MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017803	ACCGGC	2	12	7244572	7244583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851542
5502	NC_017803	CGCCGG	2	12	7246219	7246230	0 %	0 %	50 %	50 %	386851544
5503	NC_017803	TCGGCA	2	12	7247010	7247021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851545
5504	NC_017803	GCCGGT	2	12	7247491	7247502	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851545
5505	NC_017803	CCGGGT	2	12	7247617	7247628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851545
5506	NC_017803	CGGGAA	2	12	7248278	7248289	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386851545
5507	NC_017803	CGGCGC	2	12	7250365	7250376	0 %	0 %	50 %	50 %	386851547
5508	NC_017803	GACGTT	2	12	7252316	7252327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851549
5509	NC_017803	GGCCGG	2	12	7253339	7253350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851549
5510	NC_017803	GCCGTC	2	12	7253943	7253954	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851550
5511	NC_017803	CCGGTG	2	12	7254034	7254045	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851550
5512	NC_017803	CCTGGC	2	12	7254744	7254755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851551
5513	NC_017803	GCGACG	2	12	7255019	7255030	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851551
5514	NC_017803	GGCCGG	2	12	7255608	7255619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851551
5515	NC_017803	GGTGCG	2	12	7255891	7255902	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851551
5516	NC_017803	GGGGCT	2	12	7255906	7255917	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851551
5517	NC_017803	TGGCGC	2	12	7256006	7256017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851551
5518	NC_017803	CCGATC	2	12	7256306	7256317	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851551
5519	NC_017803	CCACGG	2	12	7259212	7259223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851553
5520	NC_017803	CGGCCG	2	12	7259272	7259283	0 %	0 %	50 %	50 %	386851553
5521	NC_017803	AGGCCG	2	12	7260528	7260539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851553
5522	NC_017803	CGGGGC	2	12	7260686	7260697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851553
5523	NC_017803	ATCAGC	2	12	7260828	7260839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386851553
5524	NC_017803	CGGGTG	2	12	7261086	7261097	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851553
5525	NC_017803	CGGTGT	2	12	7261336	7261347	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851553
5526	NC_017803	GGCGAG	2	12	7261388	7261399	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851553
5527	NC_017803	CAGGAT	2	12	7263192	7263203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851555
5528	NC_017803	CGATGT	2	12	7264138	7264149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851556
5529	NC_017803	CGCCAG	3	18	7264316	7264333	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851556
5530	NC_017803	CGGCTC	2	12	7264391	7264402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851556
5531	NC_017803	CGCAGT	2	12	7265205	7265216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851557
5532	NC_017803	ACCTCG	2	12	7265625	7265636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851558
5533	NC_017803	GGTGCC	2	12	7269827	7269838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851560
5534	NC_017803	CCGGTG	2	12	7270606	7270617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851560
5535	NC_017803	CGCTGG	2	12	7272069	7272080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851561
5536	NC_017803	CCCTGG	2	12	7272538	7272549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851561
5537	NC_017803	CGGTGG	2	12	7274460	7274471	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851562
5538	NC_017803	GGCCCC	2	12	7275646	7275657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851563
5539	NC_017803	CGGTGG	2	12	7277789	7277800	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851566
5540	NC_017803	GCAGGG	2	12	7278074	7278085	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851566
5541	NC_017803	CGACGG	2	12	7278086	7278097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851566
5542	NC_017803	GGCGCC	2	12	7283002	7283013	0 %	0 %	50 %	50 %	386851572
5543	NC_017803	CGTAGA	2	12	7284527	7284538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851573
5544	NC_017803	GTGCGG	2	12	7284585	7284596	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386851573
5545	NC_017803	CCGGTC	2	12	7285253	7285264	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851574
5546	NC_017803	GTCCCG	2	12	7285749	7285760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851574
5547	NC_017803	CCGAGG	2	12	7288383	7288394	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851575
5548	NC_017803	CCGGAA	2	12	7290649	7290660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851577
5549	NC_017803	GCCGGG	2	12	7291260	7291271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386851578
5550	NC_017803	TGAAGT	2	12	7291307	7291318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386851578
5551	NC_017803	GGCTCG	2	12	7292740	7292751	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851579
5552	NC_017803	ACGGCG	2	12	7295006	7295017	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851582
5553	NC_017803	CCGATC	2	12	7295432	7295443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386851582
5554	NC_017803	TCGGCG	2	12	7297211	7297222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851583
5555	NC_017803	ATCGCG	2	12	7297223	7297234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851583
5556	NC_017803	GCCGCG	2	12	7297487	7297498	0 %	0 %	50 %	50 %	386851584
5557	NC_017803	GCACCG	2	12	7298275	7298286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851584
5558	NC_017803	GCCAGC	2	12	7298924	7298935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851585
5559	NC_017803	CAGCGG	2	12	7299594	7299605	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851586
5560	NC_017803	CAGGCC	2	12	7299735	7299746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851586
5561	NC_017803	CGGCAC	2	12	7300362	7300373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851587
5562	NC_017803	CGCCGG	2	12	7300413	7300424	0 %	0 %	50 %	50 %	386851587
5563	NC_017803	CCCGCC	2	12	7301066	7301077	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	386851587
5564	NC_017803	GACGCC	2	12	7302875	7302886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851589
5565	NC_017803	ACCGAC	2	12	7310781	7310792	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386851598
5566	NC_017803	GGCCCG	2	12	7313914	7313925	0 %	0 %	50 %	50 %	386851600
5567	NC_017803	TGCCGG	2	12	7314111	7314122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851600
5568	NC_017803	CGGCCG	2	12	7316641	7316652	0 %	0 %	50 %	50 %	386851603
5569	NC_017803	CGCAAC	2	12	7317356	7317367	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386851603
5570	NC_017803	CAGCGG	2	12	7318938	7318949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851604
5571	NC_017803	CGGCGA	2	12	7322721	7322732	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851608
5572	NC_017803	CAGCAA	2	12	7325607	7325618	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386851611
5573	NC_017803	AGGCCG	2	12	7326461	7326472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851611
5574	NC_017803	CCGGAC	2	12	7328098	7328109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851612
5575	NC_017803	CCGAAG	2	12	7328126	7328137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851612
5576	NC_017803	TCGCTG	2	12	7330167	7330178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851614
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5579	NC_017803	CCACCC	2	12	7335833	7335844	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386851621
5580	NC_017803	CGCCCG	2	12	7335851	7335862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386851621
5581	NC_017803	GGACGC	2	12	7336586	7336597	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851622
5582	NC_017803	CGGCAG	2	12	7337112	7337123	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851622
5583	NC_017803	GGCCGC	2	12	7337625	7337636	0 %	0 %	50 %	50 %	386851622
5584	NC_017803	GTCGAT	2	12	7337670	7337681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851622
5585	NC_017803	CGTCGG	2	12	7339377	7339388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851623
5586	NC_017803	CACGGT	2	12	7341714	7341725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851624
5587	NC_017803	CCGGCG	2	12	7342216	7342227	0 %	0 %	50 %	50 %	386851625
5588	NC_017803	CGGCGA	2	12	7342835	7342846	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851625
5589	NC_017803	GAGGCG	2	12	7344099	7344110	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851625
5590	NC_017803	CTACCT	2	12	7344227	7344238	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386851625
5591	NC_017803	CGTGAG	2	12	7344579	7344590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851625
5592	NC_017803	GCGGCC	2	12	7345691	7345702	0 %	0 %	50 %	50 %	386851626
5593	NC_017803	CGGTCG	2	12	7353285	7353296	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851632
5594	NC_017803	GCAAGG	2	12	7356686	7356697	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386851634
5595	NC_017803	TCCGGG	2	12	7358195	7358206	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851634
5596	NC_017803	GGACGG	2	12	7359114	7359125	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386851636
5597	NC_017803	CACGGC	2	12	7361548	7361559	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851639
5598	NC_017803	CTTGGC	2	12	7363558	7363569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386851641
5599	NC_017803	ACTGGA	2	12	7366130	7366141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386851642
5600	NC_017803	AGGTGA	2	12	7366765	7366776	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386851643
5601	NC_017803	GATCGT	2	12	7369077	7369088	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386851645
5602	NC_017803	GAGCAC	2	12	7369374	7369385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851645
5603	NC_017803	CGGCGT	2	12	7370289	7370300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851645
5604	NC_017803	TGACGG	2	12	7370834	7370845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851645
5605	NC_017803	CCGGAA	2	12	7371361	7371372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386851646
5606	NC_017803	CGGTGA	2	12	7372297	7372308	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386851646
5607	NC_017803	GCCGAC	2	12	7374474	7374485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386851648
5608	NC_017803	CGACCA	2	12	7374665	7374676	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386851648
5609	NC_017803	GGCGAC	2	12	7375570	7375581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386851649
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5611	NC_017803	CGCTGG	2	12	7377110	7377121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851651
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5722	NC_017803	CCTGCC	2	12	7529523	7529534	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386851776
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5829	NC_017803	CGCGAT	2	12	7644672	7644683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386851870
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5933	NC_017803	GGCTGC	2	12	7772323	7772334	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386851971
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5937	NC_017803	TCCGGC	2	12	7775935	7775946	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386851973
5938	NC_017803	GCTGGT	2	12	7776365	7776376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386851973
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