MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017186	CCGACG	2	12	6416328	6416339	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151046
5002	NC_017186	GATCGT	2	12	6416476	6416487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384151046
5003	NC_017186	ACGGCC	2	12	6419983	6419994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151049
5004	NC_017186	TCGACG	2	12	6424619	6424630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151055
5005	NC_017186	GGCATC	2	12	6425125	6425136	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151055
5006	NC_017186	TGGCCA	2	12	6428322	6428333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151060
5007	NC_017186	CGCAGA	2	12	6431625	6431636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151062
5008	NC_017186	GGTCGA	2	12	6446718	6446729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151072
5009	NC_017186	TTTGCG	2	12	6447507	6447518	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384151073
5010	NC_017186	CGGTTT	2	12	6448730	6448741	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384151074
5011	NC_017186	TCCGGT	2	12	6448932	6448943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151074
5012	NC_017186	GCCAGC	2	12	6449439	6449450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151074
5013	NC_017186	TCGAGG	2	12	6450400	6450411	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151076
5014	NC_017186	GGCGAA	2	12	6451593	6451604	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384151076
5015	NC_017186	CGCAGC	2	12	6454018	6454029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151078
5016	NC_017186	GTCGGT	2	12	6454864	6454875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151079
5017	NC_017186	GACGGC	2	12	6470585	6470596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151096
5018	NC_017186	CCGGCA	2	12	6472778	6472789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151101
5019	NC_017186	GCCGCG	2	12	6473475	6473486	0 %	0 %	50 %	50 %	384151102
5020	NC_017186	TGGCGG	2	12	6474896	6474907	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384151103
5021	NC_017186	ACTCAC	2	12	6477460	6477471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384151106
5022	NC_017186	TCCCGC	2	12	6478254	6478265	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384151106
5023	NC_017186	GCCGAA	2	12	6479451	6479462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151107
5024	NC_017186	CAGCGC	2	12	6481903	6481914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151110
5025	NC_017186	TGCGCG	2	12	6482905	6482916	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151111
5026	NC_017186	CTCGAC	2	12	6484737	6484748	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151114
5027	NC_017186	CGGGAA	2	12	6485217	6485228	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384151115
5028	NC_017186	CGCGTC	2	12	6485781	6485792	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151115
5029	NC_017186	CCGGGC	2	12	6486401	6486412	0 %	0 %	50 %	50 %	384151116
5030	NC_017186	CAGCAC	2	12	6487145	6487156	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384151116
5031	NC_017186	ACGGCG	2	12	6487340	6487351	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151117
5032	NC_017186	CAGCCG	2	12	6487936	6487947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151117
5033	NC_017186	TCGAGC	2	12	6488475	6488486	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151117
5034	NC_017186	GCCAGC	2	12	6489288	6489299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151118
5035	NC_017186	GCCGCG	2	12	6489372	6489383	0 %	0 %	50 %	50 %	384151118
5036	NC_017186	CGGCCG	2	12	6489701	6489712	0 %	0 %	50 %	50 %	384151118
5037	NC_017186	CGCAGG	2	12	6491204	6491215	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151119
5038	NC_017186	CACCGC	2	12	6491485	6491496	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151119
5039	NC_017186	CAGCGC	2	12	6492982	6492993	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151120
5040	NC_017186	CCGCTG	2	12	6496196	6496207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151124
5041	NC_017186	GGCCTG	2	12	6496919	6496930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151124
5042	NC_017186	GGGTGG	2	12	6498231	6498242	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384151125
5043	NC_017186	GCATCC	2	12	6500531	6500542	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151127
5044	NC_017186	ACCAGG	2	12	6502451	6502462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151127
5045	NC_017186	GCGGGT	2	12	6502494	6502505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384151127
5046	NC_017186	CGGCAG	2	12	6502963	6502974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151127
5047	NC_017186	TGCCGA	2	12	6503077	6503088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151128
5048	NC_017186	CTCGCG	2	12	6503141	6503152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151128
5049	NC_017186	AGCCGC	2	12	6503969	6503980	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151129
5050	NC_017186	CGGCTG	2	12	6505142	6505153	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151131
5051	NC_017186	GCGTCG	2	12	6507390	6507401	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151134
5052	NC_017186	GCGAGC	2	12	6507880	6507891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151135
5053	NC_017186	CGTGCC	2	12	6508005	6508016	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151135
5054	NC_017186	GAACGC	2	12	6508200	6508211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151135
5055	NC_017186	GAGCAG	2	12	6508389	6508400	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384151135
5056	NC_017186	CCGGGT	2	12	6509240	6509251	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151136
5057	NC_017186	CGGTCG	2	12	6511123	6511134	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151138
5058	NC_017186	GCCGAG	2	12	6511930	6511941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151139
5059	NC_017186	GTCGGC	2	12	6512081	6512092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151139
5060	NC_017186	TCGGGT	2	12	6515884	6515895	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151144
5061	NC_017186	GCTGTT	2	12	6519067	6519078	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384151149
5062	NC_017186	CGTGGT	2	12	6519742	6519753	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151149
5063	NC_017186	CGGCTA	2	12	6522035	6522046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151151
5064	NC_017186	GCCGGT	2	12	6524098	6524109	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151153
5065	NC_017186	CCGCAG	2	12	6524621	6524632	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151154
5066	NC_017186	GACGCT	2	12	6526000	6526011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151155
5067	NC_017186	CGGCAC	2	12	6527916	6527927	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151158
5068	NC_017186	GCCGGC	2	12	6530486	6530497	0 %	0 %	50 %	50 %	384151160
5069	NC_017186	CGGGAT	2	12	6530863	6530874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151160
5070	NC_017186	GGCGCG	2	12	6530926	6530937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384151160
5071	NC_017186	TCCGGG	2	12	6531042	6531053	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151160
5072	NC_017186	CGGCCT	2	12	6531391	6531402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151160
5073	NC_017186	GGTCGC	2	12	6531874	6531885	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151160
5074	NC_017186	CAACGG	2	12	6535816	6535827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151164
5075	NC_017186	CGACCG	2	12	6536662	6536673	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151164
5076	NC_017186	GCAGTC	2	12	6537520	6537531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151164
5077	NC_017186	CCTGAC	2	12	6538748	6538759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151165
5078	NC_017186	CCAGCG	2	12	6540131	6540142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151166
5079	NC_017186	GACGGC	2	12	6541692	6541703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151168
5080	NC_017186	ACACGG	2	12	6541862	6541873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384151169
5081	NC_017186	GTTGCC	2	12	6542699	6542710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151170
5082	NC_017186	CGGGTC	2	12	6544069	6544080	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151172
5083	NC_017186	CTGGCG	2	12	6544777	6544788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151172
5084	NC_017186	CGCGCT	2	12	6545448	6545459	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151172
5085	NC_017186	CCGCAC	2	12	6553036	6553047	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151175
5086	NC_017186	GGGCTG	2	12	6553847	6553858	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384151177
5087	NC_017186	TCGACG	2	12	6556316	6556327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151180
5088	NC_017186	GAAGGC	2	12	6556778	6556789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384151181
5089	NC_017186	AGGCCG	2	12	6556936	6556947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151181
5090	NC_017186	GCCCGG	2	12	6560199	6560210	0 %	0 %	50 %	50 %	384151185
5091	NC_017186	CCGGAC	2	12	6563787	6563798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151190
5092	NC_017186	TTCGAG	2	12	6565470	6565481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384151192
5093	NC_017186	TTCGTC	2	12	6566158	6566169	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384151193
5094	NC_017186	GCCGGC	2	12	6566185	6566196	0 %	0 %	50 %	50 %	384151193
5095	NC_017186	GCTGAC	3	18	6566393	6566410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151193
5096	NC_017186	GCCCAG	2	12	6567878	6567889	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151196
5097	NC_017186	CACGGC	2	12	6568793	6568804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151196
5098	NC_017186	ACGGCT	2	12	6569760	6569771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151196
5099	NC_017186	ACGCCG	2	12	6570244	6570255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151197
5100	NC_017186	CGCCTT	2	12	6573367	6573378	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384151201
5101	NC_017186	CCGGCG	2	12	6573794	6573805	0 %	0 %	50 %	50 %	384151202
5102	NC_017186	CACGGG	2	12	6575293	6575304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151203
5103	NC_017186	GCAAAG	2	12	6576279	6576290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384151203
5104	NC_017186	CCTCGG	2	12	6577196	6577207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151205
5105	NC_017186	CGTCGG	2	12	6578070	6578081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151206
5106	NC_017186	GCGCCG	2	12	6580272	6580283	0 %	0 %	50 %	50 %	384151210
5107	NC_017186	GACGGT	2	12	6580337	6580348	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151210
5108	NC_017186	CGAGGT	2	12	6580660	6580671	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151210
5109	NC_017186	CCGGCG	2	12	6582371	6582382	0 %	0 %	50 %	50 %	384151212
5110	NC_017186	CCAAGC	2	12	6582561	6582572	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384151213
5111	NC_017186	GCCGGC	2	12	6582797	6582808	0 %	0 %	50 %	50 %	384151213
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5113	NC_017186	GTTCGC	2	12	6585413	6585424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151215
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5208	NC_017186	TGACCT	2	12	6710148	6710159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384151326
5209	NC_017186	GCGGCA	2	12	6714254	6714265	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151332
5210	NC_017186	GTCGAG	2	12	6714762	6714773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151332
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5214	NC_017186	GCGGCT	2	12	6717923	6717934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151334
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5219	NC_017186	GCTGGT	2	12	6723378	6723389	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151339
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5221	NC_017186	GCCGTC	2	12	6725393	6725404	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151341
5222	NC_017186	CGAGCC	2	12	6727773	6727784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151343
5223	NC_017186	GCCGAG	2	12	6728500	6728511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151343
5224	NC_017186	GTGTTC	2	12	6730107	6730118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384151344
5225	NC_017186	AACCCG	2	12	6730708	6730719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384151344
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5233	NC_017186	CAGCTC	2	12	6737484	6737495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151352
5234	NC_017186	ACTCGG	2	12	6737669	6737680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151352
5235	NC_017186	GATGCC	2	12	6737991	6738002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384151352
5236	NC_017186	TCACCA	2	12	6740371	6740382	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384151354
5237	NC_017186	CACCAG	2	12	6740541	6740552	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384151354
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5240	NC_017186	ACCGCA	2	12	6742436	6742447	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384151355
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5245	NC_017186	CGCGGC	2	12	6747348	6747359	0 %	0 %	50 %	50 %	384151362
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5250	NC_017186	GGCCGC	2	12	6751630	6751641	0 %	0 %	50 %	50 %	384151365
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5252	NC_017186	CAGCGC	2	12	6756090	6756101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151369
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5292	NC_017186	GTTCAA	2	12	6803664	6803675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384151414
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5302	NC_017186	GCGCTT	2	12	6819194	6819205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151434
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5316	NC_017186	CGAGCC	3	18	6833825	6833842	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151455
5317	NC_017186	CGCCCA	2	12	6840951	6840962	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151459
5318	NC_017186	TCCGGC	2	12	6841280	6841291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151459
5319	NC_017186	GTCCTG	2	12	6841716	6841727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151459
5320	NC_017186	TCGGTG	2	12	6843339	6843350	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151461
5321	NC_017186	TGCCGG	2	12	6847449	6847460	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151466
5322	NC_017186	TCCGGC	2	12	6849523	6849534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151469
5323	NC_017186	CGGCCA	2	12	6850022	6850033	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151470
5324	NC_017186	GCCGGC	2	12	6850382	6850393	0 %	0 %	50 %	50 %	384151470
5325	NC_017186	GAGCAG	2	12	6850566	6850577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384151470
5326	NC_017186	GCTTCG	2	12	6851876	6851887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151472
5327	NC_017186	ATCGCC	2	12	6851957	6851968	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151472
5328	NC_017186	GCCCGG	2	12	6852056	6852067	0 %	0 %	50 %	50 %	384151472
5329	NC_017186	CACGAT	2	12	6853306	6853317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384151474
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5331	NC_017186	TCGTGG	2	12	6853444	6853455	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384151475
5332	NC_017186	GGCGCG	2	12	6855765	6855776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384151476
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5334	NC_017186	CCGCGG	2	12	6860487	6860498	0 %	0 %	50 %	50 %	384151482
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5430	NC_017186	GAAGCT	2	12	6973044	6973055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384151573
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5432	NC_017186	CCTTGG	2	12	6976330	6976341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151575
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5436	NC_017186	TGGCGA	2	12	6981010	6981021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151579
5437	NC_017186	TCGAGA	2	12	6981554	6981565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384151580
5438	NC_017186	CGTCAC	2	12	6983682	6983693	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151583
5439	NC_017186	GCAGCG	2	12	6983828	6983839	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384151583
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5441	NC_017186	GGGCCG	2	12	6985672	6985683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384151584
5442	NC_017186	TCCGTC	2	12	6985710	6985721	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384151584
5443	NC_017186	ACCGGC	2	12	6989598	6989609	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151588
5444	NC_017186	CCACGC	2	12	6990279	6990290	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151589
5445	NC_017186	CCCGCA	2	12	6991252	6991263	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151590
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5448	NC_017186	TCCATG	2	12	6993904	6993915	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384151593
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5452	NC_017186	GTCGAG	2	12	6999605	6999616	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384151599
5453	NC_017186	CATGGT	2	12	7000974	7000985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384151601
5454	NC_017186	GGGCGA	2	12	7001550	7001561	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384151602
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5460	NC_017186	TCGGCG	2	12	7005012	7005023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384151604
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5463	NC_017186	CTCGGC	2	12	7006703	7006714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384151606
5464	NC_017186	CTGGTC	2	12	7007231	7007242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384151606
5465	NC_017186	CTGATC	2	12	7007675	7007686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384151607
5466	NC_017186	GCCACC	2	12	7008405	7008416	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384151608
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5468	NC_017186	CCTACG	2	12	7009494	7009505	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384151610
5469	NC_017186	GCCGCG	2	12	7012994	7013005	0 %	0 %	50 %	50 %	384151614
5470	NC_017186	GATGTT	2	12	7013111	7013122	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384151614
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5474	NC_017186	GCTTCA	2	12	7015145	7015156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384151615
5475	NC_017186	GACGCC	2	12	7017391	7017402	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151618
5476	NC_017186	GACGCC	2	12	7017427	7017438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384151618
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