MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017803	GATCGC	2	12	8531683	8531694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852662
6502	NC_017803	GGGCCG	2	12	8531700	8531711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852662
6503	NC_017803	CACCTG	2	12	8534334	8534345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852664
6504	NC_017803	GCCGGT	2	12	8535445	8535456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852665
6505	NC_017803	GCGTCC	2	12	8535536	8535547	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852665
6506	NC_017803	TCCGCC	2	12	8537025	8537036	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852667
6507	NC_017803	CATCCG	2	12	8537246	8537257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852667
6508	NC_017803	TTGGCG	2	12	8538472	8538483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852668
6509	NC_017803	CGCCTC	2	12	8539218	8539229	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852669
6510	NC_017803	CCCGGC	2	12	8539617	8539628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386852669
6511	NC_017803	GATGGC	2	12	8540207	8540218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852670
6512	NC_017803	CCGCCA	2	12	8541246	8541257	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852671
6513	NC_017803	CGCCGG	2	12	8542457	8542468	0 %	0 %	50 %	50 %	386852672
6514	NC_017803	GGGCCA	2	12	8542967	8542978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852672
6515	NC_017803	GCAGCG	2	12	8543075	8543086	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852672
6516	NC_017803	CTGATC	2	12	8546632	8546643	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386852674
6517	NC_017803	CGATCC	2	12	8547263	8547274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852675
6518	NC_017803	AACACC	2	12	8549661	8549672	50 %	0 %	0 %	50 %	386852677
6519	NC_017803	CCGCGG	2	12	8551288	8551299	0 %	0 %	50 %	50 %	386852678
6520	NC_017803	CAGCGC	2	12	8556584	8556595	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852683
6521	NC_017803	GGCCCG	2	12	8556746	8556757	0 %	0 %	50 %	50 %	386852683
6522	NC_017803	GGCCGG	2	12	8556863	8556874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852683
6523	NC_017803	TCGTGC	2	12	8557173	8557184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852683
6524	NC_017803	AGGGTG	2	12	8557299	8557310	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386852683
6525	NC_017803	TCTCCG	2	12	8560837	8560848	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386852686
6526	NC_017803	GGATCG	2	12	8560903	8560914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852686
6527	NC_017803	TCGGCG	2	12	8561235	8561246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852686
6528	NC_017803	GAACGA	2	12	8561582	8561593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386852686
6529	NC_017803	CCGGCA	2	12	8564918	8564929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852690
6530	NC_017803	TGGTCG	2	12	8567720	8567731	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852693
6531	NC_017803	GCGGCC	2	12	8567944	8567955	0 %	0 %	50 %	50 %	386852693
6532	NC_017803	ACCCCG	2	12	8568922	8568933	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852693
6533	NC_017803	CCGGGC	2	12	8568984	8568995	0 %	0 %	50 %	50 %	386852693
6534	NC_017803	CCGCGA	2	12	8569827	8569838	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852693
6535	NC_017803	CAGGAA	2	12	8572641	8572652	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386852697
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6537	NC_017803	CGACCA	2	12	8574547	8574558	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852698
6538	NC_017803	GATGCC	2	12	8574641	8574652	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852698
6539	NC_017803	CTCGGT	2	12	8575940	8575951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852698
6540	NC_017803	GGTCGG	2	12	8577877	8577888	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852699
6541	NC_017803	GATCAG	2	12	8578351	8578362	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386852700
6542	NC_017803	GGCAGC	2	12	8579053	8579064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852701
6543	NC_017803	GGGCCA	2	12	8580059	8580070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852702
6544	NC_017803	GTCGGA	2	12	8584029	8584040	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852705
6545	NC_017803	GTGACG	2	12	8584093	8584104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852705
6546	NC_017803	ATGCCG	2	12	8585475	8585486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852706
6547	NC_017803	GCAACG	2	12	8591239	8591250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852713
6548	NC_017803	GAGGGT	2	12	8592879	8592890	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386852715
6549	NC_017803	GGTGGC	2	12	8593547	8593558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852716
6550	NC_017803	GACGCG	2	12	8593605	8593616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852716
6551	NC_017803	CGGGGC	2	12	8593863	8593874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852716
6552	NC_017803	CGGCCT	2	12	8599404	8599415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852721
6553	NC_017803	CAGCTC	2	12	8599830	8599841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852722
6554	NC_017803	CACCCG	2	12	8601024	8601035	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852723
6555	NC_017803	TTCGCC	2	12	8601981	8601992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386852724
6556	NC_017803	CGACCA	2	12	8602960	8602971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852724
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6558	NC_017803	CGACGT	2	12	8605240	8605251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852727
6559	NC_017803	GTGTCG	2	12	8606023	8606034	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852728
6560	NC_017803	GCCGGA	2	12	8607500	8607511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852729
6561	NC_017803	AGGGCG	2	12	8607576	8607587	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852729
6562	NC_017803	CGCGGG	2	12	8608027	8608038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852729
6563	NC_017803	GCCCTC	2	12	8608100	8608111	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852729
6564	NC_017803	GGTGAG	2	12	8608115	8608126	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386852729
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6566	NC_017803	CGTGAC	2	12	8610208	8610219	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852732
6567	NC_017803	CTGCCG	2	12	8610728	8610739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852732
6568	NC_017803	CGGCTG	2	12	8611103	8611114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852732
6569	NC_017803	CGTCGG	2	12	8612901	8612912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852733
6570	NC_017803	GCCGGA	2	12	8613483	8613494	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852734
6571	NC_017803	GCGACC	2	12	8613583	8613594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852734
6572	NC_017803	TCCTGA	2	12	8615524	8615535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386852736
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6579	NC_017803	CGTACG	2	12	8625357	8625368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852744
6580	NC_017803	CCGCGG	2	12	8626146	8626157	0 %	0 %	50 %	50 %	386852745
6581	NC_017803	GAGGTC	2	12	8626744	8626755	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852745
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6584	NC_017803	CGGCAG	2	12	8631848	8631859	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852750
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6586	NC_017803	CCTGAT	2	12	8632983	8632994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386852752
6587	NC_017803	CACCAG	2	12	8633219	8633230	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852753
6588	NC_017803	GCCCTT	2	12	8633306	8633317	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386852753
6589	NC_017803	ATATCG	2	12	8635798	8635809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386852756
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6591	NC_017803	GGCACC	2	12	8637908	8637919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852759
6592	NC_017803	GCCGAC	2	12	8639899	8639910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852762
6593	NC_017803	CGGGGT	2	12	8641956	8641967	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852764
6594	NC_017803	TCGCCG	2	12	8641985	8641996	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852764
6595	NC_017803	CACCGG	2	12	8642040	8642051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852764
6596	NC_017803	GGTGAA	2	12	8642154	8642165	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386852764
6597	NC_017803	CACCGA	2	12	8642553	8642564	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852764
6598	NC_017803	AGGCCG	2	12	8646559	8646570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852768
6599	NC_017803	GAGCCA	2	12	8646600	8646611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852768
6600	NC_017803	GCGCGG	2	12	8647295	8647306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852768
6601	NC_017803	CCGGGC	2	12	8647693	8647704	0 %	0 %	50 %	50 %	386852769
6602	NC_017803	ACCGGC	2	12	8649248	8649259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852771
6603	NC_017803	ACGAGG	2	12	8650919	8650930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386852772
6604	NC_017803	GGACCG	2	12	8651231	8651242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852773
6605	NC_017803	CCGCTC	2	12	8651496	8651507	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852774
6606	NC_017803	GGTGCC	2	12	8653375	8653386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852776
6607	NC_017803	GTCGGG	2	12	8654218	8654229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852776
6608	NC_017803	CGGCAC	2	12	8654803	8654814	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852777
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6831	NC_017803	GCGTCG	2	12	8933291	8933302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386853040
6832	NC_017803	TCGGCG	2	12	8936468	8936479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386853041
6833	NC_017803	GCGACC	2	12	8936660	8936671	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853041
6834	NC_017803	CGCCAC	2	12	8937429	8937440	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386853041
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6924	NC_017803	CTGGTC	2	12	9063968	9063979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386853159
6925	NC_017803	ATCCTG	2	12	9065619	9065630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386853160
6926	NC_017803	TTCGGT	2	12	9070025	9070036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386853165
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6929	NC_017803	GCACCG	2	12	9088184	9088195	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853179
6930	NC_017803	GGCGGT	2	12	9088954	9088965	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386853179
6931	NC_017803	GCACCG	2	12	9089535	9089546	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853180
6932	NC_017803	TCCGGC	2	12	9091112	9091123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386853181
6933	NC_017803	GCCGAA	2	12	9093708	9093719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853183
6934	NC_017803	CGGCAG	2	12	9094816	9094827	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386853184
6935	NC_017803	GACGCC	2	12	9095569	9095580	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853184
6936	NC_017803	CCGACC	2	12	9096869	9096880	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386853185
6937	NC_017803	TCGAGA	2	12	9097181	9097192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386853185
6938	NC_017803	CCGCGG	2	12	9101447	9101458	0 %	0 %	50 %	50 %	386853189
6939	NC_017803	TCCGGA	2	12	9101491	9101502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853189
6940	NC_017803	CAGACC	2	12	9102792	9102803	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386853191
6941	NC_017803	CAGACC	2	12	9103209	9103220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386853191
6942	NC_017803	GGCGCA	2	12	9104004	9104015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386853192
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