MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009525	GCCCC	2	10	674177	674186	0 %	0 %	20 %	80 %	148660347
502	NC_009525	CCGGC	2	10	674769	674778	0 %	0 %	40 %	60 %	148660347
503	NC_009525	TCGTC	2	10	679755	679764	0 %	40 %	20 %	40 %	148660351
504	NC_009525	GTTGA	2	10	679780	679789	20 %	40 %	40 %	0 %	148660351
505	NC_009525	GCTCG	2	10	680898	680907	0 %	20 %	40 %	40 %	148660353
506	NC_009525	GACCT	2	10	682768	682777	20 %	20 %	20 %	40 %	148660353
507	NC_009525	GCCGC	2	10	682825	682834	0 %	0 %	40 %	60 %	148660353
508	NC_009525	CGAGG	2	10	683381	683390	20 %	0 %	60 %	20 %	148660354
509	NC_009525	TGATC	2	10	684142	684151	20 %	40 %	20 %	20 %	148660354
510	NC_009525	GAACG	2	10	686080	686089	40 %	0 %	40 %	20 %	148660355
511	NC_009525	CGATG	2	10	686831	686840	20 %	20 %	40 %	20 %	148660356
512	NC_009525	CGGGA	2	10	687221	687230	20 %	0 %	60 %	20 %	148660356
513	NC_009525	GGGCT	2	10	688285	688294	0 %	20 %	60 %	20 %	148660358
514	NC_009525	TGGGC	2	10	688667	688676	0 %	20 %	60 %	20 %	148660358
515	NC_009525	CGGGC	2	10	689489	689498	0 %	0 %	60 %	40 %	148660359
516	NC_009525	GACGG	2	10	691788	691797	20 %	0 %	60 %	20 %	148660361
517	NC_009525	CACTA	2	10	692671	692680	40 %	20 %	0 %	40 %	148660362
518	NC_009525	CCTAC	2	10	693818	693827	20 %	20 %	0 %	60 %	148660363
519	NC_009525	GCACC	2	10	695562	695571	20 %	0 %	20 %	60 %	148660364
520	NC_009525	GCCAG	2	10	695797	695806	20 %	0 %	40 %	40 %	148660364
521	NC_009525	GGTGT	2	10	696020	696029	0 %	40 %	60 %	0 %	148660364
522	NC_009525	CGGCG	2	10	697041	697050	0 %	0 %	60 %	40 %	148660367
523	NC_009525	CGGCG	2	10	697721	697730	0 %	0 %	60 %	40 %	148660367
524	NC_009525	GCGCA	2	10	699859	699868	20 %	0 %	40 %	40 %	148660371
525	NC_009525	GCGCG	2	10	700106	700115	0 %	0 %	60 %	40 %	148660371
526	NC_009525	CCGCG	2	10	700794	700803	0 %	0 %	40 %	60 %	148660372
527	NC_009525	GCCCG	2	10	701063	701072	0 %	0 %	40 %	60 %	148660372
528	NC_009525	CGGTC	2	10	702042	702051	0 %	20 %	40 %	40 %	148660374
529	NC_009525	CCCGG	2	10	702823	702832	0 %	0 %	40 %	60 %	148660375
530	NC_009525	GGTCG	2	10	703012	703021	0 %	20 %	60 %	20 %	148660375
531	NC_009525	CGGTT	2	10	703112	703121	0 %	40 %	40 %	20 %	148660375
532	NC_009525	CGCTG	2	10	703135	703144	0 %	20 %	40 %	40 %	148660375
533	NC_009525	CGGCG	2	10	708350	708359	0 %	0 %	60 %	40 %	148660385
534	NC_009525	GCACG	2	10	708929	708938	20 %	0 %	40 %	40 %	148660385
535	NC_009525	CGCGG	2	10	709490	709499	0 %	0 %	60 %	40 %	148660385
536	NC_009525	CGGCG	2	10	709553	709562	0 %	0 %	60 %	40 %	148660385
537	NC_009525	CGCGC	2	10	709738	709747	0 %	0 %	40 %	60 %	148660385
538	NC_009525	GCCGA	2	10	710592	710601	20 %	0 %	40 %	40 %	148660385
539	NC_009525	GACCG	2	10	711503	711512	20 %	0 %	40 %	40 %	148660386
540	NC_009525	CGGGG	2	10	711568	711577	0 %	0 %	80 %	20 %	148660386
541	NC_009525	CGCAC	2	10	712156	712165	20 %	0 %	20 %	60 %	148660388
542	NC_009525	CCGAT	2	10	712838	712847	20 %	20 %	20 %	40 %	148660390
543	NC_009525	GCCAC	2	10	712852	712861	20 %	0 %	20 %	60 %	148660390
544	NC_009525	ACCGC	2	10	713417	713426	20 %	0 %	20 %	60 %	148660390
545	NC_009525	TCGGG	2	10	714330	714339	0 %	20 %	60 %	20 %	148660392
546	NC_009525	TGCGC	2	10	714640	714649	0 %	20 %	40 %	40 %	148660392
547	NC_009525	CCGAT	2	10	714741	714750	20 %	20 %	20 %	40 %	148660392
548	NC_009525	GTCGA	2	10	715992	716001	20 %	20 %	40 %	20 %	148660393
549	NC_009525	CCGAC	2	10	716714	716723	20 %	0 %	20 %	60 %	148660394
550	NC_009525	CGCGG	2	10	718668	718677	0 %	0 %	60 %	40 %	148660397
551	NC_009525	CGGTC	2	10	720865	720874	0 %	20 %	40 %	40 %	148660400
552	NC_009525	CCGGT	2	10	724170	724179	0 %	20 %	40 %	40 %	148660402
553	NC_009525	GGCCG	2	10	724190	724199	0 %	0 %	60 %	40 %	148660402
554	NC_009525	CGCTG	2	10	724886	724895	0 %	20 %	40 %	40 %	148660402
555	NC_009525	CAGGC	2	10	728949	728958	20 %	0 %	40 %	40 %	148660403
556	NC_009525	AGCCG	2	10	728979	728988	20 %	0 %	40 %	40 %	148660403
557	NC_009525	CGGCC	2	10	729438	729447	0 %	0 %	40 %	60 %	148660403
558	NC_009525	CGCGG	2	10	730745	730754	0 %	0 %	60 %	40 %	148660405
559	NC_009525	GGCCA	2	10	736379	736388	20 %	0 %	40 %	40 %	148660414
560	NC_009525	CGGCG	2	10	737389	737398	0 %	0 %	60 %	40 %	148660415
561	NC_009525	TCGGG	2	10	738390	738399	0 %	20 %	60 %	20 %	148660416
562	NC_009525	GCCCC	2	10	741264	741273	0 %	0 %	20 %	80 %	148660419
563	NC_009525	GGACC	2	10	742188	742197	20 %	0 %	40 %	40 %	148660420
564	NC_009525	GCCGG	2	10	743449	743458	0 %	0 %	60 %	40 %	148660421
565	NC_009525	GCTGG	2	10	745137	745146	0 %	20 %	60 %	20 %	148660422
566	NC_009525	CGAGA	2	10	746167	746176	40 %	0 %	40 %	20 %	148660422
567	NC_009525	GCCGC	2	10	746248	746257	0 %	0 %	40 %	60 %	148660422
568	NC_009525	CGACG	2	10	747971	747980	20 %	0 %	40 %	40 %	148660423
569	NC_009525	CGCAG	2	10	749620	749629	20 %	0 %	40 %	40 %	148660425
570	NC_009525	CGGCC	2	10	751607	751616	0 %	0 %	40 %	60 %	148660428
571	NC_009525	CGGTG	2	10	752397	752406	0 %	20 %	60 %	20 %	148660428
572	NC_009525	GCTGG	2	10	761814	761823	0 %	20 %	60 %	20 %	148660441
573	NC_009525	CCGGG	2	10	765850	765859	0 %	0 %	60 %	40 %	148660442
574	NC_009525	AAGGC	2	10	766228	766237	40 %	0 %	40 %	20 %	148660442
575	NC_009525	GCGAT	2	10	768666	768675	20 %	20 %	40 %	20 %	148660443
576	NC_009525	GTTTA	2	10	768863	768872	20 %	60 %	20 %	0 %	148660443
577	NC_009525	CAGCT	2	10	769372	769381	20 %	20 %	20 %	40 %	148660444
578	NC_009525	CGCTC	2	10	770022	770031	0 %	20 %	20 %	60 %	148660444
579	NC_009525	CGCCA	2	10	771710	771719	20 %	0 %	20 %	60 %	148660445
580	NC_009525	CGCAG	2	10	774143	774152	20 %	0 %	40 %	40 %	148660447
581	NC_009525	CTCGG	2	10	774324	774333	0 %	20 %	40 %	40 %	148660447
582	NC_009525	TGCGG	2	10	775307	775316	0 %	20 %	60 %	20 %	148660448
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584	NC_009525	CCGAT	2	10	775962	775971	20 %	20 %	20 %	40 %	148660449
585	NC_009525	CAACT	2	10	776067	776076	40 %	20 %	0 %	40 %	148660449
586	NC_009525	GATCG	2	10	776699	776708	20 %	20 %	40 %	20 %	148660450
587	NC_009525	ACCGC	2	10	777635	777644	20 %	0 %	20 %	60 %	148660451
588	NC_009525	CACCG	2	10	778593	778602	20 %	0 %	20 %	60 %	148660451
589	NC_009525	GGGCC	2	10	778612	778621	0 %	0 %	60 %	40 %	148660451
590	NC_009525	TGCCC	2	10	781599	781608	0 %	20 %	20 %	60 %	148660455
591	NC_009525	CGTCG	2	10	783471	783480	0 %	20 %	40 %	40 %	148660458
592	NC_009525	GCGCT	2	10	783537	783546	0 %	20 %	40 %	40 %	148660458
593	NC_009525	GGAGT	2	10	787672	787681	20 %	20 %	60 %	0 %	148660461
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595	NC_009525	ACGGT	2	10	789562	789571	20 %	20 %	40 %	20 %	148660463
596	NC_009525	AGGTG	2	10	791458	791467	20 %	20 %	60 %	0 %	148660465
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598	NC_009525	CAGCC	2	10	795759	795768	20 %	0 %	20 %	60 %	148660469
599	NC_009525	TGCGC	2	10	797885	797894	0 %	20 %	40 %	40 %	148660471
600	NC_009525	GCGGT	2	10	798908	798917	0 %	20 %	60 %	20 %	148660472
601	NC_009525	TGCGG	2	10	799442	799451	0 %	20 %	60 %	20 %	148660472
602	NC_009525	CGCGG	2	10	800593	800602	0 %	0 %	60 %	40 %	148660473
603	NC_009525	GGTTG	2	10	800704	800713	0 %	40 %	60 %	0 %	148660473
604	NC_009525	CCGGA	2	10	803645	803654	20 %	0 %	40 %	40 %	148660478
605	NC_009525	GCCGG	2	10	806709	806718	0 %	0 %	60 %	40 %	148660483
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607	NC_009525	GCGTG	2	10	807847	807856	0 %	20 %	60 %	20 %	148660486
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609	NC_009525	GGCCG	2	10	810312	810321	0 %	0 %	60 %	40 %	148660487
610	NC_009525	CATCG	2	10	810736	810745	20 %	20 %	20 %	40 %	148660487
611	NC_009525	TGCGC	2	10	813427	813436	0 %	20 %	40 %	40 %	148660491
612	NC_009525	GGTGT	2	10	816000	816009	0 %	40 %	60 %	0 %	148660496
613	NC_009525	CGGAT	2	10	817761	817770	20 %	20 %	40 %	20 %	148660499
614	NC_009525	CGGCC	2	10	817900	817909	0 %	0 %	40 %	60 %	148660499
615	NC_009525	GTCGG	2	10	818349	818358	0 %	20 %	60 %	20 %	148660499
616	NC_009525	GGGTC	2	10	820397	820406	0 %	20 %	60 %	20 %	148660501
617	NC_009525	AATCC	2	10	820589	820598	40 %	20 %	0 %	40 %	148660501
618	NC_009525	CGGGG	2	10	821298	821307	0 %	0 %	80 %	20 %	148660502
619	NC_009525	GACGG	2	10	823317	823326	20 %	0 %	60 %	20 %	148660504
620	NC_009525	GGTGT	2	10	826796	826805	0 %	40 %	60 %	0 %	148660507
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622	NC_009525	CGCAG	2	10	828016	828025	20 %	0 %	40 %	40 %	148660509
623	NC_009525	TGCGG	2	10	828294	828303	0 %	20 %	60 %	20 %	148660509
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625	NC_009525	CGGTG	2	10	831906	831915	0 %	20 %	60 %	20 %	148660514
626	NC_009525	CGGCG	2	10	832448	832457	0 %	0 %	60 %	40 %	148660515
627	NC_009525	GGCTG	2	10	833267	833276	0 %	20 %	60 %	20 %	148660516
628	NC_009525	GCTGG	2	10	833534	833543	0 %	20 %	60 %	20 %	148660516
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