MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 46649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017167	GGC	2	6	253197	253202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134048
4002	NC_017167	GGA	3	9	253224	253232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134048
4003	NC_017167	CAT	2	6	253242	253247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134048
4004	NC_017167	GAG	2	6	253300	253305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134048
4005	NC_017167	GCC	2	6	253310	253315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134048
4006	NC_017167	GGC	2	6	253343	253348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134048
4007	NC_017167	ACG	2	6	253427	253432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4008	NC_017167	TGC	2	6	253439	253444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4009	NC_017167	CGT	2	6	253464	253469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4010	NC_017167	CGC	2	6	253507	253512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134048
4011	NC_017167	TGC	2	6	253517	253522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4012	NC_017167	GCC	2	6	253537	253542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134048
4013	NC_017167	TGG	2	6	253544	253549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134048
4014	NC_017167	CCG	2	6	253557	253562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134048
4015	NC_017167	CTC	2	6	253576	253581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134048
4016	NC_017167	TCG	2	6	253610	253615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4017	NC_017167	TCG	2	6	253706	253711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4018	NC_017167	CGG	2	6	253746	253751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134048
4019	NC_017167	GTG	2	6	253789	253794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134048
4020	NC_017167	ACG	2	6	253835	253840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134048
4021	NC_017167	GTG	2	6	253858	253863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134048
4022	NC_017167	GAT	2	6	253866	253871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134048
4023	NC_017167	ACG	2	6	254199	254204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134049
4024	NC_017167	GCG	2	6	254313	254318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134049
4025	NC_017167	GGC	2	6	254389	254394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134049
4026	NC_017167	GCG	2	6	254607	254612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134050
4027	NC_017167	TGC	2	6	254828	254833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017167	AAG	2	6	254917	254922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134051
4029	NC_017167	GAG	3	9	254955	254963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134051
4030	NC_017167	GCG	2	6	254987	254992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134051
4031	NC_017167	CAT	2	6	255095	255100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134051
4032	NC_017167	AGC	2	6	255112	255117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134051
4033	NC_017167	TCA	2	6	255133	255138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134051
4034	NC_017167	CGT	2	6	255161	255166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134051
4035	NC_017167	CCG	2	6	255253	255258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134051
4036	NC_017167	GCT	2	6	255296	255301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134051
4037	NC_017167	TCA	2	6	255349	255354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134051
4038	NC_017167	ATG	2	6	255558	255563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134052
4039	NC_017167	AAG	2	6	255568	255573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134052
4040	NC_017167	TCA	2	6	255581	255586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134052
4041	NC_017167	GAG	2	6	255604	255609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134052
4042	NC_017167	CGG	2	6	255693	255698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134053
4043	NC_017167	AAG	2	6	255758	255763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134053
4044	NC_017167	TGG	2	6	255806	255811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134053
4045	NC_017167	CGC	2	6	255814	255819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
4046	NC_017167	ACG	2	6	255851	255856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4047	NC_017167	ACG	2	6	255887	255892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4048	NC_017167	ACG	2	6	255911	255916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4049	NC_017167	TCG	2	6	255929	255934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4050	NC_017167	CAT	2	6	256152	256157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134053
4051	NC_017167	CCG	2	6	256167	256172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
4052	NC_017167	TCA	2	6	256253	256258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134053
4053	NC_017167	CAC	2	6	256261	256266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134053
4054	NC_017167	TCG	2	6	256328	256333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4055	NC_017167	CAT	2	6	256452	256457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134053
4056	NC_017167	CGT	2	6	256533	256538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4057	NC_017167	CCG	2	6	256608	256613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
4058	NC_017167	GAG	2	6	256627	256632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134053
4059	NC_017167	TTC	2	6	256705	256710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134053
4060	NC_017167	AGC	2	6	256712	256717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4061	NC_017167	CGC	2	6	256775	256780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
4062	NC_017167	AAG	2	6	256786	256791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134053
4063	NC_017167	TCG	2	6	256835	256840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4064	NC_017167	AGG	2	6	256922	256927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134053
4065	NC_017167	GAG	2	6	256936	256941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134053
4066	NC_017167	CGA	2	6	256953	256958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4067	NC_017167	GCC	2	6	256989	256994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134053
4068	NC_017167	GAC	2	6	257098	257103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134053
4069	NC_017167	CGC	2	6	257238	257243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_017167	GGC	2	6	257250	257255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_017167	ACC	2	6	257311	257316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017167	GGC	2	6	257395	257400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017167	GCG	2	6	257443	257448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017167	GAG	2	6	257531	257536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017167	TCT	2	6	257540	257545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017167	CCA	2	6	257619	257624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_017167	CGA	2	6	257628	257633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017167	GCA	2	6	257702	257707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017167	CGC	2	6	257749	257754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_017167	GAA	2	6	257761	257766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017167	CAG	2	6	257871	257876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017167	GGA	2	6	258063	258068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017167	GAA	2	6	258326	258331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017167	GGT	2	6	258401	258406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017167	GTC	2	6	258415	258420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017167	GGA	2	6	258528	258533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017167	ATC	2	6	258552	258557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_017167	CAC	2	6	258762	258767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_017167	GAT	2	6	258837	258842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017167	CCT	2	6	258893	258898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_017167	GGA	2	6	258973	258978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017167	GAA	2	6	259055	259060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017167	CAG	2	6	259152	259157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017167	AGT	2	6	259245	259250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017167	GGA	2	6	259264	259269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017167	GCG	2	6	259333	259338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_017167	ACC	2	6	259495	259500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_017167	GGA	2	6	259693	259698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017167	AGC	2	6	260153	260158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017167	CAT	2	6	260159	260164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017167	CCG	2	6	260364	260369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_017167	ACC	2	6	260473	260478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_017167	AGG	2	6	260506	260511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017167	AGC	2	6	260546	260551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017167	GGA	2	6	260790	260795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017167	AGG	2	6	260905	260910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017167	CGG	2	6	260957	260962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017167	GTA	2	6	261073	261078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017167	ACC	2	6	261228	261233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_017167	GTT	2	6	261245	261250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017167	CCT	2	6	261316	261321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017167	GGT	2	6	261453	261458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017167	CGT	2	6	261648	261653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017167	GAC	2	6	261874	261879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017167	AAG	2	6	261986	261991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134054
4116	NC_017167	CGA	2	6	262127	262132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134054
4117	NC_017167	CCT	2	6	262304	262309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_017167	CTC	2	6	262570	262575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134055
4119	NC_017167	TTG	2	6	262723	262728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134055
4120	NC_017167	ACC	2	6	262752	262757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134055
4121	NC_017167	GCG	2	6	262772	262777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134055
4122	NC_017167	TGC	2	6	263017	263022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134056
4123	NC_017167	CGA	2	6	263071	263076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134056
4124	NC_017167	GCG	2	6	263329	263334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134056
4125	NC_017167	TCT	2	6	263489	263494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_017167	TCA	2	6	263560	263565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134057
4127	NC_017167	TCG	2	6	263686	263691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134057
4128	NC_017167	CTT	2	6	263732	263737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134057
4129	NC_017167	GAA	2	6	263779	263784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134057
4130	NC_017167	GCG	2	6	263792	263797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134057
4131	NC_017167	ATC	2	6	263811	263816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134057
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4156	NC_017167	TGC	2	6	265765	265770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_017167	GGC	2	6	265984	265989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134059
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4193	NC_017167	CGC	2	6	268505	268510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134062
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4202	NC_017167	TCG	2	6	269033	269038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134062
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4230	NC_017167	GCG	2	6	271480	271485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_017167	GGT	2	6	271498	271503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134065
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4239	NC_017167	TCT	2	6	272099	272104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134065
4240	NC_017167	TTC	2	6	272212	272217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134065
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4242	NC_017167	GGC	2	6	272295	272300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134065
4243	NC_017167	GCA	2	6	272354	272359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134065
4244	NC_017167	GGC	2	6	272389	272394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134065
4245	NC_017167	TGG	2	6	272444	272449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134065
4246	NC_017167	CCG	2	6	272463	272468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134065
4247	NC_017167	GTG	2	6	272515	272520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134065
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4255	NC_017167	GCC	2	6	272996	273001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134066
4256	NC_017167	CCT	2	6	273087	273092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134066
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4261	NC_017167	CTT	2	6	273199	273204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134066
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4271	NC_017167	CGG	2	6	274025	274030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134066
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4273	NC_017167	GCG	2	6	274125	274130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134066
4274	NC_017167	GGA	2	6	274137	274142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134066
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4284	NC_017167	CGG	2	6	274811	274816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134066
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4291	NC_017167	CGG	2	6	275184	275189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134067
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4313	NC_017167	AGG	2	6	276097	276102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134068
4314	NC_017167	GCG	2	6	276105	276110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134068
4315	NC_017167	TGG	2	6	276265	276270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134068
4316	NC_017167	GGC	2	6	276281	276286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134068
4317	NC_017167	ACG	2	6	276306	276311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134068
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4319	NC_017167	GGT	2	6	276413	276418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134068
4320	NC_017167	GCT	2	6	276446	276451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134068
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4322	NC_017167	AGG	2	6	276517	276522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4323	NC_017167	TGT	2	6	276685	276690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134069
4324	NC_017167	TCA	2	6	276715	276720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134069
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4327	NC_017167	CGC	3	9	276954	276962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134070
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4330	NC_017167	CGA	2	6	277167	277172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134070
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4343	NC_017167	CGG	2	6	277821	277826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134070
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4345	NC_017167	GAT	2	6	277986	277991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134070
4346	NC_017167	GGA	2	6	278001	278006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134070
4347	NC_017167	GGC	2	6	278034	278039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134070
4348	NC_017167	CGA	2	6	278073	278078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134070
4349	NC_017167	CAT	2	6	278094	278099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134070
4350	NC_017167	CGG	3	9	278111	278119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134070
4351	NC_017167	CTT	2	6	278154	278159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134070
4352	NC_017167	GCG	2	6	278318	278323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134070
4353	NC_017167	CGT	2	6	278418	278423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134070
4354	NC_017167	TGG	2	6	278504	278509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134070
4355	NC_017167	TCA	2	6	278657	278662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4356	NC_017167	GAG	2	6	278729	278734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_017167	GAG	2	6	278818	278823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4358	NC_017167	CGA	2	6	278848	278853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134071
4359	NC_017167	TGC	2	6	278856	278861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134071
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