MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017803	GCCGTA	2	12	7861768	7861779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852052
6002	NC_017803	CGCGGC	2	12	7863754	7863765	0 %	0 %	50 %	50 %	386852055
6003	NC_017803	GCAGCC	2	12	7869677	7869688	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852064
6004	NC_017803	TCGCTG	2	12	7869847	7869858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852064
6005	NC_017803	CCGGCG	2	12	7870490	7870501	0 %	0 %	50 %	50 %	386852064
6006	NC_017803	TCGGCG	2	12	7870606	7870617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852064
6007	NC_017803	CCTCGG	2	12	7873601	7873612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852068
6008	NC_017803	CGTCGA	2	12	7874961	7874972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852069
6009	NC_017803	CGGGCC	2	12	7877468	7877479	0 %	0 %	50 %	50 %	386852070
6010	NC_017803	TCCAGC	2	12	7879164	7879175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852073
6011	NC_017803	TGCACC	2	12	7879389	7879400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852073
6012	NC_017803	TCATCC	2	12	7881463	7881474	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386852075
6013	NC_017803	GCGGCA	2	12	7884072	7884083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852076
6014	NC_017803	CCCGGC	2	12	7885315	7885326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386852077
6015	NC_017803	GAGCTG	2	12	7887159	7887170	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852080
6016	NC_017803	GGCCAG	2	12	7888749	7888760	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852081
6017	NC_017803	CCGGCG	2	12	7889203	7889214	0 %	0 %	50 %	50 %	386852081
6018	NC_017803	GGTGGC	2	12	7889376	7889387	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852081
6019	NC_017803	CGGAGC	2	12	7892802	7892813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852083
6020	NC_017803	GTTCGT	2	12	7893331	7893342	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386852083
6021	NC_017803	CCGTCG	2	12	7897049	7897060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852087
6022	NC_017803	TCCGGG	2	12	7897625	7897636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852088
6023	NC_017803	GTCGGC	2	12	7897666	7897677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852088
6024	NC_017803	GCCACC	2	12	7898068	7898079	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852088
6025	NC_017803	GGCGCG	2	12	7899627	7899638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852089
6026	NC_017803	ACCCGG	2	12	7899910	7899921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852089
6027	NC_017803	GCCGAG	2	12	7903646	7903657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852092
6028	NC_017803	GGCCGC	2	12	7905771	7905782	0 %	0 %	50 %	50 %	386852094
6029	NC_017803	AGGTGG	2	12	7907779	7907790	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386852096
6030	NC_017803	ACCGCG	2	12	7911480	7911491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852100
6031	NC_017803	CCGCTC	2	12	7916676	7916687	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852105
6032	NC_017803	CGATGA	2	12	7920880	7920891	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386852107
6033	NC_017803	CGACCG	2	12	7924025	7924036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852110
6034	NC_017803	GACCCG	2	12	7924748	7924759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852111
6035	NC_017803	CGCCGG	2	12	7926207	7926218	0 %	0 %	50 %	50 %	386852112
6036	NC_017803	GCTGGC	2	12	7926822	7926833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852113
6037	NC_017803	ACCGAG	2	12	7932381	7932392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852114
6038	NC_017803	CGGGTG	2	12	7932552	7932563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852114
6039	NC_017803	CCGGGT	2	12	7933135	7933146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852114
6040	NC_017803	AGCCGG	2	12	7937355	7937366	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852117
6041	NC_017803	GCCTCG	2	12	7938737	7938748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852119
6042	NC_017803	CCCGGA	2	12	7941878	7941889	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852123
6043	NC_017803	CTCGGC	2	12	7942020	7942031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852123
6044	NC_017803	GACCGC	2	12	7946191	7946202	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852126
6045	NC_017803	GCCCGG	2	12	7947310	7947321	0 %	0 %	50 %	50 %	386852128
6046	NC_017803	GCCGCG	2	12	7948351	7948362	0 %	0 %	50 %	50 %	386852128
6047	NC_017803	ACGTAG	2	12	7949111	7949122	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386852129
6048	NC_017803	TGGGCG	2	12	7949234	7949245	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852129
6049	NC_017803	GCGGTG	2	12	7950672	7950683	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852130
6050	NC_017803	GCTCGG	2	12	7952512	7952523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852132
6051	NC_017803	CCGCAG	4	24	7958517	7958540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852139
6052	NC_017803	AGTTGT	2	12	7959510	7959521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386852139
6053	NC_017803	GGCCTC	2	12	7960111	7960122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852139
6054	NC_017803	CCCGGT	2	12	7962692	7962703	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852142
6055	NC_017803	CGCGGC	2	12	7962980	7962991	0 %	0 %	50 %	50 %	386852142
6056	NC_017803	CGGCTG	2	12	7963836	7963847	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852142
6057	NC_017803	CGAGGA	2	12	7965121	7965132	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386852143
6058	NC_017803	GCCCGC	2	12	7965512	7965523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386852144
6059	NC_017803	CCCGAG	2	12	7966624	7966635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852145
6060	NC_017803	AGGGCG	2	12	7967003	7967014	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852145
6061	NC_017803	AGGCCG	2	12	7967270	7967281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852145
6062	NC_017803	GACGGC	2	12	7967680	7967691	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852145
6063	NC_017803	TCGGCC	2	12	7968506	7968517	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852146
6064	NC_017803	CTCCGG	2	12	7969063	7969074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852146
6065	NC_017803	CAGCGC	2	12	7969171	7969182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852146
6066	NC_017803	GGGTCG	2	12	7969396	7969407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852147
6067	NC_017803	CGCTTG	2	12	7970707	7970718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852149
6068	NC_017803	CGGAGG	2	12	7970876	7970887	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852149
6069	NC_017803	CCGAGC	2	12	7971961	7971972	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852150
6070	NC_017803	GATGCC	2	12	7972445	7972456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852150
6071	NC_017803	GTCCTC	2	12	7972979	7972990	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386852150
6072	NC_017803	CCTGAC	2	12	7973176	7973187	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852150
6073	NC_017803	GCCACC	2	12	7973393	7973404	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852151
6074	NC_017803	ACCGCC	2	12	7973450	7973461	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852151
6075	NC_017803	GCCACC	2	12	7973486	7973497	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852151
6076	NC_017803	CCACCG	2	12	7973526	7973537	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852151
6077	NC_017803	CGCGGC	2	12	7981284	7981295	0 %	0 %	50 %	50 %	386852161
6078	NC_017803	CGGTGA	2	12	7983831	7983842	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852163
6079	NC_017803	GCCTCG	2	12	7985576	7985587	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852165
6080	NC_017803	GCGGCC	2	12	7985939	7985950	0 %	0 %	50 %	50 %	386852165
6081	NC_017803	ATCCGC	2	12	7985962	7985973	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852165
6082	NC_017803	GCCGAA	2	12	7988930	7988941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852167
6083	NC_017803	GCCATC	2	12	7989354	7989365	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852167
6084	NC_017803	CCTGCG	2	12	7991652	7991663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852168
6085	NC_017803	GCACCG	2	12	7992351	7992362	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852169
6086	NC_017803	CCGGAT	2	12	7994946	7994957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852172
6087	NC_017803	AGGGCC	2	12	7998949	7998960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852176
6088	NC_017803	GTAGAG	2	12	8000388	8000399	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386852176
6089	NC_017803	CGGGTT	2	12	8001148	8001159	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852177
6090	NC_017803	CAACCG	2	12	8001221	8001232	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852177
6091	NC_017803	CCACCG	2	12	8002843	8002854	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852179
6092	NC_017803	AAGCCG	2	12	8004373	8004384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852180
6093	NC_017803	TTGCCG	2	12	8005620	8005631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852182
6094	NC_017803	GGCCAG	2	12	8007592	8007603	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852183
6095	NC_017803	GAACGG	2	12	8009209	8009220	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386852185
6096	NC_017803	CGGTCG	2	12	8010579	8010590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852186
6097	NC_017803	CCGGCG	2	12	8011787	8011798	0 %	0 %	50 %	50 %	386852187
6098	NC_017803	AGTCGC	2	12	8013762	8013773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852188
6099	NC_017803	CGGCCC	2	12	8015261	8015272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386852190
6100	NC_017803	GAGCCC	2	12	8016294	8016305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852191
6101	NC_017803	CGAGGT	2	12	8016842	8016853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852191
6102	NC_017803	GCCGGC	2	12	8018964	8018975	0 %	0 %	50 %	50 %	386852194
6103	NC_017803	ATGCCG	2	12	8019796	8019807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852195
6104	NC_017803	CTTCTC	2	12	8020882	8020893	0 %	50 %	0 %	50 %	386852196
6105	NC_017803	GGCCCG	2	12	8023007	8023018	0 %	0 %	50 %	50 %	386852198
6106	NC_017803	CGACGG	2	12	8031172	8031183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852208
6107	NC_017803	GGACGG	2	12	8033235	8033246	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852210
6108	NC_017803	CGACGC	2	12	8034582	8034593	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852212
6109	NC_017803	GATCAC	2	12	8035236	8035247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386852213
6110	NC_017803	GGCCTC	2	12	8036685	8036696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386852216
6111	NC_017803	CTCGTC	2	12	8037386	8037397	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386852217
6112	NC_017803	GGCCGG	2	12	8039966	8039977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852220
6113	NC_017803	CCGGCC	2	12	8040075	8040086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386852220
6114	NC_017803	GCGATC	2	12	8040150	8040161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852220
6115	NC_017803	TCGGCA	2	12	8040742	8040753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852220
6116	NC_017803	CTGACC	2	12	8041062	8041073	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852220
6117	NC_017803	AGAGCC	2	12	8044731	8044742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852224
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6119	NC_017803	GCTGGT	2	12	8051672	8051683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852230
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6121	NC_017803	CACCCA	2	12	8054810	8054821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386852232
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6124	NC_017803	GCCACC	2	12	8060620	8060631	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852235
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6126	NC_017803	ACCAGC	2	12	8061704	8061715	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852236
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6130	NC_017803	AGGTCG	2	12	8065471	8065482	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386852237
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6132	NC_017803	AAGTCG	2	12	8067966	8067977	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386852240
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6141	NC_017803	CAGCCG	2	12	8074480	8074491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852246
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6152	NC_017803	CCTCGC	2	12	8088165	8088176	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852257
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6164	NC_017803	CGCGAT	2	12	8102436	8102447	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852273
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6213	NC_017803	GGCACC	2	12	8165270	8165281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852319
6214	NC_017803	CCGCCA	2	12	8176999	8177010	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386852327
6215	NC_017803	GCCAGA	2	12	8177451	8177462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852327
6216	NC_017803	CCGGGC	2	12	8177793	8177804	0 %	0 %	50 %	50 %	386852328
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6218	NC_017803	GGTGAG	2	12	8178237	8178248	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	386852328
6219	NC_017803	GCCGGC	2	12	8178324	8178335	0 %	0 %	50 %	50 %	386852328
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6221	NC_017803	CTTGCG	2	12	8179118	8179129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386852329
6222	NC_017803	GGTCTG	2	12	8181762	8181773	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852332
6223	NC_017803	CGGTGC	2	12	8182675	8182686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852334
6224	NC_017803	GCCGGC	2	12	8182993	8183004	0 %	0 %	50 %	50 %	386852334
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6226	NC_017803	CGCGAG	2	12	8185400	8185411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852336
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6229	NC_017803	CGGCCG	2	12	8187918	8187929	0 %	0 %	50 %	50 %	386852338
6230	NC_017803	GCACGT	2	12	8189162	8189173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852341
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6233	NC_017803	GCCGGC	2	12	8197307	8197318	0 %	0 %	50 %	50 %	386852345
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6240	NC_017803	CGGCGA	2	12	8203617	8203628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386852348
6241	NC_017803	GCGGCC	2	12	8203778	8203789	0 %	0 %	50 %	50 %	386852348
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6243	NC_017803	ACCTCG	2	12	8204814	8204825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852349
6244	NC_017803	CAGCGC	2	12	8208261	8208272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852352
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6319	NC_017803	CGGCTA	2	12	8308094	8308105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852448
6320	NC_017803	GTGGCG	2	12	8310411	8310422	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386852450
6321	NC_017803	CCGGAT	2	12	8311929	8311940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852453
6322	NC_017803	GGTGCC	2	12	8312044	8312055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852453
6323	NC_017803	GCCAGC	2	12	8312666	8312677	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852453
6324	NC_017803	CGGGTT	2	12	8312860	8312871	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386852453
6325	NC_017803	ACCAGC	2	12	8313600	8313611	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852454
6326	NC_017803	GGCGAG	2	12	8314073	8314084	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852454
6327	NC_017803	TCGATG	2	12	8315427	8315438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386852456
6328	NC_017803	TGCCGG	2	12	8317014	8317025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386852457
6329	NC_017803	ACGACC	2	12	8322263	8322274	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386852462
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6331	NC_017803	GGCACC	2	12	8326273	8326284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386852467
6332	NC_017803	AGGGCG	2	12	8326696	8326707	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386852467
6333	NC_017803	ACGGCA	2	12	8329059	8329070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386852469
6334	NC_017803	CCGCTC	2	12	8329710	8329721	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386852470
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6442	NC_017803	GGCCGG	2	12	8452714	8452725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852585
6443	NC_017803	GACCTG	2	12	8453744	8453755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386852585
6444	NC_017803	GGCCGG	2	12	8453962	8453973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386852585
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6475	NC_017803	CTGACC	2	12	8502498	8502509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386852635
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