MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020833	ATT	2	6	137798	137803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332641
1502	NC_020833	TGT	2	6	137995	138000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332642
1503	NC_020833	CGG	2	6	138025	138030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332642
1504	NC_020833	TGT	2	6	138067	138072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332642
1505	NC_020833	AAG	2	6	138144	138149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332642
1506	NC_020833	AGA	2	6	138274	138279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332642
1507	NC_020833	ATT	2	6	138310	138315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332642
1508	NC_020833	GCT	2	6	138481	138486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332643
1509	NC_020833	GCT	3	9	138583	138591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332643
1510	NC_020833	CTG	2	6	138599	138604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332643
1511	NC_020833	CTG	2	6	138608	138613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332643
1512	NC_020833	CAT	2	6	138639	138644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332643
1513	NC_020833	GGC	2	6	138668	138673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332643
1514	NC_020833	TAT	2	6	138982	138987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1515	NC_020833	TGG	2	6	139071	139076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332644
1516	NC_020833	TTC	2	6	139140	139145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332644
1517	NC_020833	AGG	2	6	139264	139269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332644
1518	NC_020833	TGT	2	6	139279	139284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332644
1519	NC_020833	ACG	2	6	139359	139364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332644
1520	NC_020833	TTA	2	6	139431	139436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1521	NC_020833	ATT	2	6	139551	139556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1522	NC_020833	GGC	2	6	139598	139603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332644
1523	NC_020833	TAT	2	6	139808	139813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1524	NC_020833	CGT	2	6	139867	139872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332644
1525	NC_020833	ATT	2	6	140024	140029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1526	NC_020833	ATT	2	6	140192	140197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332644
1527	NC_020833	GCC	2	6	140198	140203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332644
1528	NC_020833	CGC	2	6	140380	140385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332644
1529	NC_020833	TGA	2	6	140481	140486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332644
1530	NC_020833	CGG	2	6	140494	140499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332644
1531	NC_020833	CGC	2	6	140587	140592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332645
1532	NC_020833	GCA	2	6	141168	141173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332646
1533	NC_020833	CTT	2	6	141189	141194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332646
1534	NC_020833	CAT	2	6	141210	141215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332646
1535	NC_020833	GTC	2	6	141286	141291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332646
1536	NC_020833	ACC	2	6	141296	141301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332646
1537	NC_020833	CAC	2	6	141364	141369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332646
1538	NC_020833	TAA	2	6	141477	141482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332646
1539	NC_020833	TGA	2	6	141516	141521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332646
1540	NC_020833	GTT	2	6	141534	141539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332646
1541	NC_020833	AGT	2	6	141713	141718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332646
1542	NC_020833	TAA	2	6	141736	141741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332646
1543	NC_020833	TTC	2	6	141778	141783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332646
1544	NC_020833	GTT	2	6	141918	141923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332646
1545	NC_020833	TTG	2	6	141961	141966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332646
1546	NC_020833	CAA	2	6	142095	142100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332646
1547	NC_020833	CCA	2	6	142117	142122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332646
1548	NC_020833	AGC	2	6	142202	142207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332646
1549	NC_020833	ATA	2	6	142216	142221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332646
1550	NC_020833	AAT	2	6	142513	142518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332646
1551	NC_020833	TCA	2	6	142683	142688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332646
1552	NC_020833	CTT	2	6	142692	142697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332646
1553	NC_020833	TTG	2	6	142723	142728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332646
1554	NC_020833	CGG	2	6	142794	142799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332646
1555	NC_020833	GAT	2	6	143002	143007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332646
1556	NC_020833	CAA	2	6	143019	143024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332646
1557	NC_020833	TAA	2	6	143185	143190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332647
1558	NC_020833	CTG	2	6	143340	143345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332648
1559	NC_020833	TTG	2	6	143361	143366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332648
1560	NC_020833	TAT	2	6	143480	143485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332648
1561	NC_020833	CTT	2	6	143555	143560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332649
1562	NC_020833	ATT	2	6	143761	143766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332649
1563	NC_020833	GTT	2	6	143801	143806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332649
1564	NC_020833	TAT	2	6	143814	143819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332649
1565	NC_020833	ATG	2	6	143827	143832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332649
1566	NC_020833	ATT	2	6	143882	143887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332650
1567	NC_020833	CAA	2	6	143903	143908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332650
1568	NC_020833	ATT	2	6	143923	143928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332650
1569	NC_020833	ATT	2	6	143938	143943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332650
1570	NC_020833	CGG	2	6	144100	144105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332650
1571	NC_020833	TGT	2	6	144177	144182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332650
1572	NC_020833	TAT	2	6	144235	144240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332650
1573	NC_020833	TCA	2	6	144242	144247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332650
1574	NC_020833	TGG	2	6	144261	144266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332650
1575	NC_020833	AAG	2	6	144276	144281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332650
1576	NC_020833	GGC	2	6	144341	144346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332650
1577	NC_020833	GCC	2	6	144353	144358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332650
1578	NC_020833	ACT	2	6	144424	144429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332650
1579	NC_020833	TGC	2	6	144436	144441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332650
1580	NC_020833	CGG	2	6	144563	144568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332651
1581	NC_020833	GCA	2	6	144629	144634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332651
1582	NC_020833	TGG	2	6	144766	144771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332651
1583	NC_020833	GGC	2	6	144888	144893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332651
1584	NC_020833	CAG	2	6	144963	144968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332651
1585	NC_020833	AAT	2	6	144973	144978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332651
1586	NC_020833	GCT	2	6	144992	144997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332651
1587	NC_020833	AGA	2	6	145125	145130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332651
1588	NC_020833	TAA	2	6	145172	145177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332651
1589	NC_020833	TTG	2	6	145188	145193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332651
1590	NC_020833	CAG	3	9	145200	145208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332651
1591	NC_020833	TCA	2	6	145660	145665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332652
1592	NC_020833	GTA	2	6	145710	145715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332652
1593	NC_020833	TCA	4	12	145873	145884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332652
1594	NC_020833	TGG	2	6	145928	145933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332652
1595	NC_020833	TTG	2	6	146013	146018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332652
1596	NC_020833	ATC	2	6	146025	146030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332652
1597	NC_020833	CAG	2	6	146162	146167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332652
1598	NC_020833	AGT	2	6	146170	146175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332652
1599	NC_020833	TCA	2	6	146201	146206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332652
1600	NC_020833	GGT	3	9	146807	146815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
1601	NC_020833	TGC	2	6	146824	146829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332653
1602	NC_020833	GCG	2	6	146834	146839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332653
1603	NC_020833	GCA	2	6	146909	146914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332653
1604	NC_020833	GGT	2	6	146918	146923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
1605	NC_020833	GCG	2	6	146927	146932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332653
1606	NC_020833	GGT	3	9	146981	146989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
1607	NC_020833	GTC	2	6	147081	147086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332653
1608	NC_020833	GGA	2	6	147119	147124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332653
1609	NC_020833	GCG	2	6	147149	147154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332653
1610	NC_020833	TGA	2	6	147226	147231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332653
1611	NC_020833	ATG	2	6	147293	147298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332653
1612	NC_020833	GGC	2	6	147350	147355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332653
1613	NC_020833	CGG	2	6	147382	147387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332653
1614	NC_020833	TGA	2	6	147495	147500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332653
1615	NC_020833	GTG	2	6	147513	147518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
1616	NC_020833	GGT	2	6	147521	147526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
1617	NC_020833	TAA	2	6	147535	147540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332653
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1619	NC_020833	GGT	2	6	147848	147853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332653
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1975	NC_020833	AAC	2	6	186541	186546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1976	NC_020833	ACA	2	6	186560	186565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1977	NC_020833	AAC	2	6	186613	186618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1978	NC_020833	CTG	2	6	186639	186644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332692
1979	NC_020833	ATA	2	6	186765	186770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332692
1980	NC_020833	TGA	2	6	186835	186840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332692
1981	NC_020833	ACA	2	6	186866	186871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1982	NC_020833	ACA	2	6	186951	186956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1983	NC_020833	TGA	2	6	186958	186963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332692
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1985	NC_020833	TTA	2	6	187086	187091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332692
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1989	NC_020833	TAA	2	6	187336	187341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332692
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1991	NC_020833	TGT	2	6	187528	187533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332692
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1995	NC_020833	TGA	2	6	187816	187821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332692
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1997	NC_020833	ACA	2	6	188030	188035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332692
1998	NC_020833	AAT	2	6	188117	188122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332692
1999	NC_020833	TGC	2	6	188383	188388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332692
2000	NC_020833	TTA	2	6	188405	188410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332692

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