MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009525	GGGCA	2	10	1382428	1382437	20 %	0 %	60 %	20 %	148661025
1002	NC_009525	GGTGA	2	10	1382762	1382771	20 %	20 %	60 %	0 %	148661025
1003	NC_009525	CGGCG	2	10	1385038	1385047	0 %	0 %	60 %	40 %	148661027
1004	NC_009525	AGCGC	2	10	1385478	1385487	20 %	0 %	40 %	40 %	148661027
1005	NC_009525	TGCGC	2	10	1385683	1385692	0 %	20 %	40 %	40 %	148661028
1006	NC_009525	GCCGC	2	10	1387512	1387521	0 %	0 %	40 %	60 %	148661030
1007	NC_009525	GCCGA	2	10	1387917	1387926	20 %	0 %	40 %	40 %	148661030
1008	NC_009525	CCTTG	2	10	1393741	1393750	0 %	40 %	20 %	40 %	148661035
1009	NC_009525	CGAGC	2	10	1397518	1397527	20 %	0 %	40 %	40 %	148661038
1010	NC_009525	CACGC	2	10	1397596	1397605	20 %	0 %	20 %	60 %	148661038
1011	NC_009525	TCGAT	2	10	1398432	1398441	20 %	40 %	20 %	20 %	148661038
1012	NC_009525	CGTCG	3	15	1400270	1400284	0 %	20 %	40 %	40 %	148661038
1013	NC_009525	GCGAG	2	10	1400959	1400968	20 %	0 %	60 %	20 %	148661039
1014	NC_009525	CGGCG	2	10	1400990	1400999	0 %	0 %	60 %	40 %	148661039
1015	NC_009525	ACCCG	2	10	1402608	1402617	20 %	0 %	20 %	60 %	148661040
1016	NC_009525	ATGTC	2	10	1405907	1405916	20 %	40 %	20 %	20 %	148661043
1017	NC_009525	TGCGG	2	10	1407077	1407086	0 %	20 %	60 %	20 %	148661044
1018	NC_009525	CGCCC	2	10	1407155	1407164	0 %	0 %	20 %	80 %	148661044
1019	NC_009525	TGCTG	2	10	1407623	1407632	0 %	40 %	40 %	20 %	148661045
1020	NC_009525	GGTCA	2	10	1407949	1407958	20 %	20 %	40 %	20 %	148661045
1021	NC_009525	GGCCG	2	10	1408174	1408183	0 %	0 %	60 %	40 %	148661045
1022	NC_009525	ACCGG	2	10	1409073	1409082	20 %	0 %	40 %	40 %	148661046
1023	NC_009525	CACCG	2	10	1409206	1409215	20 %	0 %	20 %	60 %	148661046
1024	NC_009525	GCGCA	2	10	1410329	1410338	20 %	0 %	40 %	40 %	148661047
1025	NC_009525	TCCGA	2	10	1411151	1411160	20 %	20 %	20 %	40 %	148661048
1026	NC_009525	TGACC	2	10	1413953	1413962	20 %	20 %	20 %	40 %	148661051
1027	NC_009525	GCCGG	2	10	1414126	1414135	0 %	0 %	60 %	40 %	148661051
1028	NC_009525	GCTGG	2	10	1416443	1416452	0 %	20 %	60 %	20 %	148661053
1029	NC_009525	GCATC	2	10	1420887	1420896	20 %	20 %	20 %	40 %	148661057
1030	NC_009525	CGGTG	2	10	1424941	1424950	0 %	20 %	60 %	20 %	148661060
1031	NC_009525	AGCAC	2	10	1427086	1427095	40 %	0 %	20 %	40 %	148661063
1032	NC_009525	CCGCG	2	10	1429030	1429039	0 %	0 %	40 %	60 %	148661065
1033	NC_009525	TCGGC	2	10	1430991	1431000	0 %	20 %	40 %	40 %	148661065
1034	NC_009525	CGGCG	2	10	1431144	1431153	0 %	0 %	60 %	40 %	148661065
1035	NC_009525	AACCG	2	10	1431563	1431572	40 %	0 %	20 %	40 %	148661066
1036	NC_009525	AGCTG	2	10	1432953	1432962	20 %	20 %	40 %	20 %	148661066
1037	NC_009525	GCGGT	2	10	1433945	1433954	0 %	20 %	60 %	20 %	148661067
1038	NC_009525	GTCCG	2	10	1434358	1434367	0 %	20 %	40 %	40 %	148661067
1039	NC_009525	GCGCG	2	10	1435709	1435718	0 %	0 %	60 %	40 %	148661068
1040	NC_009525	CCGAA	2	10	1436375	1436384	40 %	0 %	20 %	40 %	148661068
1041	NC_009525	CGCAA	2	10	1437178	1437187	40 %	0 %	20 %	40 %	148661069
1042	NC_009525	GGTCG	2	10	1439612	1439621	0 %	20 %	60 %	20 %	148661072
1043	NC_009525	TGGAA	2	10	1440181	1440190	40 %	20 %	40 %	0 %	148661072
1044	NC_009525	AACGG	2	10	1441432	1441441	40 %	0 %	40 %	20 %	148661073
1045	NC_009525	GAATT	2	10	1442883	1442892	40 %	40 %	20 %	0 %	148661075
1046	NC_009525	TCAGC	2	10	1444562	1444571	20 %	20 %	20 %	40 %	148661076
1047	NC_009525	GGCCG	2	10	1447937	1447946	0 %	0 %	60 %	40 %	148661080
1048	NC_009525	CACCG	2	10	1449320	1449329	20 %	0 %	20 %	60 %	148661080
1049	NC_009525	GCTGA	2	10	1453697	1453706	20 %	20 %	40 %	20 %	148661084
1050	NC_009525	CGGTG	2	10	1455323	1455332	0 %	20 %	60 %	20 %	148661085
1051	NC_009525	CAACC	2	10	1455354	1455363	40 %	0 %	0 %	60 %	148661085
1052	NC_009525	GCAAG	2	10	1455803	1455812	40 %	0 %	40 %	20 %	148661085
1053	NC_009525	AGCGA	2	10	1458840	1458849	40 %	0 %	40 %	20 %	148661088
1054	NC_009525	CCGGT	2	10	1459747	1459756	0 %	20 %	40 %	40 %	148661090
1055	NC_009525	CGGTG	2	10	1459949	1459958	0 %	20 %	60 %	20 %	148661090
1056	NC_009525	GGCCG	2	10	1460429	1460438	0 %	0 %	60 %	40 %	148661090
1057	NC_009525	TTTGC	2	10	1460472	1460481	0 %	60 %	20 %	20 %	148661090
1058	NC_009525	GCCAA	2	10	1462085	1462094	40 %	0 %	20 %	40 %	148661092
1059	NC_009525	CGATG	2	10	1463614	1463623	20 %	20 %	40 %	20 %	148661095
1060	NC_009525	CGGCG	2	10	1464292	1464301	0 %	0 %	60 %	40 %	148661095
1061	NC_009525	CTCGT	2	10	1464451	1464460	0 %	40 %	20 %	40 %	148661095
1062	NC_009525	GGCTC	2	10	1466304	1466313	0 %	20 %	40 %	40 %	148661097
1063	NC_009525	CGACG	2	10	1466865	1466874	20 %	0 %	40 %	40 %	148661097
1064	NC_009525	TGCAC	2	10	1467285	1467294	20 %	20 %	20 %	40 %	148661098
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1066	NC_009525	GGTGT	2	10	1472722	1472731	0 %	40 %	60 %	0 %	148661103
1067	NC_009525	CATTC	2	10	1480188	1480197	20 %	40 %	0 %	40 %	148661105
1068	NC_009525	AGGCG	2	10	1480207	1480216	20 %	0 %	60 %	20 %	148661105
1069	NC_009525	GCCAG	2	10	1481303	1481312	20 %	0 %	40 %	40 %	148661106
1070	NC_009525	AGCGC	2	10	1482940	1482949	20 %	0 %	40 %	40 %	148661107
1071	NC_009525	GCGAC	2	10	1483674	1483683	20 %	0 %	40 %	40 %	148661107
1072	NC_009525	ACCTG	2	10	1484155	1484164	20 %	20 %	20 %	40 %	148661108
1073	NC_009525	GCAAC	2	10	1487645	1487654	40 %	0 %	20 %	40 %	148661112
1074	NC_009525	GCCGG	2	10	1488006	1488015	0 %	0 %	60 %	40 %	148661112
1075	NC_009525	GTCCG	2	10	1488645	1488654	0 %	20 %	40 %	40 %	148661113
1076	NC_009525	CCCGC	2	10	1490770	1490779	0 %	0 %	20 %	80 %	148661114
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1082	NC_009525	CGGCG	2	10	1503194	1503203	0 %	0 %	60 %	40 %	148661122
1083	NC_009525	AGGAA	2	10	1503960	1503969	60 %	0 %	40 %	0 %	148661123
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1087	NC_009525	CCGTT	2	10	1511287	1511296	0 %	40 %	20 %	40 %	148661134
1088	NC_009525	CGTCC	2	10	1512051	1512060	0 %	20 %	20 %	60 %	148661134
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1091	NC_009525	AACCG	2	10	1515103	1515112	40 %	0 %	20 %	40 %	148661137
1092	NC_009525	GCTGG	2	10	1515490	1515499	0 %	20 %	60 %	20 %	148661137
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1094	NC_009525	ATCGG	2	10	1517851	1517860	20 %	20 %	40 %	20 %	148661138
1095	NC_009525	GCGGT	2	10	1518975	1518984	0 %	20 %	60 %	20 %	148661139
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1097	NC_009525	CCGAT	2	10	1520679	1520688	20 %	20 %	20 %	40 %	148661142
1098	NC_009525	GGGTG	2	10	1521992	1522001	0 %	20 %	80 %	0 %	148661143
1099	NC_009525	TCGGC	2	10	1522210	1522219	0 %	20 %	40 %	40 %	148661143
1100	NC_009525	CGGCT	2	10	1524245	1524254	0 %	20 %	40 %	40 %	148661144
1101	NC_009525	GCACG	2	10	1525081	1525090	20 %	0 %	40 %	40 %	148661144
1102	NC_009525	TCGCT	2	10	1525148	1525157	0 %	40 %	20 %	40 %	148661144
1103	NC_009525	CTGCG	2	10	1525661	1525670	0 %	20 %	40 %	40 %	148661145
1104	NC_009525	ACTTC	2	10	1525692	1525701	20 %	40 %	0 %	40 %	148661145
1105	NC_009525	TGATC	2	10	1528092	1528101	20 %	40 %	20 %	20 %	148661147
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1107	NC_009525	AGCGA	2	10	1530658	1530667	40 %	0 %	40 %	20 %	148661147
1108	NC_009525	TTGGC	2	10	1533042	1533051	0 %	40 %	40 %	20 %	148661150
1109	NC_009525	TGGGC	2	10	1534301	1534310	0 %	20 %	60 %	20 %	148661151
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1111	NC_009525	CCGTC	2	10	1541211	1541220	0 %	20 %	20 %	60 %	148661158
1112	NC_009525	TCGAC	2	10	1544167	1544176	20 %	20 %	20 %	40 %	148661160
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1116	NC_009525	GCGCC	2	10	1546159	1546168	0 %	0 %	40 %	60 %	148661163
1117	NC_009525	GACCA	2	10	1547535	1547544	40 %	0 %	20 %	40 %	148661164
1118	NC_009525	GATGC	2	10	1548081	1548090	20 %	20 %	40 %	20 %	148661164
1119	NC_009525	GATGC	2	10	1548794	1548803	20 %	20 %	40 %	20 %	148661165
1120	NC_009525	CGGCA	2	10	1549316	1549325	20 %	0 %	40 %	40 %	148661166
1121	NC_009525	TGGTG	2	10	1550901	1550910	0 %	40 %	60 %	0 %	148661167
1122	NC_009525	TGTCG	2	10	1553189	1553198	0 %	40 %	40 %	20 %	148661169
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1124	NC_009525	GCGCC	2	10	1555980	1555989	0 %	0 %	40 %	60 %	148661172
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1493	NC_009525	GGTTT	2	10	2080658	2080667	0 %	60 %	40 %	0 %	148661630
1494	NC_009525	CCGGG	2	10	2081458	2081467	0 %	0 %	60 %	40 %	148661631
1495	NC_009525	GATTC	2	10	2083108	2083117	20 %	40 %	20 %	20 %	148661634
1496	NC_009525	GTCGG	2	10	2083352	2083361	0 %	20 %	60 %	20 %	148661634
1497	NC_009525	CGGGC	2	10	2083477	2083486	0 %	0 %	60 %	40 %	148661634
1498	NC_009525	TCCGC	2	10	2083575	2083584	0 %	20 %	20 %	60 %	148661634
1499	NC_009525	TGATC	2	10	2084048	2084057	20 %	40 %	20 %	20 %	148661635
1500	NC_009525	CTGAT	2	10	2084134	2084143	20 %	40 %	20 %	20 %	148661635

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