MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009525	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	148659758
2	NC_009525	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	148659759
3	NC_009525	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	148659759
4	NC_009525	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	148659761
5	NC_009525	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	148659763
6	NC_009525	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	148659763
7	NC_009525	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	148659763
8	NC_009525	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	148659764
9	NC_009525	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	148659764
10	NC_009525	TCGAC	2	10	14528	14537	20 %	20 %	20 %	40 %	148659768
11	NC_009525	TCAGC	2	10	14701	14710	20 %	20 %	20 %	40 %	148659769
12	NC_009525	GGCGT	2	10	15512	15521	0 %	20 %	60 %	20 %	148659771
13	NC_009525	GGGCC	2	10	15795	15804	0 %	0 %	60 %	40 %	148659771
14	NC_009525	GCGTT	2	10	16540	16549	0 %	40 %	40 %	20 %	148659772
15	NC_009525	CCAGC	2	10	17080	17089	20 %	0 %	20 %	60 %	148659773
16	NC_009525	ACCGA	2	10	17843	17852	40 %	0 %	20 %	40 %	148659773
17	NC_009525	ATCGG	2	10	18235	18244	20 %	20 %	40 %	20 %	148659773
18	NC_009525	CGGCC	2	10	19244	19253	0 %	0 %	40 %	60 %	148659774
19	NC_009525	TTAGC	2	10	20395	20404	20 %	40 %	20 %	20 %	148659775
20	NC_009525	GGTCC	2	10	20467	20476	0 %	20 %	40 %	40 %	148659775
21	NC_009525	GTCGT	2	10	22986	22995	0 %	40 %	40 %	20 %	148659776
22	NC_009525	ATCAC	2	10	25259	25268	40 %	20 %	0 %	40 %	148659779
23	NC_009525	GCCGG	2	10	25946	25955	0 %	0 %	60 %	40 %	148659779
24	NC_009525	GGCAA	2	10	30659	30668	40 %	0 %	40 %	20 %	148659785
25	NC_009525	CGATC	2	10	31485	31494	20 %	20 %	20 %	40 %	148659786
26	NC_009525	CGACG	2	10	33668	33677	20 %	0 %	40 %	40 %	148659789
27	NC_009525	GCGTC	2	10	33723	33732	0 %	20 %	40 %	40 %	148659789
28	NC_009525	GACAC	2	10	33820	33829	40 %	0 %	20 %	40 %	148659789
29	NC_009525	TCCTG	2	10	38825	38834	0 %	40 %	20 %	40 %	148659795
30	NC_009525	CTCGG	2	10	38918	38927	0 %	20 %	40 %	40 %	148659795
31	NC_009525	GGCGC	2	10	39461	39470	0 %	0 %	60 %	40 %	148659795
32	NC_009525	TGGCC	2	10	39609	39618	0 %	20 %	40 %	40 %	148659795
33	NC_009525	CGGCG	2	10	40141	40150	0 %	0 %	60 %	40 %	148659795
34	NC_009525	GTCCA	2	10	40753	40762	20 %	20 %	20 %	40 %	148659796
35	NC_009525	GCCAA	2	10	42887	42896	40 %	0 %	20 %	40 %	148659798
36	NC_009525	GCACA	2	10	43686	43695	40 %	0 %	20 %	40 %	148659799
37	NC_009525	GGTAC	2	10	46220	46229	20 %	20 %	40 %	20 %	148659801
38	NC_009525	TCGAA	2	10	46452	46461	40 %	20 %	20 %	20 %	148659801
39	NC_009525	GCACC	2	10	47382	47391	20 %	0 %	20 %	60 %	148659801
40	NC_009525	CGGTG	2	10	48416	48425	0 %	20 %	60 %	20 %	148659802
41	NC_009525	TCATG	2	10	48562	48571	20 %	40 %	20 %	20 %	148659802
42	NC_009525	GCAGC	2	10	49956	49965	20 %	0 %	40 %	40 %	148659804
43	NC_009525	CCCGA	2	10	50039	50048	20 %	0 %	20 %	60 %	148659804
44	NC_009525	CAGCG	2	10	51164	51173	20 %	0 %	40 %	40 %	148659805
45	NC_009525	CTCCC	2	10	57598	57607	0 %	20 %	0 %	80 %	148659811
46	NC_009525	CGGCG	2	10	58047	58056	0 %	0 %	60 %	40 %	148659811
47	NC_009525	CGACC	2	10	59579	59588	20 %	0 %	20 %	60 %	148659813
48	NC_009525	CTTCG	2	10	60266	60275	0 %	40 %	20 %	40 %	148659814
49	NC_009525	CGGTG	2	10	61322	61331	0 %	20 %	60 %	20 %	148659817
50	NC_009525	TCAGG	2	10	63808	63817	20 %	20 %	40 %	20 %	148659818
51	NC_009525	GGCGA	2	10	67771	67780	20 %	0 %	60 %	20 %	148659822
52	NC_009525	GGTGT	2	10	70347	70356	0 %	40 %	60 %	0 %	148659824
53	NC_009525	ATCGG	2	10	70984	70993	20 %	20 %	40 %	20 %	148659824
54	NC_009525	CCGCG	2	10	71521	71530	0 %	0 %	40 %	60 %	148659824
55	NC_009525	GGCAA	2	10	71872	71881	40 %	0 %	40 %	20 %	148659824
56	NC_009525	CGACC	2	10	72161	72170	20 %	0 %	20 %	60 %	148659824
57	NC_009525	CGGGT	2	10	72615	72624	0 %	20 %	60 %	20 %	148659824
58	NC_009525	GGTCG	2	10	72675	72684	0 %	20 %	60 %	20 %	148659824
59	NC_009525	TGCCT	2	10	73379	73388	0 %	40 %	20 %	40 %	148659825
60	NC_009525	GTCCA	2	10	74250	74259	20 %	20 %	20 %	40 %	148659826
61	NC_009525	TGACC	2	10	76874	76883	20 %	20 %	20 %	40 %	148659828
62	NC_009525	GCCAA	2	10	77188	77197	40 %	0 %	20 %	40 %	148659828
63	NC_009525	GTCGC	2	10	77265	77274	0 %	20 %	40 %	40 %	148659828
64	NC_009525	GCGCG	2	10	78353	78362	0 %	0 %	60 %	40 %	148659829
65	NC_009525	CACGA	2	10	81210	81219	40 %	0 %	20 %	40 %	148659831
66	NC_009525	GAGCA	2	10	83748	83757	40 %	0 %	40 %	20 %	148659833
67	NC_009525	GCCGG	2	10	83847	83856	0 %	0 %	60 %	40 %	148659833
68	NC_009525	GCGAC	2	10	83923	83932	20 %	0 %	40 %	40 %	148659833
69	NC_009525	ATCCG	2	10	84693	84702	20 %	20 %	20 %	40 %	148659834
70	NC_009525	CACCG	2	10	85473	85482	20 %	0 %	20 %	60 %	148659835
71	NC_009525	TGGTC	2	10	87608	87617	0 %	40 %	40 %	20 %	148659837
72	NC_009525	GCTGG	2	10	88245	88254	0 %	20 %	60 %	20 %	148659838
73	NC_009525	TGGGT	2	10	91283	91292	0 %	40 %	60 %	0 %	148659844
74	NC_009525	TCGCC	2	10	91490	91499	0 %	20 %	20 %	60 %	148659844
75	NC_009525	GGGCC	2	10	92463	92472	0 %	0 %	60 %	40 %	148659845
76	NC_009525	GGCCG	2	10	93782	93791	0 %	0 %	60 %	40 %	148659846
77	NC_009525	GCGCC	2	10	94434	94443	0 %	0 %	40 %	60 %	148659846
78	NC_009525	GCTTG	2	10	96466	96475	0 %	40 %	40 %	20 %	148659848
79	NC_009525	CGTGT	2	10	96898	96907	0 %	40 %	40 %	20 %	148659849
80	NC_009525	AGATC	2	10	96977	96986	40 %	20 %	20 %	20 %	148659849
81	NC_009525	CGGCG	2	10	100558	100567	0 %	0 %	60 %	40 %	148659852
82	NC_009525	GCGGT	2	10	101634	101643	0 %	20 %	60 %	20 %	148659853
83	NC_009525	GCGCC	2	10	104466	104475	0 %	0 %	40 %	60 %	148659855
84	NC_009525	GGTGG	2	10	105154	105163	0 %	20 %	80 %	0 %	148659856
85	NC_009525	GGCTT	2	10	106167	106176	0 %	40 %	40 %	20 %	148659857
86	NC_009525	CTGGC	2	10	106889	106898	0 %	20 %	40 %	40 %	148659858
87	NC_009525	GCACA	2	10	108010	108019	40 %	0 %	20 %	40 %	148659858
88	NC_009525	CTGAA	2	10	110340	110349	40 %	20 %	20 %	20 %	148659861
89	NC_009525	ATCGC	2	10	110835	110844	20 %	20 %	20 %	40 %	148659861
90	NC_009525	TCTGA	2	10	112169	112178	20 %	40 %	20 %	20 %	148659864
91	NC_009525	CGGTC	2	10	112444	112453	0 %	20 %	40 %	40 %	148659864
92	NC_009525	GACCA	2	10	113582	113591	40 %	0 %	20 %	40 %	148659864
93	NC_009525	GGCTG	2	10	116146	116155	0 %	20 %	60 %	20 %	148659864
94	NC_009525	CCGCG	2	10	120066	120075	0 %	0 %	40 %	60 %	148659865
95	NC_009525	TCGTG	2	10	124019	124028	0 %	40 %	40 %	20 %	148659867
96	NC_009525	CCGGA	2	10	125800	125809	20 %	0 %	40 %	40 %	148659869
97	NC_009525	TGCGC	2	10	128272	128281	0 %	20 %	40 %	40 %	148659870
98	NC_009525	GCGAG	2	10	128783	128792	20 %	0 %	60 %	20 %	148659870
99	NC_009525	GGGGT	2	10	129792	129801	0 %	20 %	80 %	0 %	148659870
100	NC_009525	CCCAC	2	10	130354	130363	20 %	0 %	0 %	80 %	148659870
101	NC_009525	CCGGC	2	10	130864	130873	0 %	0 %	40 %	60 %	148659870
102	NC_009525	TGCGG	2	10	131274	131283	0 %	20 %	60 %	20 %	148659870
103	NC_009525	ATCAC	2	10	132753	132762	40 %	20 %	0 %	40 %	148659872
104	NC_009525	ATCGG	2	10	132801	132810	20 %	20 %	40 %	20 %	148659872
105	NC_009525	CGGGC	2	10	133892	133901	0 %	0 %	60 %	40 %	148659872
106	NC_009525	GCGAT	2	10	135697	135706	20 %	20 %	40 %	20 %	148659874
107	NC_009525	GTTCG	2	10	135918	135927	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
108	NC_009525	CCTGG	2	10	136310	136319	0 %	20 %	40 %	40 %	148659874
109	NC_009525	GGCCC	2	10	136416	136425	0 %	0 %	40 %	60 %	148659874
110	NC_009525	CGTTG	2	10	136928	136937	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
111	NC_009525	CGACC	2	10	137000	137009	20 %	0 %	20 %	60 %	148659874
112	NC_009525	GAGAT	2	10	140020	140029	40 %	20 %	40 %	0 %	148659878
113	NC_009525	CGGCG	2	10	142174	142183	0 %	0 %	60 %	40 %	148659880
114	NC_009525	TGCGG	2	10	142807	142816	0 %	20 %	60 %	20 %	148659881
115	NC_009525	CGCTG	2	10	143514	143523	0 %	20 %	40 %	40 %	148659882
116	NC_009525	GTTGC	2	10	144060	144069	0 %	40 %	40 %	20 %	148659882
117	NC_009525	CCGAT	2	10	144808	144817	20 %	20 %	20 %	40 %	148659882
118	NC_009525	ATCGC	2	10	145499	145508	20 %	20 %	20 %	40 %	148659883
119	NC_009525	AACCG	2	10	146238	146247	40 %	0 %	20 %	40 %	148659883
120	NC_009525	CCGCC	2	10	146825	146834	0 %	0 %	20 %	80 %	148659883
121	NC_009525	CCGCC	2	10	147468	147477	0 %	0 %	20 %	80 %	148659884
122	NC_009525	ATCGG	2	10	150952	150961	20 %	20 %	40 %	20 %	148659888
123	NC_009525	TCGTC	2	10	155910	155919	0 %	40 %	20 %	40 %	148659891
124	NC_009525	CACGC	2	10	156374	156383	20 %	0 %	20 %	60 %	148659891
125	NC_009525	ATTCT	2	10	157218	157227	20 %	60 %	0 %	20 %	148659892
126	NC_009525	AGGCG	2	10	157746	157755	20 %	0 %	60 %	20 %	148659892
127	NC_009525	TGACC	2	10	160750	160759	20 %	20 %	20 %	40 %	148659895
128	NC_009525	CGGCG	2	10	160996	161005	0 %	0 %	60 %	40 %	148659895
129	NC_009525	GCACC	2	10	161166	161175	20 %	0 %	20 %	60 %	148659896
130	NC_009525	CCGCA	2	10	162344	162353	20 %	0 %	20 %	60 %	148659897
131	NC_009525	CGCGG	2	10	162423	162432	0 %	0 %	60 %	40 %	148659897
132	NC_009525	CGGTT	2	10	162750	162759	0 %	40 %	40 %	20 %	148659897
133	NC_009525	GCCGG	2	10	163211	163220	0 %	0 %	60 %	40 %	148659898
134	NC_009525	GCGCG	2	10	163333	163342	0 %	0 %	60 %	40 %	148659898
135	NC_009525	CTGGG	2	10	165547	165556	0 %	20 %	60 %	20 %	148659900
136	NC_009525	GCCGG	2	10	166140	166149	0 %	0 %	60 %	40 %	148659901
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249	NC_009525	CTCGA	2	10	340365	340374	20 %	20 %	20 %	40 %	148660045
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252	NC_009525	CCGGA	2	10	343201	343210	20 %	0 %	40 %	40 %	148660047
253	NC_009525	GCGCC	2	10	343998	344007	0 %	0 %	40 %	60 %	148660048
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256	NC_009525	CGGTT	2	10	350169	350178	0 %	40 %	40 %	20 %	148660050
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259	NC_009525	GGGCT	2	10	352146	352155	0 %	20 %	60 %	20 %	148660052
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261	NC_009525	TGACG	2	10	359195	359204	20 %	20 %	40 %	20 %	148660059
262	NC_009525	CGCGC	2	10	364858	364867	0 %	0 %	40 %	60 %	148660065
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