MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011206	CCG	2	6	209901	209906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282367
3002	NC_011206	ACA	2	6	209950	209955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
3003	NC_011206	CAA	2	6	209968	209973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282367
3004	NC_011206	TTC	2	6	209990	209995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282367
3005	NC_011206	GTT	2	6	210051	210056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282367
3006	NC_011206	TAT	2	6	210165	210170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
3007	NC_011206	TAG	2	6	210263	210268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282368
3008	NC_011206	ATT	2	6	210416	210421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282368
3009	NC_011206	ATA	2	6	210428	210433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282368
3010	NC_011206	ATC	2	6	210454	210459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282368
3011	NC_011206	CCA	2	6	210823	210828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282369
3012	NC_011206	CAT	2	6	210833	210838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
3013	NC_011206	TCA	2	6	211023	211028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282369
3014	NC_011206	ATT	2	6	211065	211070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282369
3015	NC_011206	TCT	2	6	211151	211156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282369
3016	NC_011206	ATT	2	6	211239	211244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282369
3017	NC_011206	GTT	2	6	211372	211377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282370
3018	NC_011206	CTG	2	6	211489	211494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
3019	NC_011206	GAT	2	6	211600	211605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
3020	NC_011206	TGC	2	6	211607	211612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
3021	NC_011206	GAA	2	6	211720	211725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282370
3022	NC_011206	TGG	2	6	211800	211805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
3023	NC_011206	TGC	2	6	211821	211826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
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3026	NC_011206	GAT	2	6	212041	212046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
3027	NC_011206	TGG	2	6	212136	212141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
3028	NC_011206	TGG	2	6	212148	212153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
3029	NC_011206	TGC	2	6	212202	212207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
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3031	NC_011206	GGC	2	6	212284	212289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
3032	NC_011206	TCT	2	6	212319	212324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282370
3033	NC_011206	GAG	2	6	212443	212448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282370
3034	NC_011206	ATC	3	9	212449	212457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282370
3035	NC_011206	TCG	2	6	212474	212479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282370
3036	NC_011206	TGG	3	9	212481	212489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
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3039	NC_011206	GAA	2	6	212719	212724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282370
3040	NC_011206	CGG	2	6	212728	212733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
3041	NC_011206	TGG	2	6	212808	212813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282370
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3043	NC_011206	CGG	2	6	213090	213095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282370
3044	NC_011206	TAG	2	6	213104	213109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282370
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3050	NC_011206	AGG	2	6	213606	213611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282371
3051	NC_011206	TCG	2	6	213624	213629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
3052	NC_011206	GCG	2	6	213633	213638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282371
3053	NC_011206	TTC	2	6	213674	213679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282371
3054	NC_011206	TGG	2	6	213847	213852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282371
3055	NC_011206	AAT	2	6	213878	213883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198282371
3056	NC_011206	TGC	2	6	213935	213940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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3059	NC_011206	TTC	2	6	214233	214238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282371
3060	NC_011206	TCG	2	6	214278	214283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282371
3061	NC_011206	CGA	2	6	214291	214296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282371
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3063	NC_011206	GCG	2	6	214324	214329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282371
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3067	NC_011206	TGG	2	6	214459	214464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282371
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3103	NC_011206	TCT	2	6	216819	216824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282374
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3119	NC_011206	TCA	2	6	218849	218854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282377
3120	NC_011206	GCT	2	6	218897	218902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282377
3121	NC_011206	TCG	2	6	218923	218928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282377
3122	NC_011206	CAG	2	6	218982	218987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282377
3123	NC_011206	CGT	2	6	219020	219025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282377
3124	NC_011206	TGC	2	6	219107	219112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282378
3125	NC_011206	ACG	2	6	219162	219167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282378
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3127	NC_011206	GAT	2	6	219285	219290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282378
3128	NC_011206	CTG	2	6	219402	219407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282378
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3238	NC_011206	GTC	3	9	229450	229458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
3239	NC_011206	CTG	2	6	229459	229464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
3240	NC_011206	TCG	2	6	229517	229522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282385
3241	NC_011206	CCG	2	6	229583	229588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282385
3242	NC_011206	GGT	2	6	229611	229616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282385
3243	NC_011206	ATC	2	6	229639	229644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282385
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3247	NC_011206	GTC	2	6	229799	229804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282386
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3252	NC_011206	GTC	2	6	230165	230170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282386
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3257	NC_011206	CTG	2	6	230364	230369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282386
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3265	NC_011206	GAT	2	6	231117	231122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282386
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3473	NC_011206	CAA	2	6	245468	245473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282402
3474	NC_011206	CGG	2	6	245683	245688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282402
3475	NC_011206	TTG	2	6	246137	246142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282402
3476	NC_011206	GCC	2	6	246321	246326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282403
3477	NC_011206	CCG	2	6	246341	246346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282403
3478	NC_011206	AGC	2	6	246352	246357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282403
3479	NC_011206	GCA	2	6	246372	246377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282403
3480	NC_011206	GGT	2	6	246492	246497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282403
3481	NC_011206	GGC	2	6	246514	246519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282403
3482	NC_011206	CGC	2	6	246774	246779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282403
3483	NC_011206	GAA	2	6	246936	246941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282403
3484	NC_011206	AGA	2	6	246947	246952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282403
3485	NC_011206	CGC	2	6	246959	246964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282403
3486	NC_011206	CCG	2	6	247019	247024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282403
3487	NC_011206	CGG	2	6	247067	247072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282403
3488	NC_011206	CAC	2	6	247221	247226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282403
3489	NC_011206	GGT	3	9	247530	247538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282403
3490	NC_011206	CAT	2	6	247699	247704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282404
3491	NC_011206	ATC	2	6	247969	247974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282404
3492	NC_011206	CGA	2	6	248039	248044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282405
3493	NC_011206	GCC	2	6	248047	248052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282405
3494	NC_011206	AAC	2	6	248095	248100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282405
3495	NC_011206	CAA	2	6	248335	248340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282405
3496	NC_011206	GGC	2	6	248375	248380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282405
3497	NC_011206	CGG	2	6	248493	248498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282405
3498	NC_011206	GCC	2	6	248566	248571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282405
3499	NC_011206	ACC	2	6	248617	248622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282405
3500	NC_011206	GGC	2	6	248741	248746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406

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