MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017186	GTGCTC	2	12	9718109	9718120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154203
7502	NC_017186	GCTGAC	2	12	9718189	9718200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154203
7503	NC_017186	CTACAC	2	12	9719556	9719567	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384154204
7504	NC_017186	TGGCTG	2	12	9720261	9720272	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154205
7505	NC_017186	CGAACA	2	12	9720954	9720965	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384154206
7506	NC_017186	GGCCTG	2	12	9723620	9723631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154209
7507	NC_017186	GTTCCC	2	12	9725257	9725268	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384154211
7508	NC_017186	CGGTCT	2	12	9726242	9726253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154212
7509	NC_017186	CGGCGC	2	12	9728681	9728692	0 %	0 %	50 %	50 %	384154214
7510	NC_017186	GCCAGC	2	12	9728842	9728853	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154214
7511	NC_017186	GAAGGC	2	12	9733164	9733175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384154218
7512	NC_017186	GTTCGC	2	12	9734353	9734364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154219
7513	NC_017186	ATGTCG	2	12	9736188	9736199	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384154221
7514	NC_017186	TCGGCG	2	12	9736203	9736214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154221
7515	NC_017186	CGGGCT	2	12	9737617	9737628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154222
7516	NC_017186	CGACTT	2	12	9738849	9738860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384154224
7517	NC_017186	ACACCG	2	12	9739880	9739891	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384154224
7518	NC_017186	ACGGCG	2	12	9739994	9740005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154224
7519	NC_017186	GCATCG	2	12	9740219	9740230	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154224
7520	NC_017186	GCCGAG	2	12	9741124	9741135	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154225
7521	NC_017186	TCGCCA	2	12	9747558	9747569	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154233
7522	NC_017186	ACCTTG	2	12	9748341	9748352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384154235
7523	NC_017186	GCGCTG	2	12	9749897	9749908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154236
7524	NC_017186	TCCTTG	2	12	9750000	9750011	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384154236
7525	NC_017186	TGATCA	2	12	9750762	9750773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384154237
7526	NC_017186	GCGATC	2	12	9750893	9750904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154237
7527	NC_017186	CGGGTC	2	12	9751571	9751582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154238
7528	NC_017186	GCAGGT	2	12	9753719	9753730	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154240
7529	NC_017186	GTTGAA	2	12	9754707	9754718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384154240
7530	NC_017186	TCGCCG	2	12	9758634	9758645	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154244
7531	NC_017186	GTCGCC	2	12	9760883	9760894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154245
7532	NC_017186	CGACCG	2	12	9761350	9761361	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154245
7533	NC_017186	TGGTGC	2	12	9763042	9763053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154247
7534	NC_017186	CGTCGC	2	12	9764584	9764595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154249
7535	NC_017186	ACGCGG	2	12	9765985	9765996	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154251
7536	NC_017186	CTCGGC	2	12	9768011	9768022	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154254
7537	NC_017186	CGGTAG	2	12	9768138	9768149	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154254
7538	NC_017186	GCCGAG	2	12	9769898	9769909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154256
7539	NC_017186	CTCGAC	2	12	9770282	9770293	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154256
7540	NC_017186	GAAGAT	2	12	9770417	9770428	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384154256
7541	NC_017186	CGCGCC	2	12	9770998	9771009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384154257
7542	NC_017186	GCCGGC	2	12	9771953	9771964	0 %	0 %	50 %	50 %	384154257
7543	NC_017186	CGGACG	2	12	9773362	9773373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154258
7544	NC_017186	CGTGGT	2	12	9774200	9774211	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154259
7545	NC_017186	GCTCGA	2	12	9774974	9774985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154261
7546	NC_017186	CGCCGG	2	12	9775931	9775942	0 %	0 %	50 %	50 %	384154262
7547	NC_017186	ATGCCG	2	12	9776334	9776345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154262
7548	NC_017186	GCCGAG	2	12	9779249	9779260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154264
7549	NC_017186	CGCGGC	2	12	9780274	9780285	0 %	0 %	50 %	50 %	384154265
7550	NC_017186	CCCGGC	2	12	9782955	9782966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384154266
7551	NC_017186	GACTCG	2	12	9783982	9783993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154267
7552	NC_017186	TCGCGG	2	12	9784295	9784306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154267
7553	NC_017186	ACGGCA	2	12	9786382	9786393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154269
7554	NC_017186	GCCAGC	2	12	9786422	9786433	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154269
7555	NC_017186	TCGCCC	2	12	9786945	9786956	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384154270
7556	NC_017186	GGCTGC	2	12	9787062	9787073	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154270
7557	NC_017186	GGTCGA	2	12	9787699	9787710	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154270
7558	NC_017186	CTCGGC	2	12	9791374	9791385	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154275
7559	NC_017186	CCGTCG	2	12	9792146	9792157	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154276
7560	NC_017186	CACGGT	2	12	9794220	9794231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154276
7561	NC_017186	GTCGGC	2	12	9795135	9795146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154277
7562	NC_017186	CGACGC	2	12	9797198	9797209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154280
7563	NC_017186	CCGCAG	2	12	9798095	9798106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154280
7564	NC_017186	AGCGCG	2	12	9798171	9798182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154280
7565	NC_017186	AGGTCG	2	12	9798456	9798467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154280
7566	NC_017186	TCGCCG	2	12	9798882	9798893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154281
7567	NC_017186	CGTCAA	2	12	9802139	9802150	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384154284
7568	NC_017186	GGCCGG	2	12	9803896	9803907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154286
7569	NC_017186	ATCGCG	2	12	9808963	9808974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154290
7570	NC_017186	GTGCTG	2	12	9810637	9810648	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154292
7571	NC_017186	GGCCGC	2	12	9812524	9812535	0 %	0 %	50 %	50 %	384154296
7572	NC_017186	TGGCGG	2	12	9813119	9813130	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384154297
7573	NC_017186	CGGTGA	2	12	9816649	9816660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154302
7574	NC_017186	GCGGGC	2	12	9817131	9817142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154303
7575	NC_017186	CCTTCC	2	12	9818065	9818076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384154303
7576	NC_017186	GGCCGC	2	12	9818837	9818848	0 %	0 %	50 %	50 %	384154303
7577	NC_017186	CGTGGC	2	12	9819188	9819199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154304
7578	NC_017186	CGCCCT	2	12	9819434	9819445	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384154305
7579	NC_017186	GGCTGT	2	12	9820350	9820361	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154306
7580	NC_017186	CGTGCT	2	12	9820462	9820473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154306
7581	NC_017186	GCACGA	2	12	9823162	9823173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154309
7582	NC_017186	CGATCA	2	12	9823821	9823832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384154310
7583	NC_017186	CCGGTT	2	12	9827242	9827253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154313
7584	NC_017186	TCACCG	2	12	9827554	9827565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154313
7585	NC_017186	CATGAT	2	12	9828070	9828081	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384154314
7586	NC_017186	TCGCCT	2	12	9829287	9829298	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384154315
7587	NC_017186	ACGAGG	2	12	9829512	9829523	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384154315
7588	NC_017186	GCACCG	2	12	9831293	9831304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154317
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7590	NC_017186	TGCCGG	2	12	9834427	9834438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154319
7591	NC_017186	ACCGGC	2	12	9835914	9835925	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154320
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7593	NC_017186	AGCCCG	2	12	9839306	9839317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154324
7594	NC_017186	GCCGGT	2	12	9839770	9839781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154324
7595	NC_017186	GGCTGC	2	12	9840125	9840136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154324
7596	NC_017186	CAGCTG	2	12	9844831	9844842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154329
7597	NC_017186	GTTCCA	2	12	9846709	9846720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384154331
7598	NC_017186	CGACAC	2	12	9847578	9847589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384154332
7599	NC_017186	ACCGGC	2	12	9848052	9848063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154333
7600	NC_017186	CATCGC	2	12	9848830	9848841	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154334
7601	NC_017186	CTGGTG	2	12	9849821	9849832	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154334
7602	NC_017186	GCGCGG	2	12	9850460	9850471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154335
7603	NC_017186	CTACCG	2	12	9851823	9851834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154337
7604	NC_017186	TCGACC	2	12	9852440	9852451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154338
7605	NC_017186	TCGAAC	2	12	9855804	9855815	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384154341
7606	NC_017186	GACCAG	2	12	9857581	9857592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154343
7607	NC_017186	GGCCGA	2	12	9858524	9858535	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154344
7608	NC_017186	CGAGCG	2	12	9858611	9858622	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154344
7609	NC_017186	GTCAGC	2	12	9860074	9860085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154345
7610	NC_017186	CGGCGT	2	12	9860180	9860191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154345
7611	NC_017186	CGTCCT	2	12	9861170	9861181	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384154346
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7717	NC_017186	CGCGGG	2	12	10010054	10010065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154502
7718	NC_017186	GCATCG	2	12	10010308	10010319	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154502
7719	NC_017186	CGCGGC	2	12	10010884	10010895	0 %	0 %	50 %	50 %	384154503
7720	NC_017186	CGCGCA	2	12	10012918	10012929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154506
7721	NC_017186	GAACGC	2	12	10013300	10013311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154506
7722	NC_017186	CGCCGG	2	12	10013599	10013610	0 %	0 %	50 %	50 %	384154506
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7724	NC_017186	GCTTCA	2	12	10016235	10016246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384154508
7725	NC_017186	CGCTGT	2	12	10017323	10017334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154509
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7745	NC_017186	CCGCGG	2	12	10050771	10050782	0 %	0 %	50 %	50 %	384154542
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7813	NC_017186	GACCAG	2	12	10146966	10146977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154632
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7818	NC_017186	GCTGGC	2	12	10152619	10152630	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154637
7819	NC_017186	CCGGTG	2	12	10153091	10153102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154638
7820	NC_017186	GGCAGC	2	12	10154292	10154303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154639
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7822	NC_017186	AACGTC	2	12	10158109	10158120	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384154646
7823	NC_017186	TACGGC	2	12	10160746	10160757	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154648
7824	NC_017186	GCGGCC	2	12	10160758	10160769	0 %	0 %	50 %	50 %	384154648
7825	NC_017186	GGGCCG	2	12	10163871	10163882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154652
7826	NC_017186	CCGTCG	2	12	10166351	10166362	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154652
7827	NC_017186	TCGGCA	2	12	10169131	10169142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154654
7828	NC_017186	ACCCGG	2	12	10169503	10169514	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154654
7829	NC_017186	GAGCGG	2	12	10170173	10170184	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384154655
7830	NC_017186	GGTGCT	2	12	10170990	10171001	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154656
7831	NC_017186	AGCTGC	2	12	10171349	10171360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154656
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7852	NC_017186	GACGTC	2	12	10211360	10211371	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154688
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7856	NC_017186	CCGGCC	2	12	10217070	10217081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384154692
7857	NC_017186	CGCGGC	2	12	10218631	10218642	0 %	0 %	50 %	50 %	384154694
7858	NC_017186	CCGCGG	2	12	10223217	10223228	0 %	0 %	50 %	50 %	384154697
7859	NC_017186	CGGCGC	2	12	10223332	10223343	0 %	0 %	50 %	50 %	384154697
7860	NC_017186	ATCGAC	2	12	10224890	10224901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384154699
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7866	NC_017186	GCCGGG	2	12	10234181	10234192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384154709

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