MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011206	TGG	2	6	292843	292848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282446
4002	NC_011206	GCC	2	6	292882	292887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282446
4003	NC_011206	GCG	2	6	292888	292893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282446
4004	NC_011206	TTG	2	6	293183	293188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282447
4005	NC_011206	TTA	2	6	293313	293318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282447
4006	NC_011206	GGC	2	6	293416	293421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282447
4007	NC_011206	TTA	2	6	293748	293753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282447
4008	NC_011206	GGT	3	9	293803	293811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282447
4009	NC_011206	ACC	2	6	293824	293829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282447
4010	NC_011206	GGC	2	6	294234	294239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282448
4011	NC_011206	CAT	2	6	294318	294323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282448
4012	NC_011206	GGT	2	6	294369	294374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282448
4013	NC_011206	ATG	2	6	294384	294389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282448
4014	NC_011206	CAG	2	6	294429	294434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282448
4015	NC_011206	GTC	2	6	294445	294450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282448
4016	NC_011206	CGG	2	6	294708	294713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4017	NC_011206	CGG	2	6	294783	294788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4018	NC_011206	GAC	2	6	294790	294795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282449
4019	NC_011206	TGG	2	6	294879	294884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282449
4020	NC_011206	GAG	2	6	294910	294915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282449
4021	NC_011206	CAG	2	6	294997	295002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282449
4022	NC_011206	GGC	2	6	295147	295152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4023	NC_011206	CGG	2	6	295194	295199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4024	NC_011206	TGC	2	6	295232	295237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282449
4025	NC_011206	CGG	2	6	295448	295453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4026	NC_011206	CAG	2	6	295578	295583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282449
4027	NC_011206	CGG	2	6	295589	295594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4028	NC_011206	ATT	2	6	295663	295668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282449
4029	NC_011206	GGC	2	6	295689	295694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4030	NC_011206	GCG	2	6	295745	295750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282449
4031	NC_011206	GAG	2	6	295762	295767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282449
4032	NC_011206	ATG	2	6	295840	295845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282449
4033	NC_011206	TGG	2	6	296121	296126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282450
4034	NC_011206	GAT	2	6	296271	296276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282450
4035	NC_011206	CAC	2	6	296388	296393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282450
4036	NC_011206	TAT	2	6	296395	296400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282450
4037	NC_011206	AGC	2	6	296407	296412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282450
4038	NC_011206	CAA	2	6	296532	296537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282450
4039	NC_011206	CGG	2	6	296788	296793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282451
4040	NC_011206	CAG	2	6	296912	296917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
4041	NC_011206	GAC	2	6	296969	296974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
4042	NC_011206	CGC	2	6	296975	296980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
4043	NC_011206	GTG	2	6	297071	297076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282451
4044	NC_011206	TGT	2	6	297135	297140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282451
4045	NC_011206	GCC	2	6	297180	297185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
4046	NC_011206	GCA	2	6	297274	297279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
4047	NC_011206	CGG	2	6	297300	297305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282451
4048	NC_011206	CGC	2	6	297331	297336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
4049	NC_011206	CGC	2	6	297504	297509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282451
4050	NC_011206	CAA	2	6	297599	297604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282451
4051	NC_011206	CAG	3	9	297647	297655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282451
4052	NC_011206	CTG	2	6	297730	297735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282451
4053	NC_011206	GAT	4	12	297834	297845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282452
4054	NC_011206	GGT	2	6	297866	297871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282452
4055	NC_011206	CGG	2	6	297962	297967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282452
4056	NC_011206	GGT	2	6	298149	298154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282452
4057	NC_011206	CAG	2	6	298158	298163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282452
4058	NC_011206	AGG	2	6	298225	298230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282452
4059	NC_011206	TTC	2	6	298236	298241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282452
4060	NC_011206	CAC	2	6	298422	298427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282452
4061	NC_011206	TGC	3	9	298679	298687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282453
4062	NC_011206	CTG	2	6	298862	298867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282453
4063	NC_011206	GGC	2	6	298901	298906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282453
4064	NC_011206	TGG	2	6	298955	298960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282453
4065	NC_011206	GCC	2	6	299002	299007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282453
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4067	NC_011206	CAG	2	6	299115	299120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282453
4068	NC_011206	TGC	2	6	299126	299131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282453
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4071	NC_011206	TGA	2	6	299330	299335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282453
4072	NC_011206	CAG	2	6	299361	299366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282453
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4081	NC_011206	TCG	2	6	299881	299886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282453
4082	NC_011206	GCG	2	6	299908	299913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282453
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4090	NC_011206	CAC	2	6	300457	300462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282454
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4102	NC_011206	TGC	2	6	301109	301114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282455
4103	NC_011206	GCA	2	6	301122	301127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282455
4104	NC_011206	GCG	2	6	301139	301144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282455
4105	NC_011206	GCC	3	9	301181	301189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282455
4106	NC_011206	TGA	2	6	301254	301259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282455
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4109	NC_011206	GCA	2	6	301475	301480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282456
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4111	NC_011206	GCC	2	6	301571	301576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282456
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4113	NC_011206	TGA	2	6	301656	301661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282456
4114	NC_011206	GCA	2	6	301728	301733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282456
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4118	NC_011206	CGG	2	6	302119	302124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282456
4119	NC_011206	CGG	2	6	302142	302147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282456
4120	NC_011206	CGG	2	6	302226	302231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282456
4121	NC_011206	GCT	2	6	302291	302296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282456
4122	NC_011206	CGG	2	6	302307	302312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282456
4123	NC_011206	CCG	2	6	302342	302347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282456
4124	NC_011206	GCC	2	6	302368	302373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282456
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4133	NC_011206	TGC	2	6	302873	302878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282456
4134	NC_011206	TCA	2	6	302952	302957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282456
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4231	NC_011206	TGC	2	6	311921	311926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282468
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4234	NC_011206	TCC	2	6	312193	312198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282468
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4355	NC_011206	GGC	2	6	320951	320956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282480
4356	NC_011206	GCA	3	9	320970	320978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282480
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4472	NC_011206	GAG	2	6	328150	328155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282489
4473	NC_011206	GTT	2	6	328254	328259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282489
4474	NC_011206	TCC	3	9	328503	328511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282490
4475	NC_011206	TGC	2	6	328534	328539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4476	NC_011206	GGC	2	6	328571	328576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282490
4477	NC_011206	GGC	2	6	328580	328585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282490
4478	NC_011206	GCA	2	6	328612	328617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4479	NC_011206	GGT	2	6	328720	328725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282490
4480	NC_011206	CAG	2	6	328763	328768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4481	NC_011206	TGG	3	9	328810	328818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282490
4482	NC_011206	CTG	2	6	328819	328824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4483	NC_011206	GCT	2	6	328934	328939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4484	NC_011206	GTC	2	6	328995	329000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4485	NC_011206	AAT	2	6	329016	329021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282490
4486	NC_011206	TCC	2	6	329118	329123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282490
4487	NC_011206	GCA	2	6	329134	329139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4488	NC_011206	CAG	4	12	329177	329188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4489	NC_011206	GCA	2	6	329227	329232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4490	NC_011206	AGC	2	6	329268	329273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4491	NC_011206	CCA	2	6	329321	329326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282490
4492	NC_011206	TAC	2	6	329351	329356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282490
4493	NC_011206	TCA	2	6	329365	329370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282490
4494	NC_011206	CCG	2	6	329373	329378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282490
4495	NC_011206	GCG	2	6	329410	329415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282490
4496	NC_011206	CAG	2	6	329489	329494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4497	NC_011206	TGC	2	6	329500	329505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4498	NC_011206	CAG	2	6	329525	329530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282490
4499	NC_011206	GCC	2	6	329531	329536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282490
4500	NC_011206	GAA	2	6	329549	329554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282490

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