MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022784	TTG	2	6	42043	42048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022784	TGA	2	6	42101	42106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022784	TGC	2	6	42160	42165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625339
504	NC_022784	GCA	2	6	42174	42179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625339
505	NC_022784	CCA	2	6	42189	42194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625339
506	NC_022784	TGC	2	6	42243	42248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625339
507	NC_022784	TGA	2	6	42256	42261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625339
508	NC_022784	TGC	2	6	42295	42300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625339
509	NC_022784	TGC	2	6	42357	42362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625339
510	NC_022784	AGA	2	6	42427	42432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625339
511	NC_022784	GCT	2	6	42463	42468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625339
512	NC_022784	GAA	2	6	42742	42747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625339
513	NC_022784	GGA	2	6	42805	42810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625339
514	NC_022784	GTA	2	6	43094	43099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625339
515	NC_022784	AGC	2	6	43242	43247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625339
516	NC_022784	AAC	2	6	43262	43267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625339
517	NC_022784	CGC	2	6	43321	43326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625339
518	NC_022784	GCC	2	6	43331	43336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625339
519	NC_022784	ACA	2	6	43397	43402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625339
520	NC_022784	CAA	3	9	43466	43474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_022784	CGC	2	6	43539	43544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_022784	ACG	2	6	43546	43551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022784	CCA	2	6	43561	43566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_022784	CAA	2	6	43605	43610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625340
525	NC_022784	CAC	2	6	43710	43715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625340
526	NC_022784	TCT	2	6	43809	43814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625340
527	NC_022784	GCA	2	6	43924	43929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_022784	GCT	2	6	44009	44014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_022784	TGC	2	6	44092	44097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_022784	AGC	2	6	44289	44294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625341
531	NC_022784	TGC	2	6	44473	44478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625341
532	NC_022784	AAG	2	6	44556	44561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625341
533	NC_022784	TGT	2	6	44708	44713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625341
534	NC_022784	CAT	2	6	44717	44722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625341
535	NC_022784	TCA	2	6	44914	44919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625341
536	NC_022784	TCA	2	6	44950	44955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625341
537	NC_022784	CTG	2	6	45084	45089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625341
538	NC_022784	TGC	2	6	45197	45202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625341
539	NC_022784	TGG	2	6	45275	45280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625341
540	NC_022784	ATA	2	6	45351	45356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625341
541	NC_022784	ACA	2	6	45490	45495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_022784	CAC	2	6	45713	45718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626112
543	NC_022784	CAG	2	6	45767	45772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626112
544	NC_022784	TCA	2	6	45808	45813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626112
545	NC_022784	CAA	2	6	45935	45940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626112
546	NC_022784	ACC	2	6	45954	45959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626112
547	NC_022784	AAC	2	6	45981	45986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557626112
548	NC_022784	TCA	2	6	46114	46119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626112
549	NC_022784	TTA	2	6	46129	46134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626112
550	NC_022784	TCT	2	6	46157	46162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626112
551	NC_022784	CAG	2	6	46163	46168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626112
552	NC_022784	GCA	2	6	46183	46188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626112
553	NC_022784	AAT	2	6	46220	46225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557626112
554	NC_022784	TGC	2	6	46269	46274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626112
555	NC_022784	TAC	2	6	46342	46347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_022784	TCT	2	6	47529	47534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_022784	CTC	2	6	47566	47571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_022784	TTC	2	6	47590	47595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_022784	TGT	2	6	47651	47656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_022784	TTC	2	6	47668	47673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022784	TCA	2	6	47705	47710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_022784	ACT	2	6	47813	47818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022784	CTT	2	6	47822	47827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_022784	CCA	2	6	47847	47852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_022784	TAA	2	6	47908	47913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022784	CTT	2	6	47941	47946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022784	TCA	2	6	48067	48072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_022784	CAG	2	6	48073	48078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_022784	CTA	2	6	48082	48087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_022784	CAG	2	6	48101	48106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_022784	CTG	2	6	48115	48120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022784	CAT	2	6	48182	48187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_022784	GGT	2	6	48194	48199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_022784	CAT	2	6	48212	48217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022784	GTG	2	6	48345	48350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625342
576	NC_022784	GTA	2	6	48384	48389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_022784	CTG	2	6	48418	48423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022784	GAT	2	6	48467	48472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022784	TGT	2	6	48481	48486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_022784	CAT	2	6	48529	48534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_022784	TGC	2	6	48656	48661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_022784	GTG	2	6	48670	48675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022784	GAG	2	6	49106	49111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022784	GGT	2	6	49195	49200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022784	GTA	2	6	49231	49236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022784	GTG	2	6	49269	49274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022784	GGC	2	6	49431	49436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_022784	GAT	2	6	49443	49448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_022784	GCC	2	6	49491	49496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_022784	ATT	2	6	49554	49559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022784	GGT	2	6	49636	49641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_022784	TGC	2	6	49647	49652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_022784	GGT	2	6	49720	49725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625343
594	NC_022784	ACG	2	6	49815	49820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625343
595	NC_022784	GCG	2	6	49823	49828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625343
596	NC_022784	GAA	2	6	49915	49920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625343
597	NC_022784	AGC	2	6	50129	50134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625343
598	NC_022784	GGA	2	6	50240	50245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625343
599	NC_022784	GCC	2	6	50270	50275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625343
600	NC_022784	CTA	2	6	50305	50310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625343
601	NC_022784	CTG	2	6	50471	50476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625343
602	NC_022784	AGA	2	6	50502	50507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625343
603	NC_022784	GAG	2	6	50618	50623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625343
604	NC_022784	AGT	2	6	50667	50672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625343
605	NC_022784	GGC	2	6	50896	50901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_022784	AGC	2	6	51004	51009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_022784	CTA	2	6	51098	51103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_022784	TCG	2	6	51189	51194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625345
609	NC_022784	ACC	2	6	51215	51220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625345
610	NC_022784	CAT	2	6	51298	51303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625345
611	NC_022784	GTG	2	6	51315	51320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625345
612	NC_022784	CTA	2	6	51342	51347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625345
613	NC_022784	GTC	2	6	51383	51388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625345
614	NC_022784	TCA	2	6	51396	51401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625345
615	NC_022784	CAG	2	6	51515	51520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
616	NC_022784	CAG	2	6	51647	51652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
617	NC_022784	CAC	2	6	51851	51856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625345
618	NC_022784	ACA	2	6	51976	51981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625345
619	NC_022784	CAC	2	6	51985	51990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625345
620	NC_022784	GTT	2	6	51994	51999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625345
621	NC_022784	GCA	2	6	52038	52043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625345
622	NC_022784	CTG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625345
623	NC_022784	AGT	3	9	52147	52155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625345
624	NC_022784	CCA	2	6	52221	52226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625345
625	NC_022784	GAA	2	6	52316	52321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625345
626	NC_022784	ATT	2	6	52413	52418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625345
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628	NC_022784	TGT	2	6	52594	52599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625345
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