MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011206	CGG	2	6	32348	32353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
502	NC_011206	ATC	2	6	32382	32387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282177
503	NC_011206	TAT	2	6	32448	32453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282177
504	NC_011206	CGC	2	6	32482	32487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282177
505	NC_011206	GCG	2	6	32495	32500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
506	NC_011206	GGA	2	6	32501	32506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282177
507	NC_011206	CAT	2	6	32523	32528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282177
508	NC_011206	GCG	2	6	32534	32539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
509	NC_011206	GGC	2	6	32557	32562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
510	NC_011206	GCG	2	6	32583	32588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
511	NC_011206	TCG	2	6	32644	32649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282177
512	NC_011206	TGG	2	6	32656	32661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282177
513	NC_011206	GCC	2	6	32688	32693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282177
514	NC_011206	CAA	2	6	32813	32818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282177
515	NC_011206	TCG	2	6	32890	32895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282177
516	NC_011206	GCG	2	6	32914	32919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282177
517	NC_011206	ATT	2	6	33406	33411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282178
518	NC_011206	CCG	2	6	33444	33449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282178
519	NC_011206	TGC	2	6	33580	33585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282178
520	NC_011206	GAC	2	6	33599	33604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282178
521	NC_011206	GTT	2	6	33637	33642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282178
522	NC_011206	CCG	2	6	33674	33679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282178
523	NC_011206	GGT	2	6	33757	33762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282178
524	NC_011206	GAT	2	6	33788	33793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282178
525	NC_011206	AAT	2	6	33857	33862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282178
526	NC_011206	GCA	2	6	34017	34022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282178
527	NC_011206	CTT	2	6	34031	34036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282178
528	NC_011206	ACA	2	6	34182	34187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282178
529	NC_011206	CGG	3	9	34335	34343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282178
530	NC_011206	GGA	2	6	34472	34477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282178
531	NC_011206	CAA	2	6	34516	34521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282178
532	NC_011206	GCT	2	6	34585	34590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282178
533	NC_011206	GCA	2	6	34619	34624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282178
534	NC_011206	TGT	2	6	34693	34698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282178
535	NC_011206	CAT	2	6	34730	34735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282178
536	NC_011206	GGT	2	6	34739	34744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282178
537	NC_011206	GCT	2	6	35053	35058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282179
538	NC_011206	TGG	2	6	35192	35197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282179
539	NC_011206	TGC	2	6	35249	35254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282179
540	NC_011206	GGC	2	6	35326	35331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282179
541	NC_011206	CAC	2	6	35339	35344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282179
542	NC_011206	ATC	2	6	35404	35409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282179
543	NC_011206	CGT	2	6	35478	35483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282179
544	NC_011206	ACA	2	6	35484	35489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282179
545	NC_011206	CAA	2	6	35513	35518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282179
546	NC_011206	AAC	2	6	35581	35586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282179
547	NC_011206	TGG	2	6	35681	35686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282179
548	NC_011206	TCG	2	6	35711	35716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282179
549	NC_011206	CGG	2	6	36048	36053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282179
550	NC_011206	CCA	2	6	36182	36187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282179
551	NC_011206	AAT	2	6	36189	36194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282179
552	NC_011206	ATT	2	6	36200	36205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282179
553	NC_011206	GTG	2	6	36725	36730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282180
554	NC_011206	GAT	2	6	36756	36761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282180
555	NC_011206	GCG	2	6	36762	36767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282180
556	NC_011206	TCC	2	6	36802	36807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282180
557	NC_011206	CCA	2	6	36833	36838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282180
558	NC_011206	CGA	2	6	36932	36937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282180
559	NC_011206	CCG	2	6	36952	36957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282180
560	NC_011206	GAT	2	6	36960	36965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282180
561	NC_011206	CTC	2	6	36966	36971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282180
562	NC_011206	GTG	2	6	36988	36993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282180
563	NC_011206	TCA	2	6	37040	37045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282180
564	NC_011206	GTC	2	6	37067	37072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282180
565	NC_011206	CAC	2	6	37080	37085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282180
566	NC_011206	CCG	2	6	37090	37095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282180
567	NC_011206	TCT	2	6	37201	37206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282180
568	NC_011206	CGC	2	6	37422	37427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282180
569	NC_011206	ACG	2	6	37501	37506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282180
570	NC_011206	GCG	2	6	37587	37592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282180
571	NC_011206	CCG	2	6	37629	37634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282180
572	NC_011206	CGG	2	6	37707	37712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282180
573	NC_011206	CTG	2	6	37740	37745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282180
574	NC_011206	CTG	2	6	37831	37836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282181
575	NC_011206	GTT	2	6	37852	37857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282181
576	NC_011206	GAA	2	6	37888	37893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282181
577	NC_011206	GAA	2	6	37897	37902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282181
578	NC_011206	ACC	2	6	37913	37918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282181
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581	NC_011206	GAA	2	6	37981	37986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282181
582	NC_011206	CCA	2	6	38088	38093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282181
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584	NC_011206	ATG	2	6	38132	38137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282181
585	NC_011206	CAT	2	6	38185	38190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282181
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589	NC_011206	GAT	2	6	38404	38409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282181
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591	NC_011206	TTG	2	6	38467	38472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282181
592	NC_011206	TGG	2	6	38505	38510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282181
593	NC_011206	CAT	2	6	38641	38646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282181
594	NC_011206	TTC	2	6	38851	38856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282181
595	NC_011206	GTC	2	6	38945	38950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282181
596	NC_011206	CGG	2	6	38955	38960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282181
597	NC_011206	GGC	2	6	38962	38967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282181
598	NC_011206	GCT	2	6	38995	39000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282181
599	NC_011206	TGT	2	6	39014	39019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282181
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601	NC_011206	CCG	2	6	39116	39121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282181
602	NC_011206	CCG	2	6	39191	39196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282181
603	NC_011206	CAG	2	6	39270	39275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282181
604	NC_011206	CAG	2	6	39322	39327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282181
605	NC_011206	GAC	2	6	39331	39336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282181
606	NC_011206	TCT	2	6	39363	39368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282181
607	NC_011206	ACC	2	6	39412	39417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282182
608	NC_011206	TGA	2	6	39555	39560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282182
609	NC_011206	CAC	2	6	39577	39582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282182
610	NC_011206	CTG	2	6	39717	39722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282183
611	NC_011206	CTT	2	6	39858	39863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282183
612	NC_011206	ACG	2	6	39991	39996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282184
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614	NC_011206	TGG	2	6	40023	40028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282184
615	NC_011206	ACG	2	6	40067	40072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282184
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618	NC_011206	GAG	3	9	40430	40438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282185
619	NC_011206	GCC	2	6	40445	40450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282185
620	NC_011206	GGC	2	6	40477	40482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282185
621	NC_011206	CGC	2	6	40489	40494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282185
622	NC_011206	CCA	2	6	40507	40512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282185
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