MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017803	GCTGGT	2	12	4572620	4572631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849094
3502	NC_017803	GCTCGG	2	12	4572733	4572744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849094
3503	NC_017803	ATCGCC	2	12	4572969	4572980	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849094
3504	NC_017803	GCGCCA	2	12	4574513	4574524	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849096
3505	NC_017803	ATCAGC	2	12	4574662	4574673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386849096
3506	NC_017803	GCGCCG	2	12	4575023	4575034	0 %	0 %	50 %	50 %	386849096
3507	NC_017803	CCCGGC	2	12	4576729	4576740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386849097
3508	NC_017803	ACGGCA	2	12	4576999	4577010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386849097
3509	NC_017803	GCTGTG	2	12	4577582	4577593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849098
3510	NC_017803	GACGCC	2	12	4578446	4578457	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849099
3511	NC_017803	GATCCG	2	12	4580355	4580366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849100
3512	NC_017803	GGTTCG	2	12	4584620	4584631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849104
3513	NC_017803	GGCCAG	2	12	4585090	4585101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849104
3514	NC_017803	CGCGGT	2	12	4586538	4586549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849105
3515	NC_017803	AGGTCG	2	12	4587010	4587021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849105
3516	NC_017803	TGCCGA	2	12	4587023	4587034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849105
3517	NC_017803	ACCCCG	2	12	4587988	4587999	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386849107
3518	NC_017803	GGGCCG	2	12	4588380	4588391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386849108
3519	NC_017803	ATCTCC	2	12	4591909	4591920	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386849110
3520	NC_017803	ACCAGG	2	12	4594263	4594274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386849111
3521	NC_017803	AGAGCG	2	12	4595690	4595701	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849112
3522	NC_017803	ACCGGC	2	12	4599311	4599322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849116
3523	NC_017803	AGCGTC	2	12	4599571	4599582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849116
3524	NC_017803	ACGTGG	2	12	4601348	4601359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849117
3525	NC_017803	TCGTCA	2	12	4601557	4601568	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386849118
3526	NC_017803	ATGGCG	2	12	4601616	4601627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849118
3527	NC_017803	GAAGGC	2	12	4603874	4603885	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849120
3528	NC_017803	AGTACG	2	12	4624376	4624387	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386849138
3529	NC_017803	CGAGAT	2	12	4624624	4624635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386849139
3530	NC_017803	GTCACC	2	12	4626588	4626599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849141
3531	NC_017803	CAGGCC	2	12	4626638	4626649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849141
3532	NC_017803	GACCCG	2	12	4627274	4627285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849141
3533	NC_017803	CCAGGT	2	12	4627607	4627618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849141
3534	NC_017803	TCAGCA	2	12	4628789	4628800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386849142
3535	NC_017803	TCCGGC	2	12	4630820	4630831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849145
3536	NC_017803	TGCCGC	2	12	4631710	4631721	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849146
3537	NC_017803	GGCCCA	2	12	4635554	4635565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849150
3538	NC_017803	CACGAT	2	12	4635827	4635838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386849150
3539	NC_017803	GGTCCG	2	12	4636442	4636453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849151
3540	NC_017803	TCCGGA	2	12	4636662	4636673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849152
3541	NC_017803	AGGGTG	2	12	4637642	4637653	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386849153
3542	NC_017803	TGCCGT	2	12	4637799	4637810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386849153
3543	NC_017803	GGTGTC	2	12	4638752	4638763	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849155
3544	NC_017803	CGAGGA	2	12	4645116	4645127	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849161
3545	NC_017803	GAGACC	2	12	4648805	4648816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386849165
3546	NC_017803	CGGCCC	2	12	4650251	4650262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386849167
3547	NC_017803	CGCCGA	2	12	4651128	4651139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849168
3548	NC_017803	CTGGCC	2	12	4652204	4652215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849169
3549	NC_017803	ACGGGC	2	12	4655613	4655624	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849173
3550	NC_017803	CGGGCG	2	12	4655798	4655809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386849173
3551	NC_017803	CGGCCG	2	12	4655921	4655932	0 %	0 %	50 %	50 %	386849174
3552	NC_017803	GCAGGA	2	12	4656696	4656707	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849174
3553	NC_017803	GGGTCA	2	12	4657446	4657457	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849175
3554	NC_017803	CGCCGG	2	12	4659817	4659828	0 %	0 %	50 %	50 %	386849177
3555	NC_017803	GCCGGC	2	12	4660998	4661009	0 %	0 %	50 %	50 %	386849179
3556	NC_017803	CTGGAC	2	12	4661331	4661342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849179
3557	NC_017803	CCGGCG	2	12	4662107	4662118	0 %	0 %	50 %	50 %	386849180
3558	NC_017803	GCCGAA	2	12	4662486	4662497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386849180
3559	NC_017803	CGATGG	2	12	4665838	4665849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849184
3560	NC_017803	GGCGAG	2	12	4666060	4666071	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386849185
3561	NC_017803	CGTCGA	2	12	4668526	4668537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849190
3562	NC_017803	GACGGC	2	12	4669283	4669294	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849190
3563	NC_017803	CCCGGG	2	12	4670269	4670280	0 %	0 %	50 %	50 %	386849192
3564	NC_017803	CCGCAT	2	12	4670364	4670375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849192
3565	NC_017803	CGTTGC	2	12	4670450	4670461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386849192
3566	NC_017803	CCGCTG	2	12	4670637	4670648	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849192
3567	NC_017803	GGGGAC	2	12	4670652	4670663	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386849192
3568	NC_017803	AGGTGA	2	12	4674554	4674565	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386849198
3569	NC_017803	CGTCGA	2	12	4677395	4677406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849202
3570	NC_017803	GGCAGC	3	18	4680739	4680756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849207
3571	NC_017803	TCGTTG	2	12	4682853	4682864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386849208
3572	NC_017803	CGGTGT	2	12	4683100	4683111	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849208
3573	NC_017803	TCGGCG	2	12	4684269	4684280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849208
3574	NC_017803	CGCCCG	2	12	4687326	4687337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386849210
3575	NC_017803	GGGCGC	2	12	4689186	4689197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386849212
3576	NC_017803	GGGCGA	2	12	4695027	4695038	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386849217
3577	NC_017803	TCAGCG	2	12	4695216	4695227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849217
3578	NC_017803	CGAGGC	2	12	4695731	4695742	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849218
3579	NC_017803	GGCCAG	2	12	4696182	4696193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849218
3580	NC_017803	ACGAAC	2	12	4697505	4697516	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386849219
3581	NC_017803	GCCGCG	2	12	4699504	4699515	0 %	0 %	50 %	50 %	386849222
3582	NC_017803	CGCGCT	2	12	4699913	4699924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849223
3583	NC_017803	CAGCCG	2	12	4700375	4700386	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849224
3584	NC_017803	GGCCAC	2	12	4700611	4700622	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849225
3585	NC_017803	GATCAC	2	12	4700665	4700676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386849225
3586	NC_017803	CATCGT	2	12	4701012	4701023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386849225
3587	NC_017803	TCGCCC	2	12	4705508	4705519	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386849226
3588	NC_017803	TGCCGT	2	12	4711246	4711257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386849233
3589	NC_017803	GAACGG	2	12	4711709	4711720	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849233
3590	NC_017803	GGTGGC	2	12	4712324	4712335	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386849233
3591	NC_017803	TGCCCG	2	12	4712679	4712690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849234
3592	NC_017803	GCGCGA	2	12	4713352	4713363	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849234
3593	NC_017803	CCGCGG	2	12	4713986	4713997	0 %	0 %	50 %	50 %	386849235
3594	NC_017803	GCCGGC	2	12	4714005	4714016	0 %	0 %	50 %	50 %	386849235
3595	NC_017803	CCCGCG	2	12	4715469	4715480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386849236
3596	NC_017803	CCGGCC	2	12	4718245	4718256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386849240
3597	NC_017803	CCTGAC	2	12	4720135	4720146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849242
3598	NC_017803	GCTGTT	2	12	4721171	4721182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386849244
3599	NC_017803	GACCGC	2	12	4723042	4723053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849246
3600	NC_017803	GAGCAG	2	12	4723088	4723099	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386849246
3601	NC_017803	CCCCGA	2	12	4726167	4726178	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386849249
3602	NC_017803	CCCACC	2	12	4726460	4726471	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386849249
3603	NC_017803	CGCCGA	2	12	4727851	4727862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849250
3604	NC_017803	CGACCG	2	12	4728397	4728408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849250
3605	NC_017803	GTCACC	2	12	4729110	4729121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849251
3606	NC_017803	CATCTT	2	12	4729310	4729321	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386849251
3607	NC_017803	GGCACC	2	12	4729362	4729373	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849251
3608	NC_017803	CTCCGC	2	12	4729710	4729721	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386849252
3609	NC_017803	CGGAGC	2	12	4729941	4729952	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386849252
3610	NC_017803	GGCTCC	2	12	4730089	4730100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849252
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3614	NC_017803	CGGTGA	2	12	4735210	4735221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849259
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3712	NC_017803	GACCTG	2	12	4850047	4850058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849383
3713	NC_017803	CGCCGG	2	12	4850154	4850165	0 %	0 %	50 %	50 %	386849383
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3719	NC_017803	CACCGC	2	12	4855642	4855653	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386849388
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3832	NC_017803	AAGCGC	2	12	4982577	4982588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386849514
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