MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022784	TTG	2	6	167892	167897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625417
2002	NC_022784	TGC	2	6	167956	167961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625417
2003	NC_022784	CCT	2	6	168022	168027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625417
2004	NC_022784	GGA	2	6	168198	168203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625417
2005	NC_022784	CAA	2	6	168235	168240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625417
2006	NC_022784	TGG	2	6	168372	168377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_022784	TGC	2	6	168776	168781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625418
2008	NC_022784	CTA	2	6	168870	168875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625418
2009	NC_022784	CAA	2	6	168878	168883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625418
2010	NC_022784	CAA	2	6	168925	168930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625418
2011	NC_022784	TCA	2	6	169145	169150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625418
2012	NC_022784	CTC	2	6	169157	169162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625418
2013	NC_022784	CGC	2	6	169417	169422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625418
2014	NC_022784	CCA	2	6	169551	169556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625418
2015	NC_022784	GAG	2	6	169578	169583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625418
2016	NC_022784	TGC	2	6	169790	169795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625418
2017	NC_022784	CTC	2	6	169931	169936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625418
2018	NC_022784	TAA	2	6	169959	169964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625418
2019	NC_022784	TGG	2	6	170292	170297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_022784	TAG	2	6	170322	170327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_022784	TGG	2	6	170335	170340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_022784	TAA	2	6	170493	170498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_022784	GTC	2	6	170560	170565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2024	NC_022784	CAT	2	6	170566	170571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2025	NC_022784	TGG	2	6	170694	170699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625419
2026	NC_022784	GAT	2	6	170732	170737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625419
2027	NC_022784	GTC	2	6	170906	170911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625419
2028	NC_022784	TGG	2	6	170997	171002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625419
2029	NC_022784	TAA	2	6	171141	171146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625419
2030	NC_022784	CGT	2	6	171231	171236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625419
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2032	NC_022784	CGT	2	6	171280	171285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625420
2033	NC_022784	CAA	2	6	171513	171518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625420
2034	NC_022784	ACC	2	6	171536	171541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625420
2035	NC_022784	TCG	2	6	171721	171726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625420
2036	NC_022784	GCA	2	6	171762	171767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625420
2037	NC_022784	TGA	2	6	171774	171779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625420
2038	NC_022784	GTT	2	6	171804	171809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625420
2039	NC_022784	AGG	2	6	171993	171998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625420
2040	NC_022784	GCA	2	6	172552	172557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625421
2041	NC_022784	AGG	2	6	172643	172648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625421
2042	NC_022784	AGG	2	6	172664	172669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625421
2043	NC_022784	CGA	2	6	172712	172717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625421
2044	NC_022784	AGA	2	6	172782	172787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625421
2045	NC_022784	GAT	2	6	172791	172796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
2046	NC_022784	AAG	2	6	172820	172825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625421
2047	NC_022784	ATT	2	6	172869	172874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625421
2048	NC_022784	GCT	2	6	173067	173072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625421
2049	NC_022784	TGA	2	6	173193	173198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
2050	NC_022784	TGA	2	6	173217	173222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
2051	NC_022784	GGT	2	6	173350	173355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625422
2052	NC_022784	TTG	2	6	173358	173363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625422
2053	NC_022784	CTC	2	6	173413	173418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625422
2054	NC_022784	CAA	2	6	173518	173523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625422
2055	NC_022784	GAG	2	6	173560	173565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625422
2056	NC_022784	GAA	2	6	173648	173653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625422
2057	NC_022784	CCA	2	6	173677	173682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625422
2058	NC_022784	AAT	2	6	173695	173700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
2059	NC_022784	ACA	2	6	173703	173708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625422
2060	NC_022784	AAT	2	6	173810	173815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
2061	NC_022784	AAT	2	6	173915	173920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
2062	NC_022784	TCT	2	6	173960	173965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625422
2063	NC_022784	GTT	2	6	173987	173992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625422
2064	NC_022784	AAG	2	6	174023	174028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625422
2065	NC_022784	TGT	2	6	174101	174106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625422
2066	NC_022784	ATT	2	6	174138	174143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_022784	ATA	2	6	174188	174193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_022784	GAT	2	6	174326	174331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_022784	ATG	2	6	174399	174404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
2070	NC_022784	TGT	2	6	174445	174450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625423
2071	NC_022784	TGG	2	6	174642	174647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625423
2072	NC_022784	TCA	2	6	174798	174803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2073	NC_022784	AGT	2	6	174829	174834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
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2075	NC_022784	CAT	2	6	174988	174993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2076	NC_022784	GAG	3	9	175163	175171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625423
2077	NC_022784	TAC	2	6	175202	175207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2078	NC_022784	ATG	2	6	175283	175288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
2079	NC_022784	GCA	2	6	175290	175295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625423
2080	NC_022784	CAA	2	6	175486	175491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625423
2081	NC_022784	GGT	2	6	175580	175585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625423
2082	NC_022784	CAG	2	6	175742	175747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625423
2083	NC_022784	CAT	2	6	175890	175895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2084	NC_022784	GGT	2	6	175902	175907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2085	NC_022784	CAT	2	6	175920	175925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2087	NC_022784	GTA	2	6	176092	176097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625424
2088	NC_022784	CTG	2	6	176159	176164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_022784	GAT	2	6	176170	176175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_022784	TGT	2	6	176187	176192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_022784	CAT	2	6	176235	176240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_022784	TGC	2	6	176364	176369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_022784	TGG	2	6	176616	176621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_022784	TGG	2	6	176744	176749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_022784	AGG	2	6	176791	176796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_022784	GTA	2	6	176911	176916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626117
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2098	NC_022784	ATG	2	6	176955	176960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626117
2099	NC_022784	ACC	2	6	177320	177325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2100	NC_022784	TAG	2	6	177371	177376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_022784	CTT	2	6	177408	177413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_022784	TAA	2	6	177498	177503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_022784	CTT	2	6	177531	177536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_022784	TAA	2	6	177545	177550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_022784	CTC	2	6	177587	177592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2106	NC_022784	TGC	2	6	177736	177741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_022784	GCT	2	6	177757	177762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2108	NC_022784	CAT	2	6	177878	177883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2109	NC_022784	CTT	2	6	177982	177987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625425
2110	NC_022784	CCA	2	6	177991	177996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625425
2111	NC_022784	AGC	2	6	178008	178013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2112	NC_022784	ACA	2	6	178352	178357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625425
2113	NC_022784	ATC	2	6	178358	178363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
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2115	NC_022784	TCC	2	6	178614	178619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625425
2116	NC_022784	CTA	2	6	178645	178650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2117	NC_022784	TAC	2	6	178660	178665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2118	NC_022784	AAT	2	6	178715	178720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625425
2119	NC_022784	TAT	2	6	178826	178831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625425
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2275	NC_022784	GCG	2	6	190718	190723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625432
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2363	NC_022784	CAA	2	6	197100	197105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625437
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2368	NC_022784	GTG	2	6	197304	197309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_022784	GTT	2	6	197370	197375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_022784	TCT	2	6	197432	197437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2486	NC_022784	TGG	2	6	209399	209404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625446
2487	NC_022784	GTT	2	6	209521	209526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625446
2488	NC_022784	CTT	2	6	209538	209543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625446
2489	NC_022784	ACA	2	6	209551	209556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625446
2490	NC_022784	AGA	2	6	209582	209587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625446
2491	NC_022784	CAA	2	6	209609	209614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625446
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2494	NC_022784	CTG	2	6	209866	209871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625447
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