MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003552	TATGA	2	10	148	157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003552	TTCCT	2	10	1265	1274	0 %	60 %	0 %	40 %	20088900
3	NC_003552	CAAAT	2	10	1617	1626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_003552	GTTTT	2	10	1690	1699	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003552	ACAAT	2	10	2767	2776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003552	TTGGA	2	10	6287	6296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003552	CAATT	2	10	6513	6522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003552	TCTTT	2	10	7158	7167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003552	CCTTA	2	10	7232	7241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003552	GTAAA	2	10	7728	7737	60 %	20 %	20 %	0 %	20088903
11	NC_003552	TTCCT	2	10	10220	10229	0 %	60 %	0 %	40 %	20088905
12	NC_003552	CTTTT	2	10	10776	10785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003552	TTTAT	2	10	11351	11360	20 %	80 %	0 %	0 %	20088906
14	NC_003552	CTTTT	2	10	11417	11426	0 %	80 %	0 %	20 %	20088906
15	NC_003552	ATATC	2	10	12296	12305	40 %	40 %	0 %	20 %	20088906
16	NC_003552	TCAGA	2	10	12440	12449	40 %	20 %	20 %	20 %	20088906
17	NC_003552	TAGTT	2	10	12721	12730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003552	TGAAG	2	10	13249	13258	40 %	20 %	40 %	0 %	20088907
19	NC_003552	TTTTC	2	10	14766	14775	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003552	AGGGA	2	10	15744	15753	40 %	0 %	60 %	0 %	20088909
21	NC_003552	TTTTC	2	10	17773	17782	0 %	80 %	0 %	20 %	20088911
22	NC_003552	CATAT	2	10	17870	17879	40 %	40 %	0 %	20 %	20088911
23	NC_003552	TCTTT	2	10	20851	20860	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
24	NC_003552	CTTTT	2	10	20953	20962	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
25	NC_003552	TCTTT	2	10	21001	21010	0 %	80 %	0 %	20 %	20088913
26	NC_003552	TTTAA	2	10	22807	22816	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003552	ATCCA	2	10	22868	22877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003552	GTTTA	2	10	23078	23087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003552	ATTTT	2	10	23685	23694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003552	GATTA	2	10	24121	24130	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003552	TTTTC	2	10	24382	24391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003552	AAATC	2	10	26804	26813	60 %	20 %	0 %	20 %	20088918
33	NC_003552	ATGCA	2	10	27187	27196	40 %	20 %	20 %	20 %	20088918
34	NC_003552	CAGAC	2	10	27424	27433	40 %	0 %	20 %	40 %	20088918
35	NC_003552	GTGAA	2	10	29452	29461	40 %	20 %	40 %	0 %	20088920
36	NC_003552	TGAAA	2	10	31005	31014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003552	ATTGA	2	10	31458	31467	40 %	40 %	20 %	0 %	20088922
38	NC_003552	GGTTC	2	10	34563	34572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003552	TTAAT	2	10	39713	39722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003552	TTTCC	2	10	41934	41943	0 %	60 %	0 %	40 %	20088930
41	NC_003552	GATAG	2	10	43297	43306	40 %	20 %	40 %	0 %	20088931
42	NC_003552	AGCCG	2	10	45387	45396	20 %	0 %	40 %	40 %	20088934
43	NC_003552	TTTAT	2	10	46704	46713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003552	CATTT	2	10	46732	46741	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003552	CTCTG	2	10	47644	47653	0 %	40 %	20 %	40 %	20088936
46	NC_003552	CAGGA	2	10	48457	48466	40 %	0 %	40 %	20 %	20088936
47	NC_003552	ATTAA	2	10	52529	52538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003552	AAAAC	2	10	58369	58378	80 %	0 %	0 %	20 %	20088946
49	NC_003552	ATTTT	2	10	59055	59064	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003552	CCTGT	2	10	60179	60188	0 %	40 %	20 %	40 %	20088949
51	NC_003552	GCAGG	2	10	60850	60859	20 %	0 %	60 %	20 %	20088949
52	NC_003552	AATTT	2	10	63812	63821	40 %	60 %	0 %	0 %	20088951
53	NC_003552	AGGAA	2	10	71126	71135	60 %	0 %	40 %	0 %	20088960
54	NC_003552	ATTTT	2	10	73689	73698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003552	TGGAC	2	10	78460	78469	20 %	20 %	40 %	20 %	20088967
56	NC_003552	CTTTC	2	10	80509	80518	0 %	60 %	0 %	40 %	20088968
57	NC_003552	CAACC	2	10	81558	81567	40 %	0 %	0 %	60 %	20088970
58	NC_003552	CTTTT	2	10	83867	83876	0 %	80 %	0 %	20 %	20088971
59	NC_003552	TTTGT	2	10	85121	85130	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003552	TTTTG	2	10	86235	86244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003552	TTCTT	2	10	86954	86963	0 %	80 %	0 %	20 %	20088974
62	NC_003552	GCAGT	2	10	87278	87287	20 %	20 %	40 %	20 %	20088974
63	NC_003552	AGACC	2	10	88230	88239	40 %	0 %	20 %	40 %	20088975
64	NC_003552	CTGGG	2	10	88465	88474	0 %	20 %	60 %	20 %	20088975
65	NC_003552	CAGGG	2	10	90154	90163	20 %	0 %	60 %	20 %	20088976
66	NC_003552	ATTTT	2	10	90667	90676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003552	TAAAA	2	10	91116	91125	80 %	20 %	0 %	0 %	20088977
68	NC_003552	TGAAT	2	10	94469	94478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003552	TTTTA	2	10	94550	94559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003552	AAAGG	2	10	95138	95147	60 %	0 %	40 %	0 %	20088979
71	NC_003552	CGAAG	2	10	96471	96480	40 %	0 %	40 %	20 %	20088979
72	NC_003552	AGTGG	2	10	96735	96744	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003552	TCTTT	2	10	99855	99864	0 %	80 %	0 %	20 %	20088981
74	NC_003552	TCTTT	2	10	99911	99920	0 %	80 %	0 %	20 %	20088981
75	NC_003552	TTTCC	2	10	99962	99971	0 %	60 %	0 %	40 %	20088981
76	NC_003552	TTCTT	2	10	102885	102894	0 %	80 %	0 %	20 %	20088983
77	NC_003552	AAAAT	2	10	103638	103647	80 %	20 %	0 %	0 %	20088983
78	NC_003552	ATTAA	2	10	105060	105069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003552	GCTTC	2	10	113591	113600	0 %	40 %	20 %	40 %	20088989
80	NC_003552	TGTAA	2	10	114051	114060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003552	ATCTT	2	10	114791	114800	20 %	60 %	0 %	20 %	20088990
82	NC_003552	TTTCT	2	10	115021	115030	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_003552	TTTAG	2	10	115485	115494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003552	TCTGT	2	10	120606	120615	0 %	60 %	20 %	20 %	20088995
85	NC_003552	TTGAT	2	10	123119	123128	20 %	60 %	20 %	0 %	20088996
86	NC_003552	TTTGC	2	10	123179	123188	0 %	60 %	20 %	20 %	20088996
87	NC_003552	AAAAG	2	10	126190	126199	80 %	0 %	20 %	0 %	20088998
88	NC_003552	TGAGA	2	10	127027	127036	40 %	20 %	40 %	0 %	20089000
89	NC_003552	CTTCT	2	10	127757	127766	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_003552	AAAAG	2	10	128154	128163	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003552	ATCAA	2	10	128722	128731	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_003552	GTCCT	2	10	129414	129423	0 %	40 %	20 %	40 %	20089002
93	NC_003552	GAAAA	2	10	129621	129630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003552	TTTTC	2	10	131116	131125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003552	TCTGA	2	10	132268	132277	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003552	TTCTT	2	10	132424	132433	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_003552	TCTGT	2	10	134634	134643	0 %	60 %	20 %	20 %	20089006
98	NC_003552	AGTAC	2	10	135213	135222	40 %	20 %	20 %	20 %	20089007
99	NC_003552	ATTTC	2	10	135646	135655	20 %	60 %	0 %	20 %	20089008
100	NC_003552	CCCTG	2	10	136275	136284	0 %	20 %	20 %	60 %	20089008
101	NC_003552	GTTTC	2	10	136429	136438	0 %	60 %	20 %	20 %	20089008
102	NC_003552	ATTCT	2	10	136764	136773	20 %	60 %	0 %	20 %	20089009
103	NC_003552	GGGTG	2	10	139578	139587	0 %	20 %	80 %	0 %	20089013
104	NC_003552	ACAGA	2	10	139739	139748	60 %	0 %	20 %	20 %	20089013
105	NC_003552	GCTTT	2	10	141088	141097	0 %	60 %	20 %	20 %	20089015
106	NC_003552	GAAAA	2	10	141712	141721	80 %	0 %	20 %	0 %	20089015
107	NC_003552	TGAAT	2	10	141950	141959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003552	AAATA	2	10	142040	142049	80 %	20 %	0 %	0 %	20089016
109	NC_003552	TTCAG	2	10	142175	142184	20 %	40 %	20 %	20 %	20089016
110	NC_003552	TTCCT	2	10	144717	144726	0 %	60 %	0 %	40 %	20089018
111	NC_003552	TTAAT	2	10	144893	144902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003552	TTTCT	2	10	146665	146674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003552	AATAA	2	10	148673	148682	80 %	20 %	0 %	0 %	20089021
114	NC_003552	GGATG	2	10	150539	150548	20 %	20 %	60 %	0 %	20089023
115	NC_003552	TTACC	2	10	151029	151038	20 %	40 %	0 %	40 %	20089023
116	NC_003552	TTATT	2	10	152362	152371	20 %	80 %	0 %	0 %	20089025
117	NC_003552	AAAAC	2	10	154730	154739	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_003552	AAATT	2	10	155890	155899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003552	CCTGT	2	10	158700	158709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_003552	AAAAC	2	10	160203	160212	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_003552	ATTTT	2	10	160316	160325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003552	AAATG	2	10	160446	160455	60 %	20 %	20 %	0 %	20089032
123	NC_003552	CCATA	2	10	162037	162046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_003552	AAATG	2	10	164351	164360	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003552	CAGGG	2	10	166703	166712	20 %	0 %	60 %	20 %	20089038
126	NC_003552	CCACA	2	10	168772	168781	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_003552	ATTTT	2	10	168921	168930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003552	GGACC	2	10	171673	171682	20 %	0 %	40 %	40 %	20089042
129	NC_003552	ATATT	2	10	173736	173745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003552	ACTTT	2	10	177449	177458	20 %	60 %	0 %	20 %	20089047
131	NC_003552	ACTTA	2	10	182448	182457	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_003552	TCCTC	2	10	184024	184033	0 %	40 %	0 %	60 %	20089051
133	NC_003552	CTGTG	2	10	187263	187272	0 %	40 %	40 %	20 %	161484944
134	NC_003552	CTTCT	2	10	193371	193380	0 %	60 %	0 %	40 %	20089061
135	NC_003552	GCTCA	2	10	194133	194142	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_003552	TCTCT	2	10	197482	197491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_003552	TGGAA	2	10	198222	198231	40 %	20 %	40 %	0 %	20089064
138	NC_003552	GGAAT	2	10	198430	198439	40 %	20 %	40 %	0 %	20089064
139	NC_003552	AGTTC	2	10	199769	199778	20 %	40 %	20 %	20 %	20089064
140	NC_003552	AGGGC	2	10	202656	202665	20 %	0 %	60 %	20 %	20089067
141	NC_003552	TCGGT	2	10	204844	204853	0 %	40 %	40 %	20 %	20089069
142	NC_003552	GGGTC	2	10	204994	205003	0 %	20 %	60 %	20 %	20089069
143	NC_003552	TGCCT	2	10	205658	205667	0 %	40 %	20 %	40 %	20089069
144	NC_003552	ATTTG	2	10	210375	210384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003552	CCCAT	2	10	211057	211066	20 %	20 %	0 %	60 %	20089074
146	NC_003552	TGTTT	2	10	211306	211315	0 %	80 %	20 %	0 %	20089075
147	NC_003552	GACAT	2	10	212518	212527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_003552	AAAGA	2	10	214137	214146	80 %	0 %	20 %	0 %	20089078
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151	NC_003552	AAACG	2	10	221396	221405	60 %	0 %	20 %	20 %	20089084
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156	NC_003552	GCAAA	2	10	225806	225815	60 %	0 %	20 %	20 %	20089087
157	NC_003552	GTCCG	2	10	225923	225932	0 %	20 %	40 %	40 %	20089087
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164	NC_003552	CATAG	2	10	238461	238470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_003552	CTGTT	2	10	239478	239487	0 %	60 %	20 %	20 %	20089097
166	NC_003552	GTACC	2	10	240325	240334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
167	NC_003552	GTTTT	2	10	240682	240691	0 %	80 %	20 %	0 %	20089098
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170	NC_003552	TTAAA	2	10	242897	242906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_003552	TTAAA	2	10	242918	242927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003552	TTAAA	2	10	242939	242948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003552	TTAAA	2	10	242960	242969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_003552	TTCGA	2	10	243447	243456	20 %	40 %	20 %	20 %	20089101
175	NC_003552	AAGCT	2	10	245047	245056	40 %	20 %	20 %	20 %	20089101
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185	NC_003552	AGGGT	2	10	259469	259478	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003552	TTGAA	2	10	264804	264813	40 %	40 %	20 %	0 %	20089117
187	NC_003552	TCGCT	2	10	265445	265454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_003552	CTTTT	2	10	265980	265989	0 %	80 %	0 %	20 %	20089118
189	NC_003552	GCCGT	2	10	266187	266196	0 %	20 %	40 %	40 %	20089118
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191	NC_003552	TCCGT	2	10	267102	267111	0 %	40 %	20 %	40 %	20089119
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259	NC_003552	TCTGG	2	10	350055	350064	0 %	40 %	40 %	20 %	20089190
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263	NC_003552	GCTTT	2	10	354472	354481	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_003552	AAAGG	2	10	356378	356387	60 %	0 %	40 %	0 %	20089197
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269	NC_003552	CTTCG	2	10	361607	361616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_003552	CTGTT	2	10	362372	362381	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
271	NC_003552	CGAAA	2	10	363000	363009	60 %	0 %	20 %	20 %	20089202
272	NC_003552	TCCGG	2	10	363300	363309	0 %	20 %	40 %	40 %	20089202
273	NC_003552	TCCTG	2	10	364093	364102	0 %	40 %	20 %	40 %	20089203
274	NC_003552	ATTGG	2	10	369298	369307	20 %	40 %	40 %	0 %	20089208
275	NC_003552	TTATA	2	10	369588	369597	40 %	60 %	0 %	0 %	20089208
276	NC_003552	TGAGC	2	10	370538	370547	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
277	NC_003552	AGCTC	2	10	372161	372170	20 %	20 %	20 %	40 %	20089210
278	NC_003552	GAGCG	2	10	372199	372208	20 %	0 %	60 %	20 %	20089210
279	NC_003552	ATAAA	7	35	373664	373698	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_003552	AAAAT	2	10	374073	374082	80 %	20 %	0 %	0 %	20089212
281	NC_003552	TTTTA	2	10	374662	374671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_003552	CATTT	2	10	374978	374987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_003552	AATCT	2	10	377394	377403	40 %	40 %	0 %	20 %	20089215
284	NC_003552	ATTTG	2	10	378613	378622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_003552	CTTTA	2	10	380871	380880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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391	NC_003552	TTTTG	2	10	539859	539868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
392	NC_003552	ATATG	2	10	540178	540187	40 %	40 %	20 %	0 %	20089352
393	NC_003552	CTTTT	2	10	540654	540663	0 %	80 %	0 %	20 %	20089352
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395	NC_003552	ATTTT	2	10	543237	543246	20 %	80 %	0 %	0 %	20089355
396	NC_003552	CTTTA	6	30	546502	546531	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
397	NC_003552	AGTGC	2	10	546616	546625	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
398	NC_003552	ATTTA	2	10	548708	548717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_003552	CGGAA	2	10	548730	548739	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
400	NC_003552	CCCTG	2	10	548969	548978	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
401	NC_003552	GATAT	2	10	549753	549762	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
402	NC_003552	GTAAG	2	10	551413	551422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
403	NC_003552	TTAAA	2	10	552404	552413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_003552	ATTTC	2	10	552828	552837	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
405	NC_003552	GTACA	2	10	553003	553012	40 %	20 %	20 %	20 %	20089361
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408	NC_003552	TTTGT	2	10	554362	554371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
409	NC_003552	TATTT	2	10	556309	556318	20 %	80 %	0 %	0 %	20089365
410	NC_003552	ATTGT	2	10	556574	556583	20 %	60 %	20 %	0 %	20089365
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413	NC_003552	TGCCA	2	10	559936	559945	20 %	20 %	20 %	40 %	20089368
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