MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 48211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021081	CCT	2	6	184530	184535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881838
3002	NC_021081	AAC	2	6	184705	184710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881838
3003	NC_021081	TGA	2	6	184724	184729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881838
3004	NC_021081	CCA	2	6	184730	184735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881838
3005	NC_021081	GGT	2	6	184815	184820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881838
3006	NC_021081	TTG	2	6	184831	184836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881838
3007	NC_021081	CAT	2	6	184965	184970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881838
3008	NC_021081	TGG	2	6	184991	184996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881838
3009	NC_021081	GCG	2	6	184999	185004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881838
3010	NC_021081	TGC	2	6	185048	185053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881838
3011	NC_021081	GGT	2	6	185166	185171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881838
3012	NC_021081	CTG	2	6	185233	185238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881838
3013	NC_021081	GCT	3	9	185247	185255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881838
3014	NC_021081	GGC	2	6	185268	185273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881838
3015	NC_021081	GGC	2	6	185320	185325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_021081	GAA	2	6	185337	185342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021081	AGG	2	6	185399	185404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021081	CTG	3	9	185538	185546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881839
3019	NC_021081	TGG	3	9	185590	185598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881839
3020	NC_021081	TGA	2	6	185608	185613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881839
3021	NC_021081	GTG	2	6	185808	185813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881839
3022	NC_021081	GTG	2	6	185847	185852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881839
3023	NC_021081	CGA	2	6	185867	185872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881839
3024	NC_021081	TGC	2	6	185902	185907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881839
3025	NC_021081	TGC	2	6	186181	186186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881839
3026	NC_021081	TGC	2	6	186247	186252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881839
3027	NC_021081	ACA	2	6	186398	186403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881839
3028	NC_021081	GGC	2	6	186557	186562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881840
3029	NC_021081	ACC	2	6	186591	186596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881840
3030	NC_021081	TGA	2	6	186618	186623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881840
3031	NC_021081	TGG	2	6	186729	186734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881840
3032	NC_021081	CTG	2	6	186740	186745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3033	NC_021081	GGA	2	6	186802	186807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881840
3034	NC_021081	GGC	2	6	186812	186817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881840
3035	NC_021081	CAG	2	6	186968	186973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3036	NC_021081	CAC	2	6	187001	187006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881840
3037	NC_021081	CTG	3	9	187007	187015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3038	NC_021081	CCG	2	6	187116	187121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881840
3039	NC_021081	CGA	2	6	187243	187248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3040	NC_021081	TGC	2	6	187261	187266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3041	NC_021081	ACT	3	9	187290	187298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881840
3042	NC_021081	GTG	2	6	187307	187312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881840
3043	NC_021081	GAG	2	6	187361	187366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881840
3044	NC_021081	GGC	2	6	187471	187476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881840
3045	NC_021081	CGA	2	6	187495	187500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3046	NC_021081	CGG	2	6	187501	187506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881840
3047	NC_021081	GCA	2	6	187570	187575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3048	NC_021081	CTG	2	6	187610	187615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881840
3049	NC_021081	CGC	2	6	187688	187693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881840
3050	NC_021081	GAC	2	6	187816	187821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3051	NC_021081	GTG	2	6	187848	187853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881841
3052	NC_021081	CAC	2	6	187870	187875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881841
3053	NC_021081	GGC	2	6	187895	187900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881841
3054	NC_021081	ACG	2	6	188153	188158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3055	NC_021081	CTG	2	6	188230	188235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3056	NC_021081	TGG	2	6	188264	188269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881841
3057	NC_021081	AAG	2	6	188332	188337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881841
3058	NC_021081	TAC	2	6	188347	188352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881841
3059	NC_021081	TGG	3	9	188354	188362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881841
3060	NC_021081	CAG	2	6	188521	188526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3061	NC_021081	GCC	2	6	188585	188590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881841
3062	NC_021081	CGA	2	6	188739	188744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3063	NC_021081	CCT	2	6	188801	188806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881841
3064	NC_021081	TGG	2	6	188885	188890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881841
3065	NC_021081	CGC	2	6	188893	188898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881841
3066	NC_021081	GCA	2	6	188901	188906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3067	NC_021081	CAG	2	6	188956	188961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3068	NC_021081	CTA	2	6	188979	188984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881841
3069	NC_021081	ACG	2	6	189074	189079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3070	NC_021081	CGA	2	6	189228	189233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881841
3071	NC_021081	ACT	2	6	189320	189325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881841
3072	NC_021081	TGG	2	6	189682	189687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021081	GCG	2	6	189721	189726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021081	TGG	2	6	189738	189743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021081	CGA	2	6	189762	189767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_021081	GCA	2	6	189836	189841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_021081	CAG	2	6	189977	189982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_021081	AGC	2	6	190188	190193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_021081	TGC	2	6	190504	190509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_021081	GTC	3	9	190513	190521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_021081	AGG	2	6	190627	190632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021081	CCT	2	6	190984	190989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_021081	GGC	2	6	191027	191032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_021081	GAT	2	6	191164	191169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881842
3085	NC_021081	CAC	2	6	191248	191253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881842
3086	NC_021081	ACC	2	6	191292	191297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881842
3087	NC_021081	AGC	2	6	191418	191423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881842
3088	NC_021081	TGA	2	6	191481	191486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881842
3089	NC_021081	CGA	2	6	191542	191547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881842
3090	NC_021081	GTG	2	6	191573	191578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881842
3091	NC_021081	CAT	2	6	191635	191640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881842
3092	NC_021081	GGT	2	6	191653	191658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881842
3093	NC_021081	GTG	2	6	191729	191734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881842
3094	NC_021081	GCC	2	6	191757	191762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881842
3095	NC_021081	CGA	2	6	191797	191802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881842
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3099	NC_021081	ACC	2	6	191906	191911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881842
3100	NC_021081	CCG	2	6	192074	192079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881842
3101	NC_021081	ATC	2	6	192086	192091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881842
3102	NC_021081	GGA	2	6	192106	192111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881842
3103	NC_021081	TGA	2	6	192156	192161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881842
3104	NC_021081	GGC	2	6	192169	192174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881842
3105	NC_021081	CTT	2	6	192190	192195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881842
3106	NC_021081	CGA	2	6	192205	192210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881842
3107	NC_021081	GCA	2	6	192352	192357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881842
3108	NC_021081	TGG	2	6	192424	192429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881842
3109	NC_021081	TAT	2	6	192523	192528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021081	GTA	2	6	192614	192619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021081	TAC	2	6	192646	192651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_021081	TCA	2	6	192788	192793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881843
3113	NC_021081	GGC	2	6	192794	192799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881843
3114	NC_021081	GTT	3	9	192870	192878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881843
3115	NC_021081	GTT	2	6	192903	192908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881843
3116	NC_021081	TGC	2	6	192923	192928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881843
3117	NC_021081	GTT	2	6	193011	193016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881843
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3119	NC_021081	GGT	3	9	193269	193277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881843
3120	NC_021081	CGT	2	6	193295	193300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881843
3121	NC_021081	GCG	2	6	193429	193434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881843
3122	NC_021081	TGC	2	6	193586	193591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881843
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3148	NC_021081	TAC	2	6	195532	195537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_021081	CTT	2	6	201489	201494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881852
3241	NC_021081	GCC	2	6	201610	201615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
3242	NC_021081	CGG	2	6	201659	201664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
3243	NC_021081	CTG	2	6	201737	201742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
3244	NC_021081	CTG	2	6	201763	201768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
3245	NC_021081	GGC	2	6	201774	201779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
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3247	NC_021081	GGA	2	6	201864	201869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881852
3248	NC_021081	GTG	2	6	201895	201900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
3249	NC_021081	CAA	2	6	201933	201938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881852
3250	NC_021081	CTG	2	6	202001	202006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
3251	NC_021081	GCT	2	6	202045	202050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
3252	NC_021081	GTG	2	6	202054	202059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
3253	NC_021081	CCG	2	6	202152	202157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
3254	NC_021081	CCG	2	6	202160	202165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
3255	NC_021081	TGC	2	6	202211	202216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
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3260	NC_021081	GAA	2	6	202383	202388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881852
3261	NC_021081	CCG	2	6	202394	202399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
3262	NC_021081	GGC	2	6	202464	202469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
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3264	NC_021081	CTG	3	9	202528	202536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
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3267	NC_021081	CTG	3	9	202597	202605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
3268	NC_021081	TGC	2	6	202712	202717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881853
3269	NC_021081	AAG	2	6	202769	202774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881853
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3272	NC_021081	GAC	2	6	202984	202989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881853
3273	NC_021081	GGT	2	6	203019	203024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881853
3274	NC_021081	CTA	2	6	203041	203046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881853
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3276	NC_021081	GTG	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881853
3277	NC_021081	GCG	2	6	203336	203341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881853
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3280	NC_021081	TGG	2	6	203416	203421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
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3285	NC_021081	GCC	2	6	203876	203881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
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3315	NC_021081	ATG	2	6	206069	206074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3321	NC_021081	ATG	2	6	206438	206443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
3322	NC_021081	ATG	2	6	206447	206452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881856
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3388	NC_021081	GTT	2	6	210790	210795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3477	NC_021081	TGG	2	6	216062	216067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881865
3478	NC_021081	TGG	2	6	216142	216147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881865
3479	NC_021081	ACC	2	6	216214	216219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881866
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3481	NC_021081	TGT	2	6	216313	216318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881866
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