MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022784	GCA	2	6	407728	407733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625568
5002	NC_022784	TCG	2	6	407827	407832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625568
5003	NC_022784	CTC	2	6	407923	407928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625568
5004	NC_022784	TTG	2	6	407972	407977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_022784	GCG	2	6	408003	408008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_022784	GTA	2	6	408156	408161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_022784	GAC	2	6	408163	408168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_022784	CCG	2	6	408222	408227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_022784	ATT	2	6	408399	408404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_022784	CCG	2	6	408459	408464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_022784	CCT	2	6	408523	408528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_022784	ACG	3	9	408566	408574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_022784	CTG	2	6	408632	408637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_022784	ACT	2	6	408657	408662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_022784	ACC	2	6	408820	408825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625569
5016	NC_022784	ACA	2	6	408887	408892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625569
5017	NC_022784	CAG	2	6	408917	408922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625569
5018	NC_022784	TGC	2	6	409140	409145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625569
5019	NC_022784	TTA	2	6	409182	409187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625569
5020	NC_022784	TCT	2	6	409188	409193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625569
5021	NC_022784	GAC	2	6	409288	409293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625570
5022	NC_022784	AAT	2	6	409302	409307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625570
5023	NC_022784	CTG	2	6	409490	409495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625570
5024	NC_022784	CAT	2	6	409507	409512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625570
5025	NC_022784	GCA	2	6	409522	409527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625570
5026	NC_022784	ACC	2	6	409569	409574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625570
5027	NC_022784	CAC	2	6	409576	409581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625570
5028	NC_022784	GAC	2	6	409609	409614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625570
5029	NC_022784	AGC	2	6	409737	409742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625570
5030	NC_022784	CAA	2	6	409852	409857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625571
5031	NC_022784	AGG	2	6	409879	409884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625571
5032	NC_022784	GCA	2	6	409969	409974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625571
5033	NC_022784	CAG	2	6	410015	410020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625571
5034	NC_022784	GAA	2	6	410025	410030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625571
5035	NC_022784	GGT	2	6	410243	410248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022784	ACC	2	6	410383	410388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_022784	GCA	2	6	410435	410440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_022784	CCG	2	6	410483	410488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5039	NC_022784	CGC	2	6	410522	410527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625572
5040	NC_022784	CAC	2	6	410589	410594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625572
5041	NC_022784	GCA	2	6	410633	410638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625572
5042	NC_022784	AAC	2	6	411127	411132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625572
5043	NC_022784	CAT	2	6	411591	411596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625572
5044	NC_022784	TCC	2	6	411859	411864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625572
5045	NC_022784	AGC	2	6	411865	411870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625572
5046	NC_022784	CAC	2	6	411922	411927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625572
5047	NC_022784	CTA	2	6	412073	412078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625572
5048	NC_022784	TTG	2	6	412156	412161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625572
5049	NC_022784	TGG	2	6	412264	412269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625572
5050	NC_022784	GAC	2	6	412362	412367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625572
5051	NC_022784	CAC	2	6	412421	412426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625572
5052	NC_022784	AAT	2	6	412444	412449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625572
5053	NC_022784	GCG	2	6	412540	412545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625572
5054	NC_022784	ACC	2	6	412663	412668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625572
5055	NC_022784	ATC	2	6	412731	412736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625572
5056	NC_022784	CAA	2	6	412853	412858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625572
5057	NC_022784	CTT	2	6	412859	412864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625572
5058	NC_022784	CGC	2	6	413119	413124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625572
5059	NC_022784	TGC	2	6	413239	413244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625572
5060	NC_022784	CCA	2	6	413269	413274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625572
5061	NC_022784	GCA	2	6	413327	413332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625572
5062	NC_022784	TTG	2	6	413398	413403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_022784	TCC	2	6	413434	413439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625573
5064	NC_022784	CAG	2	6	413502	413507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625573
5065	NC_022784	CTT	2	6	413649	413654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625573
5066	NC_022784	TCC	2	6	413719	413724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625573
5067	NC_022784	GAA	2	6	413734	413739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625573
5068	NC_022784	CAT	2	6	413742	413747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625573
5069	NC_022784	ATC	2	6	413808	413813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625573
5070	NC_022784	ACC	2	6	413896	413901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625573
5071	NC_022784	TGC	2	6	413987	413992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626129
5072	NC_022784	GGA	2	6	414022	414027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626129
5073	NC_022784	TGG	2	6	414041	414046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557626129
5074	NC_022784	TGG	2	6	414048	414053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557626129
5075	NC_022784	CAT	2	6	414087	414092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626129
5076	NC_022784	CTT	2	6	414315	414320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626129
5077	NC_022784	TTG	2	6	414330	414335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557626129
5078	NC_022784	TCT	2	6	414344	414349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626129
5079	NC_022784	CTG	2	6	414377	414382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626129
5080	NC_022784	TGC	2	6	414400	414405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626129
5081	NC_022784	TCT	2	6	414520	414525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625574
5082	NC_022784	ATG	2	6	414552	414557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625574
5083	NC_022784	CAT	2	6	414808	414813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625574
5084	NC_022784	CTT	2	6	414857	414862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625574
5085	NC_022784	TGT	2	6	415112	415117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625574
5086	NC_022784	CTG	2	6	415158	415163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625574
5087	NC_022784	CAT	2	6	415186	415191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625574
5088	NC_022784	CAC	2	6	415324	415329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625574
5089	NC_022784	TCC	2	6	415470	415475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625574
5090	NC_022784	CTT	2	6	415492	415497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625574
5091	NC_022784	CTA	2	6	415681	415686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625574
5092	NC_022784	ACG	2	6	415722	415727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625574
5093	NC_022784	ACC	2	6	415917	415922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625574
5094	NC_022784	CTA	2	6	416002	416007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625574
5095	NC_022784	GGA	2	6	416101	416106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625574
5096	NC_022784	CAC	2	6	416126	416131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625574
5097	NC_022784	TAC	2	6	416374	416379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625574
5098	NC_022784	TGC	2	6	416408	416413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_022784	TAC	2	6	416416	416421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_022784	GTA	2	6	416438	416443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_022784	GCC	2	6	416447	416452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_022784	ACC	2	6	416560	416565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625575
5103	NC_022784	ATG	2	6	416579	416584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625575
5104	NC_022784	CAA	2	6	416626	416631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625575
5105	NC_022784	CAT	2	6	416695	416700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625575
5106	NC_022784	CGA	2	6	416758	416763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625575
5107	NC_022784	TCG	2	6	416796	416801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625575
5108	NC_022784	AAG	2	6	416937	416942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625575
5109	NC_022784	GCA	2	6	417130	417135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625575
5110	NC_022784	ACT	2	6	417188	417193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625575
5111	NC_022784	CCA	2	6	417499	417504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625576
5112	NC_022784	ACC	2	6	417515	417520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625576
5113	NC_022784	AAC	2	6	417737	417742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625576
5114	NC_022784	ACT	2	6	417945	417950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625576
5115	NC_022784	TTA	2	6	417986	417991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625576
5116	NC_022784	TGG	2	6	418172	418177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022784	CTG	2	6	418191	418196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_022784	CGT	2	6	418224	418229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_022784	GTG	2	6	418235	418240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022784	CTG	2	6	418290	418295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5357	NC_022784	TGC	2	6	436757	436762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5360	NC_022784	GGA	2	6	437037	437042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625584
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5487	NC_022784	TCA	2	6	448400	448405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625593
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