MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017186	AGGCCG	2	12	8398346	8398357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152922
6502	NC_017186	GCTCGT	2	12	8399844	8399855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384152923
6503	NC_017186	CTCGCC	2	12	8399956	8399967	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384152923
6504	NC_017186	CCGGCC	2	12	8400738	8400749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152924
6505	NC_017186	CGCCGT	2	12	8402584	8402595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152925
6506	NC_017186	CCGCGC	2	12	8403101	8403112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152925
6507	NC_017186	CGGGAA	2	12	8406848	8406859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384152932
6508	NC_017186	TCTTGA	2	12	8409446	8409457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384152934
6509	NC_017186	CGGCGC	2	12	8411721	8411732	0 %	0 %	50 %	50 %	384152936
6510	NC_017186	CTTGAC	2	12	8411773	8411784	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152936
6511	NC_017186	GTCCTT	2	12	8413889	8413900	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384152939
6512	NC_017186	GGGTCA	2	12	8414266	8414277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384152939
6513	NC_017186	CCTCGG	2	12	8416578	8416589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152941
6514	NC_017186	GCCAGC	2	12	8418646	8418657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152945
6515	NC_017186	GCTCGC	2	12	8419253	8419264	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152945
6516	NC_017186	GTTGCG	2	12	8422002	8422013	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384152947
6517	NC_017186	GGTCGA	2	12	8422667	8422678	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384152947
6518	NC_017186	GGTGCT	2	12	8424386	8424397	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384152950
6519	NC_017186	TCGACG	2	12	8424451	8424462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152950
6520	NC_017186	AGGCGG	2	12	8424931	8424942	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384152950
6521	NC_017186	GCCGGC	2	12	8425151	8425162	0 %	0 %	50 %	50 %	384152950
6522	NC_017186	CCAGCT	2	12	8427803	8427814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152954
6523	NC_017186	CCGCTG	2	12	8430572	8430583	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152957
6524	NC_017186	CTGCAC	2	12	8431321	8431332	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152959
6525	NC_017186	GCTGCG	2	12	8431782	8431793	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152959
6526	NC_017186	GCCCGC	2	12	8434565	8434576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152963
6527	NC_017186	GCGAGC	2	12	8434742	8434753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152963
6528	NC_017186	GCCACC	2	12	8435674	8435685	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152964
6529	NC_017186	TGGTCG	2	12	8436542	8436553	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384152964
6530	NC_017186	TCCGCC	2	12	8436775	8436786	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384152965
6531	NC_017186	GCCGAG	2	12	8439805	8439816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152966
6532	NC_017186	CGATCT	2	12	8441401	8441412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152969
6533	NC_017186	CGAGGA	2	12	8441419	8441430	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384152969
6534	NC_017186	GGCTGC	2	12	8443443	8443454	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152972
6535	NC_017186	GGCCGC	2	12	8443847	8443858	0 %	0 %	50 %	50 %	384152973
6536	NC_017186	GTTCGT	2	12	8446317	8446328	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384152975
6537	NC_017186	CGGGCT	2	12	8446476	8446487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152975
6538	NC_017186	TCGCGC	2	12	8447028	8447039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152976
6539	NC_017186	CCGCGC	2	12	8448916	8448927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152978
6540	NC_017186	CCACCC	2	12	8450038	8450049	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384152980
6541	NC_017186	CGCGGG	2	12	8451937	8451948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384152981
6542	NC_017186	CAGCGC	2	12	8452617	8452628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152982
6543	NC_017186	GGCGCG	2	12	8455304	8455315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384152985
6544	NC_017186	ACGGCG	2	12	8455434	8455445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152985
6545	NC_017186	CCGCGA	2	12	8456873	8456884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152987
6546	NC_017186	CCGGCA	2	12	8457177	8457188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152988
6547	NC_017186	GGCCCT	2	12	8460044	8460055	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152992
6548	NC_017186	CTTCGA	2	12	8461145	8461156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152994
6549	NC_017186	GCCTAC	2	12	8462623	8462634	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152996
6550	NC_017186	CTCGCG	2	12	8462875	8462886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152997
6551	NC_017186	CGCGGT	2	12	8463349	8463360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152997
6552	NC_017186	CGCCGG	2	12	8463765	8463776	0 %	0 %	50 %	50 %	384152999
6553	NC_017186	GACCGG	2	12	8464566	8464577	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153000
6554	NC_017186	CCGGCG	2	12	8464733	8464744	0 %	0 %	50 %	50 %	384153000
6555	NC_017186	CCTCGA	2	12	8465120	8465131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153000
6556	NC_017186	CGGGCT	2	12	8468404	8468415	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153002
6557	NC_017186	CCGACG	2	12	8469561	8469572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153002
6558	NC_017186	GCTCAA	2	12	8469991	8470002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153002
6559	NC_017186	TCGAGG	2	12	8470457	8470468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153003
6560	NC_017186	GGGCGT	2	12	8472373	8472384	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384153004
6561	NC_017186	CGACCA	2	12	8472941	8472952	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153005
6562	NC_017186	GCCGTC	2	12	8474501	8474512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153006
6563	NC_017186	GCCCGT	2	12	8476218	8476229	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153007
6564	NC_017186	AAGCGC	2	12	8481734	8481745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153011
6565	NC_017186	GCGTCA	2	12	8485662	8485673	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153016
6566	NC_017186	CGCCTG	2	12	8486062	8486073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153016
6567	NC_017186	GGCGCC	2	12	8489140	8489151	0 %	0 %	50 %	50 %	384153020
6568	NC_017186	TCGACC	2	12	8495064	8495075	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153025
6569	NC_017186	TCACCG	2	12	8497379	8497390	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153028
6570	NC_017186	CCGACG	2	12	8499600	8499611	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153032
6571	NC_017186	CCGCGA	2	12	8501628	8501639	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153036
6572	NC_017186	GCACCA	2	12	8502261	8502272	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153036
6573	NC_017186	CGACGT	2	12	8504979	8504990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153040
6574	NC_017186	CCGGCA	3	18	8507493	8507510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153044
6575	NC_017186	GACGCT	2	12	8508589	8508600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153044
6576	NC_017186	ACATCG	2	12	8510170	8510181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153047
6577	NC_017186	ATGTCG	2	12	8511412	8511423	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153049
6578	NC_017186	ACGTCG	2	12	8512369	8512380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153049
6579	NC_017186	CAGGAT	2	12	8513717	8513728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384153050
6580	NC_017186	GCTACC	2	12	8517653	8517664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153056
6581	NC_017186	GCCGAG	2	12	8517781	8517792	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153056
6582	NC_017186	GCAGCG	2	12	8520341	8520352	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153059
6583	NC_017186	GCCGAC	2	12	8523648	8523659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153064
6584	NC_017186	GCGACC	2	12	8524194	8524205	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153065
6585	NC_017186	CACGGT	2	12	8524267	8524278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153065
6586	NC_017186	TCACGG	2	12	8524302	8524313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153065
6587	NC_017186	GTGCCG	2	12	8525196	8525207	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153066
6588	NC_017186	GGCGCG	2	12	8525367	8525378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153066
6589	NC_017186	GGCCGC	2	12	8526013	8526024	0 %	0 %	50 %	50 %	384153066
6590	NC_017186	GTCGCC	2	12	8527457	8527468	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153068
6591	NC_017186	GATGCC	2	12	8527915	8527926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153069
6592	NC_017186	TCTCGT	2	12	8527935	8527946	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384153069
6593	NC_017186	AGCGCG	2	12	8529572	8529583	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153070
6594	NC_017186	GGCGAT	2	12	8530602	8530613	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153072
6595	NC_017186	CGATGA	2	12	8531078	8531089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384153072
6596	NC_017186	CGAGCA	2	12	8531588	8531599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153072
6597	NC_017186	AGCCGA	2	12	8532318	8532329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153073
6598	NC_017186	CACCGA	2	12	8533805	8533816	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153075
6599	NC_017186	GCCGAC	2	12	8536314	8536325	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153080
6600	NC_017186	CACGTT	2	12	8537719	8537730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153081
6601	NC_017186	GCGTCG	2	12	8539301	8539312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153082
6602	NC_017186	GGTGCT	2	12	8541581	8541592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153085
6603	NC_017186	CGCGCT	2	12	8541647	8541658	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153085
6604	NC_017186	GTGCCG	2	12	8544418	8544429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153088
6605	NC_017186	CGACCT	2	12	8545420	8545431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153090
6606	NC_017186	GTGCCG	2	12	8548411	8548422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153093
6607	NC_017186	GGCCGG	2	12	8550205	8550216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153096
6608	NC_017186	TCGACG	2	12	8551100	8551111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153096
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6610	NC_017186	ACGGCG	2	12	8553213	8553224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153098
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6711	NC_017186	GCGCTG	2	12	8700974	8700985	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153230
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6717	NC_017186	TCGCCG	2	12	8712719	8712730	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153245
6718	NC_017186	CGTGTC	2	12	8713087	8713098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153245
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6720	NC_017186	AAGCCG	2	12	8715672	8715683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153249
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6831	NC_017186	CGCGAC	2	12	8846468	8846479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153370
6832	NC_017186	GCACCA	2	12	8847643	8847654	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153370
6833	NC_017186	CACCGT	2	12	8848932	8848943	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153371
6834	NC_017186	GACATC	2	12	8849345	8849356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153372
6835	NC_017186	GATCGC	2	12	8849802	8849813	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153374
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6931	NC_017186	CTCCGC	2	12	8984589	8984600	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384153492
6932	NC_017186	CATCCG	2	12	8985807	8985818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153493
6933	NC_017186	CGAGCG	2	12	8986580	8986591	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153493
6934	NC_017186	GCGAGC	2	12	8986906	8986917	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153493
6935	NC_017186	ACCGCT	2	12	8989869	8989880	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153494
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6937	NC_017186	CTGGGC	2	12	8996137	8996148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153501
6938	NC_017186	GGACGA	2	12	8997222	8997233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153502
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