MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 32908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015574	AAT	2	6	275070	275075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986479
3502	NC_015574	CAC	2	6	275143	275148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986479
3503	NC_015574	AAG	2	6	275220	275225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986479
3504	NC_015574	TCA	2	6	275312	275317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986479
3505	NC_015574	AGA	2	6	275418	275423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986479
3506	NC_015574	TGT	3	9	275460	275468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986479
3507	NC_015574	CAA	2	6	275474	275479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986479
3508	NC_015574	CTT	2	6	275634	275639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015574	GGA	2	6	275652	275657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015574	GTA	2	6	275798	275803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986480
3511	NC_015574	ATT	2	6	276133	276138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015574	GTT	2	6	276341	276346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986481
3513	NC_015574	GAT	2	6	276442	276447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986481
3514	NC_015574	AGA	2	6	276496	276501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986481
3515	NC_015574	AAT	2	6	276577	276582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986481
3516	NC_015574	TAA	2	6	276656	276661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015574	ATA	2	6	276695	276700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015574	TGT	2	6	276712	276717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015574	GAC	2	6	277125	277130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986482
3520	NC_015574	TGG	3	9	277229	277237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986482
3521	NC_015574	AAT	2	6	277297	277302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986482
3522	NC_015574	ATG	2	6	277387	277392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986482
3523	NC_015574	TTA	2	6	277450	277455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_015574	TGA	2	6	277476	277481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015574	ATT	2	6	277550	277555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015574	TGC	2	6	277731	277736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986483
3527	NC_015574	CGG	2	6	277755	277760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986483
3528	NC_015574	GAA	2	6	277768	277773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986483
3529	NC_015574	GCA	2	6	277927	277932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986483
3530	NC_015574	AGG	2	6	277947	277952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986483
3531	NC_015574	CAG	2	6	278019	278024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986483
3532	NC_015574	ATA	2	6	278465	278470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986484
3533	NC_015574	ATT	2	6	278481	278486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986484
3534	NC_015574	CAA	2	6	278507	278512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986484
3535	NC_015574	AAT	2	6	278529	278534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986484
3536	NC_015574	CAG	2	6	278593	278598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986484
3537	NC_015574	ATA	2	6	278756	278761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986484
3538	NC_015574	GTA	2	6	278825	278830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986484
3539	NC_015574	TAT	2	6	278898	278903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_015574	ATG	2	6	278951	278956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_015574	AGT	2	6	279003	279008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_015574	AAT	2	6	279167	279172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015574	GTT	2	6	279283	279288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986485
3544	NC_015574	TGA	2	6	279296	279301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986485
3545	NC_015574	CCT	2	6	279364	279369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986485
3546	NC_015574	GAA	2	6	279370	279375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986485
3547	NC_015574	AGC	2	6	279393	279398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986485
3548	NC_015574	AGC	2	6	279495	279500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986485
3549	NC_015574	TAT	2	6	279718	279723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015574	GCT	2	6	279894	279899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986486
3551	NC_015574	TTG	2	6	279903	279908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986486
3552	NC_015574	TAA	2	6	279916	279921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986486
3553	NC_015574	TAA	2	6	279955	279960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986486
3554	NC_015574	TGA	2	6	279983	279988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986486
3555	NC_015574	ATA	2	6	280173	280178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986486
3556	NC_015574	TAA	2	6	280270	280275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986486
3557	NC_015574	AAT	2	6	280282	280287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986486
3558	NC_015574	GAT	2	6	280600	280605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986487
3559	NC_015574	TAG	2	6	280629	280634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986487
3560	NC_015574	ATT	2	6	280789	280794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986487
3561	NC_015574	GCT	2	6	280825	280830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986487
3562	NC_015574	CTG	2	6	280977	280982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986487
3563	NC_015574	CTG	2	6	281040	281045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986487
3564	NC_015574	CAT	2	6	281095	281100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986487
3565	NC_015574	TAT	2	6	281202	281207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986487
3566	NC_015574	GTG	2	6	281213	281218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986487
3567	NC_015574	ATA	2	6	281316	281321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_015574	TGG	2	6	281391	281396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986488
3569	NC_015574	CAG	2	6	281411	281416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986488
3570	NC_015574	ATA	2	6	281429	281434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986488
3571	NC_015574	TGA	2	6	281478	281483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986488
3572	NC_015574	CAC	2	6	281548	281553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986488
3573	NC_015574	CCA	2	6	281577	281582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986488
3574	NC_015574	CAA	2	6	281626	281631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986488
3575	NC_015574	GAG	2	6	281657	281662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986488
3576	NC_015574	AAT	2	6	281761	281766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986488
3577	NC_015574	AAG	2	6	281802	281807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986488
3578	NC_015574	ATA	2	6	281836	281841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015574	AAT	2	6	281888	281893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_015574	AGA	2	6	281991	281996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986489
3581	NC_015574	ATG	2	6	282017	282022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986489
3582	NC_015574	TGG	2	6	282086	282091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986489
3583	NC_015574	GCG	2	6	282200	282205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333986489
3584	NC_015574	TGA	2	6	282497	282502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_015574	TAA	2	6	282548	282553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
3586	NC_015574	AGC	2	6	282593	282598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986490
3587	NC_015574	TTG	2	6	282678	282683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986490
3588	NC_015574	AGA	2	6	282699	282704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986490
3589	NC_015574	TAT	2	6	282785	282790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986490
3590	NC_015574	TCA	2	6	282823	282828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986490
3591	NC_015574	ATG	2	6	282831	282836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986490
3592	NC_015574	TGT	2	6	282848	282853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986490
3593	NC_015574	TAA	2	6	282970	282975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
3594	NC_015574	TAC	2	6	282976	282981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986490
3595	NC_015574	ATA	2	6	283005	283010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986490
3596	NC_015574	TCA	2	6	283219	283224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015574	TTG	2	6	283334	283339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986491
3598	NC_015574	GAA	2	6	283372	283377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986491
3599	NC_015574	TGC	2	6	283455	283460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986491
3600	NC_015574	AAT	2	6	283488	283493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986491
3601	NC_015574	TCA	2	6	283559	283564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
3602	NC_015574	TCA	2	6	283571	283576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
3603	NC_015574	TGG	2	6	283637	283642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986491
3604	NC_015574	CAT	2	6	283683	283688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986491
3605	NC_015574	TGA	3	9	283731	283739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986491
3606	NC_015574	TCC	2	6	283791	283796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986491
3607	NC_015574	GAT	2	6	283804	283809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986491
3608	NC_015574	TCT	2	6	283991	283996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986492
3609	NC_015574	TCC	2	6	284046	284051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986492
3610	NC_015574	GCA	2	6	284087	284092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986492
3611	NC_015574	TAC	2	6	284158	284163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986492
3612	NC_015574	CAT	2	6	284182	284187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986492
3613	NC_015574	TTA	2	6	284243	284248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986492
3614	NC_015574	GGT	2	6	284314	284319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986492
3615	NC_015574	AAT	2	6	284372	284377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_015574	ATG	2	6	284660	284665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986493
3617	NC_015574	TCC	2	6	284859	284864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986493
3618	NC_015574	ATC	2	6	284882	284887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986493
3619	NC_015574	CAA	2	6	284910	284915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986493
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