MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009525	TCCGG	2	10	2811392	2811401	0 %	20 %	40 %	40 %	148662323
2002	NC_009525	TCGCC	2	10	2811672	2811681	0 %	20 %	20 %	60 %	148662323
2003	NC_009525	GCGGT	2	10	2812367	2812376	0 %	20 %	60 %	20 %	148662323
2004	NC_009525	CCGCC	2	10	2814214	2814223	0 %	0 %	20 %	80 %	148662325
2005	NC_009525	GCCGC	2	10	2816052	2816061	0 %	0 %	40 %	60 %	148662325
2006	NC_009525	CCGGC	2	10	2817066	2817075	0 %	0 %	40 %	60 %	148662325
2007	NC_009525	CCCGC	2	10	2817588	2817597	0 %	0 %	20 %	80 %	148662325
2008	NC_009525	CCGCG	2	10	2818675	2818684	0 %	0 %	40 %	60 %	148662327
2009	NC_009525	CTTGC	2	10	2819689	2819698	0 %	40 %	20 %	40 %	148662328
2010	NC_009525	GCTCG	2	10	2820125	2820134	0 %	20 %	40 %	40 %	148662329
2011	NC_009525	CCGGC	2	10	2821412	2821421	0 %	0 %	40 %	60 %	148662331
2012	NC_009525	CGCGT	2	10	2823081	2823090	0 %	20 %	40 %	40 %	148662333
2013	NC_009525	CCACG	2	10	2823700	2823709	20 %	0 %	20 %	60 %	148662333
2014	NC_009525	GGCAG	2	10	2825100	2825109	20 %	0 %	60 %	20 %	148662334
2015	NC_009525	GCCGG	2	10	2825252	2825261	0 %	0 %	60 %	40 %	148662335
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2022	NC_009525	CGTCG	2	10	2830128	2830137	0 %	20 %	40 %	40 %	148662338
2023	NC_009525	TCTCG	2	10	2831065	2831074	0 %	40 %	20 %	40 %	148662339
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2031	NC_009525	GGCCT	2	10	2838977	2838986	0 %	20 %	40 %	40 %	148662346
2032	NC_009525	GCCGC	2	10	2843069	2843078	0 %	0 %	40 %	60 %	148662351
2033	NC_009525	CGGCG	2	10	2843539	2843548	0 %	0 %	60 %	40 %	148662352
2034	NC_009525	CGCGA	2	10	2844395	2844404	20 %	0 %	40 %	40 %	148662352
2035	NC_009525	CTGTG	2	10	2845497	2845506	0 %	40 %	40 %	20 %	148662354
2036	NC_009525	TCGGC	2	10	2847814	2847823	0 %	20 %	40 %	40 %	148662356
2037	NC_009525	ACGGC	2	10	2848132	2848141	20 %	0 %	40 %	40 %	148662356
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2040	NC_009525	GCGCC	2	10	2854784	2854793	0 %	0 %	40 %	60 %	148662361
2041	NC_009525	CTGTG	2	10	2856164	2856173	0 %	40 %	40 %	20 %	148662361
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2045	NC_009525	GCCGG	2	10	2857475	2857484	0 %	0 %	60 %	40 %	148662361
2046	NC_009525	GCGAC	2	10	2858537	2858546	20 %	0 %	40 %	40 %	148662361
2047	NC_009525	CGGCG	2	10	2862447	2862456	0 %	0 %	60 %	40 %	148662362
2048	NC_009525	GCCCT	2	10	2865734	2865743	0 %	20 %	20 %	60 %	148662366
2049	NC_009525	CCAGC	2	10	2866610	2866619	20 %	0 %	20 %	60 %	148662367
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2055	NC_009525	CCGGC	2	10	2872124	2872133	0 %	0 %	40 %	60 %	148662373
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2125	NC_009525	GCCGG	2	10	2958613	2958622	0 %	0 %	60 %	40 %	148662458
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2129	NC_009525	CCGCA	2	10	2960801	2960810	20 %	0 %	20 %	60 %	148662462
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2244	NC_009525	ACCCG	3	15	3124496	3124510	20 %	0 %	20 %	60 %	148662646
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2476	NC_009525	CGATG	2	10	3446700	3446709	20 %	20 %	40 %	20 %	148662925
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2481	NC_009525	ACCAA	2	10	3450902	3450911	60 %	0 %	0 %	40 %	148662929
2482	NC_009525	CAACC	2	10	3452787	3452796	40 %	0 %	0 %	60 %	148662931
2483	NC_009525	GATCG	2	10	3454262	3454271	20 %	20 %	40 %	20 %	148662933
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2485	NC_009525	GCCGC	2	10	3455432	3455441	0 %	0 %	40 %	60 %	148662934
2486	NC_009525	TGCCG	2	10	3455460	3455469	0 %	20 %	40 %	40 %	148662934
2487	NC_009525	CGGCC	2	10	3455825	3455834	0 %	0 %	40 %	60 %	148662934
2488	NC_009525	GTCGC	2	10	3456439	3456448	0 %	20 %	40 %	40 %	148662934
2489	NC_009525	TCACG	2	10	3457694	3457703	20 %	20 %	20 %	40 %	148662934
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2491	NC_009525	CCGAA	2	10	3460011	3460020	40 %	0 %	20 %	40 %	148662936
2492	NC_009525	GACAA	2	10	3460744	3460753	60 %	0 %	20 %	20 %	148662937
2493	NC_009525	CGCAC	2	10	3462482	3462491	20 %	0 %	20 %	60 %	148662938
2494	NC_009525	GCGAC	2	10	3462705	3462714	20 %	0 %	40 %	40 %	148662938
2495	NC_009525	CGCGA	2	10	3462996	3463005	20 %	0 %	40 %	40 %	148662938
2496	NC_009525	ATTCC	2	10	3464302	3464311	20 %	40 %	0 %	40 %	148662940
2497	NC_009525	CTCCC	2	10	3465932	3465941	0 %	20 %	0 %	80 %	148662941
2498	NC_009525	CCCAT	2	10	3470632	3470641	20 %	20 %	0 %	60 %	148662944
2499	NC_009525	GGTGC	2	10	3470646	3470655	0 %	20 %	60 %	20 %	148662944
2500	NC_009525	AGCTG	2	10	3474235	3474244	20 %	20 %	40 %	20 %	148662947

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