MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 7866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017186	GCGACG	2	12	7696662	7696673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152263
6002	NC_017186	TCGGCG	2	12	7697148	7697159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152263
6003	NC_017186	CGGAAG	2	12	7698518	7698529	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384152264
6004	NC_017186	CCGCGC	2	12	7702732	7702743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152267
6005	NC_017186	CCGCCA	2	12	7704858	7704869	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152270
6006	NC_017186	GGCCGT	2	12	7705332	7705343	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152270
6007	NC_017186	TTGAGC	2	12	7705512	7705523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384152271
6008	NC_017186	GCGCCA	2	12	7706712	7706723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152272
6009	NC_017186	GCCCCG	2	12	7708503	7708514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152274
6010	NC_017186	GCTCCG	2	12	7709664	7709675	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152275
6011	NC_017186	CCCGCG	2	12	7710105	7710116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152275
6012	NC_017186	CCGCGC	2	12	7711248	7711259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384152275
6013	NC_017186	TGCCGC	2	12	7711626	7711637	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152275
6014	NC_017186	GACGCC	2	12	7712230	7712241	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152276
6015	NC_017186	GTTCAG	2	12	7718807	7718818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384152280
6016	NC_017186	CGTGTT	2	12	7720199	7720210	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384152280
6017	NC_017186	GTCACG	2	12	7721942	7721953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152280
6018	NC_017186	GAAGCC	2	12	7725761	7725772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384152284
6019	NC_017186	AGTACA	2	12	7727557	7727568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384152286
6020	NC_017186	GCGCGT	2	12	7728296	7728307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152287
6021	NC_017186	ACTCCG	2	12	7728449	7728460	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152287
6022	NC_017186	ATCTGC	2	12	7728715	7728726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152287
6023	NC_017186	CCGCCA	2	12	7728818	7728829	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152287
6024	NC_017186	CGCGGG	2	12	7729637	7729648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384152288
6025	NC_017186	TCACCG	2	12	7731434	7731445	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152290
6026	NC_017186	GGTGCT	2	12	7731696	7731707	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384152290
6027	NC_017186	GACTTC	2	12	7732072	7732083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152290
6028	NC_017186	CGATCG	2	12	7737968	7737979	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152296
6029	NC_017186	GCCGTG	2	12	7740006	7740017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152298
6030	NC_017186	CACCCG	2	12	7741576	7741587	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152299
6031	NC_017186	CACCGC	2	12	7741786	7741797	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152299
6032	NC_017186	CAGCCG	2	12	7742993	7743004	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152300
6033	NC_017186	CGAGGT	2	12	7743220	7743231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384152300
6034	NC_017186	CGCGGC	2	12	7746376	7746387	0 %	0 %	50 %	50 %	384152306
6035	NC_017186	GCCAGC	2	12	7746799	7746810	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152307
6036	NC_017186	CGCCCA	2	12	7747467	7747478	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152307
6037	NC_017186	CGGCCG	2	12	7749538	7749549	0 %	0 %	50 %	50 %	384152309
6038	NC_017186	CCTTCG	2	12	7751107	7751118	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384152311
6039	NC_017186	CGGCGC	2	12	7753780	7753791	0 %	0 %	50 %	50 %	384152316
6040	NC_017186	ACCGGA	2	12	7757073	7757084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384152320
6041	NC_017186	CGTCGA	2	12	7757671	7757682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152321
6042	NC_017186	GTCGAC	2	12	7758320	7758331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152321
6043	NC_017186	CCGGCA	2	12	7761186	7761197	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152322
6044	NC_017186	GAGCTG	2	12	7762217	7762228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384152324
6045	NC_017186	GGCTGC	2	12	7764105	7764116	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152326
6046	NC_017186	CCTCGG	2	12	7764175	7764186	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152326
6047	NC_017186	ACCGCG	2	12	7765084	7765095	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152327
6048	NC_017186	GGCCGC	2	12	7766110	7766121	0 %	0 %	50 %	50 %	384152328
6049	NC_017186	GCGTCA	2	12	7766130	7766141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152328
6050	NC_017186	CCTCGG	2	12	7766733	7766744	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152329
6051	NC_017186	CGAAGG	2	12	7767452	7767463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384152329
6052	NC_017186	CAGCTG	2	12	7768159	7768170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152330
6053	NC_017186	CCGCCC	2	12	7768640	7768651	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384152331
6054	NC_017186	CCGGTG	2	12	7769604	7769615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152332
6055	NC_017186	GATCTC	2	12	7772575	7772586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152333
6056	NC_017186	CTCGAT	2	12	7775891	7775902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384152334
6057	NC_017186	TCGACC	2	12	7777522	7777533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152334
6058	NC_017186	CGTCGG	2	12	7781246	7781257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152338
6059	NC_017186	GCGACC	2	12	7782695	7782706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152339
6060	NC_017186	CCGCGG	2	12	7784629	7784640	0 %	0 %	50 %	50 %	384152342
6061	NC_017186	CCGGCG	2	12	7784926	7784937	0 %	0 %	50 %	50 %	384152343
6062	NC_017186	CCGAGC	2	12	7795057	7795068	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152353
6063	NC_017186	GGCGCG	2	12	7796935	7796946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384152354
6064	NC_017186	GGCCGA	2	12	7798417	7798428	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152356
6065	NC_017186	TCGCCG	2	12	7800925	7800936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152359
6066	NC_017186	GTCGCT	2	12	7802507	7802518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384152359
6067	NC_017186	CCGGGG	2	12	7803564	7803575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384152359
6068	NC_017186	GTGCGG	2	12	7803895	7803906	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384152360
6069	NC_017186	GACAGC	2	12	7803997	7804008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384152360
6070	NC_017186	CCGGAC	2	12	7804083	7804094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152360
6071	NC_017186	CATGTA	2	12	7804809	7804820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384152360
6072	NC_017186	GCGACG	2	12	7806591	7806602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152362
6073	NC_017186	GTCGCC	2	12	7806691	7806702	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152362
6074	NC_017186	ATCCTC	2	12	7807920	7807931	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384152364
6075	NC_017186	ACCTGC	2	12	7808634	7808645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152365
6076	NC_017186	CGCACG	2	12	7813455	7813466	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152368
6077	NC_017186	CACCGC	2	12	7814046	7814057	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152369
6078	NC_017186	ACCGCG	2	12	7814885	7814896	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384152369
6079	NC_017186	CGTCGG	2	12	7815544	7815555	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152370
6080	NC_017186	TCGGCC	2	12	7816164	7816175	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152370
6081	NC_017186	GCGATC	2	12	7816501	7816512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152371
6082	NC_017186	GGATCA	2	12	7821467	7821478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384152376
6083	NC_017186	TCGGCG	2	12	7822728	7822739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152377
6084	NC_017186	AGGCGG	2	12	7822948	7822959	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384152377
6085	NC_017186	TCGGCC	2	12	7824790	7824801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152378
6086	NC_017186	CGGCGC	2	12	7825583	7825594	0 %	0 %	50 %	50 %	384152380
6087	NC_017186	CGGGAG	2	12	7825609	7825620	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384152380
6088	NC_017186	GTCTTG	2	12	7826787	7826798	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384152380
6089	NC_017186	CATGAT	2	12	7828407	7828418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384152382
6090	NC_017186	CCGAGG	2	12	7829450	7829461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152382
6091	NC_017186	TGACCG	2	12	7829903	7829914	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152383
6092	NC_017186	CGGCGA	2	12	7829936	7829947	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152383
6093	NC_017186	GCTGCC	2	12	7829997	7830008	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152383
6094	NC_017186	GGTGAA	2	12	7830183	7830194	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384152383
6095	NC_017186	CCCGAC	2	12	7830207	7830218	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152383
6096	NC_017186	GCGGTC	2	12	7830322	7830333	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152383
6097	NC_017186	GCTTCG	2	12	7831739	7831750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384152384
6098	NC_017186	GTCTCG	2	12	7832173	7832184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384152384
6099	NC_017186	CGTCGG	2	12	7835101	7835112	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152388
6100	NC_017186	CCGATG	2	12	7837355	7837366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152389
6101	NC_017186	CCGCGG	2	12	7842138	7842149	0 %	0 %	50 %	50 %	384152396
6102	NC_017186	GGACCT	2	12	7842956	7842967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152397
6103	NC_017186	CGCTTC	2	12	7849100	7849111	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384152405
6104	NC_017186	CGCGGC	2	12	7859988	7859999	0 %	0 %	50 %	50 %	384152422
6105	NC_017186	GTAGCC	2	12	7861238	7861249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152424
6106	NC_017186	CGCTCG	2	12	7861264	7861275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152424
6107	NC_017186	TCGCCG	2	12	7861737	7861748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152424
6108	NC_017186	GCCGTC	2	12	7861829	7861840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152424
6109	NC_017186	GACGGC	2	12	7862234	7862245	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152424
6110	NC_017186	CGGGCA	2	12	7863664	7863675	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384152426
6111	NC_017186	TCGGGG	2	12	7865232	7865243	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384152426
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6322	NC_017186	TGGTGA	2	12	8191056	8191067	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384152729
6323	NC_017186	CAGTAG	2	12	8193621	8193632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384152730
6324	NC_017186	GTCGGC	2	12	8193710	8193721	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384152730
6325	NC_017186	GTGCTC	2	12	8194513	8194524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384152731
6326	NC_017186	GCCGGC	2	12	8194805	8194816	0 %	0 %	50 %	50 %	384152731
6327	NC_017186	CACCGC	2	12	8195487	8195498	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384152732
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6330	NC_017186	CAGGTC	2	12	8198557	8198568	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152735
6331	NC_017186	GGCCGC	2	12	8199454	8199465	0 %	0 %	50 %	50 %	384152736
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6429	NC_017186	CCGCCC	2	12	8320071	8320082	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384152853
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6431	NC_017186	CACCAG	2	12	8322380	8322391	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384152853
6432	NC_017186	CGCCTG	2	12	8324317	8324328	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384152854
6433	NC_017186	GAAAGC	2	12	8325093	8325104	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384152855
6434	NC_017186	GCCGAT	2	12	8326337	8326348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384152856
6435	NC_017186	CATCGC	2	12	8330681	8330692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384152859
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