MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 29115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020833	TGA	2	6	46894	46899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
502	NC_020833	GAC	2	6	46959	46964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
503	NC_020833	ACC	2	6	47271	47276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332559
504	NC_020833	GCA	2	6	47277	47282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
505	NC_020833	GCA	2	6	47466	47471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
506	NC_020833	CAG	3	9	47476	47484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
507	NC_020833	GGT	2	6	47511	47516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332559
508	NC_020833	AGT	2	6	47534	47539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
509	NC_020833	GCA	2	6	47547	47552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332559
510	NC_020833	CGG	2	6	47570	47575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332559
511	NC_020833	TGA	2	6	47584	47589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332559
512	NC_020833	GGT	3	9	47592	47600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332559
513	NC_020833	GAA	2	6	47637	47642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332559
514	NC_020833	AGA	2	6	47663	47668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332559
515	NC_020833	ATA	2	6	47681	47686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332559
516	NC_020833	TGC	2	6	47780	47785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332560
517	NC_020833	CAA	2	6	47823	47828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332560
518	NC_020833	GTG	2	6	47854	47859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
519	NC_020833	CAA	2	6	47913	47918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332560
520	NC_020833	TTA	2	6	48047	48052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332560
521	NC_020833	TGG	2	6	48055	48060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
522	NC_020833	TGA	2	6	48071	48076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332560
523	NC_020833	GAA	2	6	48189	48194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332560
524	NC_020833	TAC	2	6	48409	48414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332560
525	NC_020833	TGG	2	6	48595	48600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332560
526	NC_020833	CTG	2	6	48747	48752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332560
527	NC_020833	CCA	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332561
528	NC_020833	CAG	2	6	49067	49072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332561
529	NC_020833	ATT	2	6	49141	49146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332561
530	NC_020833	TAT	2	6	49265	49270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332561
531	NC_020833	GGC	2	6	49400	49405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332561
532	NC_020833	CCG	2	6	49437	49442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
533	NC_020833	GTG	2	6	49490	49495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
534	NC_020833	TGG	2	6	49500	49505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
535	NC_020833	GCG	2	6	49525	49530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332561
536	NC_020833	CCG	2	6	49674	49679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
537	NC_020833	TGA	2	6	49682	49687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332561
538	NC_020833	GTG	2	6	49704	49709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
539	NC_020833	ACA	2	6	49771	49776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332561
540	NC_020833	AAG	2	6	49861	49866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332561
541	NC_020833	CTT	2	6	49904	49909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332561
542	NC_020833	GCC	2	6	49985	49990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332561
543	NC_020833	TGT	2	6	49993	49998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332561
544	NC_020833	ACA	2	6	50068	50073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332561
545	NC_020833	TGA	3	9	50113	50121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332561
546	NC_020833	AGC	2	6	50132	50137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332561
547	NC_020833	GGT	2	6	50262	50267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332561
548	NC_020833	ATG	2	6	50428	50433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332562
549	NC_020833	TTC	2	6	50641	50646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332562
550	NC_020833	GGT	2	6	50730	50735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332562
551	NC_020833	ATA	2	6	50807	50812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332562
552	NC_020833	CAA	2	6	50914	50919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332562
553	NC_020833	CCG	2	6	50966	50971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332562
554	NC_020833	TCA	2	6	51002	51007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332562
555	NC_020833	CAA	2	6	51087	51092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332562
556	NC_020833	CAG	2	6	51123	51128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332562
557	NC_020833	GTT	2	6	51223	51228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
558	NC_020833	TGA	2	6	51299	51304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332562
559	NC_020833	TTG	2	6	51368	51373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
560	NC_020833	GTT	2	6	51390	51395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332562
561	NC_020833	CTG	2	6	51510	51515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332563
562	NC_020833	GAA	2	6	51568	51573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332563
563	NC_020833	ATC	2	6	51598	51603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332563
564	NC_020833	AAG	2	6	51756	51761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332563
565	NC_020833	TGT	2	6	51812	51817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332563
566	NC_020833	TGA	2	6	51834	51839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332563
567	NC_020833	GGC	2	6	52230	52235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332564
568	NC_020833	CAC	2	6	52328	52333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332564
569	NC_020833	TAA	2	6	52400	52405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332564
570	NC_020833	ACT	2	6	52462	52467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332564
571	NC_020833	GCC	2	6	52488	52493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332564
572	NC_020833	CCG	2	6	52496	52501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332564
573	NC_020833	ATA	2	6	52509	52514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332564
574	NC_020833	CCA	2	6	52547	52552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332564
575	NC_020833	TGA	2	6	52651	52656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332564
576	NC_020833	CAT	3	9	52700	52708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332564
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580	NC_020833	AAC	2	6	52924	52929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332564
581	NC_020833	GTA	2	6	53031	53036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332564
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583	NC_020833	TCA	2	6	53196	53201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332565
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586	NC_020833	AAT	2	6	53329	53334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332565
587	NC_020833	TAA	2	6	53382	53387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332565
588	NC_020833	AAC	2	6	53428	53433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332565
589	NC_020833	TTG	2	6	53482	53487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332565
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591	NC_020833	GAA	2	6	53743	53748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332565
592	NC_020833	AAG	2	6	53768	53773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332565
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595	NC_020833	GCA	3	9	53957	53965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332565
596	NC_020833	GAA	2	6	54252	54257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332565
597	NC_020833	TAG	2	6	54259	54264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332565
598	NC_020833	AGT	2	6	54439	54444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332565
599	NC_020833	ACC	2	6	54463	54468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332565
600	NC_020833	ACT	2	6	54860	54865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332566
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603	NC_020833	TCA	2	6	54953	54958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332566
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605	NC_020833	TAG	2	6	55174	55179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332566
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607	NC_020833	AAC	2	6	55279	55284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332566
608	NC_020833	TCA	2	6	55316	55321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332566
609	NC_020833	AAT	2	6	55367	55372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332566
610	NC_020833	TTG	2	6	55399	55404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332566
611	NC_020833	ATT	2	6	55477	55482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332567
612	NC_020833	CTT	2	6	55820	55825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332568
613	NC_020833	CGG	2	6	56139	56144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332568
614	NC_020833	GCA	2	6	56365	56370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332568
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616	NC_020833	AGT	2	6	56641	56646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332568
617	NC_020833	TGA	2	6	56671	56676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332568
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620	NC_020833	ATA	2	6	56877	56882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332568
621	NC_020833	AGA	2	6	57001	57006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332568
622	NC_020833	TTG	2	6	57139	57144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332568
623	NC_020833	CAG	2	6	57145	57150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332568
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625	NC_020833	GTT	2	6	57284	57289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332568
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