MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020833	AAC	2	6	90718	90723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332599
1002	NC_020833	ATT	2	6	90848	90853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332599
1003	NC_020833	TTG	2	6	90871	90876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332599
1004	NC_020833	GAA	2	6	90918	90923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332599
1005	NC_020833	CAA	2	6	90933	90938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332599
1006	NC_020833	TAA	2	6	91025	91030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332599
1007	NC_020833	TAT	2	6	97123	97128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332600
1008	NC_020833	ATT	2	6	97218	97223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332600
1009	NC_020833	GTT	2	6	97332	97337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332600
1010	NC_020833	TTC	2	6	97402	97407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332600
1011	NC_020833	CTT	2	6	97422	97427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332600
1012	NC_020833	GCT	2	6	97522	97527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332600
1013	NC_020833	ATA	2	6	97575	97580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332600
1014	NC_020833	GTG	2	6	97598	97603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332600
1015	NC_020833	GAG	2	6	97649	97654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332600
1016	NC_020833	ATT	2	6	97659	97664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332600
1017	NC_020833	AAT	2	6	97706	97711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332600
1018	NC_020833	CAG	2	6	97712	97717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332600
1019	NC_020833	TGT	2	6	97723	97728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332600
1020	NC_020833	CAG	2	6	97748	97753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332600
1021	NC_020833	ACC	2	6	97925	97930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332600
1022	NC_020833	TCA	2	6	97972	97977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332600
1023	NC_020833	TTC	2	6	98094	98099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332601
1024	NC_020833	TTG	3	9	98226	98234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332601
1025	NC_020833	AAT	2	6	98238	98243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332601
1026	NC_020833	TAC	2	6	98289	98294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332601
1027	NC_020833	CGG	2	6	98301	98306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332601
1028	NC_020833	TTG	2	6	98340	98345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332601
1029	NC_020833	ATA	2	6	98356	98361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332601
1030	NC_020833	GGC	2	6	98477	98482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332601
1031	NC_020833	GTT	3	9	98534	98542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332601
1032	NC_020833	TGC	2	6	98644	98649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332601
1033	NC_020833	TGG	2	6	98908	98913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332601
1034	NC_020833	TGT	2	6	98944	98949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332601
1035	NC_020833	GTC	2	6	99075	99080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332601
1036	NC_020833	GTG	2	6	99099	99104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332601
1037	NC_020833	AGT	2	6	99151	99156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332601
1038	NC_020833	ACC	2	6	99157	99162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332601
1039	NC_020833	TAA	2	6	99291	99296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332602
1040	NC_020833	TCA	2	6	99298	99303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332602
1041	NC_020833	CGG	2	6	99448	99453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332602
1042	NC_020833	TTC	2	6	99499	99504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332602
1043	NC_020833	ATC	2	6	99556	99561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332602
1044	NC_020833	TTG	2	6	99613	99618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332602
1045	NC_020833	TTG	2	6	99693	99698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332602
1046	NC_020833	TAA	2	6	99717	99722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332602
1047	NC_020833	TTC	2	6	99744	99749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332602
1048	NC_020833	TCA	2	6	99781	99786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332602
1049	NC_020833	CGG	2	6	99803	99808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332602
1050	NC_020833	ATA	2	6	99814	99819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332602
1051	NC_020833	CGC	2	6	99894	99899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332602
1052	NC_020833	ACT	2	6	99961	99966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332602
1053	NC_020833	CGC	2	6	100101	100106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332602
1054	NC_020833	TTA	2	6	100156	100161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332602
1055	NC_020833	TGG	2	6	100211	100216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332602
1056	NC_020833	AAT	2	6	100475	100480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332602
1057	NC_020833	CAA	2	6	100595	100600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332602
1058	NC_020833	GTC	2	6	100952	100957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332603
1059	NC_020833	TTG	2	6	100994	100999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332603
1060	NC_020833	CGG	2	6	101051	101056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332603
1061	NC_020833	TGA	2	6	101136	101141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332603
1062	NC_020833	CGG	2	6	101151	101156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332603
1063	NC_020833	GCA	2	6	101185	101190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332603
1064	NC_020833	CCG	2	6	101198	101203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332603
1065	NC_020833	GTA	2	6	101245	101250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332603
1066	NC_020833	ATT	2	6	101281	101286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332603
1067	NC_020833	ATG	2	6	101339	101344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332603
1068	NC_020833	TGT	2	6	101673	101678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332604
1069	NC_020833	ATG	2	6	101741	101746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332604
1070	NC_020833	TTA	2	6	101759	101764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332604
1071	NC_020833	AGC	2	6	101791	101796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332604
1072	NC_020833	TTG	2	6	101816	101821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332604
1073	NC_020833	TGC	2	6	101905	101910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332604
1074	NC_020833	ATT	3	9	101975	101983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332604
1075	NC_020833	TTA	2	6	101988	101993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332604
1076	NC_020833	GAT	2	6	102001	102006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332604
1077	NC_020833	GGC	2	6	102095	102100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332604
1078	NC_020833	ATC	2	6	102131	102136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332604
1079	NC_020833	TCA	2	6	102247	102252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332604
1080	NC_020833	TTA	2	6	102336	102341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332605
1081	NC_020833	ATT	2	6	102351	102356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332605
1082	NC_020833	GGT	2	6	102425	102430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332605
1083	NC_020833	CAC	2	6	102533	102538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332605
1084	NC_020833	ATG	2	6	102540	102545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332605
1085	NC_020833	ACA	2	6	102634	102639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332606
1086	NC_020833	GGT	2	6	102689	102694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332606
1087	NC_020833	GTG	2	6	102695	102700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332606
1088	NC_020833	TTG	2	6	102890	102895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332606
1089	NC_020833	ACC	2	6	103062	103067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332606
1090	NC_020833	TAA	2	6	103072	103077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332606
1091	NC_020833	ATA	2	6	103143	103148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332606
1092	NC_020833	TGG	2	6	103255	103260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332607
1093	NC_020833	CAC	2	6	103275	103280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332607
1094	NC_020833	TTG	2	6	103685	103690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332607
1095	NC_020833	CAT	2	6	103698	103703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332607
1096	NC_020833	CTG	2	6	104055	104060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332608
1097	NC_020833	CTG	2	6	104190	104195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332608
1098	NC_020833	GCT	2	6	104213	104218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332608
1099	NC_020833	GGC	2	6	104299	104304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332608
1100	NC_020833	CTG	2	6	104379	104384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332608
1101	NC_020833	TGG	2	6	104385	104390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332608
1102	NC_020833	GCT	2	6	104489	104494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332608
1103	NC_020833	CTT	2	6	104508	104513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332608
1104	NC_020833	ATA	2	6	104818	104823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332609
1105	NC_020833	GAA	3	9	104826	104834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332609
1106	NC_020833	TAT	2	6	104837	104842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332609
1107	NC_020833	TGG	2	6	104846	104851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332609
1108	NC_020833	CTT	2	6	104873	104878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332609
1109	NC_020833	TTC	2	6	104889	104894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332609
1110	NC_020833	TCA	2	6	105046	105051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332609
1111	NC_020833	TCT	2	6	105133	105138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332609
1112	NC_020833	TTC	2	6	105228	105233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332609
1113	NC_020833	GTT	2	6	105281	105286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332609
1114	NC_020833	TGC	2	6	105296	105301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332609
1115	NC_020833	GCC	2	6	105307	105312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332609
1116	NC_020833	AAT	2	6	105313	105318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332609
1117	NC_020833	TGA	2	6	105501	105506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
1118	NC_020833	ATG	2	6	105533	105538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
1119	NC_020833	CAA	2	6	105539	105544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332610
1120	NC_020833	ATG	3	9	105618	105626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
1121	NC_020833	GCA	2	6	105638	105643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332610
1122	NC_020833	TTG	2	6	105644	105649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332610
1123	NC_020833	TGG	2	6	105744	105749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332610
1124	NC_020833	TGG	2	6	105891	105896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332610
1125	NC_020833	GAA	2	6	105908	105913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332610
1126	NC_020833	CCG	2	6	105996	106001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332610
1127	NC_020833	CGC	2	6	106085	106090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332610
1128	NC_020833	GCT	2	6	106129	106134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332610
1129	NC_020833	GGT	2	6	106186	106191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332610
1130	NC_020833	TGC	2	6	106201	106206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332610
1131	NC_020833	TCG	2	6	106315	106320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332610
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1137	NC_020833	TGG	2	6	106762	106767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332610
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1141	NC_020833	ATG	2	6	107082	107087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
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1143	NC_020833	ATG	2	6	107138	107143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
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1146	NC_020833	GAT	2	6	107480	107485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
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1152	NC_020833	TGT	2	6	107940	107945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332610
1153	NC_020833	GTA	2	6	107993	107998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
1154	NC_020833	TGA	2	6	108037	108042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332610
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1241	NC_020833	TTC	2	6	115312	115317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332618
1242	NC_020833	CTT	2	6	115339	115344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332618
1243	NC_020833	ACC	2	6	115518	115523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332618
1244	NC_020833	TTC	2	6	115531	115536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332618
1245	NC_020833	TTG	2	6	115576	115581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332618
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1479	NC_020833	ACA	2	6	135982	135987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332640
1480	NC_020833	GTA	2	6	136023	136028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332640
1481	NC_020833	GTG	2	6	136038	136043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332640
1482	NC_020833	TAT	2	6	136070	136075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332640
1483	NC_020833	TCA	2	6	136153	136158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332640
1484	NC_020833	ATT	2	6	136251	136256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332640
1485	NC_020833	TGG	2	6	136271	136276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332640
1486	NC_020833	TAA	2	6	136505	136510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332640
1487	NC_020833	ATA	2	6	136735	136740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332640
1488	NC_020833	GTT	2	6	136763	136768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332640
1489	NC_020833	CCA	2	6	136786	136791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332640
1490	NC_020833	TAC	2	6	136802	136807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332640
1491	NC_020833	GGT	2	6	136869	136874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332640
1492	NC_020833	GGC	2	6	136893	136898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332640
1493	NC_020833	TGC	2	6	136918	136923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332640
1494	NC_020833	GGT	2	6	137015	137020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332640
1495	NC_020833	CTG	2	6	137069	137074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332640
1496	NC_020833	AAT	2	6	137139	137144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332640
1497	NC_020833	AGC	2	6	137169	137174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332640
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1499	NC_020833	TAT	2	6	137714	137719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332641
1500	NC_020833	GCA	2	6	137774	137779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332641

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