MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017186	ACCGTC	2	12	3203667	3203678	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148173
2502	NC_017186	GTCGCC	2	12	3205625	3205636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148175
2503	NC_017186	TGCCGA	2	12	3213448	3213459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148184
2504	NC_017186	CGGTCG	2	12	3214291	3214302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148184
2505	NC_017186	CGACCT	2	12	3215178	3215189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148185
2506	NC_017186	GTGGCC	2	12	3215951	3215962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148186
2507	NC_017186	TCGGCG	2	12	3216576	3216587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148187
2508	NC_017186	GCAGCC	2	12	3218502	3218513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148190
2509	NC_017186	CGGGCG	2	12	3220203	3220214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148193
2510	NC_017186	AGCGCG	2	12	3220947	3220958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148193
2511	NC_017186	GGCGAC	2	12	3223028	3223039	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148195
2512	NC_017186	AGCCGA	2	12	3225536	3225547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384148198
2513	NC_017186	GCAGCG	2	12	3226193	3226204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148198
2514	NC_017186	CCGGGG	2	12	3226510	3226521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148198
2515	NC_017186	GGTGCT	2	12	3228173	3228184	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384148200
2516	NC_017186	GTGCCG	2	12	3228867	3228878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148201
2517	NC_017186	GCGACC	2	12	3229157	3229168	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148201
2518	NC_017186	GCGACG	2	12	3230552	3230563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148203
2519	NC_017186	ACTGCG	2	12	3233171	3233182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148207
2520	NC_017186	TCGCCG	2	12	3233909	3233920	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148207
2521	NC_017186	GCGGAC	2	12	3239231	3239242	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148215
2522	NC_017186	ACGTCG	2	12	3239897	3239908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148216
2523	NC_017186	CGCGGC	2	12	3241413	3241424	0 %	0 %	50 %	50 %	384148218
2524	NC_017186	TCGCGG	2	12	3241508	3241519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148218
2525	NC_017186	GCCCTG	2	12	3241816	3241827	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148219
2526	NC_017186	CGCGCC	2	12	3242256	3242267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148219
2527	NC_017186	GCCCGC	2	12	3243589	3243600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148220
2528	NC_017186	GCCGGT	2	12	3244273	3244284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148220
2529	NC_017186	GACCTC	2	12	3244883	3244894	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148221
2530	NC_017186	CGGTGT	2	12	3245980	3245991	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384148221
2531	NC_017186	GGCGGT	2	12	3246077	3246088	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384148221
2532	NC_017186	GCCGCG	2	12	3246141	3246152	0 %	0 %	50 %	50 %	384148221
2533	NC_017186	ACCGCG	2	12	3246324	3246335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148221
2534	NC_017186	ACGGCC	2	12	3246989	3247000	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148222
2535	NC_017186	GCGACG	2	12	3247376	3247387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148222
2536	NC_017186	GTCGGC	2	12	3248615	3248626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148224
2537	NC_017186	CGTTGC	2	12	3249660	3249671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148226
2538	NC_017186	TGCCGT	2	12	3249954	3249965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148227
2539	NC_017186	TGGCGA	2	12	3250692	3250703	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148227
2540	NC_017186	ACGTCG	2	12	3250790	3250801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148227
2541	NC_017186	CAGCTT	2	12	3253989	3254000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384148230
2542	NC_017186	GAGCAG	2	12	3256141	3256152	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384148232
2543	NC_017186	GGTCAG	2	12	3257632	3257643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148234
2544	NC_017186	CGAACC	2	12	3259776	3259787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148237
2545	NC_017186	TTCGTC	2	12	3260395	3260406	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384148237
2546	NC_017186	CCGCGG	2	12	3260923	3260934	0 %	0 %	50 %	50 %	384148238
2547	NC_017186	CCGGTG	2	12	3265709	3265720	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148242
2548	NC_017186	ACCGCG	2	12	3268458	3268469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148245
2549	NC_017186	CAACGG	2	12	3271084	3271095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384148248
2550	NC_017186	CGGCAG	2	12	3271639	3271650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148248
2551	NC_017186	CAACGC	2	12	3271951	3271962	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148248
2552	NC_017186	CCCCGG	2	12	3273527	3273538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148250
2553	NC_017186	GTCGAC	2	12	3274680	3274691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148252
2554	NC_017186	GGGCGC	2	12	3275000	3275011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148252
2555	NC_017186	CCGGCG	2	12	3275423	3275434	0 %	0 %	50 %	50 %	384148253
2556	NC_017186	CGGCTT	2	12	3276890	3276901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148254
2557	NC_017186	CTGGCC	2	12	3277748	3277759	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148255
2558	NC_017186	GGCGCG	2	12	3278021	3278032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148255
2559	NC_017186	CGCGCT	2	12	3279120	3279131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148256
2560	NC_017186	CCAGGT	2	12	3279162	3279173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148256
2561	NC_017186	CCGACC	2	12	3282008	3282019	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384148259
2562	NC_017186	TCGCCG	2	12	3284502	3284513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148261
2563	NC_017186	CGGCTG	2	12	3285945	3285956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148263
2564	NC_017186	CGGTGC	2	12	3287089	3287100	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148264
2565	NC_017186	TGGCGT	2	12	3288869	3288880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384148266
2566	NC_017186	CCGCGG	2	12	3290122	3290133	0 %	0 %	50 %	50 %	384148267
2567	NC_017186	GCGACG	2	12	3291503	3291514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148269
2568	NC_017186	ACGGTG	2	12	3295179	3295190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148272
2569	NC_017186	GCGGCA	2	12	3295420	3295431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148272
2570	NC_017186	GATCTG	2	12	3296610	3296621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384148273
2571	NC_017186	TCGACG	2	12	3297535	3297546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148274
2572	NC_017186	CGCGGC	2	12	3298015	3298026	0 %	0 %	50 %	50 %	384148275
2573	NC_017186	GGCGCG	2	12	3299996	3300007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148275
2574	NC_017186	ATGACC	2	12	3302736	3302747	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384148279
2575	NC_017186	TCACCG	2	12	3305148	3305159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148281
2576	NC_017186	CGCTAC	2	12	3305276	3305287	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148281
2577	NC_017186	GGCGAG	2	12	3305297	3305308	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384148281
2578	NC_017186	CGCCGA	2	12	3305956	3305967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148281
2579	NC_017186	GGCCCC	2	12	3306865	3306876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148281
2580	NC_017186	TCCGGA	2	12	3307516	3307527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148282
2581	NC_017186	CGTTCG	2	12	3308949	3308960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148283
2582	NC_017186	CCTGCT	2	12	3313564	3313575	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384148284
2583	NC_017186	CGACCA	2	12	3313996	3314007	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148284
2584	NC_017186	CGCGGT	2	12	3314578	3314589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148284
2585	NC_017186	GCCCGT	2	12	3315496	3315507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148284
2586	NC_017186	GAACTC	2	12	3317294	3317305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384148284
2587	NC_017186	CCGGGG	2	12	3318378	3318389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384148284
2588	NC_017186	CACCGA	2	12	3318805	3318816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148284
2589	NC_017186	CTCGCC	2	12	3320603	3320614	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384148284
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2591	NC_017186	CTGCGG	2	12	3320822	3320833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148284
2592	NC_017186	TGCGGC	2	12	3321975	3321986	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148284
2593	NC_017186	CCGGCG	2	12	3324213	3324224	0 %	0 %	50 %	50 %	384148284
2594	NC_017186	CGGCGT	2	12	3324793	3324804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148284
2595	NC_017186	CCGCGC	2	12	3325884	3325895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148284
2596	NC_017186	ATCGCG	2	12	3326493	3326504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148284
2597	NC_017186	CGCGTC	2	12	3328511	3328522	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148284
2598	NC_017186	GCTGGC	2	12	3329272	3329283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148284
2599	NC_017186	ACGCCC	2	12	3333210	3333221	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384148287
2600	NC_017186	GGCCGC	2	12	3334600	3334611	0 %	0 %	50 %	50 %	384148287
2601	NC_017186	GGCGCA	2	12	3336418	3336429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148287
2602	NC_017186	GACCCG	2	12	3336670	3336681	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148287
2603	NC_017186	AGACGT	2	12	3337459	3337470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384148287
2604	NC_017186	ACCGAA	2	12	3338648	3338659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384148287
2605	NC_017186	GCCCGC	2	12	3341704	3341715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148287
2606	NC_017186	CCCGGC	2	12	3341722	3341733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148287
2607	NC_017186	GCACCG	2	12	3341754	3341765	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148287
2608	NC_017186	CTGCGG	2	12	3344027	3344038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148287
2609	NC_017186	CCGCGT	2	12	3344218	3344229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148287
2610	NC_017186	CGGACC	2	12	3344592	3344603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148287
2611	NC_017186	CGCCGT	2	12	3344740	3344751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148287
2612	NC_017186	CGCGGC	2	12	3346054	3346065	0 %	0 %	50 %	50 %	384148287
2613	NC_017186	TGTCGC	2	12	3346350	3346361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148287
2614	NC_017186	GCCGGT	2	12	3348838	3348849	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148287
2615	NC_017186	GCACCG	2	12	3350250	3350261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148287
2616	NC_017186	CGCAAC	2	12	3350998	3351009	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148288
2617	NC_017186	CGCTGC	2	12	3351071	3351082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148288
2618	NC_017186	CGGTGG	2	12	3351233	3351244	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384148288
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2624	NC_017186	CGCGGC	2	12	3358157	3358168	0 %	0 %	50 %	50 %	384148295
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2640	NC_017186	CGTCGA	2	12	3368346	3368357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148307
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2720	NC_017186	CCCGGC	2	12	3495645	3495656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384148425
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2722	NC_017186	GCCAGC	2	12	3498573	3498584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148428
2723	NC_017186	TTGGCC	2	12	3499559	3499570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148429
2724	NC_017186	CCGGCG	2	12	3500367	3500378	0 %	0 %	50 %	50 %	384148430
2725	NC_017186	GGCCGA	2	12	3500403	3500414	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148430
2726	NC_017186	CTTCGA	2	12	3500742	3500753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384148430
2727	NC_017186	AGGGCG	2	12	3500972	3500983	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384148430
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2734	NC_017186	CGACGC	2	12	3511631	3511642	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148441
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2749	NC_017186	GCCGGC	2	12	3526660	3526671	0 %	0 %	50 %	50 %	384148457
2750	NC_017186	TCGACG	2	12	3527844	3527855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384148458
2751	NC_017186	CTCGGT	2	12	3528101	3528112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148458
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2796	NC_017186	AGGTGC	2	12	3582039	3582050	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148500
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2799	NC_017186	CGGGAA	2	12	3584674	3584685	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384148503
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2817	NC_017186	GCCGCG	2	12	3602413	3602424	0 %	0 %	50 %	50 %	384148521
2818	NC_017186	TCACCG	2	12	3603413	3603424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148523
2819	NC_017186	CGTTGC	2	12	3607196	3607207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148529
2820	NC_017186	AGAAGT	2	12	3607364	3607375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384148529
2821	NC_017186	CGCCGG	2	12	3608333	3608344	0 %	0 %	50 %	50 %	384148529
2822	NC_017186	GCCGGT	2	12	3609753	3609764	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148529
2823	NC_017186	TGCGGG	2	12	3610171	3610182	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384148530
2824	NC_017186	GGGTGG	2	12	3612747	3612758	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384148533
2825	NC_017186	GCACCG	2	12	3615275	3615286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148535
2826	NC_017186	ACGCCA	2	12	3617820	3617831	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384148538
2827	NC_017186	CGCTGC	2	12	3618229	3618240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148538
2828	NC_017186	GCGGCC	2	12	3618425	3618436	0 %	0 %	50 %	50 %	384148538
2829	NC_017186	TCGCCG	2	12	3618740	3618751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148539
2830	NC_017186	CGCGCA	2	12	3624601	3624612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148543
2831	NC_017186	GGACCG	2	12	3626552	3626563	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148545
2832	NC_017186	GACGGC	2	12	3628472	3628483	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148546
2833	NC_017186	GACCGG	2	12	3630719	3630730	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148549
2834	NC_017186	CCGTCG	2	12	3631002	3631013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148549
2835	NC_017186	TCGGCG	2	12	3633735	3633746	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148551
2836	NC_017186	TTCGGC	2	12	3635284	3635295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148552
2837	NC_017186	GCTCGC	2	12	3636036	3636047	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148552
2838	NC_017186	GCCCGA	2	12	3637032	3637043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148553
2839	NC_017186	CGCCTA	2	12	3637359	3637370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148553
2840	NC_017186	GCCTGC	2	12	3638144	3638155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384148553
2841	NC_017186	GCGAGA	2	12	3639076	3639087	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384148554
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2859	NC_017186	CCGCGA	2	12	3668346	3668357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148578
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2862	NC_017186	GCCGGC	2	12	3673286	3673297	0 %	0 %	50 %	50 %	384148582
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2864	NC_017186	CCGCGG	2	12	3674869	3674880	0 %	0 %	50 %	50 %	384148584
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2884	NC_017186	GCGCCG	2	12	3699308	3699319	0 %	0 %	50 %	50 %	384148605
2885	NC_017186	TGATCG	2	12	3701097	3701108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384148606
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2918	NC_017186	CAGGGA	3	18	3756622	3756639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384148655
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2920	NC_017186	CGGCCA	2	12	3759774	3759785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148659
2921	NC_017186	GCGACC	2	12	3760433	3760444	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384148659
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2926	NC_017186	GTTGAC	2	12	3765881	3765892	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384148665
2927	NC_017186	CTCGAA	2	12	3768413	3768424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384148667
2928	NC_017186	CCGGGC	2	12	3768872	3768883	0 %	0 %	50 %	50 %	384148668
2929	NC_017186	TCACCG	2	12	3769335	3769346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384148668
2930	NC_017186	AGGCCG	2	12	3770229	3770240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384148669
2931	NC_017186	CAGGTG	2	12	3770615	3770626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148669
2932	NC_017186	CGCCGG	2	12	3771417	3771428	0 %	0 %	50 %	50 %	384148670
2933	NC_017186	CAGTTC	2	12	3771451	3771462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384148670
2934	NC_017186	GATCGG	2	12	3772090	3772101	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384148671
2935	NC_017186	GTCCTG	2	12	3773443	3773454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384148674
2936	NC_017186	TCCTCG	2	12	3773573	3773584	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384148674
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2939	NC_017186	CGGCTG	2	12	3777509	3777520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148677
2940	NC_017186	GTGCCG	2	12	3778091	3778102	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384148677
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