MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017186	CATCCG	2	12	4521759	4521770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149317
3502	NC_017186	GCCCGC	2	12	4525116	4525127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384149319
3503	NC_017186	GCACCT	2	12	4525455	4525466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149319
3504	NC_017186	CTGGCG	2	12	4526332	4526343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149319
3505	NC_017186	CACGGC	2	12	4530040	4530051	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149321
3506	NC_017186	TCGCCG	2	12	4530740	4530751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149322
3507	NC_017186	CCGGGT	2	12	4532288	4532299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149324
3508	NC_017186	CGCCGT	2	12	4533031	4533042	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149325
3509	NC_017186	ACCGCG	2	12	4535996	4536007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149326
3510	NC_017186	CCAGCA	2	12	4536519	4536530	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384149326
3511	NC_017186	GTGATG	2	12	4536848	4536859	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384149326
3512	NC_017186	GGAGAA	2	12	4538148	4538159	50 %	0 %	50 %	0 %	384149327
3513	NC_017186	TCGCCC	2	12	4541974	4541985	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384149332
3514	NC_017186	CCTCGA	2	12	4542749	4542760	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149332
3515	NC_017186	GCTTGC	2	12	4544344	4544355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384149334
3516	NC_017186	GCGGGC	2	12	4544621	4544632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384149334
3517	NC_017186	ACCGTG	2	12	4546294	4546305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149336
3518	NC_017186	GACCGT	2	12	4546554	4546565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149337
3519	NC_017186	GGCGAG	2	12	4549070	4549081	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384149341
3520	NC_017186	TCGGCG	2	12	4549281	4549292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149341
3521	NC_017186	CACCGG	2	12	4552249	4552260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149344
3522	NC_017186	GGACGC	2	12	4552522	4552533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149344
3523	NC_017186	TCGACG	2	12	4555098	4555109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149348
3524	NC_017186	TCGACC	2	12	4555479	4555490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149348
3525	NC_017186	ACGCTG	2	12	4555871	4555882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149348
3526	NC_017186	CCGAGC	2	12	4556999	4557010	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149349
3527	NC_017186	ACGCCG	2	12	4557119	4557130	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149349
3528	NC_017186	GCCACG	2	12	4557855	4557866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149350
3529	NC_017186	GTGGTC	2	12	4558622	4558633	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384149352
3530	NC_017186	CGGCGA	2	12	4559119	4559130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149352
3531	NC_017186	GGGGCT	2	12	4560397	4560408	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149353
3532	NC_017186	CGGCAT	2	12	4561890	4561901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149355
3533	NC_017186	CGCGGT	2	12	4563076	4563087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149356
3534	NC_017186	CGACCG	2	12	4565378	4565389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149357
3535	NC_017186	CGCCGG	2	12	4566273	4566284	0 %	0 %	50 %	50 %	384149358
3536	NC_017186	GGTGCC	2	12	4566339	4566350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149358
3537	NC_017186	CAGGTC	2	12	4567344	4567355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149359
3538	NC_017186	GCGCGG	2	12	4568446	4568457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384149361
3539	NC_017186	GCTGGG	2	12	4568520	4568531	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149361
3540	NC_017186	GCGCCT	2	12	4571854	4571865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149363
3541	NC_017186	GCGGTG	2	12	4571916	4571927	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149363
3542	NC_017186	CTTCGC	2	12	4572146	4572157	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384149364
3543	NC_017186	GCTGCA	2	12	4574887	4574898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149365
3544	NC_017186	CGGTCT	2	12	4576153	4576164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384149365
3545	NC_017186	GCGCGG	2	12	4576381	4576392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384149365
3546	NC_017186	TGCAGC	2	12	4577211	4577222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149365
3547	NC_017186	CGTCGG	2	12	4579380	4579391	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149367
3548	NC_017186	GCCGTT	2	12	4579804	4579815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384149367
3549	NC_017186	CGGCCG	2	12	4581166	4581177	0 %	0 %	50 %	50 %	384149368
3550	NC_017186	GACGGC	2	12	4583639	4583650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149370
3551	NC_017186	CGCCAG	2	12	4584835	4584846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149371
3552	NC_017186	GAGCCC	2	12	4584934	4584945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149371
3553	NC_017186	GTTGCG	2	12	4588469	4588480	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384149374
3554	NC_017186	CGAGGC	2	12	4588928	4588939	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149375
3555	NC_017186	GCCGAG	2	12	4589247	4589258	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149375
3556	NC_017186	CCTCGG	2	12	4590648	4590659	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149377
3557	NC_017186	CCGGGT	2	12	4591039	4591050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149378
3558	NC_017186	CCGGTG	2	12	4591334	4591345	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149378
3559	NC_017186	TCATCG	2	12	4592190	4592201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384149378
3560	NC_017186	CAAGGC	2	12	4593327	4593338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384149381
3561	NC_017186	CTCGAC	2	12	4593577	4593588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149381
3562	NC_017186	GCAAGG	2	12	4593872	4593883	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384149381
3563	NC_017186	GCGACG	2	12	4594067	4594078	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149381
3564	NC_017186	TTCGGG	3	18	4594434	4594451	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384149381
3565	NC_017186	CGGTGG	2	12	4594689	4594700	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149381
3566	NC_017186	CGGAGG	2	12	4594787	4594798	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384149381
3567	NC_017186	CGGGCT	2	12	4595132	4595143	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149381
3568	NC_017186	GGTTCG	2	12	4595269	4595280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384149381
3569	NC_017186	GACGGC	2	12	4595308	4595319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149381
3570	NC_017186	ATCCAC	2	12	4595668	4595679	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384149381
3571	NC_017186	GCAGCC	2	12	4596153	4596164	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149381
3572	NC_017186	AAGAGG	2	12	4596751	4596762	50 %	0 %	50 %	0 %	384149382
3573	NC_017186	CCGCGA	2	12	4598601	4598612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149386
3574	NC_017186	TCGTCC	2	12	4599319	4599330	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384149388
3575	NC_017186	GCCGCG	2	12	4600234	4600245	0 %	0 %	50 %	50 %	384149388
3576	NC_017186	GGCGAG	2	12	4600878	4600889	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384149389
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3579	NC_017186	TCGTGA	2	12	4605472	4605483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384149393
3580	NC_017186	CGCGGG	2	12	4606193	4606204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384149394
3581	NC_017186	ACCCCC	2	12	4606702	4606713	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384149394
3582	NC_017186	TCGACC	2	12	4608181	4608192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149396
3583	NC_017186	GACGTC	2	12	4609063	4609074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149397
3584	NC_017186	GCAGGC	3	18	4609940	4609957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149398
3585	NC_017186	CCGGCG	2	12	4610421	4610432	0 %	0 %	50 %	50 %	384149399
3586	NC_017186	CGTGGA	2	12	4611013	4611024	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384149399
3587	NC_017186	GTCCGG	2	12	4611125	4611136	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149399
3588	NC_017186	TCCGGC	2	12	4611231	4611242	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149399
3589	NC_017186	CGGTCA	2	12	4611265	4611276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149399
3590	NC_017186	CCACGA	2	12	4612610	4612621	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384149402
3591	NC_017186	CGTGCA	2	12	4613110	4613121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149402
3592	NC_017186	GACCGG	2	12	4614397	4614408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149404
3593	NC_017186	TCGGCC	2	12	4623002	4623013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149416
3594	NC_017186	GCCCGC	2	12	4627055	4627066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384149420
3595	NC_017186	GGCGCG	2	12	4627208	4627219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384149420
3596	NC_017186	GGCGAA	2	12	4628520	4628531	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384149422
3597	NC_017186	CGTGCG	2	12	4630721	4630732	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149424
3598	NC_017186	ACGCCG	2	12	4631929	4631940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149425
3599	NC_017186	GGCTGG	2	12	4632867	4632878	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149426
3600	NC_017186	GGGCTG	2	12	4633484	4633495	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149426
3601	NC_017186	CGGTCG	2	12	4634231	4634242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149427
3602	NC_017186	GCTCCA	2	12	4634463	4634474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149428
3603	NC_017186	TCACCG	2	12	4634858	4634869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384149428
3604	NC_017186	TCCGGC	2	12	4635097	4635108	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149429
3605	NC_017186	GACCGG	2	12	4636833	4636844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384149432
3606	NC_017186	TCGGCG	2	12	4636981	4636992	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149432
3607	NC_017186	CGGTGC	2	12	4639687	4639698	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149435
3608	NC_017186	CGTCGA	2	12	4643385	4643396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149438
3609	NC_017186	CCGCGT	2	12	4644926	4644937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149441
3610	NC_017186	CGCGTC	2	12	4648496	4648507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384149444
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3718	NC_017186	GCCAGC	2	12	4769771	4769782	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149560
3719	NC_017186	GTCGGC	2	12	4770212	4770223	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384149561
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3833	NC_017186	GATCGT	2	12	4890362	4890373	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384149663
3834	NC_017186	CGTCGA	2	12	4895894	4895905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384149669
3835	NC_017186	CCGACG	2	12	4897575	4897586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384149671
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3837	NC_017186	GCTGGG	2	12	4901154	4901165	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384149673
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