MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020833	TGT	2	6	480541	480546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332998
5003	NC_020833	GTA	2	6	480575	480580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332998
5004	NC_020833	ATT	2	6	480638	480643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332998
5005	NC_020833	GTG	3	9	480680	480688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332998
5006	NC_020833	GAC	2	6	480689	480694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332998
5007	NC_020833	CAA	2	6	480739	480744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332998
5008	NC_020833	TGA	2	6	480880	480885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332998
5009	NC_020833	GAA	2	6	481148	481153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332998
5010	NC_020833	AGC	2	6	481205	481210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332998
5011	NC_020833	ACG	2	6	481239	481244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332998
5012	NC_020833	GCT	3	9	481250	481258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332998
5013	NC_020833	ATT	2	6	481297	481302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332998
5014	NC_020833	ATT	2	6	481877	481882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332999
5015	NC_020833	CTG	2	6	481907	481912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332999
5016	NC_020833	ATA	2	6	481951	481956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332999
5017	NC_020833	GCA	2	6	482004	482009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332999
5018	NC_020833	TCA	2	6	482034	482039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332999
5019	NC_020833	ATA	2	6	482043	482048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332999
5020	NC_020833	CAC	2	6	482110	482115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332999
5021	NC_020833	GTT	2	6	482143	482148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332999
5022	NC_020833	TGC	2	6	482158	482163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332999
5023	NC_020833	TCT	2	6	482325	482330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332999
5024	NC_020833	GTT	2	6	482377	482382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332999
5025	NC_020833	TAT	2	6	482503	482508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332999
5026	NC_020833	GTA	2	6	482518	482523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332999
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5028	NC_020833	TAA	2	6	482708	482713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332999
5029	NC_020833	CTC	2	6	482744	482749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472332999
5030	NC_020833	GAA	2	6	482751	482756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332999
5031	NC_020833	TTC	2	6	482783	482788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332999
5032	NC_020833	TCA	2	6	482938	482943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332999
5033	NC_020833	TCA	2	6	483156	483161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332999
5034	NC_020833	ATC	2	6	483255	483260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332999
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5036	NC_020833	ATT	2	6	483392	483397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332999
5037	NC_020833	ATA	2	6	483417	483422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332999
5038	NC_020833	TTG	2	6	483606	483611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333000
5039	NC_020833	TAA	2	6	483693	483698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333000
5040	NC_020833	TAT	2	6	483701	483706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333000
5041	NC_020833	ATC	2	6	483849	483854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333000
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5044	NC_020833	TTC	2	6	484129	484134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333000
5045	NC_020833	TTC	2	6	484146	484151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333000
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5048	NC_020833	TGC	2	6	484263	484268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333000
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5050	NC_020833	TGC	2	6	484479	484484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333000
5051	NC_020833	GTT	2	6	484629	484634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333001
5052	NC_020833	GTT	2	6	484701	484706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333001
5053	NC_020833	TCT	2	6	484895	484900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333001
5054	NC_020833	CAT	2	6	484924	484929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333001
5055	NC_020833	CTT	2	6	484938	484943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333001
5056	NC_020833	TAA	2	6	484945	484950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333001
5057	NC_020833	TGA	2	6	484974	484979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333001
5058	NC_020833	CAT	2	6	485034	485039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333001
5059	NC_020833	CAT	2	6	485223	485228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333001
5060	NC_020833	TGC	2	6	485230	485235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333001
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5062	NC_020833	TAA	2	6	485298	485303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333001
5063	NC_020833	CAA	2	6	485433	485438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472333001
5064	NC_020833	GCT	2	6	485444	485449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333001
5065	NC_020833	TCT	2	6	485531	485536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333001
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5071	NC_020833	AAT	2	6	486368	486373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333002
5072	NC_020833	TTA	2	6	486382	486387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333002
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5086	NC_020833	TTC	2	6	488340	488345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333004
5087	NC_020833	AAT	2	6	488424	488429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333004
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5089	NC_020833	ATA	2	6	488501	488506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333004
5090	NC_020833	CTG	2	6	488534	488539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472333004
5091	NC_020833	CCG	2	6	488617	488622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472333004
5092	NC_020833	AAT	2	6	488993	488998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472333005
5093	NC_020833	GCA	2	6	489120	489125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333005
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5102	NC_020833	TCA	2	6	489639	489644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333005
5103	NC_020833	CCA	2	6	489726	489731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472333005
5104	NC_020833	TAC	2	6	489764	489769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333005
5105	NC_020833	AAG	2	6	489796	489801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472333005
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5119	NC_020833	TTG	2	6	490781	490786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472333006
5120	NC_020833	CTT	2	6	490792	490797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472333006
5121	NC_020833	TGG	2	6	490827	490832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472333006
5122	NC_020833	ATT	2	6	490844	490849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472333006
5123	NC_020833	CTA	2	6	491002	491007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333006
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5477	NC_020833	ATG	2	6	523889	523894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333036
5478	NC_020833	TGA	2	6	523902	523907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333036
5479	NC_020833	TGA	2	6	524022	524027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472333036
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5481	NC_020833	TAC	2	6	524284	524289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472333036
5482	NC_020833	AGC	2	6	524340	524345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472333036
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