MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	GCA	2	6	19	24	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022784	CTT	2	6	36	41	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022784	TTG	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022784	TGA	2	6	153	158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022784	TCA	2	6	167	172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022784	GTT	2	6	182	187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022784	TGT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022784	CAG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
9	NC_022784	ACA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625307
10	NC_022784	CGA	2	6	378	383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
11	NC_022784	CAT	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625307
12	NC_022784	AGG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625307
13	NC_022784	TGA	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625307
14	NC_022784	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625307
15	NC_022784	GCA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
16	NC_022784	GAC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
17	NC_022784	CGG	2	6	1000	1005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625307
18	NC_022784	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625307
19	NC_022784	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
20	NC_022784	TTG	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625307
21	NC_022784	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
22	NC_022784	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
23	NC_022784	AGA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
24	NC_022784	AGT	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625307
25	NC_022784	TGC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
26	NC_022784	CTA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625307
27	NC_022784	GCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
28	NC_022784	ATA	2	6	1633	1638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625307
29	NC_022784	AGC	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
30	NC_022784	GCA	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
31	NC_022784	GAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
32	NC_022784	TGC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
33	NC_022784	CGG	2	6	2188	2193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625308
34	NC_022784	GCC	2	6	2199	2204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625308
35	NC_022784	GCT	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
36	NC_022784	TAG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625308
37	NC_022784	ACA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625308
38	NC_022784	GCC	2	6	2358	2363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625308
39	NC_022784	TAT	2	6	2378	2383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625308
40	NC_022784	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625308
41	NC_022784	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
42	NC_022784	CAC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625308
43	NC_022784	CCG	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625309
44	NC_022784	ACA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625309
45	NC_022784	TTG	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625309
46	NC_022784	AAT	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625309
47	NC_022784	TCT	2	6	2882	2887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625309
48	NC_022784	TGC	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625309
49	NC_022784	TTG	2	6	3094	3099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625309
50	NC_022784	AGG	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625309
51	NC_022784	CTG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
52	NC_022784	TCG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
53	NC_022784	CTC	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625310
54	NC_022784	CAC	2	6	3431	3436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625310
55	NC_022784	GCG	2	6	3473	3478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625310
56	NC_022784	TTG	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625310
57	NC_022784	CTC	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625310
58	NC_022784	ATG	2	6	3812	3817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625310
59	NC_022784	CTG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
60	NC_022784	TGC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
61	NC_022784	GCT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
62	NC_022784	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625310
63	NC_022784	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625310
64	NC_022784	TCA	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625310
65	NC_022784	ATG	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022784	TGT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022784	GTC	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625311
68	NC_022784	GAA	2	6	4753	4758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625311
69	NC_022784	AGG	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626111
70	NC_022784	GCG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626111
71	NC_022784	GAA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626111
72	NC_022784	TGT	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022784	TGC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022784	ATG	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625312
75	NC_022784	ACT	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
76	NC_022784	TTC	2	6	5487	5492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625312
77	NC_022784	TTC	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625312
78	NC_022784	TCA	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
79	NC_022784	CTG	2	6	5661	5666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
80	NC_022784	GTT	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625312
81	NC_022784	TGT	2	6	5738	5743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625312
82	NC_022784	CAA	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
83	NC_022784	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
84	NC_022784	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
85	NC_022784	GCT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
86	NC_022784	CCA	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625312
87	NC_022784	AAC	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
88	NC_022784	CAA	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
89	NC_022784	CAA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
90	NC_022784	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
91	NC_022784	CGT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
92	NC_022784	TGG	2	6	6379	6384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022784	TCG	2	6	6442	6447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625313
94	NC_022784	TCA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625313
95	NC_022784	TAC	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625313
96	NC_022784	CGT	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625313
97	NC_022784	TTA	2	6	6849	6854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022784	TGA	2	6	6958	6963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022784	CTG	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022784	TGC	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
101	NC_022784	TAC	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625314
102	NC_022784	CGT	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
103	NC_022784	GAC	2	6	7396	7401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
104	NC_022784	TGC	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
105	NC_022784	GCT	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
106	NC_022784	GCA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
107	NC_022784	GGT	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625314
108	NC_022784	TGT	2	6	7963	7968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625314
109	NC_022784	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625314
110	NC_022784	CAC	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625314
111	NC_022784	GAG	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625314
112	NC_022784	GTA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625314
113	NC_022784	GCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
114	NC_022784	TCA	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625314
115	NC_022784	AAC	2	6	8559	8564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625314
116	NC_022784	GCC	2	6	8585	8590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_022784	TAT	2	6	8688	8693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625315
118	NC_022784	CGC	2	6	8850	8855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625315
119	NC_022784	TGT	2	6	8928	8933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625315
120	NC_022784	TCA	5	15	8962	8976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625315
121	NC_022784	TCT	2	6	9020	9025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625315
122	NC_022784	GAA	2	6	9055	9060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625315
123	NC_022784	AAT	2	6	9089	9094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625315
124	NC_022784	TGC	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625315
125	NC_022784	TCA	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625315
126	NC_022784	GCC	2	6	9205	9210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625315
127	NC_022784	CAG	2	6	9325	9330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625315
128	NC_022784	ACC	2	6	9564	9569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625315
129	NC_022784	GCT	2	6	9788	9793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
130	NC_022784	TCG	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
131	NC_022784	CAG	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625316
132	NC_022784	TGC	2	6	10068	10073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
133	NC_022784	CGA	3	9	10314	10322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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136	NC_022784	GGT	2	6	10599	10604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022784	TGC	2	6	10691	10696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022784	TTC	2	6	10726	10731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_022784	AGG	2	6	10747	10752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_022784	TGA	2	6	10911	10916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022784	CAT	2	6	11002	11007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_022784	GTT	2	6	11011	11016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022784	ACG	2	6	11057	11062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022784	GTT	2	6	11166	11171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_022784	GTT	2	6	12507	12512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_022784	CGC	2	6	21508	21513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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261	NC_022784	TGC	2	6	21854	21859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625322
262	NC_022784	CAT	2	6	21879	21884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625322
263	NC_022784	CTG	2	6	21961	21966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625322
264	NC_022784	TGA	2	6	22071	22076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625322
265	NC_022784	GCC	2	6	22165	22170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625322
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269	NC_022784	CAT	2	6	22563	22568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625322
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274	NC_022784	GTG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625322
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276	NC_022784	GCG	2	6	23074	23079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625322
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292	NC_022784	ATG	2	6	24236	24241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022784	ACC	2	6	24254	24259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
294	NC_022784	ATG	2	6	24266	24271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_022784	CAG	2	6	24333	24338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_022784	CTG	2	6	24347	24352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_022784	CTG	2	6	24375	24380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_022784	TGA	2	6	24381	24386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_022784	GGA	2	6	24452	24457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_022784	TTA	2	6	24542	24547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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370	NC_022784	AGA	2	6	29313	29318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625330
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382	NC_022784	GGC	2	6	30983	30988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_022784	CCG	2	6	31087	31092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
384	NC_022784	AGG	2	6	31103	31108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
385	NC_022784	CGG	2	6	31199	31204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
386	NC_022784	TGC	2	6	31322	31327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_022784	TGT	2	6	31391	31396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
388	NC_022784	CTG	2	6	31420	31425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
389	NC_022784	TGC	2	6	31426	31431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
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391	NC_022784	TGC	2	6	31598	31603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
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472	NC_022784	ACC	2	6	39338	39343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_022784	CTT	2	6	42031	42036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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