MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003552	AAAAC	2	10	665420	665429	80 %	0 %	0 %	20 %	20089450
502	NC_003552	AGTAA	2	10	668680	668689	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_003552	CTGGA	2	10	670014	670023	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
504	NC_003552	AATAA	2	10	671386	671395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_003552	TGAAT	2	10	672464	672473	40 %	40 %	20 %	0 %	20089455
506	NC_003552	AGATA	2	10	672958	672967	60 %	20 %	20 %	0 %	20089456
507	NC_003552	CTTCT	2	10	674046	674055	0 %	60 %	0 %	40 %	20089458
508	NC_003552	TTATT	2	10	675564	675573	20 %	80 %	0 %	0 %	20089460
509	NC_003552	ATGAA	2	10	676068	676077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
510	NC_003552	AAACG	2	10	676366	676375	60 %	0 %	20 %	20 %	20089461
511	NC_003552	CGCTA	2	10	677457	677466	20 %	20 %	20 %	40 %	20089462
512	NC_003552	TTTCC	2	10	677670	677679	0 %	60 %	0 %	40 %	20089462
513	NC_003552	CAATG	2	10	679040	679049	40 %	20 %	20 %	20 %	20089464
514	NC_003552	ATTTT	2	10	682873	682882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_003552	TTAAG	2	10	683206	683215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_003552	TCAAT	2	10	685023	685032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_003552	TGCGC	2	10	685453	685462	0 %	20 %	40 %	40 %	20089470
518	NC_003552	AGGCG	2	10	688499	688508	20 %	0 %	60 %	20 %	20089473
519	NC_003552	TCAGG	2	10	689187	689196	20 %	20 %	40 %	20 %	20089474
520	NC_003552	GAACT	2	10	689927	689936	40 %	20 %	20 %	20 %	20089475
521	NC_003552	AAATG	2	10	695733	695742	60 %	20 %	20 %	0 %	20089480
522	NC_003552	TTTTC	2	10	695816	695825	0 %	80 %	0 %	20 %	20089480
523	NC_003552	AAGAT	2	10	699986	699995	60 %	20 %	20 %	0 %	20089483
524	NC_003552	CCCCA	2	10	700308	700317	20 %	0 %	0 %	80 %	20089483
525	NC_003552	TCCTG	2	10	703001	703010	0 %	40 %	20 %	40 %	20089488
526	NC_003552	TTCCT	2	10	704373	704382	0 %	60 %	0 %	40 %	20089490
527	NC_003552	GGGCT	2	10	706519	706528	0 %	20 %	60 %	20 %	20089492
528	NC_003552	CAGAA	2	10	712011	712020	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
529	NC_003552	GGTCA	2	10	712443	712452	20 %	20 %	40 %	20 %	20089497
530	NC_003552	CAGGT	2	10	715118	715127	20 %	20 %	40 %	20 %	20089498
531	NC_003552	GCAAC	2	10	715971	715980	40 %	0 %	20 %	40 %	20089499
532	NC_003552	ATCCG	2	10	719848	719857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
533	NC_003552	TGGAA	2	10	720779	720788	40 %	20 %	40 %	0 %	20089503
534	NC_003552	GGCCT	2	10	721063	721072	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
535	NC_003552	AACGG	2	10	723126	723135	40 %	0 %	40 %	20 %	20089504
536	NC_003552	TTTCC	2	10	728899	728908	0 %	60 %	0 %	40 %	20089507
537	NC_003552	TAAAG	2	10	730337	730346	60 %	20 %	20 %	0 %	20089508
538	NC_003552	AAATC	2	10	731484	731493	60 %	20 %	0 %	20 %	20089508
539	NC_003552	GTGCA	2	10	732642	732651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
540	NC_003552	CCAAC	2	10	732959	732968	40 %	0 %	0 %	60 %	20089509
541	NC_003552	TTGTT	2	10	733985	733994	0 %	80 %	20 %	0 %	20089509
542	NC_003552	CTAAA	2	10	734051	734060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
543	NC_003552	ATTCC	2	10	734728	734737	20 %	40 %	0 %	40 %	20089510
544	NC_003552	GAAAC	2	10	735574	735583	60 %	0 %	20 %	20 %	20089511
545	NC_003552	GCAAA	2	10	736157	736166	60 %	0 %	20 %	20 %	20089511
546	NC_003552	TGGAG	2	10	737440	737449	20 %	20 %	60 %	0 %	20089514
547	NC_003552	GGTAG	2	10	739531	739540	20 %	20 %	60 %	0 %	20089515
548	NC_003552	TTTTG	2	10	740332	740341	0 %	80 %	20 %	0 %	20089516
549	NC_003552	ATATC	2	10	741721	741730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
550	NC_003552	TTCTT	3	15	743968	743982	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
551	NC_003552	CTCTT	2	10	743986	743995	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
552	NC_003552	TCTCT	2	10	744019	744028	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
553	NC_003552	TCTCT	2	10	744053	744062	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
554	NC_003552	ATTCT	2	10	744307	744316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
555	NC_003552	TTTTC	2	10	746894	746903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_003552	CATTT	2	10	749347	749356	20 %	60 %	0 %	20 %	20089524
557	NC_003552	TGCCC	2	10	749457	749466	0 %	20 %	20 %	60 %	20089524
558	NC_003552	TAAAG	2	10	749933	749942	60 %	20 %	20 %	0 %	20089525
559	NC_003552	AAAGA	2	10	750856	750865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
560	NC_003552	CTGCC	2	10	754607	754616	0 %	20 %	20 %	60 %	20089528
561	NC_003552	TTTCC	2	10	754887	754896	0 %	60 %	0 %	40 %	20089528
562	NC_003552	ATTGA	2	10	755363	755372	40 %	40 %	20 %	0 %	20089528
563	NC_003552	TGGGT	2	10	760743	760752	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
564	NC_003552	GCAGG	2	10	761808	761817	20 %	0 %	60 %	20 %	20089536
565	NC_003552	AGCGA	2	10	763346	763355	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
566	NC_003552	AGGGA	2	10	763623	763632	40 %	0 %	60 %	0 %	20089538
567	NC_003552	GGAGG	2	10	765107	765116	20 %	0 %	80 %	0 %	20089538
568	NC_003552	AGGAG	2	10	765757	765766	40 %	0 %	60 %	0 %	20089538
569	NC_003552	AAAAG	2	10	765967	765976	80 %	0 %	20 %	0 %	20089539
570	NC_003552	CGATT	2	10	768105	768114	20 %	40 %	20 %	20 %	20089540
571	NC_003552	ATATA	2	10	771389	771398	60 %	40 %	0 %	0 %	20089542
572	NC_003552	TATTT	2	10	772584	772593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_003552	CTTCT	2	10	773621	773630	0 %	60 %	0 %	40 %	20089544
574	NC_003552	AAAAT	2	10	773930	773939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_003552	GTTTT	2	10	773957	773966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
576	NC_003552	AAGGA	2	10	774597	774606	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
577	NC_003552	GCTAG	2	10	774658	774667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
578	NC_003552	CATAA	2	10	774871	774880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_003552	GATCA	2	10	777056	777065	40 %	20 %	20 %	20 %	20089546
580	NC_003552	ACCTG	2	10	779420	779429	20 %	20 %	20 %	40 %	20089549
581	NC_003552	ATTGT	2	10	779470	779479	20 %	60 %	20 %	0 %	20089549
582	NC_003552	AAAAG	2	10	783664	783673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
583	NC_003552	AGCGA	2	10	783722	783731	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
584	NC_003552	TGTGG	2	10	784215	784224	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
585	NC_003552	CAGGA	2	10	785072	785081	40 %	0 %	40 %	20 %	20089555
586	NC_003552	TGAAA	2	10	786062	786071	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
587	NC_003552	TGCCG	2	10	786474	786483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
588	NC_003552	GCCCC	2	10	791160	791169	0 %	0 %	20 %	80 %	20089560
589	NC_003552	CTCTA	2	10	791834	791843	20 %	40 %	0 %	40 %	20089560
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591	NC_003552	CGCTC	2	10	794277	794286	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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595	NC_003552	TTTAT	2	10	797163	797172	20 %	80 %	0 %	0 %	20089566
596	NC_003552	TCTGC	2	10	797725	797734	0 %	40 %	20 %	40 %	20089566
597	NC_003552	GTCTT	2	10	799359	799368	0 %	60 %	20 %	20 %	20089567
598	NC_003552	AAAGC	2	10	800818	800827	60 %	0 %	20 %	20 %	20089569
599	NC_003552	TCTGG	2	10	801626	801635	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
600	NC_003552	ATTTG	2	10	810340	810349	20 %	60 %	20 %	0 %	20089578
601	NC_003552	CCCTG	2	10	811187	811196	0 %	20 %	20 %	60 %	20089578
602	NC_003552	GAACA	2	10	812013	812022	60 %	0 %	20 %	20 %	20089579
603	NC_003552	TGATC	2	10	812060	812069	20 %	40 %	20 %	20 %	20089579
604	NC_003552	GATTT	2	10	813121	813130	20 %	60 %	20 %	0 %	20089580
605	NC_003552	ATTAT	2	10	813241	813250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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607	NC_003552	TCTTT	2	10	815338	815347	0 %	80 %	0 %	20 %	20089583
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609	NC_003552	TTCTT	2	10	817721	817730	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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612	NC_003552	GAAGT	2	10	822396	822405	40 %	20 %	40 %	0 %	20089590
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615	NC_003552	TTATG	2	10	825181	825190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_003552	TCTTT	2	10	829484	829493	0 %	80 %	0 %	20 %	20089595
617	NC_003552	TCACT	2	10	830658	830667	20 %	40 %	0 %	40 %	20089597
618	NC_003552	TCTCT	2	10	833381	833390	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
619	NC_003552	TCTTT	2	10	833417	833426	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_003552	CAAAA	2	10	833713	833722	80 %	0 %	0 %	20 %	20089600
621	NC_003552	TTTTG	2	10	833731	833740	0 %	80 %	20 %	0 %	20089600
622	NC_003552	TTAAG	2	10	836681	836690	40 %	40 %	20 %	0 %	20089602
623	NC_003552	AAAGC	2	10	836828	836837	60 %	0 %	20 %	20 %	20089603
624	NC_003552	GAAAT	2	10	837845	837854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
625	NC_003552	ATCCT	2	10	840326	840335	20 %	40 %	0 %	40 %	20089606
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629	NC_003552	CCTTT	2	10	848367	848376	0 %	60 %	0 %	40 %	20089613
630	NC_003552	CATTC	2	10	850175	850184	20 %	40 %	0 %	40 %	20089614
631	NC_003552	ATAAC	2	10	851279	851288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_003552	TTGAT	2	10	852234	852243	20 %	60 %	20 %	0 %	20089616
633	NC_003552	TTTTC	2	10	852595	852604	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
634	NC_003552	GTTTC	2	10	854369	854378	0 %	60 %	20 %	20 %	20089619
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