MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017186	CGCGAT	2	12	9073827	9073838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153581
7002	NC_017186	CTTCGG	2	12	9074052	9074063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153581
7003	NC_017186	CGTCGA	2	12	9074759	9074770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153581
7004	NC_017186	ACGTCG	2	12	9075013	9075024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153581
7005	NC_017186	ACCGGG	2	12	9076758	9076769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153583
7006	NC_017186	TGCTCG	2	12	9078189	9078200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153584
7007	NC_017186	GGCGAG	2	12	9078401	9078412	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384153584
7008	NC_017186	TGATCG	2	12	9079484	9079495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153585
7009	NC_017186	GGTCCA	2	12	9079740	9079751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153585
7010	NC_017186	CCTGTT	2	12	9079921	9079932	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384153586
7011	NC_017186	TGCCGG	2	12	9083954	9083965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153590
7012	NC_017186	GGCTGG	2	12	9085338	9085349	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384153592
7013	NC_017186	CCTGCA	2	12	9085472	9085483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153592
7014	NC_017186	GCCGCG	2	12	9087109	9087120	0 %	0 %	50 %	50 %	384153593
7015	NC_017186	CGGCTC	2	12	9089045	9089056	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153595
7016	NC_017186	CGCGAT	2	12	9090330	9090341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153596
7017	NC_017186	AGACCG	2	12	9091130	9091141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153596
7018	NC_017186	GCTGCC	2	12	9091293	9091304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153596
7019	NC_017186	CTGCAC	2	12	9092509	9092520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153597
7020	NC_017186	CAGCTC	2	12	9093980	9093991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153598
7021	NC_017186	ACGGCC	2	12	9095561	9095572	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153600
7022	NC_017186	GACGAA	2	12	9096962	9096973	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384153601
7023	NC_017186	CCGAGG	2	12	9097381	9097392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153602
7024	NC_017186	GCTGTG	2	12	9099730	9099741	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153604
7025	NC_017186	CGATCG	2	12	9101842	9101853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153608
7026	NC_017186	CACCGG	2	12	9102520	9102531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153609
7027	NC_017186	CGGTCC	2	12	9102747	9102758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153609
7028	NC_017186	CTCGGC	2	12	9104117	9104128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153609
7029	NC_017186	GCCCGT	2	12	9105735	9105746	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153611
7030	NC_017186	CTGGCC	2	12	9108117	9108128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153612
7031	NC_017186	TCGACC	2	12	9108874	9108885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153613
7032	NC_017186	CGTTCT	2	12	9108901	9108912	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384153613
7033	NC_017186	CATCGA	2	12	9109094	9109105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153613
7034	NC_017186	TCGCCG	2	12	9110199	9110210	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153614
7035	NC_017186	CAAGCG	2	12	9110424	9110435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153615
7036	NC_017186	CACCGG	2	12	9110463	9110474	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153615
7037	NC_017186	ACCCGG	2	12	9111590	9111601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153615
7038	NC_017186	CCGCTT	2	12	9112863	9112874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384153617
7039	NC_017186	GCTCCG	2	12	9113530	9113541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153618
7040	NC_017186	TCGGCC	2	12	9114835	9114846	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153619
7041	NC_017186	ACGAAG	2	12	9115539	9115550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384153620
7042	NC_017186	CATCAG	2	12	9117203	9117214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153622
7043	NC_017186	CCGGCC	2	12	9118582	9118593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153623
7044	NC_017186	CGGGGT	2	12	9119433	9119444	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384153625
7045	NC_017186	GCGAGC	2	12	9119983	9119994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153625
7046	NC_017186	ATCGGG	2	12	9120127	9120138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153625
7047	NC_017186	CCGGCG	2	12	9120467	9120478	0 %	0 %	50 %	50 %	384153625
7048	NC_017186	CGGCAC	2	12	9121743	9121754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153626
7049	NC_017186	GCAGAT	2	12	9122888	9122899	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384153626
7050	NC_017186	GGCGCC	2	12	9123468	9123479	0 %	0 %	50 %	50 %	384153626
7051	NC_017186	TCGACA	2	12	9124252	9124263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153626
7052	NC_017186	CTTCGG	2	12	9127466	9127477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153631
7053	NC_017186	CTGGCC	2	12	9127587	9127598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153631
7054	NC_017186	GGAGCA	2	12	9128535	9128546	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153631
7055	NC_017186	CGTCCG	2	12	9128629	9128640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153631
7056	NC_017186	GGTCCT	2	12	9133790	9133801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153635
7057	NC_017186	GGCGCG	2	12	9134668	9134679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153636
7058	NC_017186	GGTTCG	2	12	9135194	9135205	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153636
7059	NC_017186	CGAGGC	2	12	9141467	9141478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153640
7060	NC_017186	AACGGG	2	12	9142915	9142926	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153641
7061	NC_017186	TCTTGG	2	12	9144853	9144864	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384153641
7062	NC_017186	CGGCTC	2	12	9149265	9149276	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153642
7063	NC_017186	TTCGAG	2	12	9149301	9149312	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153642
7064	NC_017186	GTCGAC	2	12	9151026	9151037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153644
7065	NC_017186	GGCTTC	2	12	9151947	9151958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153645
7066	NC_017186	GCTGGT	2	12	9152944	9152955	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153646
7067	NC_017186	TCGTGA	2	12	9154623	9154634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153649
7068	NC_017186	CACCGA	2	12	9155874	9155885	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153652
7069	NC_017186	TCCACG	2	12	9156455	9156466	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153652
7070	NC_017186	CAGCAC	2	12	9158906	9158917	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153655
7071	NC_017186	GACGGC	2	12	9160256	9160267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153657
7072	NC_017186	AGCACG	2	12	9160269	9160280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153657
7073	NC_017186	CGCCGA	2	12	9161557	9161568	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153658
7074	NC_017186	CATCGG	2	12	9163016	9163027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153660
7075	NC_017186	CCTGGG	2	12	9163174	9163185	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153660
7076	NC_017186	CTCGCG	2	12	9163361	9163372	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153661
7077	NC_017186	GCGGCC	2	12	9167374	9167385	0 %	0 %	50 %	50 %	384153664
7078	NC_017186	GCTGGC	2	12	9169441	9169452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153666
7079	NC_017186	CCGAGC	2	12	9171257	9171268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153668
7080	NC_017186	ACGCCA	2	12	9176950	9176961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153674
7081	NC_017186	CTCGGC	2	12	9178783	9178794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153675
7082	NC_017186	GCTCGC	2	12	9178854	9178865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153675
7083	NC_017186	GACTTC	2	12	9180120	9180131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153676
7084	NC_017186	TACCAG	2	12	9180963	9180974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153676
7085	NC_017186	GCCGAG	2	12	9182997	9183008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153677
7086	NC_017186	TCCGGC	2	12	9183532	9183543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153677
7087	NC_017186	GATCGC	2	12	9186096	9186107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153679
7088	NC_017186	CGGAAA	2	12	9186114	9186125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384153679
7089	NC_017186	CGGTGC	2	12	9187450	9187461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153681
7090	NC_017186	TGGGCG	2	12	9189199	9189210	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384153683
7091	NC_017186	GTCGTG	2	12	9189222	9189233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153683
7092	NC_017186	CACCGA	2	12	9190199	9190210	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153684
7093	NC_017186	GGTCGC	2	12	9192545	9192556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153687
7094	NC_017186	TCGAGG	2	12	9193348	9193359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153688
7095	NC_017186	GGTCCG	2	12	9194413	9194424	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153689
7096	NC_017186	GCCAGC	2	12	9194700	9194711	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153690
7097	NC_017186	GCGACG	2	12	9195471	9195482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153690
7098	NC_017186	ATCGGG	2	12	9197452	9197463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153692
7099	NC_017186	GTGGCC	2	12	9198262	9198273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153693
7100	NC_017186	CTTCGG	2	12	9202536	9202547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153700
7101	NC_017186	GCCGGT	2	12	9202883	9202894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153700
7102	NC_017186	CGCGCT	2	12	9203292	9203303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153700
7103	NC_017186	GAGCTG	2	12	9203614	9203625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153700
7104	NC_017186	ACCTGG	2	12	9205351	9205362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153701
7105	NC_017186	TGCCGC	2	12	9209201	9209212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153705
7106	NC_017186	CCAGTT	2	12	9209364	9209375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153705
7107	NC_017186	CCCACG	2	12	9209588	9209599	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384153705
7108	NC_017186	CAGCGC	2	12	9210316	9210327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153706
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7110	NC_017186	CGACGG	2	12	9212114	9212125	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153707
7111	NC_017186	CGATGC	2	12	9214286	9214297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153709
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7219	NC_017186	CGTGAC	2	12	9338754	9338765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153833
7220	NC_017186	GACCAC	2	12	9348283	9348294	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153844
7221	NC_017186	GACGGC	2	12	9348846	9348857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153845
7222	NC_017186	GCGAGC	2	12	9349087	9349098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153845
7223	NC_017186	CGGCGT	2	12	9350702	9350713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153847
7224	NC_017186	GGGCGC	2	12	9351192	9351203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153847
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7226	NC_017186	CCGGCC	2	12	9355088	9355099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153852
7227	NC_017186	CCAGCT	2	12	9355565	9355576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153853
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7231	NC_017186	TCTCGA	2	12	9358349	9358360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153857
7232	NC_017186	GCCGAG	2	12	9358551	9358562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153857
7233	NC_017186	CCGGGA	2	12	9358993	9359004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153857
7234	NC_017186	CCGAGC	2	12	9360052	9360063	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153859
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7238	NC_017186	GAGGAA	2	12	9366114	9366125	50 %	0 %	50 %	0 %	384153865
7239	NC_017186	CGGGAT	2	12	9367445	9367456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153866
7240	NC_017186	CATCGA	2	12	9367463	9367474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153866
7241	NC_017186	ATCGCC	2	12	9371497	9371508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153868
7242	NC_017186	CCGATC	2	12	9371602	9371613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153868
7243	NC_017186	CGGCGA	2	12	9372394	9372405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153869
7244	NC_017186	GACTTC	2	12	9372777	9372788	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153869
7245	NC_017186	GTGCTG	2	12	9373549	9373560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153870
7246	NC_017186	CGCCCG	2	12	9377265	9377276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153874
7247	NC_017186	GGCGCG	3	18	9381025	9381042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153879
7248	NC_017186	CGGTGC	3	18	9381084	9381101	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153879
7249	NC_017186	TCCGGC	2	12	9381406	9381417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153879
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7251	NC_017186	GTTGCA	2	12	9383999	9384010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153880
7252	NC_017186	CGGACT	2	12	9384061	9384072	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153880
7253	NC_017186	ACGCCG	2	12	9384241	9384252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153880
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7255	NC_017186	GAAGGT	2	12	9389971	9389982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384153886
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7314	NC_017186	GCGGGA	2	12	9474627	9474638	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384153976
7315	NC_017186	CAGTGC	2	12	9475793	9475804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153977
7316	NC_017186	CCCTCA	2	12	9475930	9475941	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384153977
7317	NC_017186	GGCGCT	2	12	9476367	9476378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153978
7318	NC_017186	TTCGGC	2	12	9476605	9476616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153978
7319	NC_017186	CCTGGC	2	12	9477567	9477578	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153978
7320	NC_017186	AGACGG	2	12	9478424	9478435	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153979
7321	NC_017186	TCGCGG	2	12	9480311	9480322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153982
7322	NC_017186	GCGGCC	2	12	9481353	9481364	0 %	0 %	50 %	50 %	384153984
7323	NC_017186	GAACAG	2	12	9482348	9482359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384153985
7324	NC_017186	AGCGCG	2	12	9482610	9482621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153985
7325	NC_017186	CGGCAG	2	12	9482675	9482686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153985
7326	NC_017186	GCTGGT	2	12	9484877	9484888	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153987
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7328	NC_017186	GCGAGC	2	12	9488603	9488614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153989
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7331	NC_017186	CGGTGT	2	12	9490939	9490950	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153992
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7435	NC_017186	GGACGC	2	12	9609305	9609316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154101
7436	NC_017186	TCAAGG	2	12	9611420	9611431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384154103
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7438	NC_017186	CCTGGT	2	12	9624572	9624583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154118
7439	NC_017186	CCGCGA	2	12	9626619	9626630	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154119
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7441	NC_017186	GTCGAC	2	12	9635347	9635358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154125
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