MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003552	TGACC	2	10	5271058	5271067	20 %	20 %	20 %	40 %	20093088
4002	NC_003552	CTGCT	2	10	5272465	5272474	0 %	40 %	20 %	40 %	20093088
4003	NC_003552	GGAGG	2	10	5274248	5274257	20 %	0 %	80 %	0 %	20093090
4004	NC_003552	AACGG	2	10	5274716	5274725	40 %	0 %	40 %	20 %	20093090
4005	NC_003552	GCACA	2	10	5275475	5275484	40 %	0 %	20 %	40 %	20093090
4006	NC_003552	GTGTG	2	10	5275739	5275748	0 %	40 %	60 %	0 %	20093090
4007	NC_003552	CCAAT	2	10	5276544	5276553	40 %	20 %	0 %	40 %	20093090
4008	NC_003552	TTACC	2	10	5279895	5279904	20 %	40 %	0 %	40 %	20093093
4009	NC_003552	TAAAA	2	10	5280449	5280458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_003552	GGAAC	2	10	5283844	5283853	40 %	0 %	40 %	20 %	20093094
4011	NC_003552	ATGGT	2	10	5286133	5286142	20 %	40 %	40 %	0 %	20093094
4012	NC_003552	ATGAT	2	10	5288013	5288022	40 %	40 %	20 %	0 %	20093094
4013	NC_003552	TAAAA	2	10	5288238	5288247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_003552	AAAAC	2	10	5292146	5292155	80 %	0 %	0 %	20 %	20093095
4015	NC_003552	GGGCC	2	10	5294543	5294552	0 %	0 %	60 %	40 %	20093098
4016	NC_003552	GAAGG	2	10	5295706	5295715	40 %	0 %	60 %	0 %	20093098
4017	NC_003552	TTCGG	2	10	5298927	5298936	0 %	40 %	40 %	20 %	20093099
4018	NC_003552	CAGTT	2	10	5300171	5300180	20 %	40 %	20 %	20 %	20093099
4019	NC_003552	CATAA	2	10	5300215	5300224	60 %	20 %	0 %	20 %	20093099
4020	NC_003552	ATGGT	2	10	5305155	5305164	20 %	40 %	40 %	0 %	20093101
4021	NC_003552	ACTGT	2	10	5309262	5309271	20 %	40 %	20 %	20 %	20093103
4022	NC_003552	CATAA	2	10	5309682	5309691	60 %	20 %	0 %	20 %	20093103
4023	NC_003552	CGGCA	2	10	5310539	5310548	20 %	0 %	40 %	40 %	20093104
4024	NC_003552	ACCGA	2	10	5310576	5310585	40 %	0 %	20 %	40 %	20093104
4025	NC_003552	GCAGT	2	10	5312853	5312862	20 %	20 %	40 %	20 %	20093104
4026	NC_003552	TCTGG	2	10	5313126	5313135	0 %	40 %	40 %	20 %	20093104
4027	NC_003552	AGGAA	2	10	5314724	5314733	60 %	0 %	40 %	0 %	20093104
4028	NC_003552	AAAAT	2	10	5315553	5315562	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_003552	CGGGT	2	10	5316857	5316866	0 %	20 %	60 %	20 %	20093106
4030	NC_003552	AGAAA	2	10	5318054	5318063	80 %	0 %	20 %	0 %	20093106
4031	NC_003552	AAAAT	2	10	5319048	5319057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_003552	CAGTT	2	10	5319663	5319672	20 %	40 %	20 %	20 %	20093108
4033	NC_003552	TTCTT	2	10	5320222	5320231	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_003552	TCCTG	2	10	5320936	5320945	0 %	40 %	20 %	40 %	20093109
4035	NC_003552	AACCT	2	10	5323091	5323100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4036	NC_003552	GTACA	2	10	5325037	5325046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4037	NC_003552	AGGCC	2	10	5328390	5328399	20 %	0 %	40 %	40 %	20093115
4038	NC_003552	TGAAC	2	10	5329749	5329758	40 %	20 %	20 %	20 %	20093116
4039	NC_003552	ACCGA	2	10	5330966	5330975	40 %	0 %	20 %	40 %	20093117
4040	NC_003552	CATAA	2	10	5334496	5334505	60 %	20 %	0 %	20 %	20093120
4041	NC_003552	CTGCC	2	10	5334633	5334642	0 %	20 %	20 %	60 %	20093120
4042	NC_003552	TCTTT	2	10	5336107	5336116	0 %	80 %	0 %	20 %	20093122
4043	NC_003552	CCTCT	2	10	5336481	5336490	0 %	40 %	0 %	60 %	20093122
4044	NC_003552	GCTCA	2	10	5337188	5337197	20 %	20 %	20 %	40 %	20093122
4045	NC_003552	TATAA	2	10	5340421	5340430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_003552	TTTGA	3	15	5340431	5340445	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_003552	ATTAT	2	10	5340537	5340546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_003552	TAACA	2	10	5340595	5340604	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4049	NC_003552	AAGAG	2	10	5340976	5340985	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_003552	TGCCT	2	10	5341197	5341206	0 %	40 %	20 %	40 %	20093124
4051	NC_003552	GAAGA	2	10	5342121	5342130	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_003552	AGCGA	2	10	5342174	5342183	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_003552	TTTCA	2	10	5344456	5344465	20 %	60 %	0 %	20 %	20093126
4054	NC_003552	CCAGA	2	10	5345237	5345246	40 %	0 %	20 %	40 %	20093127
4055	NC_003552	CAGAT	2	10	5345896	5345905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4056	NC_003552	TAAAT	2	10	5346251	5346260	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_003552	CCCTT	2	10	5347051	5347060	0 %	40 %	0 %	60 %	20093128
4058	NC_003552	TCCGT	2	10	5350748	5350757	0 %	40 %	20 %	40 %	20093133
4059	NC_003552	TTTGA	2	10	5353462	5353471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_003552	GATGT	2	10	5357014	5357023	20 %	40 %	40 %	0 %	20093138
4061	NC_003552	AAGTA	2	10	5360430	5360439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_003552	GAAAG	2	10	5360503	5360512	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_003552	GAAAG	2	10	5360525	5360534	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_003552	CAGCC	2	10	5361076	5361085	20 %	0 %	20 %	60 %	20093140
4065	NC_003552	TGATT	2	10	5361153	5361162	20 %	60 %	20 %	0 %	20093140
4066	NC_003552	GCCCC	2	10	5361593	5361602	0 %	0 %	20 %	80 %	20093140
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4072	NC_003552	CAGGC	2	10	5363995	5364004	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4073	NC_003552	TGCCC	2	10	5365544	5365553	0 %	20 %	20 %	60 %	20093141
4074	NC_003552	TAACT	2	10	5366877	5366886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4080	NC_003552	GAAAG	2	10	5377115	5377124	60 %	0 %	40 %	0 %	20093149
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4083	NC_003552	AGTTA	2	10	5383843	5383852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_003552	TTCCC	2	10	5393398	5393407	0 %	40 %	0 %	60 %	20093161
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4097	NC_003552	CCCTT	2	10	5395119	5395128	0 %	40 %	0 %	60 %	20093163
4098	NC_003552	CATGG	2	10	5395236	5395245	20 %	20 %	40 %	20 %	20093163
4099	NC_003552	CTGTA	2	10	5396169	5396178	20 %	40 %	20 %	20 %	20093164
4100	NC_003552	CATCC	2	10	5402204	5402213	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4101	NC_003552	CTAAG	2	10	5403765	5403774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_003552	GGGCA	2	10	5404768	5404777	20 %	0 %	60 %	20 %	20093167
4103	NC_003552	AGAGA	2	10	5405934	5405943	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4105	NC_003552	TAAAA	2	10	5407740	5407749	80 %	20 %	0 %	0 %	20093168
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4108	NC_003552	AGAGG	2	10	5411878	5411887	40 %	0 %	60 %	0 %	20093171
4109	NC_003552	ACGGC	2	10	5412293	5412302	20 %	0 %	40 %	40 %	20093171
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4111	NC_003552	CAGGG	2	10	5415194	5415203	20 %	0 %	60 %	20 %	20093173
4112	NC_003552	GAAAA	2	10	5415897	5415906	80 %	0 %	20 %	0 %	20093173
4113	NC_003552	TGATT	2	10	5418450	5418459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4116	NC_003552	TAATC	2	10	5422257	5422266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4125	NC_003552	AGGGA	2	10	5434897	5434906	40 %	0 %	60 %	0 %	20093188
4126	NC_003552	CCTGG	2	10	5435993	5436002	0 %	20 %	40 %	40 %	20093189
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