MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009525	GCGCG	2	10	4179268	4179277	0 %	0 %	60 %	40 %	148663591
3002	NC_009525	GCCGC	2	10	4179346	4179355	0 %	0 %	40 %	60 %	148663591
3003	NC_009525	CGGCG	2	10	4180338	4180347	0 %	0 %	60 %	40 %	148663592
3004	NC_009525	GGTGA	2	10	4182922	4182931	20 %	20 %	60 %	0 %	148663593
3005	NC_009525	GACCT	2	10	4182943	4182952	20 %	20 %	20 %	40 %	148663593
3006	NC_009525	GCGCG	2	10	4184008	4184017	0 %	0 %	60 %	40 %	148663594
3007	NC_009525	CGGCT	2	10	4189163	4189172	0 %	20 %	40 %	40 %	148663596
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3010	NC_009525	GCCGT	2	10	4193162	4193171	0 %	20 %	40 %	40 %	148663600
3011	NC_009525	GCGCA	2	10	4193619	4193628	20 %	0 %	40 %	40 %	148663600
3012	NC_009525	TGCGC	2	10	4193877	4193886	0 %	20 %	40 %	40 %	148663600
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3014	NC_009525	ACCGG	2	10	4196037	4196046	20 %	0 %	40 %	40 %	148663602
3015	NC_009525	CCAGG	2	10	4196060	4196069	20 %	0 %	40 %	40 %	148663602
3016	NC_009525	TGACC	2	10	4196288	4196297	20 %	20 %	20 %	40 %	148663603
3017	NC_009525	CCGTG	2	10	4197371	4197380	0 %	20 %	40 %	40 %	148663603
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3021	NC_009525	CCCGG	2	10	4200349	4200358	0 %	0 %	40 %	60 %	148663606
3022	NC_009525	GGCAG	2	10	4200363	4200372	20 %	0 %	60 %	20 %	148663606
3023	NC_009525	GCCCG	2	10	4202262	4202271	0 %	0 %	40 %	60 %	148663609
3024	NC_009525	GCGAC	2	10	4202931	4202940	20 %	0 %	40 %	40 %	148663609
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3039	NC_009525	CGGGC	2	10	4227360	4227369	0 %	0 %	60 %	40 %	148663642
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3056	NC_009525	CCCCG	2	10	4254548	4254557	0 %	0 %	20 %	80 %	148663662
3057	NC_009525	CCGTG	2	10	4255204	4255213	0 %	20 %	40 %	40 %	148663663
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3120	NC_009525	GCCGT	2	10	4364107	4364116	0 %	20 %	40 %	40 %	148663744
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3122	NC_009525	CGGCG	2	10	4367089	4367098	0 %	0 %	60 %	40 %	148663746
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3154	NC_009525	GTCGC	2	10	4414122	4414131	0 %	20 %	40 %	40 %	148663784
3155	NC_009525	TCCGG	2	10	4414242	4414251	0 %	20 %	40 %	40 %	148663784
3156	NC_009525	CGCGC	2	10	4415005	4415014	0 %	0 %	40 %	60 %	148663785
3157	NC_009525	CCGAG	2	10	4418920	4418929	20 %	0 %	40 %	40 %	148663790

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.