MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011206	CTG	2	6	98248	98253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282252
1502	NC_011206	TCC	2	6	98422	98427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282253
1503	NC_011206	CAC	2	6	98455	98460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282253
1504	NC_011206	CGG	2	6	98502	98507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282253
1505	NC_011206	CCA	2	6	98529	98534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282253
1506	NC_011206	AGC	2	6	98558	98563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1507	NC_011206	TCA	2	6	98568	98573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282253
1508	NC_011206	GAT	2	6	98638	98643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282253
1509	NC_011206	GGT	2	6	98644	98649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282253
1510	NC_011206	CGA	2	6	98748	98753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1511	NC_011206	GCC	2	6	98756	98761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282253
1512	NC_011206	ATG	2	6	98828	98833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282253
1513	NC_011206	GGC	2	6	98880	98885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282253
1514	NC_011206	TGG	2	6	98889	98894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282253
1515	NC_011206	CCG	2	6	98913	98918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282253
1516	NC_011206	CTG	2	6	99013	99018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1517	NC_011206	ATG	2	6	99038	99043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282253
1518	NC_011206	GGC	2	6	99058	99063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282253
1519	NC_011206	CAT	2	6	99070	99075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282253
1520	NC_011206	GCA	2	6	99102	99107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1521	NC_011206	GAC	2	6	99226	99231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1522	NC_011206	CAG	2	6	99235	99240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1523	NC_011206	GGT	2	6	99334	99339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282253
1524	NC_011206	AGC	3	9	99491	99499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1525	NC_011206	GCG	2	6	99527	99532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282253
1526	NC_011206	TGA	2	6	99534	99539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282253
1527	NC_011206	TGC	2	6	99540	99545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1528	NC_011206	ACC	2	6	99569	99574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282253
1529	NC_011206	GCA	2	6	99653	99658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282253
1530	NC_011206	CCG	2	6	99820	99825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282254
1531	NC_011206	CCG	2	6	99853	99858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282254
1532	NC_011206	ATG	2	6	99868	99873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282254
1533	NC_011206	GAT	2	6	100014	100019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282254
1534	NC_011206	GGC	2	6	100097	100102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282254
1535	NC_011206	GGC	2	6	100111	100116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282254
1536	NC_011206	GCA	2	6	100132	100137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1537	NC_011206	CCA	2	6	100292	100297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282254
1538	NC_011206	CAG	2	6	100317	100322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1539	NC_011206	CAG	3	9	100347	100355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1540	NC_011206	AGC	2	6	100396	100401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282254
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1542	NC_011206	GCC	2	6	100482	100487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282254
1543	NC_011206	GCG	2	6	100529	100534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282254
1544	NC_011206	CCG	2	6	100538	100543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282254
1545	NC_011206	GAT	2	6	100578	100583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282254
1546	NC_011206	GAT	2	6	100611	100616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282254
1547	NC_011206	GCC	2	6	100644	100649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282254
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1550	NC_011206	CGG	2	6	100730	100735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282254
1551	NC_011206	TGC	2	6	100749	100754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1552	NC_011206	GTT	2	6	100803	100808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282254
1553	NC_011206	TGA	2	6	100951	100956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282254
1554	NC_011206	CAG	2	6	100986	100991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1555	NC_011206	TGC	2	6	101027	101032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282254
1556	NC_011206	CGA	2	6	101065	101070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282255
1557	NC_011206	GGC	2	6	101134	101139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282255
1558	NC_011206	TGC	2	6	101164	101169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282255
1559	NC_011206	CCA	2	6	101422	101427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282255
1560	NC_011206	GTC	2	6	101459	101464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282255
1561	NC_011206	TCA	2	6	101499	101504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282255
1562	NC_011206	CAT	2	6	101533	101538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282255
1563	NC_011206	CCA	2	6	101698	101703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282255
1564	NC_011206	TCG	2	6	101721	101726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282255
1565	NC_011206	CCA	3	9	101728	101736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282255
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1567	NC_011206	GCA	2	6	102197	102202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282256
1568	NC_011206	TGG	2	6	102216	102221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282256
1569	NC_011206	GGC	2	6	102290	102295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282256
1570	NC_011206	CTG	2	6	102348	102353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282256
1571	NC_011206	CTG	3	9	102453	102461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282256
1572	NC_011206	GGC	3	9	102581	102589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282256
1573	NC_011206	TGC	2	6	102614	102619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282256
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1576	NC_011206	CAG	2	6	102687	102692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282256
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1584	NC_011206	GGC	2	6	103034	103039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282256
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1587	NC_011206	GCG	2	6	103146	103151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282256
1588	NC_011206	GCC	2	6	103284	103289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282256
1589	NC_011206	GCC	2	6	103293	103298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282256
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1601	NC_011206	TGA	2	6	104385	104390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282257
1602	NC_011206	AGC	2	6	104478	104483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282257
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1856	NC_011206	CAT	2	6	121745	121750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282275
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1973	NC_011206	TTC	2	6	131174	131179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282288
1974	NC_011206	TCA	2	6	131262	131267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282288
1975	NC_011206	AAT	2	6	131282	131287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282288
1976	NC_011206	CAA	2	6	131404	131409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282288
1977	NC_011206	TAA	2	6	131439	131444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282288
1978	NC_011206	TGT	2	6	131445	131450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282288
1979	NC_011206	GAA	2	6	131481	131486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282288
1980	NC_011206	TGT	2	6	131490	131495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282288
1981	NC_011206	CTG	2	6	131576	131581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282288
1982	NC_011206	GCT	2	6	131706	131711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282288
1983	NC_011206	TAT	2	6	131714	131719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282288
1984	NC_011206	ATG	2	6	131785	131790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282288
1985	NC_011206	ATA	2	6	131852	131857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282289
1986	NC_011206	GGC	2	6	131980	131985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282289
1987	NC_011206	GTC	2	6	131992	131997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282289
1988	NC_011206	CCA	3	9	132021	132029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282289
1989	NC_011206	ACC	2	6	132053	132058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282289
1990	NC_011206	TGA	2	6	132246	132251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282289
1991	NC_011206	CCT	2	6	132287	132292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282289
1992	NC_011206	CGC	2	6	132315	132320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282289
1993	NC_011206	CCT	2	6	132398	132403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282289
1994	NC_011206	GAC	2	6	132451	132456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282289
1995	NC_011206	AGC	2	6	132462	132467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282289
1996	NC_011206	TGA	2	6	132520	132525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282289
1997	NC_011206	TCC	2	6	132560	132565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282289
1998	NC_011206	ATT	2	6	132703	132708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282289
1999	NC_011206	CTG	2	6	132734	132739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282289
2000	NC_011206	AGG	2	6	132751	132756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282289

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