MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020833	TGC	2	6	282339	282344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332781
3002	NC_020833	TGA	2	6	282432	282437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332781
3003	NC_020833	TGG	2	6	282530	282535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
3004	NC_020833	TAC	2	6	282539	282544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332781
3005	NC_020833	TGG	2	6	282563	282568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
3006	NC_020833	TTA	2	6	282680	282685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332781
3007	NC_020833	TAG	3	9	282810	282818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332781
3008	NC_020833	CTG	2	6	282830	282835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332781
3009	NC_020833	TAA	2	6	282910	282915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332781
3010	NC_020833	TTA	2	6	282920	282925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332781
3011	NC_020833	GGT	2	6	282940	282945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
3012	NC_020833	ATT	2	6	283127	283132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332781
3013	NC_020833	GTG	2	6	283202	283207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
3014	NC_020833	GAT	2	6	283216	283221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332781
3015	NC_020833	GGC	2	6	283496	283501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332781
3016	NC_020833	GCG	2	6	283598	283603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332781
3017	NC_020833	AGA	2	6	283654	283659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332781
3018	NC_020833	TAT	2	6	283682	283687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332781
3019	NC_020833	GGT	2	6	283736	283741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
3020	NC_020833	TGA	2	6	283858	283863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332782
3021	NC_020833	AAT	2	6	283882	283887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332782
3022	NC_020833	CTA	2	6	283913	283918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332782
3023	NC_020833	ATC	2	6	284028	284033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332782
3024	NC_020833	CGA	2	6	284179	284184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332782
3025	NC_020833	CAC	2	6	284275	284280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332782
3026	NC_020833	TGG	2	6	284292	284297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332782
3027	NC_020833	TTC	2	6	284407	284412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332782
3028	NC_020833	GAA	2	6	284427	284432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332782
3029	NC_020833	TCT	2	6	284593	284598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332783
3030	NC_020833	TCG	2	6	284608	284613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3031	NC_020833	TCT	3	9	284620	284628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332783
3032	NC_020833	CTT	2	6	284678	284683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332783
3033	NC_020833	TCC	2	6	284701	284706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332783
3034	NC_020833	ATA	2	6	284737	284742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332783
3035	NC_020833	AGT	2	6	284789	284794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332783
3036	NC_020833	AGC	2	6	284841	284846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3037	NC_020833	TTC	3	9	284847	284855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332783
3038	NC_020833	TTA	2	6	284872	284877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332783
3039	NC_020833	TCA	2	6	284968	284973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332783
3040	NC_020833	ATA	2	6	284980	284985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332783
3041	NC_020833	CTG	2	6	285056	285061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3042	NC_020833	CGT	2	6	285144	285149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3043	NC_020833	GCA	2	6	285178	285183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332783
3044	NC_020833	ACC	2	6	285360	285365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332783
3045	NC_020833	CCA	2	6	285371	285376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332783
3046	NC_020833	AAT	2	6	285408	285413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332783
3047	NC_020833	CAC	2	6	285593	285598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332783
3048	NC_020833	CCA	2	6	285604	285609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332783
3049	NC_020833	CAC	2	6	285611	285616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332783
3050	NC_020833	CGG	2	6	285649	285654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332783
3051	NC_020833	TCT	2	6	286185	286190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3052	NC_020833	GTT	2	6	286274	286279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332784
3053	NC_020833	CTT	2	6	286371	286376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3054	NC_020833	GGT	2	6	286588	286593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332784
3055	NC_020833	CGG	2	6	286650	286655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332784
3056	NC_020833	TTC	2	6	286660	286665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332784
3057	NC_020833	TAA	2	6	286726	286731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332784
3058	NC_020833	CAT	2	6	286792	286797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332784
3059	NC_020833	GAA	2	6	286801	286806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332784
3060	NC_020833	GGC	2	6	286887	286892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332784
3061	NC_020833	TGC	2	6	286945	286950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332784
3062	NC_020833	CGC	2	6	287247	287252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332784
3063	NC_020833	CAC	2	6	287263	287268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332784
3064	NC_020833	ATT	2	6	287452	287457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332784
3065	NC_020833	AAT	2	6	287494	287499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332784
3066	NC_020833	GAG	2	6	287546	287551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332784
3067	NC_020833	TTG	2	6	287893	287898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332784
3068	NC_020833	AGC	2	6	288060	288065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332785
3069	NC_020833	ATC	2	6	288077	288082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332785
3070	NC_020833	GAA	2	6	288277	288282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332785
3071	NC_020833	AAG	2	6	288667	288672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332786
3072	NC_020833	CGG	2	6	288755	288760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332786
3073	NC_020833	GGT	2	6	288798	288803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332786
3074	NC_020833	TTC	2	6	288887	288892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332786
3075	NC_020833	GAT	2	6	288915	288920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332786
3076	NC_020833	TGT	2	6	289170	289175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332787
3077	NC_020833	ATG	2	6	289229	289234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332787
3078	NC_020833	AAT	2	6	289325	289330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332787
3079	NC_020833	TAA	2	6	289601	289606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332788
3080	NC_020833	GGT	2	6	289608	289613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332788
3081	NC_020833	GTT	2	6	289702	289707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332788
3082	NC_020833	GTA	2	6	289709	289714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332788
3083	NC_020833	AAT	2	6	289869	289874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332788
3084	NC_020833	CTT	2	6	289897	289902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332788
3085	NC_020833	CTG	2	6	289915	289920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332788
3086	NC_020833	CTT	2	6	290182	290187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332788
3087	NC_020833	TGT	2	6	290243	290248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332788
3088	NC_020833	ATT	2	6	290541	290546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332789
3089	NC_020833	CAA	2	6	290594	290599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332789
3090	NC_020833	CTT	3	9	290699	290707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332789
3091	NC_020833	CTA	2	6	290708	290713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332789
3092	NC_020833	TCG	2	6	290785	290790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332789
3093	NC_020833	TAA	2	6	290895	290900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332789
3094	NC_020833	CCA	2	6	290923	290928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332789
3095	NC_020833	TGC	2	6	291074	291079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332790
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3098	NC_020833	CAG	2	6	291304	291309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3099	NC_020833	ACA	2	6	291318	291323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332790
3100	NC_020833	GAT	2	6	291451	291456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332790
3101	NC_020833	CAC	2	6	291467	291472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332790
3102	NC_020833	TAC	2	6	291496	291501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3103	NC_020833	AGC	2	6	291509	291514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3104	NC_020833	ACG	2	6	291527	291532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3105	NC_020833	ATC	2	6	291605	291610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
3106	NC_020833	GCT	2	6	291723	291728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332790
3107	NC_020833	ATC	2	6	291741	291746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332790
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3110	NC_020833	AAG	2	6	292170	292175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332791
3111	NC_020833	TAG	2	6	292326	292331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332791
3112	NC_020833	ATC	2	6	292620	292625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332791
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3117	NC_020833	CAG	2	6	293132	293137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332791
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3119	NC_020833	TAT	2	6	293243	293248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332791
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3238	NC_020833	GAT	2	6	311271	311276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332811
3239	NC_020833	TCG	2	6	311291	311296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332811
3240	NC_020833	GGC	2	6	311408	311413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332811
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3244	NC_020833	ATG	2	6	311546	311551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332811
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3474	NC_020833	TAT	2	6	333441	333446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332838
3475	NC_020833	GAT	2	6	333516	333521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
3476	NC_020833	TGG	2	6	333594	333599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332838
3477	NC_020833	GCA	2	6	333613	333618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332838
3478	NC_020833	GTG	2	6	333734	333739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332838
3479	NC_020833	GGT	2	6	333783	333788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332838
3480	NC_020833	GAT	2	6	333891	333896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
3481	NC_020833	TGA	2	6	333954	333959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332838
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3484	NC_020833	ATT	2	6	334337	334342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332839
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3489	NC_020833	GCA	2	6	335078	335083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332841
3490	NC_020833	TAT	2	6	335085	335090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332841
3491	NC_020833	AAT	2	6	335093	335098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332841
3492	NC_020833	TCA	2	6	335111	335116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
3493	NC_020833	TCA	2	6	335118	335123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
3494	NC_020833	AGT	2	6	335151	335156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332841
3495	NC_020833	GTG	2	6	335208	335213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332841
3496	NC_020833	TAC	2	6	335274	335279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332841
3497	NC_020833	TGG	3	9	335357	335365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332841
3498	NC_020833	AAG	2	6	335495	335500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332841
3499	NC_020833	ATA	2	6	335711	335716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332841
3500	NC_020833	GCT	2	6	335720	335725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332841

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