MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009525	GCTCG	2	10	2087284	2087293	0 %	20 %	40 %	40 %	148661638
1502	NC_009525	CAGCG	2	10	2092061	2092070	20 %	0 %	40 %	40 %	148661641
1503	NC_009525	CCGTT	2	10	2092072	2092081	0 %	40 %	20 %	40 %	148661641
1504	NC_009525	GGCCC	2	10	2092723	2092732	0 %	0 %	40 %	60 %	148661642
1505	NC_009525	CGGGG	2	10	2092900	2092909	0 %	0 %	80 %	20 %	148661642
1506	NC_009525	TGGCT	2	10	2093842	2093851	0 %	40 %	40 %	20 %	148661642
1507	NC_009525	GCCGC	2	10	2093869	2093878	0 %	0 %	40 %	60 %	148661642
1508	NC_009525	CGGGG	2	10	2094346	2094355	0 %	0 %	80 %	20 %	148661642
1509	NC_009525	GGCAA	2	10	2096300	2096309	40 %	0 %	40 %	20 %	148661643
1510	NC_009525	GCCCC	2	10	2100656	2100665	0 %	0 %	20 %	80 %	148661648
1511	NC_009525	ATGCC	2	10	2102466	2102475	20 %	20 %	20 %	40 %	148661649
1512	NC_009525	CGATC	2	10	2102551	2102560	20 %	20 %	20 %	40 %	148661649
1513	NC_009525	GCGAC	2	10	2103540	2103549	20 %	0 %	40 %	40 %	148661649
1514	NC_009525	GGCCA	2	10	2105064	2105073	20 %	0 %	40 %	40 %	148661650
1515	NC_009525	CCGCT	2	10	2106831	2106840	0 %	20 %	20 %	60 %	148661653
1516	NC_009525	CGGTG	2	10	2108120	2108129	0 %	20 %	60 %	20 %	148661656
1517	NC_009525	TCGGT	2	10	2109184	2109193	0 %	40 %	40 %	20 %	148661656
1518	NC_009525	GTCGA	2	10	2112355	2112364	20 %	20 %	40 %	20 %	148661660
1519	NC_009525	CGTCG	2	10	2114435	2114444	0 %	20 %	40 %	40 %	148661662
1520	NC_009525	GGTCG	2	10	2114579	2114588	0 %	20 %	60 %	20 %	148661662
1521	NC_009525	CGGCC	2	10	2119524	2119533	0 %	0 %	40 %	60 %	148661668
1522	NC_009525	CAGCC	2	10	2121062	2121071	20 %	0 %	20 %	60 %	148661669
1523	NC_009525	ACGTC	2	10	2121663	2121672	20 %	20 %	20 %	40 %	148661670
1524	NC_009525	CGGCG	2	10	2122022	2122031	0 %	0 %	60 %	40 %	148661670
1525	NC_009525	CGCAG	2	10	2123207	2123216	20 %	0 %	40 %	40 %	148661672
1526	NC_009525	GGACA	2	10	2125301	2125310	40 %	0 %	40 %	20 %	148661672
1527	NC_009525	GCTCG	2	10	2128517	2128526	0 %	20 %	40 %	40 %	148661674
1528	NC_009525	ACCTG	2	10	2129242	2129251	20 %	20 %	20 %	40 %	148661674
1529	NC_009525	CCGGA	2	10	2129459	2129468	20 %	0 %	40 %	40 %	148661675
1530	NC_009525	ACAGC	2	10	2131113	2131122	40 %	0 %	20 %	40 %	148661676
1531	NC_009525	GCCAG	2	10	2132352	2132361	20 %	0 %	40 %	40 %	148661678
1532	NC_009525	AGGAG	2	10	2135703	2135712	40 %	0 %	60 %	0 %	148661682
1533	NC_009525	CTGTG	2	10	2136152	2136161	0 %	40 %	40 %	20 %	148661683
1534	NC_009525	GCCGC	2	10	2136629	2136638	0 %	0 %	40 %	60 %	148661683
1535	NC_009525	GTCCT	2	10	2136694	2136703	0 %	40 %	20 %	40 %	148661683
1536	NC_009525	CGTGT	2	10	2142128	2142137	0 %	40 %	40 %	20 %	148661687
1537	NC_009525	TGAGC	2	10	2144866	2144875	20 %	20 %	40 %	20 %	148661692
1538	NC_009525	TGCCG	2	10	2145740	2145749	0 %	20 %	40 %	40 %	148661692
1539	NC_009525	CAGTC	2	10	2150922	2150931	20 %	20 %	20 %	40 %	148661701
1540	NC_009525	CACAA	2	10	2151176	2151185	60 %	0 %	0 %	40 %	148661701
1541	NC_009525	TCATC	2	10	2154375	2154384	20 %	40 %	0 %	40 %	148661704
1542	NC_009525	GCCGG	2	10	2155917	2155926	0 %	0 %	60 %	40 %	148661707
1543	NC_009525	ACGCC	2	10	2159800	2159809	20 %	0 %	20 %	60 %	148661710
1544	NC_009525	TGGTG	2	10	2160071	2160080	0 %	40 %	60 %	0 %	148661710
1545	NC_009525	CGGTG	2	10	2161166	2161175	0 %	20 %	60 %	20 %	148661712
1546	NC_009525	TGGGG	2	10	2161602	2161611	0 %	20 %	80 %	0 %	148661713
1547	NC_009525	GGCCG	2	10	2165201	2165210	0 %	0 %	60 %	40 %	148661716
1548	NC_009525	CCACA	2	10	2169569	2169578	40 %	0 %	0 %	60 %	148661721
1549	NC_009525	CCCAT	2	10	2170101	2170110	20 %	20 %	0 %	60 %	148661722
1550	NC_009525	GGTGA	2	10	2172939	2172948	20 %	20 %	60 %	0 %	148661725
1551	NC_009525	TCGCC	2	10	2176027	2176036	0 %	20 %	20 %	60 %	148661725
1552	NC_009525	TTGGC	2	10	2176261	2176270	0 %	40 %	40 %	20 %	148661725
1553	NC_009525	CTAAG	2	10	2176625	2176634	40 %	20 %	20 %	20 %	148661725
1554	NC_009525	CCCGC	2	10	2177185	2177194	0 %	0 %	20 %	80 %	148661725
1555	NC_009525	GCCGA	2	10	2179796	2179805	20 %	0 %	40 %	40 %	148661726
1556	NC_009525	CCGAC	2	10	2181446	2181455	20 %	0 %	20 %	60 %	148661727
1557	NC_009525	GCTTG	2	10	2181758	2181767	0 %	40 %	40 %	20 %	148661728
1558	NC_009525	CGGTG	2	10	2184898	2184907	0 %	20 %	60 %	20 %	148661730
1559	NC_009525	CCCCA	2	10	2185854	2185863	20 %	0 %	0 %	80 %	148661731
1560	NC_009525	CGGAC	2	10	2187877	2187886	20 %	0 %	40 %	40 %	148661733
1561	NC_009525	ACGCG	2	10	2188178	2188187	20 %	0 %	40 %	40 %	148661733
1562	NC_009525	CGTGT	2	10	2188221	2188230	0 %	40 %	40 %	20 %	148661733
1563	NC_009525	TGGTG	2	10	2189598	2189607	0 %	40 %	60 %	0 %	148661735
1564	NC_009525	CTGAC	2	10	2189720	2189729	20 %	20 %	20 %	40 %	148661735
1565	NC_009525	GGACC	2	10	2191543	2191552	20 %	0 %	40 %	40 %	148661737
1566	NC_009525	CGACG	2	10	2194473	2194482	20 %	0 %	40 %	40 %	148661741
1567	NC_009525	TGCGG	2	10	2196133	2196142	0 %	20 %	60 %	20 %	148661743
1568	NC_009525	GCGTT	2	10	2196910	2196919	0 %	40 %	40 %	20 %	148661743
1569	NC_009525	GACCG	2	10	2197032	2197041	20 %	0 %	40 %	40 %	148661743
1570	NC_009525	CCGTG	2	10	2197419	2197428	0 %	20 %	40 %	40 %	148661744
1571	NC_009525	CGGTG	2	10	2198450	2198459	0 %	20 %	60 %	20 %	148661745
1572	NC_009525	CGCTG	2	10	2198972	2198981	0 %	20 %	40 %	40 %	148661745
1573	NC_009525	CGGTC	2	10	2199306	2199315	0 %	20 %	40 %	40 %	148661745
1574	NC_009525	CGGCT	2	10	2199422	2199431	0 %	20 %	40 %	40 %	148661745
1575	NC_009525	GCAAG	2	10	2201780	2201789	40 %	0 %	40 %	20 %	148661746
1576	NC_009525	TGTGC	2	10	2203664	2203673	0 %	40 %	40 %	20 %	148661749
1577	NC_009525	GGCCA	2	10	2205340	2205349	20 %	0 %	40 %	40 %	148661752
1578	NC_009525	GCGCC	2	10	2206190	2206199	0 %	0 %	40 %	60 %	148661753
1579	NC_009525	TGGCC	2	10	2206397	2206406	0 %	20 %	40 %	40 %	148661753
1580	NC_009525	CCGAC	2	10	2210997	2211006	20 %	0 %	20 %	60 %	148661761
1581	NC_009525	TGCGC	2	10	2212165	2212174	0 %	20 %	40 %	40 %	148661763
1582	NC_009525	TTCGG	2	10	2212459	2212468	0 %	40 %	40 %	20 %	148661763
1583	NC_009525	GGCGC	2	10	2214221	2214230	0 %	0 %	60 %	40 %	148661768
1584	NC_009525	GGTCG	2	10	2217627	2217636	0 %	20 %	60 %	20 %	148661773
1585	NC_009525	GGCCG	2	10	2219121	2219130	0 %	0 %	60 %	40 %	148661774
1586	NC_009525	AGGCC	2	10	2219772	2219781	20 %	0 %	40 %	40 %	148661775
1587	NC_009525	GGGGC	2	10	2220155	2220164	0 %	0 %	80 %	20 %	148661775
1588	NC_009525	CGACG	2	10	2220722	2220731	20 %	0 %	40 %	40 %	148661776
1589	NC_009525	CGCAA	2	10	2221195	2221204	40 %	0 %	20 %	40 %	148661776
1590	NC_009525	GAAAT	2	10	2221523	2221532	60 %	20 %	20 %	0 %	148661776
1591	NC_009525	ATGTC	2	10	2222394	2222403	20 %	40 %	20 %	20 %	148661777
1592	NC_009525	CAGGC	2	10	2223868	2223877	20 %	0 %	40 %	40 %	148661778
1593	NC_009525	CAACG	2	10	2224292	2224301	40 %	0 %	20 %	40 %	148661779
1594	NC_009525	GGCAA	2	10	2224372	2224381	40 %	0 %	40 %	20 %	148661779
1595	NC_009525	TCCGG	2	10	2224860	2224869	0 %	20 %	40 %	40 %	148661779
1596	NC_009525	GACCG	2	10	2229726	2229735	20 %	0 %	40 %	40 %	148661786
1597	NC_009525	GCTGC	2	10	2230173	2230182	0 %	20 %	40 %	40 %	148661786
1598	NC_009525	TCCGG	2	10	2232314	2232323	0 %	20 %	40 %	40 %	148661788
1599	NC_009525	TGCCT	2	10	2232552	2232561	0 %	40 %	20 %	40 %	148661788
1600	NC_009525	TCACC	2	10	2232947	2232956	20 %	20 %	0 %	60 %	148661788
1601	NC_009525	GTGGA	2	10	2233671	2233680	20 %	20 %	60 %	0 %	148661789
1602	NC_009525	GGCGG	2	10	2236546	2236555	0 %	0 %	80 %	20 %	148661793
1603	NC_009525	CGCGC	2	10	2249195	2249204	0 %	0 %	40 %	60 %	148661810
1604	NC_009525	GACGG	2	10	2251424	2251433	20 %	0 %	60 %	20 %	148661811
1605	NC_009525	GTACG	2	10	2252899	2252908	20 %	20 %	40 %	20 %	148661812
1606	NC_009525	CTGGA	2	10	2256477	2256486	20 %	20 %	40 %	20 %	148661814
1607	NC_009525	CCGTC	2	10	2257119	2257128	0 %	20 %	20 %	60 %	148661815
1608	NC_009525	CTGGC	2	10	2258278	2258287	0 %	20 %	40 %	40 %	148661816
1609	NC_009525	TACAA	2	10	2260272	2260281	60 %	20 %	0 %	20 %	148661818
1610	NC_009525	CACCG	2	10	2260428	2260437	20 %	0 %	20 %	60 %	148661818
1611	NC_009525	ACCGA	2	10	2261389	2261398	40 %	0 %	20 %	40 %	148661819
1612	NC_009525	GACCG	2	10	2261928	2261937	20 %	0 %	40 %	40 %	148661820
1613	NC_009525	CGGCC	2	10	2263266	2263275	0 %	0 %	40 %	60 %	148661820
1614	NC_009525	GCGCC	2	10	2269381	2269390	0 %	0 %	40 %	60 %	148661826
1615	NC_009525	CTGCG	2	10	2269530	2269539	0 %	20 %	40 %	40 %	148661826
1616	NC_009525	CGGCT	2	10	2270642	2270651	0 %	20 %	40 %	40 %	148661827
1617	NC_009525	CCGGT	2	10	2271892	2271901	0 %	20 %	40 %	40 %	148661829
1618	NC_009525	ACCCG	2	10	2273615	2273624	20 %	0 %	20 %	60 %	148661830
1619	NC_009525	TGGAT	2	10	2276081	2276090	20 %	40 %	40 %	0 %	148661833
1620	NC_009525	GCCGC	2	10	2277996	2278005	0 %	0 %	40 %	60 %	148661837
1621	NC_009525	GGCCA	2	10	2278782	2278791	20 %	0 %	40 %	40 %	148661838
1622	NC_009525	TGGCG	2	10	2279055	2279064	0 %	20 %	60 %	20 %	148661838
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1624	NC_009525	AGCAC	2	10	2281057	2281066	40 %	0 %	20 %	40 %	148661839
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1743	NC_009525	CGGCG	2	10	2425870	2425879	0 %	0 %	60 %	40 %	148661971
1744	NC_009525	TGGTG	2	10	2427242	2427251	0 %	40 %	60 %	0 %	148661972
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1871	NC_009525	CTGCA	2	10	2611608	2611617	20 %	20 %	20 %	40 %	148662155
1872	NC_009525	CGAGC	2	10	2613614	2613623	20 %	0 %	40 %	40 %	148662157
1873	NC_009525	TCGGG	2	10	2616097	2616106	0 %	20 %	60 %	20 %	148662160
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1883	NC_009525	GGGTC	2	10	2630907	2630916	0 %	20 %	60 %	20 %	148662171
1884	NC_009525	CGCTG	2	10	2630966	2630975	0 %	20 %	40 %	40 %	148662171
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1887	NC_009525	CCCGG	2	10	2634684	2634693	0 %	0 %	40 %	60 %	148662173
1888	NC_009525	CGTCG	2	10	2635005	2635014	0 %	20 %	40 %	40 %	148662173
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1896	NC_009525	CGGCG	2	10	2653726	2653735	0 %	0 %	60 %	40 %	148662191
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1898	NC_009525	GCGCG	2	10	2655458	2655467	0 %	0 %	60 %	40 %	148662194
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1902	NC_009525	GCGCG	2	10	2662446	2662455	0 %	0 %	60 %	40 %	148662202
1903	NC_009525	GGGGT	2	10	2663450	2663459	0 %	20 %	80 %	0 %	148662202
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1912	NC_009525	CGGCG	2	10	2676737	2676746	0 %	0 %	60 %	40 %	148662212
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1963	NC_009525	GCCGA	2	10	2759815	2759824	20 %	0 %	40 %	40 %	148662283
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1972	NC_009525	CTTGG	2	10	2767149	2767158	0 %	40 %	40 %	20 %	148662290
1973	NC_009525	CAGCG	2	10	2767725	2767734	20 %	0 %	40 %	40 %	148662290
1974	NC_009525	GGCCC	2	10	2768644	2768653	0 %	0 %	40 %	60 %	148662290
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1979	NC_009525	GGCTG	2	10	2778005	2778014	0 %	20 %	60 %	20 %	148662298
1980	NC_009525	ACCCA	2	10	2778624	2778633	40 %	0 %	0 %	60 %	148662298
1981	NC_009525	GGCCG	2	10	2779081	2779090	0 %	0 %	60 %	40 %	148662299
1982	NC_009525	CGGGT	2	10	2779244	2779253	0 %	20 %	60 %	20 %	148662299
1983	NC_009525	GCGCC	2	10	2781151	2781160	0 %	0 %	40 %	60 %	148662302
1984	NC_009525	ACGCA	2	10	2784502	2784511	40 %	0 %	20 %	40 %	148662304
1985	NC_009525	TGCGA	2	10	2789822	2789831	20 %	20 %	40 %	20 %	148662311
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1987	NC_009525	GGTCC	2	10	2794705	2794714	0 %	20 %	40 %	40 %	148662312
1988	NC_009525	CGGAC	2	10	2795185	2795194	20 %	0 %	40 %	40 %	148662312
1989	NC_009525	CAGCG	2	10	2795562	2795571	20 %	0 %	40 %	40 %	148662312
1990	NC_009525	ACGTC	2	10	2795935	2795944	20 %	20 %	20 %	40 %	148662312
1991	NC_009525	TCGAC	2	10	2797488	2797497	20 %	20 %	20 %	40 %	148662314
1992	NC_009525	TCAGC	2	10	2797661	2797670	20 %	20 %	20 %	40 %	148662315
1993	NC_009525	ACGCC	2	10	2798860	2798869	20 %	0 %	20 %	60 %	148662316
1994	NC_009525	GTGCG	2	10	2799887	2799896	0 %	20 %	60 %	20 %	148662317
1995	NC_009525	CGCCC	2	10	2805423	2805432	0 %	0 %	20 %	80 %	148662320
1996	NC_009525	CCGGC	2	10	2805853	2805862	0 %	0 %	40 %	60 %	148662320
1997	NC_009525	AGCCG	2	10	2806551	2806560	20 %	0 %	40 %	40 %	148662321
1998	NC_009525	CCGTC	2	10	2808987	2808996	0 %	20 %	20 %	60 %	148662322
1999	NC_009525	CGAGG	2	10	2809906	2809915	20 %	0 %	60 %	20 %	148662323
2000	NC_009525	GCCAG	2	10	2810613	2810622	20 %	0 %	40 %	40 %	148662323

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