MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017803	GCCCTG	2	12	3889894	3889905	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848484
3002	NC_017803	CGGCAT	2	12	3890133	3890144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848484
3003	NC_017803	ACATGC	2	12	3890534	3890545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386848484
3004	NC_017803	CGACGG	2	12	3891745	3891756	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848485
3005	NC_017803	AGCGGG	2	12	3896643	3896654	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848489
3006	NC_017803	GCGCAG	2	12	3897515	3897526	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848490
3007	NC_017803	AGGCGG	2	12	3899101	3899112	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848491
3008	NC_017803	TGGTCG	2	12	3901939	3901950	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386848491
3009	NC_017803	CCGACG	2	12	3902507	3902518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848492
3010	NC_017803	TGGCCG	2	12	3905315	3905326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848496
3011	NC_017803	TGCCGA	2	12	3906546	3906557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848498
3012	NC_017803	TGGTCG	2	12	3907047	3907058	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386848499
3013	NC_017803	CGCGGC	2	12	3909172	3909183	0 %	0 %	50 %	50 %	386848503
3014	NC_017803	TCGGCG	2	12	3909915	3909926	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848504
3015	NC_017803	GGGAGC	2	12	3910505	3910516	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848505
3016	NC_017803	ACGTTG	2	12	3912411	3912422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386848507
3017	NC_017803	ACCGCC	2	12	3914154	3914165	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386848507
3018	NC_017803	CCGGCA	2	12	3917155	3917166	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848510
3019	NC_017803	CGCCGA	2	12	3919259	3919270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848510
3020	NC_017803	GCCACC	2	12	3921201	3921212	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386848510
3021	NC_017803	GTTCTT	2	12	3922338	3922349	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386848511
3022	NC_017803	GTTCTG	2	12	3922620	3922631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386848511
3023	NC_017803	GTCCGC	2	12	3922791	3922802	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848511
3024	NC_017803	CACCGA	2	12	3923037	3923048	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386848511
3025	NC_017803	CCCGGT	2	12	3926903	3926914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848512
3026	NC_017803	GCGACC	2	12	3928969	3928980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848513
3027	NC_017803	GCACGC	2	12	3929394	3929405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848513
3028	NC_017803	CGGCTG	2	12	3929551	3929562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848513
3029	NC_017803	GAGCAG	2	12	3930901	3930912	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386848514
3030	NC_017803	AGCCGG	2	12	3931343	3931354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848514
3031	NC_017803	TCGCCG	2	12	3934050	3934061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848517
3032	NC_017803	TCGCCA	2	12	3934239	3934250	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386848517
3033	NC_017803	GCGGTC	2	12	3934969	3934980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848519
3034	NC_017803	GTGCAG	2	12	3939109	3939120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386848524
3035	NC_017803	CGGCCA	2	12	3942389	3942400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848527
3036	NC_017803	GGCGAG	2	12	3943410	3943421	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848527
3037	NC_017803	GCCGGA	2	12	3944021	3944032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848528
3038	NC_017803	TTCGCC	2	12	3944678	3944689	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386848529
3039	NC_017803	GGTGCT	2	12	3945714	3945725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386848530
3040	NC_017803	GTCGAC	2	12	3946472	3946483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848531
3041	NC_017803	ACCGCT	2	12	3947015	3947026	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386848531
3042	NC_017803	TGGGTG	2	12	3947313	3947324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386848531
3043	NC_017803	GGGTCC	2	12	3948917	3948928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848533
3044	NC_017803	CGCAGC	2	12	3952110	3952121	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848537
3045	NC_017803	ACGTCG	2	12	3954382	3954393	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848539
3046	NC_017803	CCACGG	2	12	3959875	3959886	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848543
3047	NC_017803	GGGGTG	2	12	3960705	3960716	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	386848543
3048	NC_017803	CAGGAC	2	12	3962819	3962830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386848545
3049	NC_017803	TGCGCC	2	12	3967679	3967690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848549
3050	NC_017803	CGGCTG	2	12	3968603	3968614	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848549
3051	NC_017803	CCAGCA	2	12	3968685	3968696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386848549
3052	NC_017803	GCCCCA	2	12	3970918	3970929	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386848550
3053	NC_017803	GACGGT	2	12	3972762	3972773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386848551
3054	NC_017803	GACGGC	2	12	3973080	3973091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848551
3055	NC_017803	TGCCGG	2	12	3974758	3974769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848554
3056	NC_017803	CGCGGT	2	12	3976546	3976557	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848556
3057	NC_017803	TCGACG	2	12	3978256	3978267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848558
3058	NC_017803	CGAGGA	2	12	3978332	3978343	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386848558
3059	NC_017803	GCCTGG	2	12	3980107	3980118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848560
3060	NC_017803	CGGCAG	2	12	3980646	3980657	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848562
3061	NC_017803	CGGCCA	2	12	3982131	3982142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848564
3062	NC_017803	GCGGGC	2	12	3982193	3982204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386848564
3063	NC_017803	GCATCG	2	12	3982848	3982859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848564
3064	NC_017803	TCTGGT	2	12	3985630	3985641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386848566
3065	NC_017803	CCGGCC	2	12	3987356	3987367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386848566
3066	NC_017803	CCGTCG	2	12	3989154	3989165	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848567
3067	NC_017803	TTGGCG	2	12	3989747	3989758	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386848567
3068	NC_017803	ACCGGC	2	12	3991185	3991196	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848568
3069	NC_017803	TGGCCA	2	12	3991300	3991311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848568
3070	NC_017803	GGTCGC	2	12	3991946	3991957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848569
3071	NC_017803	GGCTGC	2	12	3993259	3993270	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848571
3072	NC_017803	GACCGG	2	12	3993912	3993923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848571
3073	NC_017803	CCGACG	2	12	3999115	3999126	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848571
3074	NC_017803	CGCGGA	2	12	4000145	4000156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848572
3075	NC_017803	GCAGGC	2	12	4001395	4001406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848573
3076	NC_017803	CGGCCT	2	12	4003042	4003053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848573
3077	NC_017803	CCGGCC	2	12	4003474	4003485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386848573
3078	NC_017803	TGCCGG	2	12	4003908	4003919	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848573
3079	NC_017803	TCGACG	2	12	4004383	4004394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848574
3080	NC_017803	GCCTTC	2	12	4005999	4006010	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386848574
3081	NC_017803	GCCGAG	2	12	4007394	4007405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848575
3082	NC_017803	GGTCGC	2	12	4010377	4010388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848578
3083	NC_017803	GAGTTC	2	12	4010555	4010566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386848578
3084	NC_017803	CGCCAC	2	12	4012396	4012407	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386848579
3085	NC_017803	CGGAGG	2	12	4015622	4015633	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848584
3086	NC_017803	CGCCGG	2	12	4016402	4016413	0 %	0 %	50 %	50 %	386848584
3087	NC_017803	TGCCCT	2	12	4016477	4016488	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386848584
3088	NC_017803	TCGGCG	2	12	4023660	4023671	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848589
3089	NC_017803	GTACCG	2	12	4024016	4024027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848589
3090	NC_017803	GTCGTA	2	12	4025018	4025029	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386848589
3091	NC_017803	GGGCCG	2	12	4025344	4025355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386848589
3092	NC_017803	AGATCG	2	12	4026513	4026524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386848589
3093	NC_017803	GAGCTG	2	12	4027316	4027327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386848589
3094	NC_017803	CGGCTG	2	12	4029493	4029504	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848592
3095	NC_017803	CCTCGA	2	12	4029708	4029719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386848592
3096	NC_017803	CCACCC	2	12	4032208	4032219	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	386848594
3097	NC_017803	GTGGCG	2	12	4034023	4034034	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386848596
3098	NC_017803	GCCTCG	2	12	4034281	4034292	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848596
3099	NC_017803	TCCTGA	2	12	4039054	4039065	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386848600
3100	NC_017803	TGCCGT	2	12	4039457	4039468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386848601
3101	NC_017803	ACCGGG	2	12	4039720	4039731	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848601
3102	NC_017803	GCGATC	2	12	4040496	4040507	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848602
3103	NC_017803	CCTGGA	2	12	4049442	4049453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848609
3104	NC_017803	TTGCCG	2	12	4050169	4050180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386848610
3105	NC_017803	CGCCGA	2	12	4056812	4056823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848613
3106	NC_017803	GACCCG	2	12	4059389	4059400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848616
3107	NC_017803	GCACAT	2	12	4063287	4063298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386848619
3108	NC_017803	TGGCCC	2	12	4065005	4065016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848619
3109	NC_017803	CGACGC	2	12	4065021	4065032	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848619
3110	NC_017803	CGGGCT	2	12	4068090	4068101	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386848622
3111	NC_017803	CGCCGA	2	12	4072119	4072130	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848624
3112	NC_017803	CGTCCT	2	12	4072279	4072290	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386848625
3113	NC_017803	CTGCCG	2	12	4072331	4072342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848625
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3203	NC_017803	CGGTCT	2	12	4180231	4180242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386848711
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3205	NC_017803	GGCACC	3	18	4183460	4183477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848714
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3211	NC_017803	GCCCGC	2	12	4187745	4187756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386848719
3212	NC_017803	AGCGCG	2	12	4188409	4188420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386848720
3213	NC_017803	GGTTCG	2	12	4188769	4188780	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386848720
3214	NC_017803	GACGGG	2	12	4190481	4190492	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386848720
3215	NC_017803	CTCGTC	2	12	4190840	4190851	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	386848720
3216	NC_017803	CTGGCC	2	12	4191357	4191368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848721
3217	NC_017803	GCCAAG	2	12	4191835	4191846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386848722
3218	NC_017803	CCGCTG	2	12	4192864	4192875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386848723
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3220	NC_017803	CCGACG	2	12	4193528	4193539	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386848723
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3328	NC_017803	GCCACC	2	12	4328302	4328313	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386848855
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3437	NC_017803	CCAGGT	2	12	4460978	4460989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848999
3438	NC_017803	TCAGCG	2	12	4461161	4461172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386848999
3439	NC_017803	GTCGCC	2	12	4464357	4464368	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386849002
3440	NC_017803	CGAGCC	2	12	4464374	4464385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849002
3441	NC_017803	TCGCTG	2	12	4464814	4464825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386849002
3442	NC_017803	CGGGGC	2	12	4470352	4470363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386849008
3443	NC_017803	GCCGCG	2	12	4470431	4470442	0 %	0 %	50 %	50 %	386849008
3444	NC_017803	GATCGG	2	12	4471478	4471489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849009
3445	NC_017803	CCAGCG	2	12	4472326	4472337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849009
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3459	NC_017803	TCGGCG	2	12	4501466	4501477	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849038
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3462	NC_017803	TGCCGA	2	12	4508477	4508488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849047
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3469	NC_017803	ACCTGG	2	12	4511640	4511651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386849049
3470	NC_017803	CTCGGT	2	12	4511759	4511770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386849049
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3473	NC_017803	GGTGCG	2	12	4519754	4519765	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386849056
3474	NC_017803	TCGGCG	2	12	4521576	4521587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386849057
3475	NC_017803	CCCGCA	2	12	4526790	4526801	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386849060
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3492	NC_017803	GTCGGT	2	12	4559724	4559735	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386849082
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3498	NC_017803	CAGCGC	2	12	4568118	4568129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386849090
3499	NC_017803	CTGCAC	2	12	4571212	4571223	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386849093
3500	NC_017803	GGTGAC	2	12	4572014	4572025	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386849094

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