41829	41834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986281
520	NC_015574	CCA	2	6	41975	41980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986281
521	NC_015574	CAA	2	6	42020	42025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986281
522	NC_015574	TAC	2	6	42244	42249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986281
523	NC_015574	ACG	2	6	42290	42295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986281
524	NC_015574	ATG	2	6	42545	42550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986281
525	NC_015574	CAG	2	6	42584	42589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986281
526	NC_015574	CTG	2	6	42599	42604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986281
527	NC_015574	GAT	2	6	42655	42660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986281
528	NC_015574	GGC	2	6	42681	42686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986281
529	NC_015574	AGA	2	6	42854	42859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015574	GGC	2	6	43118	43123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986282
531	NC_015574	ATA	2	6	43127	43132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986282
532	NC_015574	AAG	2	6	43278	43283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986282
533	NC_015574	CTT	2	6	43292	43297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986282
534	NC_015574	TTC	2	6	43446	43451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986282
535	NC_015574	ATG	2	6	43853	43858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986282
536	NC_015574	GAA	2	6	44047	44052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986282
537	NC_015574	TTA	2	6	44097	44102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986282
538	NC_015574	TTG	2	6	44103	44108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986282
539	NC_015574	ATG	2	6	44267	44272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986282
540	NC_015574	ATG	2	6	44319	44324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986282
541	NC_015574	CTT	2	6	44346	44351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986282
542	NC_015574	TTG	2	6	44379	44384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986282
543	NC_015574	AGT	2	6	44612	44617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015574	CTT	2	6	44622	44627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015574	AAT	2	6	44700	44705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015574	ATC	2	6	44736	44741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015574	ATC	2	6	44754	44759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015574	ATC	2	6	44772	44777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015574	ATC	2	6	44790	44795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015574	ATC	2	6	44808	44813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015574	ATC	2	6	44826	44831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015574	ATC	2	6	44844	44849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015574	GAA	2	6	44968	44973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015574	TTC	2	6	45150	45155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986283
555	NC_015574	CAT	2	6	45207	45212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986283
556	NC_015574	CAG	2	6	45305	45310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986283
557	NC_015574	CTT	2	6	45525	45530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986283
558	NC_015574	TCC	2	6	45612	45617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986283
559	NC_015574	GCA	2	6	45664	45669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986283
560	NC_015574	TCG	3	9	45700	45708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986283
561	NC_015574	GTT	2	6	45869	45874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015574	TGA	2	6	46118	46123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986284
563	NC_015574	TAC	2	6	46398	46403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015574	TAT	2	6	46446	46451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015574	CAA	2	6	46536	46541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015574	CAT	2	6	46603	46608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015574	TTG	2	6	46725	46730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986285
568	NC_015574	CAT	2	6	46746	46751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986285
569	NC_015574	GAA	2	6	46765	46770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986285
570	NC_015574	TTA	2	6	46805	46810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986285
571	NC_015574	CAA	2	6	46818	46823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986285
572	NC_015574	AAT	2	6	46864	46869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986285
573	NC_015574	CAG	2	6	46884	46889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986285
574	NC_015574	CAG	2	6	46907	46912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986285
575	NC_015574	TAT	2	6	46915	46920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986285
576	NC_015574	CTT	3	9	46962	46970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986285
577	NC_015574	TAT	2	6	47002	47007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986285
578	NC_015574	AGA	2	6	47009	47014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986285
579	NC_015574	CCA	2	6	47250	47255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986285
580	NC_015574	ATC	2	6	47282	47287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986285
581	NC_015574	GGA	2	6	47359	47364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986285
582	NC_015574	AAT	2	6	47381	47386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986285
583	NC_015574	AGC	2	6	47416	47421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986285
584	NC_015574	CAT	2	6	47428	47433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986285
585	NC_015574	TTC	2	6	47676	47681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986285
586	NC_015574	ATG	2	6	47913	47918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986286
587	NC_015574	GGA	2	6	47931	47936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986286
588	NC_015574	ACA	2	6	48132	48137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986286
589	NC_015574	CCG	2	6	48144	48149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986286
590	NC_015574	TGA	2	6	48157	48162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986286
591	NC_015574	GTT	2	6	48192	48197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986286
592	NC_015574	CAT	2	6	48202	48207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986286
593	NC_015574	TCT	2	6	48232	48237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986286
594	NC_015574	TGT	2	6	48286	48291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986286
595	NC_015574	GTT	2	6	48374	48379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986286
596	NC_015574	CCA	2	6	48394	48399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986286
597	NC_015574	TCC	2	6	48407	48412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986286
598	NC_015574	CCG	2	6	48450	48455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333986286
599	NC_015574	CTT	2	6	48684	48689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986286
600	NC_015574	CAG	2	6	48718	48723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986286
601	NC_015574	TAA	2	6	48870	48875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015574	TTG	2	6	49143	49148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015574	ATT	2	6	49331	49336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
604	NC_015574	GCG	2	6	49368	49373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986287
605	NC_015574	CGG	2	6	49412	49417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986287
606	NC_015574	ACA	2	6	49453	49458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
607	NC_015574	ATG	2	6	49570	49575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986287
608	NC_015574	ACA	2	6	49656	49661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
609	NC_015574	CAA	2	6	49690	49695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
610	NC_015574	AAT	2	6	49710	49715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
611	NC_015574	TGG	2	6	49724	49729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
612	NC_015574	TCG	2	6	49861	49866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986287
613	NC_015574	TGG	2	6	49928	49933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
614	NC_015574	ACA	2	6	49984	49989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
615	NC_015574	TAT	2	6	50120	50125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986287
616	NC_015574	ACA	2	6	50152	50157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
617	NC_015574	TGG	2	6	50171	50176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
618	NC_015574	CTT	2	6	50203	50208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986287
619	NC_015574	TGG	2	6	50249	50254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
620	NC_015574	ATA	2	6	50263	50268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
621	NC_015574	TGG	2	6	50327	50332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
622	NC_015574	CTA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986287
623	NC_015574	CAA	2	6	50393	50398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986287
624	NC_015574	TAA	2	6	50405	50410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986287
625	NC_015574	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986287
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