MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022784	CTT	2	6	365802	365807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625537
4502	NC_022784	CTG	2	6	365845	365850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625537
4503	NC_022784	CTA	2	6	365891	365896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625537
4504	NC_022784	GTC	2	6	365959	365964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625537
4505	NC_022784	GCT	2	6	365980	365985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625537
4506	NC_022784	TCC	2	6	366003	366008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625537
4507	NC_022784	TTG	2	6	366031	366036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625537
4508	NC_022784	GTG	2	6	366037	366042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625537
4509	NC_022784	GCT	2	6	366168	366173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625537
4510	NC_022784	GCG	2	6	366280	366285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625537
4511	NC_022784	ATC	2	6	366546	366551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625537
4512	NC_022784	TCG	2	6	366645	366650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_022784	CGC	2	6	366874	366879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_022784	GCC	2	6	366886	366891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4515	NC_022784	AAG	2	6	367005	367010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_022784	CAA	2	6	367110	367115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_022784	TTC	2	6	367134	367139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_022784	GTA	2	6	367264	367269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_022784	ACT	2	6	367274	367279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_022784	ACT	2	6	367406	367411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_022784	CTC	2	6	367420	367425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_022784	GAA	2	6	367484	367489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_022784	ACG	2	6	368223	368228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_022784	CTG	2	6	368316	368321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_022784	AGC	2	6	368344	368349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_022784	CGC	2	6	368352	368357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_022784	TGC	2	6	368450	368455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_022784	ACT	2	6	368552	368557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_022784	CGC	2	6	368893	368898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_022784	TCA	2	6	368965	368970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_022784	GCT	2	6	369050	369055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_022784	CGT	3	9	369082	369090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_022784	CGT	2	6	369151	369156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_022784	CTA	2	6	369240	369245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_022784	GGT	2	6	369278	369283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_022784	TGG	2	6	369305	369310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_022784	CGG	2	6	369325	369330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_022784	CAC	2	6	369427	369432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_022784	CGG	2	6	369488	369493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_022784	CCA	2	6	369630	369635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625538
4541	NC_022784	CGA	2	6	369862	369867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4542	NC_022784	AGC	2	6	370008	370013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4543	NC_022784	AAC	2	6	370130	370135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625540
4544	NC_022784	TTC	2	6	370361	370366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625540
4545	NC_022784	AGA	2	6	370494	370499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625540
4546	NC_022784	GTT	2	6	370585	370590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625540
4547	NC_022784	TCC	2	6	370694	370699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625540
4548	NC_022784	GCT	2	6	370828	370833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4549	NC_022784	CGC	2	6	370842	370847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625540
4550	NC_022784	GCA	2	6	370894	370899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4551	NC_022784	TTG	2	6	370938	370943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625540
4552	NC_022784	GCT	2	6	370966	370971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4553	NC_022784	TAA	2	6	370977	370982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625540
4554	NC_022784	GCA	2	6	371006	371011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4555	NC_022784	TGG	2	6	371023	371028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625540
4556	NC_022784	ACA	2	6	371160	371165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625540
4557	NC_022784	ACC	2	6	371261	371266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625540
4558	NC_022784	GAG	2	6	371285	371290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625540
4559	NC_022784	AGG	2	6	371367	371372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625540
4560	NC_022784	TTG	2	6	371469	371474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625540
4561	NC_022784	ATG	2	6	371547	371552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625540
4562	NC_022784	CGG	2	6	371673	371678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625540
4563	NC_022784	CAG	2	6	371713	371718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4564	NC_022784	ACG	2	6	371856	371861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4565	NC_022784	ACG	2	6	371898	371903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4566	NC_022784	GAA	2	6	371968	371973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625540
4567	NC_022784	AGA	2	6	371998	372003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625540
4568	NC_022784	TAG	2	6	372036	372041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625540
4569	NC_022784	GCA	2	6	372184	372189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4570	NC_022784	GTG	2	6	372201	372206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625540
4571	NC_022784	GGA	2	6	372212	372217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625540
4572	NC_022784	TGC	2	6	372236	372241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4573	NC_022784	TGC	2	6	372265	372270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625540
4574	NC_022784	ACG	2	6	372394	372399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625541
4575	NC_022784	GTG	2	6	372445	372450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625541
4576	NC_022784	GCA	2	6	372455	372460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625541
4577	NC_022784	TGC	2	6	372702	372707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_022784	CTG	2	6	372945	372950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625542
4579	NC_022784	TGG	2	6	373072	373077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625542
4580	NC_022784	TGT	2	6	373078	373083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625542
4581	NC_022784	GAC	2	6	373120	373125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625542
4582	NC_022784	GGA	2	6	373233	373238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625542
4583	NC_022784	CTA	2	6	373361	373366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625542
4584	NC_022784	CTG	2	6	373385	373390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625542
4585	NC_022784	GTC	2	6	373462	373467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625542
4586	NC_022784	TGC	2	6	373514	373519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625542
4587	NC_022784	TTG	2	6	373568	373573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625542
4588	NC_022784	GTG	2	6	373675	373680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625542
4589	NC_022784	AGA	2	6	373919	373924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625542
4590	NC_022784	CAC	2	6	374005	374010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625542
4591	NC_022784	TGT	2	6	374145	374150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_022784	TTG	2	6	374307	374312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4593	NC_022784	CAA	2	6	374328	374333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625543
4594	NC_022784	CTG	2	6	374385	374390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625543
4595	NC_022784	TGG	2	6	374397	374402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625543
4596	NC_022784	CTA	2	6	374436	374441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625543
4597	NC_022784	ATT	2	6	374480	374485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625543
4598	NC_022784	TGG	2	6	374512	374517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625543
4599	NC_022784	TGT	2	6	374518	374523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4600	NC_022784	GGT	2	6	374560	374565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625543
4601	NC_022784	TAT	2	6	374578	374583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625543
4602	NC_022784	GGA	2	6	374673	374678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625543
4603	NC_022784	GTT	2	6	374706	374711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4604	NC_022784	TTC	2	6	374712	374717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625543
4605	NC_022784	ATT	2	6	374751	374756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625543
4606	NC_022784	CTG	2	6	374825	374830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625543
4607	NC_022784	TTG	2	6	374930	374935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4608	NC_022784	GCT	2	6	374994	374999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625543
4609	NC_022784	TAT	2	6	375016	375021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625543
4610	NC_022784	AGT	2	6	375022	375027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625543
4611	NC_022784	TGT	2	6	375130	375135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4612	NC_022784	TGA	2	6	375410	375415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625543
4613	NC_022784	TGT	2	6	375433	375438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625543
4614	NC_022784	GAT	2	6	375448	375453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625543
4615	NC_022784	TCC	2	6	375514	375519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625543
4616	NC_022784	TAT	2	6	375633	375638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625544
4617	NC_022784	TGT	3	9	375686	375694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625544
4618	NC_022784	TCC	2	6	375695	375700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625544
4619	NC_022784	GAG	2	6	375819	375824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625544
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4621	NC_022784	GTG	2	6	375943	375948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625544
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