MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003552	TCTCT	2	10	2689181	2689190	0 %	60 %	0 %	40 %	20091023
2002	NC_003552	TCACT	2	10	2689378	2689387	20 %	40 %	0 %	40 %	20091023
2003	NC_003552	ATTAT	2	10	2690140	2690149	40 %	60 %	0 %	0 %	20091024
2004	NC_003552	TATAA	2	10	2690200	2690209	60 %	40 %	0 %	0 %	20091024
2005	NC_003552	TTTTC	2	10	2692089	2692098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2006	NC_003552	ATCCA	2	10	2693176	2693185	40 %	20 %	0 %	40 %	20091026
2007	NC_003552	ACCCA	2	10	2693601	2693610	40 %	0 %	0 %	60 %	20091026
2008	NC_003552	TTGCT	2	10	2694340	2694349	0 %	60 %	20 %	20 %	20091027
2009	NC_003552	TTCAG	2	10	2694877	2694886	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2010	NC_003552	AGGGT	2	10	2694949	2694958	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_003552	AAATC	2	10	2696577	2696586	60 %	20 %	0 %	20 %	20091029
2012	NC_003552	GGAAG	2	10	2697159	2697168	40 %	0 %	60 %	0 %	20091029
2013	NC_003552	TTTTC	2	10	2697586	2697595	0 %	80 %	0 %	20 %	20091029
2014	NC_003552	CAGGG	2	10	2698899	2698908	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2015	NC_003552	CCTGA	2	10	2702524	2702533	20 %	20 %	20 %	40 %	20091037
2016	NC_003552	TCAGG	2	10	2706404	2706413	20 %	20 %	40 %	20 %	20091040
2017	NC_003552	AGCAA	2	10	2708514	2708523	60 %	0 %	20 %	20 %	20091041
2018	NC_003552	GATTT	2	10	2708802	2708811	20 %	60 %	20 %	0 %	20091041
2019	NC_003552	GTAAA	2	10	2709539	2709548	60 %	20 %	20 %	0 %	20091042
2020	NC_003552	GCAGA	2	10	2712980	2712989	40 %	0 %	40 %	20 %	20091044
2021	NC_003552	GTTGT	2	10	2713084	2713093	0 %	60 %	40 %	0 %	20091045
2022	NC_003552	ATTTC	2	10	2714190	2714199	20 %	60 %	0 %	20 %	20091046
2023	NC_003552	CTTTT	2	10	2714272	2714281	0 %	80 %	0 %	20 %	20091046
2024	NC_003552	TTCTT	2	10	2714517	2714526	0 %	80 %	0 %	20 %	20091046
2025	NC_003552	CGCTC	2	10	2721310	2721319	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2026	NC_003552	GTAAA	2	10	2721378	2721387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2027	NC_003552	AGATC	2	10	2722340	2722349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2028	NC_003552	GTTTT	2	10	2722758	2722767	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_003552	CAAAG	2	10	2724088	2724097	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2030	NC_003552	CCTTT	2	10	2728057	2728066	0 %	60 %	0 %	40 %	20091058
2031	NC_003552	AATGA	2	10	2730122	2730131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_003552	AAATC	2	10	2730934	2730943	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2033	NC_003552	TTCCT	2	10	2731176	2731185	0 %	60 %	0 %	40 %	20091060
2034	NC_003552	CTTAA	2	10	2731984	2731993	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2035	NC_003552	AAAGA	2	10	2733026	2733035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_003552	AATGT	2	10	2733226	2733235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_003552	GAGTA	2	10	2733307	2733316	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_003552	GGAAA	2	10	2736706	2736715	60 %	0 %	40 %	0 %	20091065
2039	NC_003552	TTCCT	2	10	2739318	2739327	0 %	60 %	0 %	40 %	20091069
2040	NC_003552	TTCCA	2	10	2739404	2739413	20 %	40 %	0 %	40 %	20091070
2041	NC_003552	CAGGC	2	10	2739464	2739473	20 %	0 %	40 %	40 %	20091070
2042	NC_003552	TTGAC	2	10	2744775	2744784	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2043	NC_003552	AGGAA	2	10	2745335	2745344	60 %	0 %	40 %	0 %	20091074
2044	NC_003552	TTACC	2	10	2745901	2745910	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2045	NC_003552	ACCTT	2	10	2745936	2745945	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2046	NC_003552	AATGA	2	10	2746715	2746724	60 %	20 %	20 %	0 %	20091075
2047	NC_003552	TAATA	2	10	2746967	2746976	60 %	40 %	0 %	0 %	20091075
2048	NC_003552	AGGAT	2	10	2748344	2748353	40 %	20 %	40 %	0 %	20091075
2049	NC_003552	TTTAT	2	10	2749723	2749732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_003552	TCATC	2	10	2750488	2750497	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2051	NC_003552	ATAAA	2	10	2750639	2750648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_003552	GAAAA	2	10	2750707	2750716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_003552	CTTCT	2	10	2752513	2752522	0 %	60 %	0 %	40 %	20091079
2054	NC_003552	TTGAT	2	10	2754176	2754185	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_003552	AACCT	2	10	2758676	2758685	40 %	20 %	0 %	40 %	20091083
2056	NC_003552	TTTAG	2	10	2759770	2759779	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_003552	TGTCA	2	10	2760270	2760279	20 %	40 %	20 %	20 %	20091084
2058	NC_003552	CTGTA	2	10	2761307	2761316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2059	NC_003552	TAGTT	2	10	2761439	2761448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2060	NC_003552	AATCC	2	10	2762423	2762432	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2061	NC_003552	CGCAA	2	10	2762472	2762481	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2062	NC_003552	ATGTA	2	10	2764392	2764401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_003552	ATAAC	2	10	2764572	2764581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2064	NC_003552	TTTTG	2	10	2765205	2765214	0 %	80 %	20 %	0 %	20091087
2065	NC_003552	TTGAA	2	10	2765426	2765435	40 %	40 %	20 %	0 %	20091087
2066	NC_003552	AATGG	2	10	2766600	2766609	40 %	20 %	40 %	0 %	20091089
2067	NC_003552	ATGAG	2	10	2768166	2768175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_003552	ATAAG	2	10	2768706	2768715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_003552	AGGGG	2	10	2769352	2769361	20 %	0 %	80 %	0 %	20091092
2070	NC_003552	GGCTA	2	10	2770721	2770730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2071	NC_003552	CTGTT	2	10	2771266	2771275	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2072	NC_003552	GTCCT	2	10	2771890	2771899	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2073	NC_003552	CGGCT	2	10	2773519	2773528	0 %	20 %	40 %	40 %	20091093
2074	NC_003552	CTTTT	2	10	2774159	2774168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2075	NC_003552	CATGC	2	10	2775050	2775059	20 %	20 %	20 %	40 %	20091094
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2078	NC_003552	AAAAG	2	10	2778123	2778132	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2079	NC_003552	TTAAG	2	10	2778152	2778161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2080	NC_003552	ATTTT	2	10	2779381	2779390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2081	NC_003552	GCACC	2	10	2781777	2781786	20 %	0 %	20 %	60 %	20091099
2082	NC_003552	TGACT	2	10	2783737	2783746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2083	NC_003552	TAACT	2	10	2783799	2783808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2084	NC_003552	TGTTT	2	10	2783892	2783901	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_003552	CCAAA	2	10	2785439	2785448	60 %	0 %	0 %	40 %	20091102
2086	NC_003552	GCAAA	2	10	2786804	2786813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2087	NC_003552	TCAAA	2	10	2787602	2787611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2088	NC_003552	TTCCT	2	10	2789429	2789438	0 %	60 %	0 %	40 %	20091104
2089	NC_003552	GATCA	2	10	2790415	2790424	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2090	NC_003552	TCGCT	2	10	2791447	2791456	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2091	NC_003552	TAAGG	2	10	2792594	2792603	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_003552	AAAGA	2	10	2792639	2792648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_003552	GGGAG	2	10	2793210	2793219	20 %	0 %	80 %	0 %	20091109
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2095	NC_003552	TTTCT	2	10	2795556	2795565	0 %	80 %	0 %	20 %	20091111
2096	NC_003552	TTCTT	2	10	2795602	2795611	0 %	80 %	0 %	20 %	20091111
2097	NC_003552	TGCTT	2	10	2796078	2796087	0 %	60 %	20 %	20 %	20091111
2098	NC_003552	GTCCT	2	10	2797430	2797439	0 %	40 %	20 %	40 %	20091113
2099	NC_003552	AAAGA	2	10	2798431	2798440	80 %	0 %	20 %	0 %	20091115
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2102	NC_003552	AGAGG	2	10	2802557	2802566	40 %	0 %	60 %	0 %	20091118
2103	NC_003552	ACAGG	2	10	2802728	2802737	40 %	0 %	40 %	20 %	20091118
2104	NC_003552	TTCCC	2	10	2803261	2803270	0 %	40 %	0 %	60 %	20091119
2105	NC_003552	CATTG	2	10	2803588	2803597	20 %	40 %	20 %	20 %	20091119
2106	NC_003552	AAAGA	2	10	2804634	2804643	80 %	0 %	20 %	0 %	20091120
2107	NC_003552	GCAGT	2	10	2805039	2805048	20 %	20 %	40 %	20 %	20091121
2108	NC_003552	GTATT	2	10	2805201	2805210	20 %	60 %	20 %	0 %	20091121
2109	NC_003552	TGATA	2	10	2806220	2806229	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_003552	TAATC	2	10	2806264	2806273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2111	NC_003552	ATCAG	2	10	2806935	2806944	40 %	20 %	20 %	20 %	20091122
2112	NC_003552	GGATG	2	10	2807062	2807071	20 %	20 %	60 %	0 %	20091122
2113	NC_003552	GTATG	2	10	2808007	2808016	20 %	40 %	40 %	0 %	20091122
2114	NC_003552	TTGCT	2	10	2811822	2811831	0 %	60 %	20 %	20 %	20091124
2115	NC_003552	AAAGG	2	10	2811870	2811879	60 %	0 %	40 %	0 %	20091124
2116	NC_003552	TTCTT	2	10	2813659	2813668	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2117	NC_003552	CAAAA	2	10	2815298	2815307	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2118	NC_003552	GTTAA	2	10	2815471	2815480	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_003552	GTTAA	2	10	2815487	2815496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_003552	GTTAA	2	10	2815535	2815544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2121	NC_003552	TGAGT	2	10	2816290	2816299	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_003552	CTAAA	2	10	2816392	2816401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2123	NC_003552	TGCCC	2	10	2818812	2818821	0 %	20 %	20 %	60 %	20091129
2124	NC_003552	AAATG	2	10	2819279	2819288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2125	NC_003552	CCATA	2	10	2820014	2820023	40 %	20 %	0 %	40 %	20091130
2126	NC_003552	TCGAT	2	10	2823617	2823626	20 %	40 %	20 %	20 %	20091132
2127	NC_003552	GATTT	2	10	2824762	2824771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2128	NC_003552	CAAAA	2	10	2825307	2825316	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2129	NC_003552	ATAAA	2	10	2826590	2826599	80 %	20 %	0 %	0 %	20091137
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2132	NC_003552	AAGAG	2	10	2833600	2833609	60 %	0 %	40 %	0 %	20091140
2133	NC_003552	CCTTA	2	10	2834168	2834177	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2134	NC_003552	GCACC	2	10	2835793	2835802	20 %	0 %	20 %	60 %	20091142
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2140	NC_003552	AAAGA	2	10	2848037	2848046	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2149	NC_003552	GGACT	2	10	2858363	2858372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2152	NC_003552	AAAAG	2	10	2859443	2859452	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2153	NC_003552	ATACA	2	10	2859677	2859686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2166	NC_003552	AACAA	2	10	2877418	2877427	80 %	0 %	0 %	20 %	20091172
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2172	NC_003552	TAAAA	2	10	2883148	2883157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2173	NC_003552	ATTTT	2	10	2883677	2883686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2258	NC_003552	GATTT	2	10	3013992	3014001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2259	NC_003552	TTAAA	2	10	3014249	3014258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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