MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020833	ATT	2	6	134	139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332508
2	NC_020833	CAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332508
3	NC_020833	AAG	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332508
4	NC_020833	TGC	2	6	578	583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332508
5	NC_020833	TCT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332508
6	NC_020833	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332509
7	NC_020833	TTG	2	6	905	910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332509
8	NC_020833	AGT	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332509
9	NC_020833	GTT	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332509
10	NC_020833	ATC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332509
11	NC_020833	AAT	2	6	1265	1270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332509
12	NC_020833	TAA	2	6	1289	1294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332509
13	NC_020833	CAG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332509
14	NC_020833	CCA	2	6	1444	1449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332509
15	NC_020833	CCA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332509
16	NC_020833	ATA	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332509
17	NC_020833	CCA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332509
18	NC_020833	CAA	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332509
19	NC_020833	ATT	3	9	1721	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332509
20	NC_020833	CAA	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332509
21	NC_020833	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332509
22	NC_020833	GTT	2	6	2167	2172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332509
23	NC_020833	CCT	2	6	2600	2605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332510
24	NC_020833	TGA	2	6	2616	2621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332510
25	NC_020833	CGC	2	6	2649	2654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332510
26	NC_020833	GCA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332510
27	NC_020833	TGG	2	6	2676	2681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332510
28	NC_020833	AGA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332510
29	NC_020833	ATT	2	6	2845	2850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332510
30	NC_020833	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332510
31	NC_020833	CAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332510
32	NC_020833	GTA	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332510
33	NC_020833	TGA	2	6	3033	3038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332510
34	NC_020833	ACA	2	6	3104	3109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332510
35	NC_020833	GTT	2	6	3248	3253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332511
36	NC_020833	CAA	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332511
37	NC_020833	ATT	2	6	3555	3560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332511
38	NC_020833	GCG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332511
39	NC_020833	CAA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332511
40	NC_020833	GGC	3	9	3655	3663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332511
41	NC_020833	ATT	2	6	3664	3669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332511
42	NC_020833	GCA	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332511
43	NC_020833	GTG	2	6	3964	3969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332511
44	NC_020833	TGG	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332511
45	NC_020833	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332512
46	NC_020833	CTA	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332512
47	NC_020833	ATT	2	6	4543	4548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332512
48	NC_020833	CAA	2	6	4560	4565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332512
49	NC_020833	ATT	2	6	4629	4634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332512
50	NC_020833	ATG	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332512
51	NC_020833	CAA	2	6	4840	4845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332512
52	NC_020833	AAG	2	6	4856	4861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332512
53	NC_020833	AAG	2	6	5012	5017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332512
54	NC_020833	AAT	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332513
55	NC_020833	ATC	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332514
56	NC_020833	AGC	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332514
57	NC_020833	ATT	2	6	5481	5486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332514
58	NC_020833	CAA	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332514
59	NC_020833	TCG	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332514
60	NC_020833	AAT	2	6	5811	5816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332514
61	NC_020833	TGT	2	6	5821	5826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332514
62	NC_020833	TTA	2	6	5848	5853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332514
63	NC_020833	GAT	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332515
64	NC_020833	CTT	2	6	6210	6215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332515
65	NC_020833	CGG	2	6	6216	6221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332515
66	NC_020833	ATC	2	6	6334	6339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332515
67	NC_020833	CGC	2	6	6429	6434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332515
68	NC_020833	GCA	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332515
69	NC_020833	CTG	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332515
70	NC_020833	ATC	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332515
71	NC_020833	CAG	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332516
72	NC_020833	TAA	2	6	7316	7321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332516
73	NC_020833	GGC	2	6	7514	7519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332517
74	NC_020833	CTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332517
75	NC_020833	CTG	2	6	7596	7601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332517
76	NC_020833	AAC	2	6	7665	7670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332517
77	NC_020833	TGG	2	6	7695	7700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332517
78	NC_020833	GGT	2	6	7704	7709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332517
79	NC_020833	CTG	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332517
80	NC_020833	GAT	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332517
81	NC_020833	CAA	2	6	8129	8134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332517
82	NC_020833	GAA	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332517
83	NC_020833	GGT	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332518
84	NC_020833	TAC	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332518
85	NC_020833	TGA	2	6	8343	8348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332518
86	NC_020833	ACC	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332518
87	NC_020833	TTA	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332518
88	NC_020833	GTG	2	6	8554	8559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332518
89	NC_020833	TAC	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332519
90	NC_020833	GCA	2	6	9225	9230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332520
91	NC_020833	ACT	2	6	9302	9307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332520
92	NC_020833	CCG	2	6	9466	9471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332521
93	NC_020833	CCG	2	6	9758	9763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332522
94	NC_020833	AGC	2	6	9822	9827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332522
95	NC_020833	AGC	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332522
96	NC_020833	CCG	2	6	9891	9896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332522
97	NC_020833	TGA	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332522
98	NC_020833	GCA	2	6	10156	10161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332522
99	NC_020833	TGC	2	6	10164	10169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332522
100	NC_020833	TTA	2	6	10285	10290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332522
101	NC_020833	AGA	2	6	10332	10337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332522
102	NC_020833	CAA	2	6	10483	10488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332522
103	NC_020833	AGA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332522
104	NC_020833	CAA	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332522
105	NC_020833	TTA	2	6	10632	10637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332522
106	NC_020833	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332523
107	NC_020833	TGA	2	6	11187	11192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332524
108	NC_020833	CTG	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332524
109	NC_020833	CAA	2	6	11309	11314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332524
110	NC_020833	TGG	2	6	11526	11531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332524
111	NC_020833	TGA	2	6	11602	11607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332524
112	NC_020833	TGG	2	6	11608	11613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332524
113	NC_020833	TGT	2	6	11623	11628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332524
114	NC_020833	AAT	3	9	11630	11638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
115	NC_020833	ATT	2	6	11677	11682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332524
116	NC_020833	ATG	2	6	11715	11720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332524
117	NC_020833	CAA	2	6	11785	11790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332524
118	NC_020833	ATT	2	6	11907	11912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332524
119	NC_020833	GAT	2	6	11975	11980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332524
120	NC_020833	TGT	2	6	12010	12015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332524
121	NC_020833	GAC	2	6	12274	12279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332524
122	NC_020833	AAT	2	6	12341	12346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
123	NC_020833	GCA	2	6	12450	12455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332524
124	NC_020833	AAT	2	6	12473	12478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
125	NC_020833	ATA	2	6	12540	12545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
126	NC_020833	TAA	2	6	12556	12561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
127	NC_020833	TAA	2	6	12634	12639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
128	NC_020833	AAT	2	6	12686	12691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
129	NC_020833	TAA	2	6	12718	12723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
130	NC_020833	GAT	2	6	12776	12781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332524
131	NC_020833	TAA	2	6	13023	13028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332524
132	NC_020833	ACA	2	6	13103	13108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332524
133	NC_020833	TTG	2	6	13149	13154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332524
134	NC_020833	AAC	2	6	13168	13173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332524
135	NC_020833	ATG	2	6	13613	13618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332525
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137	NC_020833	TAA	2	6	13994	13999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332526
138	NC_020833	TAA	2	6	14060	14065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332526
139	NC_020833	AAT	2	6	14216	14221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332526
140	NC_020833	AAT	2	6	14707	14712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332526
141	NC_020833	GGT	2	6	15013	15018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332526
142	NC_020833	CAT	2	6	15052	15057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332526
143	NC_020833	TAA	2	6	15209	15214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332526
144	NC_020833	TGT	2	6	15228	15233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332526
145	NC_020833	CAT	2	6	15256	15261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332526
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149	NC_020833	ATC	2	6	15555	15560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332527
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152	NC_020833	TTG	2	6	15850	15855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332527
153	NC_020833	AAG	2	6	15856	15861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332527
154	NC_020833	AAT	2	6	15918	15923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332527
155	NC_020833	GAA	2	6	15945	15950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332527
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158	NC_020833	TAT	2	6	16036	16041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332528
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162	NC_020833	TAA	2	6	16379	16384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332529
163	NC_020833	AAT	2	6	16391	16396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332529
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168	NC_020833	ATT	2	6	17006	17011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332530
169	NC_020833	TGA	2	6	17224	17229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332530
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248	NC_020833	AAT	2	6	23037	23042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332537
249	NC_020833	ACG	2	6	23094	23099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332537
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251	NC_020833	CTT	3	9	23129	23137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332537
252	NC_020833	CAA	2	6	23288	23293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332537
253	NC_020833	AGC	2	6	23598	23603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332538
254	NC_020833	TAA	2	6	23610	23615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332538
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256	NC_020833	CAT	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332539
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258	NC_020833	ATA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332539
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280	NC_020833	CTG	2	6	26104	26109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332541
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