MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017167	CTG	2	6	187446	187451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133972
3003	NC_017167	CAT	2	6	187525	187530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133972
3004	NC_017167	GGA	2	6	187559	187564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133972
3005	NC_017167	CTG	2	6	187565	187570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133972
3006	NC_017167	GCG	2	6	187705	187710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133973
3007	NC_017167	CTT	2	6	187739	187744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133973
3008	NC_017167	ACC	2	6	187815	187820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133973
3009	NC_017167	CCG	2	6	187895	187900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133973
3010	NC_017167	GTC	2	6	187958	187963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133973
3011	NC_017167	GCC	2	6	188085	188090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133973
3012	NC_017167	TCG	2	6	188106	188111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133973
3013	NC_017167	CCG	2	6	188181	188186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133973
3014	NC_017167	TTC	2	6	188286	188291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133973
3015	NC_017167	GCG	2	6	188541	188546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133974
3016	NC_017167	GGT	2	6	188598	188603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133974
3017	NC_017167	TGC	2	6	188627	188632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3018	NC_017167	GAA	2	6	188707	188712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133974
3019	NC_017167	TCA	2	6	188744	188749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133974
3020	NC_017167	CGG	2	6	188783	188788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133974
3021	NC_017167	CCT	2	6	188799	188804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133974
3022	NC_017167	ATG	2	6	188836	188841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133974
3023	NC_017167	TCG	2	6	188987	188992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3024	NC_017167	CAA	2	6	189015	189020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133974
3025	NC_017167	TCG	2	6	189032	189037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3026	NC_017167	CCG	2	6	189058	189063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133974
3027	NC_017167	ATT	2	6	189094	189099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133974
3028	NC_017167	ACT	2	6	189104	189109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133974
3029	NC_017167	CAG	2	6	189111	189116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3030	NC_017167	AGC	2	6	189164	189169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3031	NC_017167	CTT	2	6	189285	189290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133974
3032	NC_017167	TAC	2	6	189334	189339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133974
3033	NC_017167	TGG	2	6	189395	189400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133974
3034	NC_017167	TGG	2	6	189440	189445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133974
3035	NC_017167	CAG	2	6	189508	189513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133974
3036	NC_017167	CTA	2	6	189633	189638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133974
3037	NC_017167	CCT	2	6	189651	189656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133974
3038	NC_017167	ACT	2	6	189686	189691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133974
3039	NC_017167	CGG	2	6	189737	189742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133974
3040	NC_017167	GAT	2	6	189825	189830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133974
3041	NC_017167	CAA	2	6	190005	190010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133974
3042	NC_017167	CCA	2	6	190022	190027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133974
3043	NC_017167	TTC	2	6	190039	190044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133974
3044	NC_017167	CGG	2	6	190047	190052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133974
3045	NC_017167	AAG	2	6	190180	190185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133974
3046	NC_017167	GCG	2	6	190198	190203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017167	CGG	2	6	190257	190262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133975
3048	NC_017167	CAA	2	6	190356	190361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133975
3049	NC_017167	CCT	2	6	190392	190397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133975
3050	NC_017167	GGA	2	6	190440	190445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133975
3051	NC_017167	AGC	2	6	190589	190594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133975
3052	NC_017167	GAG	2	6	190621	190626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133975
3053	NC_017167	CGT	2	6	190629	190634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133975
3054	NC_017167	GCG	2	6	190670	190675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133975
3055	NC_017167	GGA	2	6	190686	190691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133975
3056	NC_017167	GCG	2	6	190768	190773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
3057	NC_017167	GGT	2	6	190784	190789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133976
3058	NC_017167	CGG	2	6	190869	190874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
3059	NC_017167	TGC	2	6	191032	191037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133976
3060	NC_017167	GCA	2	6	191054	191059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133976
3061	NC_017167	TCA	2	6	191248	191253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133976
3062	NC_017167	CGC	2	6	191269	191274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133976
3063	NC_017167	CAT	2	6	191435	191440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133976
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3065	NC_017167	GGC	2	6	191484	191489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
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3067	NC_017167	GAC	2	6	191682	191687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133976
3068	NC_017167	CAT	2	6	191705	191710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133976
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3071	NC_017167	AGG	2	6	191878	191883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133976
3072	NC_017167	GCG	2	6	191974	191979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133976
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3074	NC_017167	CGA	2	6	192134	192139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133976
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3076	NC_017167	CGG	2	6	192359	192364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133977
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3083	NC_017167	TCA	2	6	192802	192807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133977
3084	NC_017167	CTT	2	6	192908	192913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133977
3085	NC_017167	CGC	2	6	192916	192921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133977
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3089	NC_017167	CGT	2	6	193391	193396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133977
3090	NC_017167	CAT	2	6	193415	193420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133977
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3095	NC_017167	TTC	2	6	193760	193765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133979
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3101	NC_017167	ACG	2	6	194417	194422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133979
3102	NC_017167	TCT	2	6	194429	194434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133979
3103	NC_017167	TGG	2	6	194550	194555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133979
3104	NC_017167	TCG	2	6	194641	194646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133979
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3106	NC_017167	TCG	2	6	194707	194712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133979
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3110	NC_017167	TCC	2	6	195119	195124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3111	NC_017167	ACG	2	6	195200	195205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017167	GGA	2	6	195244	195249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
3113	NC_017167	GCG	2	6	195253	195258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133980
3114	NC_017167	GAG	2	6	195386	195391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
3115	NC_017167	CGG	2	6	195394	195399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133980
3116	NC_017167	GAG	2	6	195437	195442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
3117	NC_017167	CAT	2	6	195472	195477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133980
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3119	NC_017167	CGT	2	6	195762	195767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133980
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3356	NC_017167	ATG	2	6	211917	211922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134003
3357	NC_017167	TGC	2	6	212129	212134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3358	NC_017167	GTC	2	6	212345	212350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3359	NC_017167	GCT	2	6	212413	212418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3360	NC_017167	ACG	2	6	212677	212682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134004
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3385	NC_017167	TCC	2	6	214512	214517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3393	NC_017167	GAG	2	6	215004	215009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3395	NC_017167	TCA	2	6	215082	215087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3473	NC_017167	CGG	2	6	220823	220828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3474	NC_017167	ATC	2	6	220913	220918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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