MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011206	GGC	2	6	360379	360384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282524
5002	NC_011206	GCC	2	6	360409	360414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282524
5003	NC_011206	CCA	2	6	360459	360464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282524
5004	NC_011206	TGG	4	12	360468	360479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282524
5005	NC_011206	GGC	2	6	360577	360582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282524
5006	NC_011206	GAA	2	6	360614	360619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282524
5007	NC_011206	GCT	2	6	360650	360655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282524
5008	NC_011206	CAG	2	6	360751	360756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282524
5009	NC_011206	TGC	2	6	360854	360859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282525
5010	NC_011206	GGC	3	9	360869	360877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282525
5011	NC_011206	GCC	2	6	360900	360905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282525
5012	NC_011206	GCA	2	6	360949	360954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282525
5013	NC_011206	CCT	2	6	360982	360987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282525
5014	NC_011206	GCA	2	6	360991	360996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282525
5015	NC_011206	TGA	2	6	361041	361046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282525
5016	NC_011206	GCG	2	6	361092	361097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282525
5017	NC_011206	TGG	2	6	361111	361116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282525
5018	NC_011206	GCT	2	6	361158	361163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282525
5019	NC_011206	GCC	2	6	361218	361223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282525
5020	NC_011206	GCG	2	6	361299	361304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282525
5021	NC_011206	ATG	2	6	361347	361352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282525
5022	NC_011206	GGC	2	6	361571	361576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282525
5023	NC_011206	TCC	2	6	361912	361917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282526
5024	NC_011206	GCG	2	6	361953	361958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282526
5025	NC_011206	GAC	2	6	361971	361976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282526
5026	NC_011206	GCG	2	6	361984	361989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282526
5027	NC_011206	GCC	2	6	362010	362015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282526
5028	NC_011206	GAA	2	6	362130	362135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282526
5029	NC_011206	GCC	2	6	362146	362151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282526
5030	NC_011206	TCC	2	6	362177	362182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282526
5031	NC_011206	CCA	2	6	362329	362334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282526
5032	NC_011206	AGG	2	6	362482	362487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282526
5033	NC_011206	CAC	2	6	362538	362543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282526
5034	NC_011206	CAG	2	6	362589	362594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282526
5035	NC_011206	AGC	2	6	362680	362685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282526
5036	NC_011206	CAA	2	6	362697	362702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282526
5037	NC_011206	CGA	2	6	362768	362773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282526
5038	NC_011206	TAA	2	6	362866	362871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282526
5039	NC_011206	CGG	3	9	362876	362884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282526
5040	NC_011206	GAA	3	9	362916	362924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282526
5041	NC_011206	ATG	2	6	362974	362979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282526
5042	NC_011206	CAG	2	6	362991	362996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282526
5043	NC_011206	GAT	2	6	363003	363008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282526
5044	NC_011206	CCA	2	6	363009	363014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282526
5045	NC_011206	ACC	2	6	363047	363052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282526
5046	NC_011206	TCC	2	6	363075	363080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282527
5047	NC_011206	AGC	2	6	363165	363170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5048	NC_011206	CCG	2	6	363196	363201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282527
5049	NC_011206	GAC	2	6	363293	363298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5050	NC_011206	ATC	2	6	363369	363374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282527
5051	NC_011206	TCG	2	6	363438	363443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5052	NC_011206	CAG	2	6	363554	363559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5053	NC_011206	GGC	3	9	363560	363568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282527
5054	NC_011206	CAG	2	6	363620	363625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5055	NC_011206	CGT	2	6	363670	363675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5056	NC_011206	GCC	2	6	363686	363691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282527
5057	NC_011206	GGC	2	6	363734	363739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282527
5058	NC_011206	GCA	2	6	363813	363818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5059	NC_011206	GAT	2	6	363847	363852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282527
5060	NC_011206	GGC	3	9	363872	363880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282527
5061	NC_011206	GCC	2	6	363995	364000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282527
5062	NC_011206	CGG	2	6	364003	364008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282527
5063	NC_011206	GTG	2	6	364047	364052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282527
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5065	NC_011206	CGA	2	6	364084	364089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282527
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5067	NC_011206	CTG	2	6	364258	364263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282527
5068	NC_011206	CGG	2	6	364282	364287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282527
5069	NC_011206	TGA	2	6	364460	364465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282528
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5072	NC_011206	ATG	2	6	364579	364584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282528
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5074	NC_011206	ATG	2	6	364618	364623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282528
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5083	NC_011206	GAA	2	6	365364	365369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282528
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5093	NC_011206	GCG	2	6	365802	365807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282529
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5118	NC_011206	GCT	2	6	367936	367941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282530
5119	NC_011206	GCG	2	6	368005	368010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282530
5120	NC_011206	GAT	2	6	368058	368063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282530
5121	NC_011206	GGC	2	6	368104	368109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282530
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5355	NC_011206	TCG	2	6	383750	383755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282544
5356	NC_011206	TGG	2	6	383828	383833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282544
5357	NC_011206	TCC	2	6	383906	383911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282544
5358	NC_011206	AGC	2	6	383914	383919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282544
5359	NC_011206	TGC	2	6	383930	383935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282544
5360	NC_011206	GCT	2	6	384245	384250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282545
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5374	NC_011206	GCG	2	6	384731	384736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282545
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5473	NC_011206	TGC	2	6	392698	392703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282553
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