MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003552	AAAGG	2	10	3330065	3330074	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_003552	ATAAA	2	10	3330388	3330397	80 %	20 %	0 %	0 %	20091503
2503	NC_003552	ATCTA	2	10	3330574	3330583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2504	NC_003552	CCAAA	2	10	3333509	3333518	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2505	NC_003552	TCATA	2	10	3334350	3334359	40 %	40 %	0 %	20 %	20091504
2506	NC_003552	ACCAG	2	10	3334778	3334787	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2507	NC_003552	ATTGA	2	10	3335091	3335100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_003552	AGTGA	2	10	3336555	3336564	40 %	20 %	40 %	0 %	20091506
2509	NC_003552	GGCAG	2	10	3336589	3336598	20 %	0 %	60 %	20 %	20091506
2510	NC_003552	AATCG	2	10	3337342	3337351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2511	NC_003552	TTTTA	2	10	3338470	3338479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_003552	AGGAA	2	10	3340433	3340442	60 %	0 %	40 %	0 %	20091510
2513	NC_003552	TTCTG	2	10	3340698	3340707	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_003552	GCTGA	2	10	3341946	3341955	20 %	20 %	40 %	20 %	20091512
2515	NC_003552	TCAAA	2	10	3342347	3342356	60 %	20 %	0 %	20 %	20091512
2516	NC_003552	TGAAA	2	10	3343120	3343129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_003552	AACTT	2	10	3344360	3344369	40 %	40 %	0 %	20 %	229017561
2518	NC_003552	GAGCG	2	10	3345874	3345883	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2519	NC_003552	GCAGA	2	10	3346781	3346790	40 %	0 %	40 %	20 %	20091514
2520	NC_003552	TTTCA	2	10	3346954	3346963	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2521	NC_003552	GCATG	2	10	3347065	3347074	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2522	NC_003552	AAAGG	2	10	3348964	3348973	60 %	0 %	40 %	0 %	20091515
2523	NC_003552	AAGAA	2	10	3349553	3349562	80 %	0 %	20 %	0 %	20091515
2524	NC_003552	CGGGT	2	10	3352454	3352463	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2525	NC_003552	CCTTA	2	10	3353133	3353142	20 %	40 %	0 %	40 %	20091518
2526	NC_003552	GTCTG	2	10	3354207	3354216	0 %	40 %	40 %	20 %	20091518
2527	NC_003552	GAAAA	2	10	3356820	3356829	80 %	0 %	20 %	0 %	20091519
2528	NC_003552	GAAAA	2	10	3357027	3357036	80 %	0 %	20 %	0 %	20091519
2529	NC_003552	ATTCT	2	10	3360676	3360685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2530	NC_003552	TCCTT	2	10	3363868	3363877	0 %	60 %	0 %	40 %	20091525
2531	NC_003552	TGAAT	2	10	3366870	3366879	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_003552	GATAG	2	10	3369161	3369170	40 %	20 %	40 %	0 %	20091530
2533	NC_003552	GATAG	2	10	3369284	3369293	40 %	20 %	40 %	0 %	20091530
2534	NC_003552	ACAGT	2	10	3369965	3369974	40 %	20 %	20 %	20 %	20091530
2535	NC_003552	ATCCT	2	10	3370192	3370201	20 %	40 %	0 %	40 %	20091530
2536	NC_003552	AATAG	2	10	3370214	3370223	60 %	20 %	20 %	0 %	20091530
2537	NC_003552	AATCA	2	10	3370308	3370317	60 %	20 %	0 %	20 %	20091530
2538	NC_003552	TATAT	2	10	3372642	3372651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_003552	GATCA	2	10	3375505	3375514	40 %	20 %	20 %	20 %	20091535
2540	NC_003552	TCTCT	2	10	3375740	3375749	0 %	60 %	0 %	40 %	20091535
2541	NC_003552	ATTTG	2	10	3382372	3382381	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_003552	CTCTT	2	10	3385624	3385633	0 %	60 %	0 %	40 %	20091539
2543	NC_003552	CTTTT	2	10	3386577	3386586	0 %	80 %	0 %	20 %	20091540
2544	NC_003552	ATCGT	2	10	3388397	3388406	20 %	40 %	20 %	20 %	20091542
2545	NC_003552	GAAGA	2	10	3389393	3389402	60 %	0 %	40 %	0 %	20091543
2546	NC_003552	TCATA	2	10	3389875	3389884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2547	NC_003552	CGGTT	2	10	3391838	3391847	0 %	40 %	40 %	20 %	20091545
2548	NC_003552	ATGGG	2	10	3392336	3392345	20 %	20 %	60 %	0 %	20091545
2549	NC_003552	GTAAA	2	10	3392654	3392663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_003552	TGTCA	2	10	3394566	3394575	20 %	40 %	20 %	20 %	20091547
2551	NC_003552	GTGAT	2	10	3394663	3394672	20 %	40 %	40 %	0 %	20091547
2552	NC_003552	AAAGT	2	10	3397814	3397823	60 %	20 %	20 %	0 %	20091549
2553	NC_003552	GTTCT	2	10	3398537	3398546	0 %	60 %	20 %	20 %	20091550
2554	NC_003552	AGCGT	2	10	3399443	3399452	20 %	20 %	40 %	20 %	20091550
2555	NC_003552	TCCCA	2	10	3399479	3399488	20 %	20 %	0 %	60 %	20091550
2556	NC_003552	TTGTG	2	10	3400028	3400037	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_003552	TAAAA	2	10	3401061	3401070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_003552	ATATC	2	10	3403593	3403602	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2559	NC_003552	CATTG	2	10	3405736	3405745	20 %	40 %	20 %	20 %	20091554
2560	NC_003552	TTGCT	2	10	3406416	3406425	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2561	NC_003552	CAAAT	2	10	3406550	3406559	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2562	NC_003552	TATAT	2	10	3408156	3408165	40 %	60 %	0 %	0 %	20091556
2563	NC_003552	AAGAT	2	10	3408585	3408594	60 %	20 %	20 %	0 %	20091556
2564	NC_003552	AATCC	2	10	3409153	3409162	40 %	20 %	0 %	40 %	20091556
2565	NC_003552	CCTTT	2	10	3411017	3411026	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2566	NC_003552	GTTCA	2	10	3413995	3414004	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_003552	CTTTG	2	10	3414073	3414082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_003552	ATTCA	2	10	3414818	3414827	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2569	NC_003552	ACTTT	2	10	3415030	3415039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2570	NC_003552	AATTT	2	10	3415887	3415896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_003552	TTTAA	2	10	3415905	3415914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_003552	TTTAC	2	10	3419493	3419502	20 %	60 %	0 %	20 %	20091562
2573	NC_003552	AAATG	2	10	3422304	3422313	60 %	20 %	20 %	0 %	20091563
2574	NC_003552	GTGAC	2	10	3426182	3426191	20 %	20 %	40 %	20 %	20091568
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2577	NC_003552	ATGGG	2	10	3431806	3431815	20 %	20 %	60 %	0 %	20091573
2578	NC_003552	TCAAG	2	10	3432181	3432190	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2579	NC_003552	AAGAA	2	10	3433129	3433138	80 %	0 %	20 %	0 %	20091574
2580	NC_003552	GCTTT	2	10	3435065	3435074	0 %	60 %	20 %	20 %	20091576
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2585	NC_003552	GCATC	2	10	3443275	3443284	20 %	20 %	20 %	40 %	20091583
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2587	NC_003552	ATTGC	2	10	3443719	3443728	20 %	40 %	20 %	20 %	20091583
2588	NC_003552	TAAAG	2	10	3444470	3444479	60 %	20 %	20 %	0 %	20091584
2589	NC_003552	GAAAA	2	10	3444550	3444559	80 %	0 %	20 %	0 %	20091584
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2593	NC_003552	ATTGC	2	10	3449929	3449938	20 %	40 %	20 %	20 %	20091588
2594	NC_003552	CATGC	2	10	3450553	3450562	20 %	20 %	20 %	40 %	20091589
2595	NC_003552	GAAAA	2	10	3450760	3450769	80 %	0 %	20 %	0 %	20091589
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2598	NC_003552	AATTT	2	10	3455063	3455072	40 %	60 %	0 %	0 %	20091592
2599	NC_003552	GATAG	2	10	3456158	3456167	40 %	20 %	40 %	0 %	20091594
2600	NC_003552	GGAAA	2	10	3456814	3456823	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_003552	AATTT	2	10	3456993	3457002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_003552	TTTTA	2	10	3457129	3457138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_003552	AAATT	2	10	3457204	3457213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_003552	ATCAC	2	10	3457285	3457294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2605	NC_003552	ACGGG	2	10	3457595	3457604	20 %	0 %	60 %	20 %	20091595
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2607	NC_003552	TTTCC	2	10	3462297	3462306	0 %	60 %	0 %	40 %	20091600
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2609	NC_003552	AAATA	2	10	3464093	3464102	80 %	20 %	0 %	0 %	20091602
2610	NC_003552	GTTTT	2	10	3465266	3465275	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_003552	AGTAT	2	10	3467205	3467214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_003552	TAAGG	2	10	3468108	3468117	40 %	20 %	40 %	0 %	20091606
2613	NC_003552	ATTTT	2	10	3469199	3469208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_003552	AAAAG	2	10	3470957	3470966	80 %	0 %	20 %	0 %	20091607
2615	NC_003552	ATAGT	2	10	3472958	3472967	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_003552	AATAT	2	10	3473181	3473190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_003552	GAAAA	2	10	3474223	3474232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_003552	AGGAA	2	10	3474878	3474887	60 %	0 %	40 %	0 %	20091611
2619	NC_003552	AAATG	2	10	3474911	3474920	60 %	20 %	20 %	0 %	20091611
2620	NC_003552	AAAGG	2	10	3474959	3474968	60 %	0 %	40 %	0 %	20091611
2621	NC_003552	TTCCA	2	10	3476045	3476054	20 %	40 %	0 %	40 %	20091612
2622	NC_003552	TCTAT	2	10	3476831	3476840	20 %	60 %	0 %	20 %	20091614
2623	NC_003552	TTCCT	2	10	3476865	3476874	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2627	NC_003552	TCAGA	2	10	3483407	3483416	40 %	20 %	20 %	20 %	20091616
2628	NC_003552	CAGTT	2	10	3484396	3484405	20 %	40 %	20 %	20 %	20091616
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