MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022784	GCG	2	6	450112	450117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626130
5502	NC_022784	CTT	2	6	450277	450282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625595
5503	NC_022784	TTC	2	6	450320	450325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625595
5504	NC_022784	TTC	2	6	450338	450343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625595
5505	NC_022784	CCA	2	6	450391	450396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625595
5506	NC_022784	CAG	2	6	450505	450510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625595
5507	NC_022784	GTA	2	6	450563	450568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625595
5508	NC_022784	TGA	2	6	450631	450636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022784	TTA	2	6	450746	450751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625596
5510	NC_022784	GCT	2	6	450787	450792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625596
5511	NC_022784	TTG	2	6	451127	451132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5512	NC_022784	TGG	2	6	451262	451267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625596
5513	NC_022784	CAC	2	6	451338	451343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625596
5514	NC_022784	ATA	2	6	451407	451412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625596
5515	NC_022784	TGT	2	6	451475	451480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5516	NC_022784	GCT	2	6	451532	451537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625596
5517	NC_022784	ATG	2	6	451642	451647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625596
5518	NC_022784	TGT	2	6	451658	451663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5519	NC_022784	GTT	2	6	451788	451793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5520	NC_022784	TTG	2	6	451831	451836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5521	NC_022784	ATT	2	6	451860	451865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625596
5522	NC_022784	TTG	2	6	451972	451977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625596
5523	NC_022784	TAT	2	6	452102	452107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625596
5524	NC_022784	CTT	2	6	452126	452131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625596
5525	NC_022784	CTT	2	6	452360	452365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625596
5526	NC_022784	TTC	2	6	452554	452559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625596
5527	NC_022784	AAT	2	6	453096	453101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625596
5528	NC_022784	GCC	2	6	453396	453401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_022784	AGC	2	6	453473	453478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_022784	CCT	2	6	453539	453544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_022784	TTG	2	6	453592	453597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_022784	GAA	2	6	453625	453630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_022784	TCA	2	6	453649	453654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_022784	GCG	2	6	454778	454783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_022784	GCG	2	6	454810	454815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_022784	AAT	3	9	454845	454853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_022784	TGT	2	6	454918	454923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_022784	CTT	2	6	454936	454941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_022784	GCC	2	6	455042	455047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_022784	GAG	2	6	455054	455059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625597
5541	NC_022784	AGT	2	6	455131	455136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625597
5542	NC_022784	CGT	2	6	455347	455352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625597
5543	NC_022784	GGC	2	6	455662	455667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625597
5544	NC_022784	GGC	2	6	455671	455676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625597
5545	NC_022784	TGA	2	6	455716	455721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625597
5546	NC_022784	TGA	2	6	455836	455841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625597
5547	NC_022784	TTG	2	6	455862	455867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625597
5548	NC_022784	CTA	2	6	455939	455944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625597
5549	NC_022784	TGT	2	6	455965	455970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625597
5550	NC_022784	AAT	2	6	456067	456072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625597
5551	NC_022784	ACA	2	6	456129	456134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625597
5552	NC_022784	CTA	2	6	456153	456158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625597
5553	NC_022784	GTG	2	6	456165	456170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625597
5554	NC_022784	ATT	2	6	456185	456190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625597
5555	NC_022784	CGC	2	6	456202	456207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625597
5556	NC_022784	TGC	2	6	456223	456228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625597
5557	NC_022784	TGC	2	6	456233	456238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625597
5558	NC_022784	TGA	2	6	456292	456297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625597
5559	NC_022784	ATA	2	6	456299	456304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625597
5560	NC_022784	CAG	2	6	456305	456310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625597
5561	NC_022784	TCT	2	6	456328	456333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625597
5562	NC_022784	GTA	2	6	456552	456557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_022784	CTT	2	6	456559	456564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_022784	GAT	2	6	456612	456617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5565	NC_022784	ATT	2	6	456639	456644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625598
5566	NC_022784	TGG	2	6	456925	456930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625598
5567	NC_022784	GGA	2	6	456955	456960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625598
5568	NC_022784	GTA	2	6	456970	456975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5569	NC_022784	CTG	2	6	457077	457082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5570	NC_022784	ATA	2	6	457087	457092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625598
5571	NC_022784	GCG	2	6	457093	457098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625598
5572	NC_022784	GCA	2	6	457280	457285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5573	NC_022784	CTA	2	6	457294	457299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625598
5574	NC_022784	ATG	2	6	457326	457331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5575	NC_022784	TAA	2	6	457384	457389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625598
5576	NC_022784	GAA	2	6	457505	457510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625598
5577	NC_022784	TGA	2	6	457595	457600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5578	NC_022784	GGA	3	9	457627	457635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625598
5579	NC_022784	GAC	3	9	457773	457781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5580	NC_022784	TGC	2	6	457792	457797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5581	NC_022784	CCT	3	9	457863	457871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625598
5582	NC_022784	AAG	2	6	457896	457901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625598
5583	NC_022784	GGA	2	6	457904	457909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625598
5584	NC_022784	ATT	2	6	457944	457949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625598
5585	NC_022784	GGA	2	6	458014	458019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625598
5586	NC_022784	GCG	2	6	458138	458143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625598
5587	NC_022784	GGC	2	6	458379	458384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625598
5588	NC_022784	GAT	2	6	458430	458435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5589	NC_022784	GGA	2	6	458690	458695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625598
5590	NC_022784	AGA	2	6	458714	458719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625598
5591	NC_022784	AGA	2	6	458749	458754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625598
5592	NC_022784	TGA	2	6	458867	458872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625598
5593	NC_022784	GAA	2	6	458883	458888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625598
5594	NC_022784	CTG	2	6	458898	458903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5595	NC_022784	GCA	2	6	458978	458983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625598
5596	NC_022784	ATT	2	6	458984	458989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625598
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5598	NC_022784	TGT	2	6	459171	459176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_022784	GTC	2	6	459220	459225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_022784	AAT	2	6	459378	459383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625599
5601	NC_022784	GAA	2	6	459417	459422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625599
5602	NC_022784	AGT	2	6	459456	459461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625599
5603	NC_022784	TAC	2	6	459559	459564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625599
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5605	NC_022784	AGC	2	6	459673	459678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625599
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5607	NC_022784	GCA	2	6	459832	459837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_022784	ATC	2	6	459879	459884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_022784	TGC	2	6	460108	460113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_022784	ATA	2	6	460267	460272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_022784	CAA	2	6	460294	460299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_022784	CGC	2	6	460314	460319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_022784	ACT	2	6	460442	460447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_022784	AAG	2	6	460493	460498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_022784	CTC	2	6	460592	460597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_022784	TCA	2	6	460650	460655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_022784	ACA	2	6	460693	460698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_022784	TCG	2	6	460720	460725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_022784	CAT	2	6	460790	460795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625600
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5621	NC_022784	AGT	2	6	460987	460992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625600
5622	NC_022784	TGC	2	6	460993	460998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625600
5623	NC_022784	CTT	2	6	461002	461007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625600
5624	NC_022784	CTA	2	6	461033	461038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625600
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