MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 39436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011206	GAC	2	6	248755	248760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3502	NC_011206	GCG	2	6	248774	248779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3503	NC_011206	GAT	2	6	248849	248854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3504	NC_011206	TCA	2	6	248962	248967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282406
3505	NC_011206	CGG	2	6	249015	249020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3506	NC_011206	GCG	2	6	249119	249124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3507	NC_011206	GCG	2	6	249253	249258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3508	NC_011206	AGG	2	6	249273	249278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282406
3509	NC_011206	CCG	2	6	249279	249284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282406
3510	NC_011206	GAA	3	9	249292	249300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282406
3511	NC_011206	TCG	2	6	249393	249398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3512	NC_011206	GGT	2	6	249523	249528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282406
3513	NC_011206	CGG	2	6	249564	249569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3514	NC_011206	CCA	2	6	249589	249594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282406
3515	NC_011206	GAA	2	6	249626	249631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282406
3516	NC_011206	TGA	2	6	249693	249698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3517	NC_011206	GAT	2	6	249709	249714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3518	NC_011206	CAT	2	6	249781	249786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282406
3519	NC_011206	GCC	2	6	249833	249838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282406
3520	NC_011206	ATG	2	6	249887	249892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3521	NC_011206	ATG	2	6	250034	250039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3522	NC_011206	TCG	2	6	250068	250073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3523	NC_011206	AAC	2	6	250125	250130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282406
3524	NC_011206	GAA	2	6	250229	250234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198282406
3525	NC_011206	TCG	2	6	250260	250265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3526	NC_011206	GCT	2	6	250282	250287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3527	NC_011206	CTG	2	6	250289	250294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3528	NC_011206	CGA	2	6	250297	250302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3529	NC_011206	TCA	2	6	250380	250385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282406
3530	NC_011206	CAT	2	6	250447	250452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282406
3531	NC_011206	GGC	2	6	250471	250476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3532	NC_011206	CGA	2	6	250602	250607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3533	NC_011206	CTG	2	6	250631	250636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282406
3534	NC_011206	CGG	2	6	250638	250643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3535	NC_011206	CAG	2	6	250745	250750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282406
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3537	NC_011206	GGC	2	6	250945	250950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3538	NC_011206	CGG	2	6	250959	250964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282406
3539	NC_011206	GAT	2	6	251100	251105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282406
3540	NC_011206	CAT	2	6	251453	251458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282407
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3542	NC_011206	AGG	2	6	251482	251487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282407
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3544	NC_011206	TCG	2	6	251805	251810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282408
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3550	NC_011206	CAT	2	6	253500	253505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282409
3551	NC_011206	CAA	2	6	253509	253514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198282409
3552	NC_011206	ATT	2	6	253567	253572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198282409
3553	NC_011206	CTT	2	6	253590	253595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282409
3554	NC_011206	CAG	2	6	253711	253716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282409
3555	NC_011206	GCT	2	6	253728	253733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282409
3556	NC_011206	GCG	2	6	253739	253744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282409
3557	NC_011206	GGC	2	6	253863	253868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282409
3558	NC_011206	GAT	2	6	253894	253899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282409
3559	NC_011206	CAT	2	6	253920	253925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282409
3560	NC_011206	GGA	2	6	253947	253952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282409
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3562	NC_011206	TCG	2	6	254117	254122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282409
3563	NC_011206	TCA	2	6	254298	254303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282409
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3570	NC_011206	GAT	2	6	254854	254859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282409
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3572	NC_011206	GCA	2	6	254895	254900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282409
3573	NC_011206	TGG	2	6	254934	254939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282409
3574	NC_011206	GCG	2	6	254952	254957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282409
3575	NC_011206	ATC	2	6	254963	254968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282409
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3579	NC_011206	GCT	2	6	255344	255349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282410
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3581	NC_011206	CGG	2	6	255519	255524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282411
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3583	NC_011206	CTG	2	6	255649	255654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282411
3584	NC_011206	TCT	2	6	255674	255679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282411
3585	NC_011206	TTC	2	6	255680	255685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282411
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3587	NC_011206	TCC	2	6	257379	257384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282412
3588	NC_011206	ATC	2	6	257439	257444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282412
3589	NC_011206	ATC	2	6	257553	257558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282412
3590	NC_011206	CGC	2	6	257576	257581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282412
3591	NC_011206	CTC	2	6	257615	257620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282412
3592	NC_011206	GCC	2	6	257732	257737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282412
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3598	NC_011206	AGC	2	6	258638	258643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282413
3599	NC_011206	CTG	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282413
3600	NC_011206	CAG	2	6	258952	258957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3601	NC_011206	CCG	2	6	259020	259025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282414
3602	NC_011206	ACC	3	9	259034	259042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282414
3603	NC_011206	CTT	2	6	259122	259127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282414
3604	NC_011206	CTG	2	6	259183	259188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3605	NC_011206	CCT	2	6	259197	259202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282414
3606	NC_011206	CCA	2	6	259248	259253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282414
3607	NC_011206	TGC	2	6	259775	259780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3608	NC_011206	CAG	2	6	259795	259800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3609	NC_011206	GCT	2	6	259857	259862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3610	NC_011206	GTC	2	6	259980	259985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282414
3611	NC_011206	CCT	2	6	260104	260109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282415
3612	NC_011206	TTC	2	6	260117	260122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198282415
3613	NC_011206	ATC	2	6	260148	260153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282415
3614	NC_011206	CGC	4	12	260174	260185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282415
3615	NC_011206	CTG	2	6	260315	260320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282415
3616	NC_011206	TTG	2	6	260343	260348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198282415
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3618	NC_011206	CCA	2	6	260452	260457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282415
3619	NC_011206	GCT	2	6	260485	260490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282415
3620	NC_011206	CGG	2	6	260497	260502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282415
3621	NC_011206	TGG	2	6	260504	260509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282415
3622	NC_011206	ACC	2	6	260520	260525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282415
3623	NC_011206	CCT	2	6	260560	260565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282415
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3625	NC_011206	TGG	2	6	260607	260612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282415
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3855	NC_011206	ATG	3	9	281801	281809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198282435
3856	NC_011206	GTC	2	6	281860	281865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282435
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3858	NC_011206	TCA	2	6	282098	282103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282435
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3973	NC_011206	CCT	2	6	291121	291126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198282445
3974	NC_011206	CCG	2	6	291427	291432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282445
3975	NC_011206	GGA	2	6	291481	291486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282445
3976	NC_011206	ATC	2	6	291545	291550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198282445
3977	NC_011206	AGG	2	6	291585	291590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198282445
3978	NC_011206	CGG	2	6	291606	291611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
3979	NC_011206	GCC	3	9	291626	291634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282445
3980	NC_011206	GTG	2	6	291731	291736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282445
3981	NC_011206	ACC	2	6	291744	291749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198282445
3982	NC_011206	CGG	2	6	291930	291935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282445
3983	NC_011206	GCC	2	6	292057	292062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282446
3984	NC_011206	GCT	2	6	292103	292108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282446
3985	NC_011206	CCG	2	6	292118	292123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198282446
3986	NC_011206	TGG	2	6	292124	292129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198282446
3987	NC_011206	CGA	2	6	292247	292252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282446
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3996	NC_011206	CTG	2	6	292682	292687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198282446
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3999	NC_011206	GCA	2	6	292727	292732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198282446
4000	NC_011206	CGG	2	6	292763	292768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198282446

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