MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022784	CTG	2	6	84571	84576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_022784	GGC	2	6	84599	84604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_022784	GAT	2	6	84710	84715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022784	CGG	3	9	84809	84817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625361
1005	NC_022784	GAT	2	6	84883	84888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625361
1006	NC_022784	CCT	2	6	84895	84900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625361
1007	NC_022784	GCT	2	6	85002	85007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1008	NC_022784	ACA	2	6	85024	85029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625361
1009	NC_022784	ATC	2	6	85120	85125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625361
1010	NC_022784	CTG	2	6	85352	85357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1011	NC_022784	TTA	2	6	85613	85618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625361
1012	NC_022784	GCA	2	6	85626	85631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1013	NC_022784	CAA	2	6	85772	85777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625361
1014	NC_022784	CTG	2	6	85818	85823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1015	NC_022784	CTG	2	6	86144	86149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1016	NC_022784	CAT	2	6	86162	86167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625361
1017	NC_022784	TCG	2	6	86208	86213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625361
1018	NC_022784	TGT	3	9	86336	86344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625362
1019	NC_022784	CTC	2	6	86610	86615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625362
1020	NC_022784	GCA	2	6	86894	86899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1021	NC_022784	AGC	2	6	87110	87115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1022	NC_022784	TGC	2	6	87130	87135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625362
1023	NC_022784	GCT	2	6	87238	87243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625363
1024	NC_022784	CTT	2	6	87293	87298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625363
1025	NC_022784	CCT	2	6	87311	87316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625363
1026	NC_022784	AAT	2	6	87609	87614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022784	TGT	2	6	87650	87655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022784	TTG	2	6	87685	87690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1029	NC_022784	GCA	2	6	87723	87728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1030	NC_022784	CGT	2	6	87729	87734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1031	NC_022784	GAG	2	6	87798	87803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625364
1032	NC_022784	TGA	2	6	87838	87843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625364
1033	NC_022784	GAA	2	6	87873	87878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625364
1034	NC_022784	GTT	2	6	87989	87994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1035	NC_022784	CTT	2	6	88024	88029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625364
1036	NC_022784	TGT	2	6	88035	88040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1037	NC_022784	GGC	2	6	88049	88054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625364
1038	NC_022784	AGC	2	6	88091	88096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1039	NC_022784	GCA	2	6	88181	88186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1040	NC_022784	AAG	2	6	88218	88223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625364
1041	NC_022784	TAA	2	6	88225	88230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625364
1042	NC_022784	CTT	2	6	88258	88263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625364
1043	NC_022784	CCG	2	6	88320	88325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625364
1044	NC_022784	GTT	2	6	88404	88409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1045	NC_022784	TTG	2	6	88495	88500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625364
1046	NC_022784	GCT	2	6	88502	88507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625364
1047	NC_022784	GTA	2	6	88619	88624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625364
1048	NC_022784	TCC	2	6	88676	88681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625364
1049	NC_022784	GTG	2	6	88720	88725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625365
1050	NC_022784	TGT	2	6	88995	89000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625365
1051	NC_022784	GGA	2	6	89178	89183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625365
1052	NC_022784	TTG	2	6	89207	89212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625365
1053	NC_022784	AAG	2	6	89575	89580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625366
1054	NC_022784	TGT	2	6	89627	89632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625366
1055	NC_022784	TGG	2	6	89796	89801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1056	NC_022784	TGT	2	6	89810	89815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625366
1057	NC_022784	CAA	2	6	89967	89972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625366
1058	NC_022784	CTG	2	6	90101	90106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1059	NC_022784	TGC	2	6	90121	90126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1060	NC_022784	GCT	2	6	90132	90137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1061	NC_022784	ATA	2	6	90181	90186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625366
1062	NC_022784	TGC	2	6	90190	90195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625366
1063	NC_022784	GTG	2	6	90310	90315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1064	NC_022784	CTT	2	6	90399	90404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625366
1065	NC_022784	TGG	2	6	90606	90611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625366
1066	NC_022784	TAG	2	6	90750	90755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022784	ACC	2	6	90765	90770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_022784	GGT	2	6	90781	90786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_022784	TCT	2	6	90812	90817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625367
1070	NC_022784	TGC	2	6	90837	90842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625367
1071	NC_022784	GGC	2	6	90910	90915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625367
1072	NC_022784	AGC	2	6	91046	91051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625367
1073	NC_022784	GAC	2	6	91052	91057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625367
1074	NC_022784	GCC	3	9	91106	91114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625367
1075	NC_022784	TTG	2	6	91148	91153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625367
1076	NC_022784	GCT	2	6	91259	91264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625367
1077	NC_022784	GAA	2	6	91348	91353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625367
1078	NC_022784	CAA	2	6	91467	91472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_022784	TGA	2	6	91586	91591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625368
1080	NC_022784	TCC	2	6	91602	91607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625368
1081	NC_022784	TCG	2	6	91633	91638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625368
1082	NC_022784	GCC	2	6	91675	91680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625368
1083	NC_022784	TGT	2	6	91722	91727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625368
1084	NC_022784	TCT	2	6	91772	91777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625368
1085	NC_022784	TGG	2	6	92023	92028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625368
1086	NC_022784	TAC	2	6	92091	92096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_022784	CGG	2	6	92169	92174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_022784	CTG	2	6	92391	92396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_022784	ACA	2	6	92421	92426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_022784	GAA	2	6	92540	92545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_022784	AAG	2	6	92549	92554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022784	GTG	2	6	92585	92590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022784	TTC	2	6	92642	92647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_022784	CTA	2	6	97514	97519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022784	TCA	2	6	97527	97532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022784	TGT	2	6	97540	97545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022784	CGT	2	6	97625	97630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625369
1098	NC_022784	TCG	2	6	97752	97757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625369
1099	NC_022784	TGG	2	6	97918	97923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625369
1100	NC_022784	ACC	2	6	98009	98014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625369
1101	NC_022784	AGG	2	6	98031	98036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625369
1102	NC_022784	CCT	2	6	98092	98097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625369
1103	NC_022784	CAA	2	6	98098	98103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625369
1104	NC_022784	GCC	2	6	98112	98117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625369
1105	NC_022784	GCT	2	6	98300	98305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_022784	GAT	2	6	98363	98368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022784	GTC	2	6	98800	98805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_022784	CTG	2	6	98823	98828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_022784	GTT	2	6	99035	99040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_022784	AGG	2	6	99043	99048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_022784	GCA	2	6	99161	99166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_022784	TGC	2	6	99172	99177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_022784	TGC	2	6	99221	99226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_022784	CTT	2	6	99255	99260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022784	TTC	2	6	99466	99471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_022784	TGC	2	6	99487	99492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_022784	ATG	2	6	99524	99529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_022784	CCA	2	6	99530	99535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_022784	TCA	2	6	99540	99545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_022784	CAG	3	9	99655	99663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_022784	TGC	2	6	99709	99714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022784	GCT	2	6	99800	99805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022784	AGG	2	6	100050	100055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022784	GCT	2	6	100247	100252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_022784	CAA	2	6	100287	100292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_022784	CTG	2	6	110254	110259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625372
1254	NC_022784	ACC	2	6	110347	110352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625372
1255	NC_022784	TTG	2	6	110360	110365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625372
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1282	NC_022784	CTG	2	6	112479	112484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1284	NC_022784	CTG	2	6	112491	112496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1368	NC_022784	CAG	2	6	119620	119625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625377
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1374	NC_022784	TAC	2	6	120456	120461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_022784	CAA	2	6	120468	120473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_022784	ACG	2	6	120490	120495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1381	NC_022784	TGC	2	6	120889	120894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1490	NC_022784	CTC	2	6	129843	129848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625386
1491	NC_022784	CAA	2	6	129850	129855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625386
1492	NC_022784	TTC	2	6	129862	129867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625386
1493	NC_022784	TAT	2	6	129886	129891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625386
1494	NC_022784	CAA	2	6	130106	130111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625386
1495	NC_022784	TTG	2	6	130320	130325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625386
1496	NC_022784	GTG	2	6	130326	130331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1497	NC_022784	CTG	2	6	130359	130364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1498	NC_022784	CAA	2	6	130378	130383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_022784	GCG	2	6	130926	130931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625387
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