MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 4366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003552	TATAT	2	10	1348700	1348709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_003552	CTGAA	2	10	1349220	1349229	40 %	20 %	20 %	20 %	20090007
1003	NC_003552	ATCCT	2	10	1350611	1350620	20 %	40 %	0 %	40 %	20090008
1004	NC_003552	CCTGC	2	10	1352021	1352030	0 %	20 %	20 %	60 %	20090009
1005	NC_003552	CCAAA	2	10	1352583	1352592	60 %	0 %	0 %	40 %	20090009
1006	NC_003552	TCTCT	2	10	1353266	1353275	0 %	60 %	0 %	40 %	20090010
1007	NC_003552	TGACC	2	10	1354309	1354318	20 %	20 %	20 %	40 %	20090011
1008	NC_003552	CATAG	2	10	1356656	1356665	40 %	20 %	20 %	20 %	20090013
1009	NC_003552	GCCTG	2	10	1358175	1358184	0 %	20 %	40 %	40 %	20090013
1010	NC_003552	TGGTA	2	10	1358253	1358262	20 %	40 %	40 %	0 %	20090014
1011	NC_003552	ACCGT	2	10	1361357	1361366	20 %	20 %	20 %	40 %	20090015
1012	NC_003552	AAAAT	2	10	1361390	1361399	80 %	20 %	0 %	0 %	20090015
1013	NC_003552	TTTTC	2	10	1361745	1361754	0 %	80 %	0 %	20 %	20090015
1014	NC_003552	TGACT	2	10	1362202	1362211	20 %	40 %	20 %	20 %	20090015
1015	NC_003552	TCAAC	2	10	1363923	1363932	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1016	NC_003552	ATAAA	2	10	1363986	1363995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003552	TCCGC	2	10	1365851	1365860	0 %	20 %	20 %	60 %	20090019
1018	NC_003552	GGAAG	2	10	1366436	1366445	40 %	0 %	60 %	0 %	20090019
1019	NC_003552	TCTTT	2	10	1366819	1366828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1020	NC_003552	AAAGT	2	10	1366851	1366860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003552	TATAA	2	10	1376502	1376511	60 %	40 %	0 %	0 %	20090028
1022	NC_003552	AGGAA	2	10	1378833	1378842	60 %	0 %	40 %	0 %	20090029
1023	NC_003552	GGAAA	2	10	1380479	1380488	60 %	0 %	40 %	0 %	20090030
1024	NC_003552	AGAGG	2	10	1382246	1382255	40 %	0 %	60 %	0 %	20090031
1025	NC_003552	GCTTT	2	10	1382367	1382376	0 %	60 %	20 %	20 %	20090031
1026	NC_003552	CTGCA	2	10	1382538	1382547	20 %	20 %	20 %	40 %	20090031
1027	NC_003552	CCTGC	2	10	1382747	1382756	0 %	20 %	20 %	60 %	20090031
1028	NC_003552	TTACT	2	10	1384140	1384149	20 %	60 %	0 %	20 %	20090032
1029	NC_003552	GGCAG	2	10	1384790	1384799	20 %	0 %	60 %	20 %	20090033
1030	NC_003552	TTTTC	2	10	1385953	1385962	0 %	80 %	0 %	20 %	20090035
1031	NC_003552	TCCTG	2	10	1386697	1386706	0 %	40 %	20 %	40 %	20090036
1032	NC_003552	AGGAA	2	10	1388989	1388998	60 %	0 %	40 %	0 %	20090037
1033	NC_003552	CCATA	2	10	1391281	1391290	40 %	20 %	0 %	40 %	20090038
1034	NC_003552	CGGAC	2	10	1392041	1392050	20 %	0 %	40 %	40 %	20090038
1035	NC_003552	ATATT	2	10	1399646	1399655	40 %	60 %	0 %	0 %	20090044
1036	NC_003552	AGAAT	2	10	1400783	1400792	60 %	20 %	20 %	0 %	20090045
1037	NC_003552	GATAA	2	10	1403185	1403194	60 %	20 %	20 %	0 %	20090046
1038	NC_003552	CAGGG	2	10	1403991	1404000	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_003552	TTGCA	2	10	1404130	1404139	20 %	40 %	20 %	20 %	20090047
1040	NC_003552	ATATA	2	10	1404609	1404618	60 %	40 %	0 %	0 %	20090047
1041	NC_003552	ATTTA	2	10	1406218	1406227	40 %	60 %	0 %	0 %	20090047
1042	NC_003552	ATTAT	2	10	1407665	1407674	40 %	60 %	0 %	0 %	20090048
1043	NC_003552	TCAGA	2	10	1407676	1407685	40 %	20 %	20 %	20 %	20090048
1044	NC_003552	AATTA	2	10	1408723	1408732	60 %	40 %	0 %	0 %	20090049
1045	NC_003552	CTTTT	2	10	1409212	1409221	0 %	80 %	0 %	20 %	20090049
1046	NC_003552	CTTTC	2	10	1412659	1412668	0 %	60 %	0 %	40 %	20090052
1047	NC_003552	AAAGG	2	10	1413871	1413880	60 %	0 %	40 %	0 %	20090053
1048	NC_003552	GCCTG	2	10	1413881	1413890	0 %	20 %	40 %	40 %	20090053
1049	NC_003552	TTTTG	2	10	1414115	1414124	0 %	80 %	20 %	0 %	20090053
1050	NC_003552	AAATT	2	10	1415965	1415974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_003552	AGAAT	2	10	1416749	1416758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003552	GGGAA	2	10	1417113	1417122	40 %	0 %	60 %	0 %	20090056
1053	NC_003552	CCTTT	2	10	1420003	1420012	0 %	60 %	0 %	40 %	20090058
1054	NC_003552	AAACA	2	10	1421303	1421312	80 %	0 %	0 %	20 %	20090059
1055	NC_003552	CAGGC	2	10	1421907	1421916	20 %	0 %	40 %	40 %	20090059
1056	NC_003552	GATCC	2	10	1422016	1422025	20 %	20 %	20 %	40 %	20090059
1057	NC_003552	CCGAA	2	10	1422559	1422568	40 %	0 %	20 %	40 %	20090060
1058	NC_003552	GTGCT	2	10	1422592	1422601	0 %	40 %	40 %	20 %	20090060
1059	NC_003552	CCAGT	2	10	1423487	1423496	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_003552	ATTAT	2	10	1423804	1423813	40 %	60 %	0 %	0 %	20090061
1061	NC_003552	CATCC	2	10	1424900	1424909	20 %	20 %	0 %	60 %	20090061
1062	NC_003552	TCAGC	2	10	1428396	1428405	20 %	20 %	20 %	40 %	20090063
1063	NC_003552	GATTT	2	10	1429099	1429108	20 %	60 %	20 %	0 %	20090064
1064	NC_003552	ATATA	2	10	1433422	1433431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_003552	ATCCC	2	10	1436519	1436528	20 %	20 %	0 %	60 %	20090068
1066	NC_003552	TGCAT	2	10	1436621	1436630	20 %	40 %	20 %	20 %	20090068
1067	NC_003552	AAATA	2	10	1439181	1439190	80 %	20 %	0 %	0 %	20090070
1068	NC_003552	AATCA	2	10	1440613	1440622	60 %	20 %	0 %	20 %	20090072
1069	NC_003552	AAATA	2	10	1445771	1445780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003552	AACTT	2	10	1447702	1447711	40 %	40 %	0 %	20 %	20090079
1071	NC_003552	GTACA	2	10	1447742	1447751	40 %	20 %	20 %	20 %	20090079
1072	NC_003552	GCTGC	2	10	1448688	1448697	0 %	20 %	40 %	40 %	20090080
1073	NC_003552	TGGTG	2	10	1449381	1449390	0 %	40 %	60 %	0 %	20090080
1074	NC_003552	AAAAT	2	10	1449604	1449613	80 %	20 %	0 %	0 %	20090081
1075	NC_003552	GAACT	2	10	1449714	1449723	40 %	20 %	20 %	20 %	20090081
1076	NC_003552	TTGAT	2	10	1450943	1450952	20 %	60 %	20 %	0 %	20090082
1077	NC_003552	AGGGG	2	10	1452866	1452875	20 %	0 %	80 %	0 %	20090083
1078	NC_003552	GATTG	2	10	1455745	1455754	20 %	40 %	40 %	0 %	20090086
1079	NC_003552	GCCGG	2	10	1455977	1455986	0 %	0 %	60 %	40 %	20090086
1080	NC_003552	TTTCA	2	10	1457020	1457029	20 %	60 %	0 %	20 %	20090088
1081	NC_003552	CGATA	2	10	1461171	1461180	40 %	20 %	20 %	20 %	20090092
1082	NC_003552	GCTTT	2	10	1461880	1461889	0 %	60 %	20 %	20 %	20090093
1083	NC_003552	TTATC	2	10	1462186	1462195	20 %	60 %	0 %	20 %	20090093
1084	NC_003552	AATTT	2	10	1463444	1463453	40 %	60 %	0 %	0 %	20090094
1085	NC_003552	GTCTG	2	10	1466108	1466117	0 %	40 %	40 %	20 %	20090096
1086	NC_003552	AAAAT	2	10	1468057	1468066	80 %	20 %	0 %	0 %	20090098
1087	NC_003552	CAATG	2	10	1470515	1470524	40 %	20 %	20 %	20 %	20090100
1088	NC_003552	GGGAA	2	10	1470842	1470851	40 %	0 %	60 %	0 %	20090100
1089	NC_003552	TCCTG	2	10	1471337	1471346	0 %	40 %	20 %	40 %	20090101
1090	NC_003552	CCTCT	2	10	1471509	1471518	0 %	40 %	0 %	60 %	20090101
1091	NC_003552	CGTTT	2	10	1472026	1472035	0 %	60 %	20 %	20 %	20090101
1092	NC_003552	GCTTC	2	10	1472039	1472048	0 %	40 %	20 %	40 %	20090101
1093	NC_003552	TTTGA	2	10	1477021	1477030	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_003552	AAAAT	2	10	1478018	1478027	80 %	20 %	0 %	0 %	20090107
1095	NC_003552	AAATC	2	10	1478397	1478406	60 %	20 %	0 %	20 %	20090107
1096	NC_003552	GAAAG	2	10	1478496	1478505	60 %	0 %	40 %	0 %	20090107
1097	NC_003552	AAAGT	2	10	1479500	1479509	60 %	20 %	20 %	0 %	20090107
1098	NC_003552	CGGAA	2	10	1480790	1480799	40 %	0 %	40 %	20 %	20090107
1099	NC_003552	TTTGC	2	10	1480993	1481002	0 %	60 %	20 %	20 %	20090107
1100	NC_003552	GAATA	2	10	1481555	1481564	60 %	20 %	20 %	0 %	20090107
1101	NC_003552	TTTTC	2	10	1482516	1482525	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_003552	TCCTT	2	10	1482807	1482816	0 %	60 %	0 %	40 %	20090108
1103	NC_003552	TCGTC	2	10	1483291	1483300	0 %	40 %	20 %	40 %	20090108
1104	NC_003552	GAGAA	2	10	1485729	1485738	60 %	0 %	40 %	0 %	20090111
1105	NC_003552	TACTG	2	10	1487839	1487848	20 %	40 %	20 %	20 %	20090113
1106	NC_003552	TTTCA	2	10	1490720	1490729	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1107	NC_003552	AACGA	2	10	1491961	1491970	60 %	0 %	20 %	20 %	20090115
1108	NC_003552	ATAAG	2	10	1495196	1495205	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003552	TGCTT	2	10	1497074	1497083	0 %	60 %	20 %	20 %	20090120
1110	NC_003552	GATCT	2	10	1497695	1497704	20 %	40 %	20 %	20 %	20090121
1111	NC_003552	GGGTC	2	10	1498476	1498485	0 %	20 %	60 %	20 %	20090121
1112	NC_003552	TGCTT	2	10	1498538	1498547	0 %	60 %	20 %	20 %	20090121
1113	NC_003552	AATAC	2	10	1500655	1500664	60 %	20 %	0 %	20 %	20090123
1114	NC_003552	CCAGG	2	10	1502694	1502703	20 %	0 %	40 %	40 %	20090126
1115	NC_003552	ACGGA	2	10	1503126	1503135	40 %	0 %	40 %	20 %	20090127
1116	NC_003552	GTCTC	2	10	1503618	1503627	0 %	40 %	20 %	40 %	20090127
1117	NC_003552	TCGGG	2	10	1504756	1504765	0 %	20 %	60 %	20 %	20090127
1118	NC_003552	CACCT	2	10	1505752	1505761	20 %	20 %	0 %	60 %	20090128
1119	NC_003552	CTGCG	2	10	1506765	1506774	0 %	20 %	40 %	40 %	20090128
1120	NC_003552	TGCCC	2	10	1507399	1507408	0 %	20 %	20 %	60 %	20090128
1121	NC_003552	AAATT	2	10	1510075	1510084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003552	TCAAT	2	10	1510448	1510457	40 %	40 %	0 %	20 %	20090131
1123	NC_003552	GGAAA	2	10	1511337	1511346	60 %	0 %	40 %	0 %	20090131
1124	NC_003552	AGGGG	2	10	1511686	1511695	20 %	0 %	80 %	0 %	20090131
1125	NC_003552	ATTGC	2	10	1513633	1513642	20 %	40 %	20 %	20 %	20090134
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