MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017186	CGCCTG	2	12	5701313	5701324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150359
4502	NC_017186	CGATCA	2	12	5705665	5705676	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384150365
4503	NC_017186	CGGCGT	2	12	5705824	5705835	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150365
4504	NC_017186	GCATCT	2	12	5706504	5706515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384150366
4505	NC_017186	TCGGCC	2	12	5706768	5706779	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150367
4506	NC_017186	CGACCG	2	12	5714891	5714902	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150373
4507	NC_017186	GTCGCG	2	12	5716634	5716645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150374
4508	NC_017186	CGGTGA	2	12	5717137	5717148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150374
4509	NC_017186	CCGGCC	2	12	5717900	5717911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150375
4510	NC_017186	CGGCAC	2	12	5718386	5718397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150376
4511	NC_017186	GGTGCA	2	12	5720999	5721010	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150379
4512	NC_017186	ACGGCG	2	12	5721369	5721380	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150380
4513	NC_017186	CAGCAC	2	12	5721398	5721409	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150380
4514	NC_017186	GTCGAG	2	12	5722065	5722076	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150381
4515	NC_017186	GCCGAC	2	12	5722092	5722103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150381
4516	NC_017186	CGGCGC	2	12	5722861	5722872	0 %	0 %	50 %	50 %	384150382
4517	NC_017186	CGCCGG	2	12	5723552	5723563	0 %	0 %	50 %	50 %	384150384
4518	NC_017186	CACCGC	2	12	5723597	5723608	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384150384
4519	NC_017186	CCGGCT	2	12	5724959	5724970	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150385
4520	NC_017186	GCGCCG	2	12	5725424	5725435	0 %	0 %	50 %	50 %	384150385
4521	NC_017186	CCTCGG	2	12	5725532	5725543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150385
4522	NC_017186	CGATGT	2	12	5725745	5725756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384150385
4523	NC_017186	CGGCCG	2	12	5726168	5726179	0 %	0 %	50 %	50 %	384150385
4524	NC_017186	GTCGAT	2	12	5728189	5728200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384150387
4525	NC_017186	ACCAGC	2	12	5729066	5729077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150387
4526	NC_017186	CGTGGT	2	12	5729642	5729653	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384150388
4527	NC_017186	CGTCGG	2	12	5731794	5731805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150389
4528	NC_017186	GCCGGC	2	12	5732905	5732916	0 %	0 %	50 %	50 %	384150389
4529	NC_017186	ACTGGG	2	12	5734244	5734255	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150390
4530	NC_017186	CACCGA	2	12	5735492	5735503	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150391
4531	NC_017186	CAGGAA	2	12	5736746	5736757	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384150392
4532	NC_017186	GCGACC	2	12	5737140	5737151	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150392
4533	NC_017186	CTTCTC	2	12	5737394	5737405	0 %	50 %	0 %	50 %	384150392
4534	NC_017186	ACGATG	2	12	5741973	5741984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384150394
4535	NC_017186	CTACCT	2	12	5743450	5743461	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384150395
4536	NC_017186	GGCCGC	2	12	5744281	5744292	0 %	0 %	50 %	50 %	384150395
4537	NC_017186	ACCGCG	2	12	5744486	5744497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150395
4538	NC_017186	GCGCCG	2	12	5750039	5750050	0 %	0 %	50 %	50 %	384150400
4539	NC_017186	TCGGCG	2	12	5750123	5750134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150400
4540	NC_017186	CGACCA	2	12	5751492	5751503	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150401
4541	NC_017186	TTCGAG	2	12	5752025	5752036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384150401
4542	NC_017186	CGCGGC	2	12	5752390	5752401	0 %	0 %	50 %	50 %	384150402
4543	NC_017186	GTTGGC	2	12	5753989	5754000	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384150403
4544	NC_017186	CGGCCG	2	12	5754132	5754143	0 %	0 %	50 %	50 %	384150403
4545	NC_017186	ACGGTG	2	12	5755537	5755548	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150404
4546	NC_017186	GGCCGC	2	12	5759918	5759929	0 %	0 %	50 %	50 %	384150407
4547	NC_017186	TTCTGC	2	12	5761162	5761173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384150408
4548	NC_017186	CCCGGT	2	12	5761995	5762006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150408
4549	NC_017186	TGCCGG	2	12	5763162	5763173	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150409
4550	NC_017186	GCGTCC	2	12	5763350	5763361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150409
4551	NC_017186	TCACCG	2	12	5764053	5764064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150409
4552	NC_017186	GCGACG	2	12	5764229	5764240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150409
4553	NC_017186	TCGCGA	2	12	5768650	5768661	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150412
4554	NC_017186	CTGTAC	2	12	5768940	5768951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384150412
4555	NC_017186	TTCAAG	2	12	5774531	5774542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384150418
4556	NC_017186	GTCGAG	2	12	5775378	5775389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150419
4557	NC_017186	GCAGCG	2	12	5776297	5776308	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150420
4558	NC_017186	CCAGCG	2	12	5777025	5777036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150421
4559	NC_017186	GCCGAC	2	12	5778688	5778699	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150424
4560	NC_017186	CCGAGG	2	12	5780344	5780355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150426
4561	NC_017186	TCGAAG	2	12	5780557	5780568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384150426
4562	NC_017186	TCGACG	2	12	5782187	5782198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150429
4563	NC_017186	GAAGGT	2	12	5782664	5782675	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384150430
4564	NC_017186	GCAGCT	2	12	5783809	5783820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150430
4565	NC_017186	CGAGCT	2	12	5784275	5784286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150431
4566	NC_017186	CGACGG	2	12	5784377	5784388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150431
4567	NC_017186	GGCCGG	2	12	5784658	5784669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384150431
4568	NC_017186	CCGCGG	2	12	5785757	5785768	0 %	0 %	50 %	50 %	384150433
4569	NC_017186	GTGGGT	2	12	5786605	5786616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384150434
4570	NC_017186	TCCACG	2	12	5786711	5786722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150434
4571	NC_017186	GCGCTC	2	12	5787103	5787114	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150435
4572	NC_017186	CCGAAC	2	12	5789732	5789743	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150440
4573	NC_017186	GCCCGG	2	12	5790409	5790420	0 %	0 %	50 %	50 %	384150441
4574	NC_017186	CCCGCA	2	12	5791255	5791266	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384150442
4575	NC_017186	ACCGCG	2	12	5791731	5791742	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150442
4576	NC_017186	CACGTC	2	12	5791833	5791844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150442
4577	NC_017186	TCCTGC	2	12	5793122	5793133	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384150443
4578	NC_017186	CTCGGC	2	12	5793142	5793153	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150443
4579	NC_017186	GACCGG	2	12	5796329	5796340	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150444
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4581	NC_017186	GAGCCG	2	12	5801704	5801715	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150450
4582	NC_017186	GTCGTA	2	12	5804172	5804183	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384150450
4583	NC_017186	CCATCG	2	12	5805680	5805691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150450
4584	NC_017186	CAGCCG	2	12	5806247	5806258	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150451
4585	NC_017186	GCCCCC	2	12	5807357	5807368	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384150453
4586	NC_017186	GCCGCT	2	12	5807666	5807677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150453
4587	NC_017186	CTGCAT	2	12	5809216	5809227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384150454
4588	NC_017186	CGGAGA	2	12	5809951	5809962	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384150455
4589	NC_017186	GGGTGG	2	12	5811540	5811551	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384150456
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4591	NC_017186	CGCCGA	2	12	5816566	5816577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150462
4592	NC_017186	GTCGAC	2	12	5816870	5816881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150462
4593	NC_017186	ATCCCG	2	12	5817305	5817316	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150463
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4595	NC_017186	CGGCCG	2	12	5821578	5821589	0 %	0 %	50 %	50 %	384150465
4596	NC_017186	CCTGGC	2	12	5824339	5824350	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150467
4597	NC_017186	GTAGCC	2	12	5826679	5826690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150468
4598	NC_017186	CGGCTA	2	12	5828491	5828502	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150469
4599	NC_017186	CTCGGC	2	12	5829479	5829490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150469
4600	NC_017186	TGTGGC	2	12	5829753	5829764	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384150469
4601	NC_017186	AACGGC	2	12	5829893	5829904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384150469
4602	NC_017186	GGTGTC	2	12	5830135	5830146	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384150469
4603	NC_017186	GCACCC	2	12	5830342	5830353	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384150470
4604	NC_017186	GCTTCC	2	12	5832068	5832079	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384150471
4605	NC_017186	CGCGGC	2	12	5833235	5833246	0 %	0 %	50 %	50 %	384150472
4606	NC_017186	GCCTCG	2	12	5834704	5834715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150474
4607	NC_017186	TCGACC	2	12	5835838	5835849	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150476
4608	NC_017186	GGCTGC	2	12	5836474	5836485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150476
4609	NC_017186	CGGACG	2	12	5836735	5836746	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150476
4610	NC_017186	CGGCAG	2	12	5836853	5836864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150477
4611	NC_017186	ACGTCG	2	12	5837668	5837679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150478
4612	NC_017186	AGCGGC	2	12	5838781	5838792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150479
4613	NC_017186	CGAGGG	2	12	5843966	5843977	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384150485
4614	NC_017186	TCGGCC	2	12	5845297	5845308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150487
4615	NC_017186	CCGGCC	2	12	5845791	5845802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150488
4616	NC_017186	GATGCC	2	12	5846114	5846125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150488
4617	NC_017186	GGCGAT	2	12	5848003	5848014	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150490
4618	NC_017186	CGCTGA	2	12	5848152	5848163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150490
4619	NC_017186	GTTCAT	2	12	5848633	5848644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384150490
4620	NC_017186	CAGCGG	2	12	5849183	5849194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150490
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4626	NC_017186	AGCTCC	2	12	5856233	5856244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150495
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4630	NC_017186	CCAGGT	2	12	5859480	5859491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150498
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4632	NC_017186	TGCTCG	2	12	5859743	5859754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384150498
4633	NC_017186	CGTCAC	2	12	5860125	5860136	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150498
4634	NC_017186	GGTGCA	2	12	5861445	5861456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150500
4635	NC_017186	CGGCAC	2	12	5862001	5862012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150501
4636	NC_017186	CGAACC	2	12	5862636	5862647	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384150501
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4638	NC_017186	CACCGG	2	12	5866990	5867001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150507
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4640	NC_017186	CTCGAC	2	12	5870195	5870206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150512
4641	NC_017186	TTCGGC	2	12	5872191	5872202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384150512
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4643	NC_017186	GGCCGC	2	12	5873045	5873056	0 %	0 %	50 %	50 %	384150514
4644	NC_017186	GCGCTT	2	12	5874071	5874082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384150514
4645	NC_017186	GCCACC	2	12	5875494	5875505	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384150515
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4676	NC_017186	GCCGCG	2	12	5911678	5911689	0 %	0 %	50 %	50 %	384150552
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4681	NC_017186	CCGCGG	2	12	5917698	5917709	0 %	0 %	50 %	50 %	384150557
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4709	NC_017186	CGGCCG	2	12	5952207	5952218	0 %	0 %	50 %	50 %	384150592
4710	NC_017186	GCGTCG	2	12	5956558	5956569	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150595
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4715	NC_017186	CGGTGC	2	12	5961711	5961722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150602
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4718	NC_017186	GGCGCA	2	12	5963002	5963013	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150603
4719	NC_017186	ACCGGA	2	12	5964118	5964129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384150604
4720	NC_017186	TCCAGG	2	12	5965848	5965859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150606
4721	NC_017186	GAGGTG	2	12	5967863	5967874	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384150608
4722	NC_017186	AACTGG	2	12	5968497	5968508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384150609
4723	NC_017186	ACTCGA	2	12	5968759	5968770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384150609
4724	NC_017186	ACCGTG	2	12	5973403	5973414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150614
4725	NC_017186	GCCCGC	2	12	5974349	5974360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150615
4726	NC_017186	CGGCCC	2	12	5974366	5974377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150615
4727	NC_017186	GGCGTA	2	12	5974523	5974534	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150615
4728	NC_017186	GTAGGC	2	12	5974943	5974954	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150615
4729	NC_017186	CGCGGT	2	12	5980910	5980921	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150616
4730	NC_017186	CGCGGG	2	12	5981922	5981933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384150616
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4732	NC_017186	TCCAGC	2	12	5983885	5983896	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150618
4733	NC_017186	GCGGTG	2	12	5983999	5984010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384150618
4734	NC_017186	CTCGAC	2	12	5984916	5984927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384150618
4735	NC_017186	CACGGC	2	12	5985078	5985089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150618
4736	NC_017186	AGCGCG	2	12	5985316	5985327	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384150618
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4738	NC_017186	GACGTC	2	12	5987441	5987452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384150620
4739	NC_017186	GCTTCG	2	12	5989051	5989062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384150622
4740	NC_017186	TCGGCG	2	12	5989303	5989314	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150622
4741	NC_017186	GTTCCA	2	12	5989491	5989502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384150622
4742	NC_017186	GCGGGC	2	12	5991998	5992009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384150625
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4744	NC_017186	CGCACG	2	12	5994518	5994529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150628
4745	NC_017186	GGCGTG	2	12	5994535	5994546	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384150628
4746	NC_017186	ATCAGC	2	12	5994848	5994859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384150628
4747	NC_017186	CGTCGG	2	12	5996490	5996501	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150630
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4749	NC_017186	CGCGGC	2	12	6004403	6004414	0 %	0 %	50 %	50 %	384150635
4750	NC_017186	GCCCCG	2	12	6004981	6004992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150636
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4752	NC_017186	GTCGCC	2	12	6006970	6006981	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384150637
4753	NC_017186	CGCGGG	2	12	6008233	6008244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384150638
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4787	NC_017186	CCGGCG	2	12	6043039	6043050	0 %	0 %	50 %	50 %	384150673
4788	NC_017186	TGTCGG	2	12	6044576	6044587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384150675
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4824	NC_017186	CCGGCC	2	12	6081349	6081360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384150701
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4827	NC_017186	CGAGCA	2	12	6086783	6086794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384150705
4828	NC_017186	CGGCCA	2	12	6090303	6090314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150712
4829	NC_017186	CGAAGG	2	12	6090730	6090741	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384150713
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4831	NC_017186	GCCGGT	2	12	6097865	6097876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384150719
4832	NC_017186	GGCACC	2	12	6098108	6098119	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384150719
4833	NC_017186	AGGTCG	2	12	6098318	6098329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384150720
4834	NC_017186	GCCCGG	2	12	6101213	6101224	0 %	0 %	50 %	50 %	384150725
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