MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Actinoplanes sp. SE50/110 chromosome

Total Repeats: 7034

< Previous123456789101112131415Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017803	GATCGT	2	12	9200523	9200534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386853285
7002	NC_017803	ACGAGC	2	12	9200558	9200569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853285
7003	NC_017803	GCTGGC	2	12	9202207	9202218	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386853286
7004	NC_017803	CCGGGT	2	12	9202690	9202701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386853286
7005	NC_017803	CCGAGA	2	12	9205439	9205450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386853289
7006	NC_017803	GTACAC	2	12	9205521	9205532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386853289
7007	NC_017803	CTCCAG	2	12	9207128	9207139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386853291
7008	NC_017803	CACCGG	2	12	9207221	9207232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853291
7009	NC_017803	GGGGCA	2	12	9208913	9208924	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386853292
7010	NC_017803	CGGATC	2	12	9209155	9209166	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853292
7011	NC_017803	CGCGGC	2	12	9211346	9211357	0 %	0 %	50 %	50 %	386853293
7012	NC_017803	GTGCTG	2	12	9212667	9212678	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386853295
7013	NC_017803	GCCTCG	2	12	9213731	9213742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386853296
7014	NC_017803	GCCCGT	2	12	9215191	9215202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386853297
7015	NC_017803	GCCGCT	2	12	9215638	9215649	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386853297
7016	NC_017803	CTCGGC	2	12	9217825	9217836	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386853298
7017	NC_017803	GCGATC	2	12	9218532	9218543	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853299
7018	NC_017803	CGAGGA	2	12	9218939	9218950	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386853299
7019	NC_017803	GGTCGG	2	12	9219032	9219043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386853299
7020	NC_017803	GTCAAC	2	12	9219660	9219671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386853299
7021	NC_017803	GTGGGC	2	12	9221716	9221727	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386853301
7022	NC_017803	CCGAGC	2	12	9223394	9223405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853304
7023	NC_017803	GAGGCG	2	12	9223789	9223800	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386853304
7024	NC_017803	AGCCGC	2	12	9224591	9224602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853305
7025	NC_017803	TTCTCG	2	12	9226455	9226466	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386853306
7026	NC_017803	GGCGGT	2	12	9227008	9227019	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386853307
7027	NC_017803	GCCCCG	2	12	9227686	9227697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386853308
7028	NC_017803	CTCCAC	2	12	9228459	9228470	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	386853308
7029	NC_017803	TCAGGC	2	12	9231800	9231811	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853309
7030	NC_017803	GCGCCG	2	12	9232943	9232954	0 %	0 %	50 %	50 %	386853310
7031	NC_017803	GTCGGC	2	12	9235544	9235555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386853312
7032	NC_017803	ACGTCG	2	12	9235947	9235958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853312
7033	NC_017803	GGCACC	2	12	9235974	9235985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	386853312
7034	NC_017803	TGCGCA	2	12	9238577	9238588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386853316

< Previous123456789101112131415Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.